KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00010357001
Entry
GSPATT00010357001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20178  vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04148  Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04148 Efferocytosis
    GSPATT00010357001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00010357001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Endosome - Lysosome transport
  Tethering complex
   CORVET complex
    GSPATT00010357001
SSDB
Motif
Pfam: Vps8 zf-RING_2 zf-rbx1 PIH1_CS
Other DBs
NCBI-GeneID: 5027305
NCBI-ProteinID: XP_001441520
Genoscope: GSPATT00010357001
UniProt: A0CTK6
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1358 aa
MKIDEIIANPNLCPPKERKSTTPNSKEQINKLDQLLKGNLIENKVNAIESKKEISQYKQI
DKKMPFKDNYSLLYNLSIGNKKIDQYTNQKQVQEIKEIPYVLENIGKQERQQFQIQSQFD
QTEMLKAFEKKIHTLELFKEVKVSNKQEEFYEKNKGLLITSITCFENMVAFGTNRAVIYI
QFNNQINQLEQNKKINHSPIICLRFLDKGTKLIGISEKQVLLYVKNEFVKAFQLKIESIP
ISMTVCQKSKNFKIQLLMADSLGNVYGIRIKQTLLKYGMQMKLELKENILCHQIESINFQ
DQEYILLTFKDQIQLVNLKPEYQLLMKLNYKVQENRIIQVKWQIEKKTLLIAVGNDNTLE
VLSIQFEKQNDRLKSNLNLLCQYSFNNQYIQYFTWLSNDIIFVKHERKLYSLIGISEILK
QKVDIIQKSLSQDIMSQKIGELLVFENSICNFQNQLFFISNEEKIYKSRIVQYKLNTWED
QMQQFQLNNELKEQFGMGLYLYSGKLIKLGNLPRIGRQEYLKPHLHTLVSRFVESSVKSQ
SFNSIYIAMDFLIