Paramecium tetraurelia: GSPATT00010357001
Help
Entry
GSPATT00010357001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K20178
vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ptm00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
GSPATT00010357001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
GSPATT00010357001
Membrane trafficking [BR:
ptm04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
GSPATT00010357001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps8
zf-RING_2
zf-rbx1
PIH1_CS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5027305
NCBI-ProteinID:
XP_001441520
Genoscope:
GSPATT00010357001
UniProt:
A0CTK6
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
1358 aa
AA seq
DB search
MKIDEIIANPNLCPPKERKSTTPNSKEQINKLDQLLKGNLIENKVNAIESKKEISQYKQI
DKKMPFKDNYSLLYNLSIGNKKIDQYTNQKQVQEIKEIPYVLENIGKQERQQFQIQSQFD
QTEMLKAFEKKIHTLELFKEVKVSNKQEEFYEKNKGLLITSITCFENMVAFGTNRAVIYI
QFNNQINQLEQNKKINHSPIICLRFLDKGTKLIGISEKQVLLYVKNEFVKAFQLKIESIP
ISMTVCQKSKNFKIQLLMADSLGNVYGIRIKQTLLKYGMQMKLELKENILCHQIESINFQ
DQEYILLTFKDQIQLVNLKPEYQLLMKLNYKVQENRIIQVKWQIEKKTLLIAVGNDNTLE
VLSIQFEKQNDRLKSNLNLLCQYSFNNQYIQYFTWLSNDIIFVKHERKLYSLIGISEILK
QKVDIIQKSLSQDIMSQKIGELLVFENSICNFQNQLFFISNEEKIYKSRIVQYKLNTWED
QMQQFQLNNELKEQFGMGLYLYSGKLIKLGNLPRIGRQEYLKPHLHTLVSRFVESSVKSQ
SFNSIYIAMDFLIMIESYEFLFNQIYLIYKSNRYERQFYESLESFINKGVIKQIPIDTSL
KDILDYFSKGDKLKLLKFLIFNLDKSFINYSLIKEFCIQSNLQSILIYIPPKDIEDYKTP
ILTIFEIYQSCLNNNSQVLQHYFKSTKLDITSLSQKQIDEQIQCLGYKCIWFMSLIFKGE
SLSQEKIPEKYWPQIVIEILQWLLESEVLERFLQIDAGIFLNELLLILKDNKTYNKLQGF
KDALDKQQGELSEIIIRNIYTKIKKLNIVSQFNCFILEIMKLGYQISYEDFLQVMIYNLR
CPYENLKVFVDKSNFKFQKMEYKLQEDMTDQDKIKRDNLLIQYITFFTTQLLGDDQQLQS
ILSEASCSILSCSRIQSEIYCLKGDWIKCIGTMLASSSLIDKEYIFNYIDRILNSNQFYN
QKEEIIKFCVTIVQQLADVSVEKLKILLQYFPNYLYKQAIVKLDNHPNFKLYLLNQIIQD
SRNKNEIIDKQIMISYIRLLCKHHPQDVYDELQFGDFPQEDCMIICKEYKIMKGVAFLKE
RSGCLQEALDIYFDVIRTDFIALESGHSQLELQQQLLILILPCLKICRENCSNEDDNFQY
WLTCVNRMLILRLEFRLQTNKFNSINKLFQEILMEMFESVHPKLIISNLSQLLKPFTHIE
ELRRTTVTLQKLCFFQLITHEQFIGNQTYQNFKRLEILYGQEQKGTLLMDRCLVCSQENE
KYMYAFMSCCHIFHKQCLRLIKNVKVCKICLDKGIHSDQLNVQLEILVDNDYVQPGDQLI
KQPTIEEQLQLSKQEQRQLRINKLKMLDMENEIKEILY
NT seq
4077 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatagatgaaattattgctaatccaaatttatgccctcctaaggaaagaaaatca
acaactccaaatagcaaggaatagataaataaattagattaactactcaaagggaatttg
attgagaacaaagtaaatgcaatagaatcaaaaaaagaaatttcataatataaataaatc
gataagaaaatgccttttaaggataactactcattattgtataacttatcaattggaaat
aaaaaaatagattaatatacaaatcaaaaataagtttaagaaataaaagaaattccatat
gtattagagaatattggaaaacaagaaaggtaataattttagatacaatcataattcgat
taaacagagatgttgaaggcttttgaaaaaaaaatacacactttagagttatttaaagaa
gtaaaggtttcgaataaataagaggaattttatgaaaaaaataaaggattgttgataact
agtataacttgttttgaaaatatggtagcctttggaactaacagagctgtaatctatatc
taatttaataaccaaataaattagttggagcaaaacaaaaaaattaatcatagtccaatt
atttgtctaagatttttagataaaggcactaaattaataggtatttcggagaaataagtg
ttattgtacgttaaaaatgaatttgtaaaggcattttaattgaaaatagaaagtattcct
atttcaatgactgtttgttaaaagtcgaaaaactttaagatttagttattgatggctgat
tcattgggtaatgtgtatggaattagaattaaataaaccctattaaaatatggaatgtag
atgaaattagaattaaaagagaatattttatgtcattagattgaatctataaatttttaa
gattaggaatacatcctattaacatttaaagactaaatacaattagtcaatttgaaacca
gaatatcaactactaatgaaattaaattataaggttcaagagaatagaatcatttaagtt
aaatggtaaattgaaaagaagacactcttaatagcagttggtaatgataacacattagaa
gttctatcaatttaatttgagaagtaaaatgatagattgaaatctaatttaaacttgtta
tgtcaatacagttttaataactaatatatatagtattttacttggctgagcaatgatatt
atatttgttaaacatgaaagaaagttgtattctttaataggaatatcagagattctaaaa
taaaaagtagatataatttaaaaatctttaagtcaggatattatgagttaaaaaattgga
gaactattagtttttgagaattcaatttgtaatttttaaaattaactgttctttatttcc
aatgaagaaaagatatataaatcaagaatagtataatataaattaaatacttgggaagat
tagatgtaataattccaattaaataatgagttgaaggaataatttggaatgggattgtat
ttgtattcaggaaaactcataaaattagggaatcttccaagaattggacgataagagtat
ctaaaacctcatttacacaccttagtatcaagatttgttgaaagtagtgtaaaatcttaa
tcatttaattcaatttacatagctatggatttcttaataatgattgaatcatatgagttt
ctatttaactaaatatatttaatctataaaagtaatagatatgaaaggtaattttatgaa
agtttggaatcttttataaacaaaggagttattaaataaataccaatagatacttcattg
aaggatatacttgactattttagtaaaggcgataagttaaaattattgaagtttttgatt
tttaatctagacaaaagctttattaattattctcttatcaaagaattctgtattcaatcc
aacttacagagtatattgatatacattccaccaaaagatattgaagattataagacacct
atattgactatttttgagatttatcaatcctgcttaaataacaattcttaagttttatag
cattattttaaatcaacaaagttggatataacaagtctaagccaaaaataaattgatgag
tagatataatgtttaggttataaatgtatttggtttatgagtttaatatttaaaggagaa
tcactttcttaggagaagattcctgaaaaatattggcctcagatagtaattgagatatta
taatggcttttagaaagtgaagtattggagaggttcttataaatagatgctggaatattt
ttgaatgaactcttgttaattttaaaggataataagacttataacaaattataaggtttt
aaggatgcattagataaataacaaggtgaactttctgagatcatcatcagaaatatatat
acgaaaattaagaaattaaatatagtaagctaattcaattgttttattttggaaataatg
aagttaggttattaaatatcttatgaggatttcttgtaagttatgatttacaatttaaga
tgcccatatgagaatttaaaggtgtttgtagacaaaagtaactttaagttttaaaagatg
gaatataaattataagaggacatgacagattaggataaaataaaaagagataatttactg
atttaatatataacatttttcacaacccagttattaggagatgattagtaattgtagagc
attttatcagaagcttcttgttcaatactttcatgttcaagaattcaatctgaaatatat
tgtttaaaaggagattggataaaatgtattggtactatgctagcatcgtcatctctaatt
gataaggaatacatattcaattatattgataggatactcaattcaaattaattttacaat
tagaaagaggaaattattaaattttgtgtgactattgtttaataattggctgatgtaagt
gttgagaaattgaagatacttttgcaatattttcctaactatttatataaataagcaata
gttaagttggataaccatcccaattttaaactatatttgctgaatcaaataatataagat
tctaggaataagaatgaaataattgataaataaattatgatctcctatataaggttattg
tgcaagcatcacccataggatgtatacgatgaattgcaatttggagatttcccataagaa
gattgtatgattatctgtaaagaatataaaataatgaaaggagttgcatttctaaaagaa
agaagtggatgcttataagaagctctagacatatattttgatgttatcagaacagatttt
attgctctagagagtggacactctcaactcgaattacaataacaattactaatattaata
ttaccttgtttaaaaatatgcagagaaaactgttctaacgaagatgataattttcaatat
tggttgacctgtgttaatagaatgctaattttacgtttagaattccgtttatagacgaat
aagtttaattccattaataaattattctaagagatcttaatggaaatgtttgagagtgtc
catcccaagttgattattagtaatttaagttaactattaaaaccttttacccatattgaa
gaactgagaagaacaactgtaacattgcagaagttatgctttttttaattaattacacat
gaacaatttataggaaatcaaacttattaaaattttaaaagattagagatattatatggt
taagaataaaaagggactcttttaatggatagatgtctggtatgctcacaggaaaatgaa
aagtatatgtatgcatttatgtcatgttgtcacatttttcataagtaatgtttgagacta
attaaaaatgtaaaagtgtgtaagatttgtttagataaagggattcattctgattaatta
aatgtataattagaaatattagtagacaacgattatgtataacctggtgattaattaata
aagtaacctacaatagaagagtagctacaattatcaaagtaggagtagagataattacga
attaataaattgaaaatgctggatatggaaaatgagattaaagaaattttgtactga
DBGET
integrated database retrieval system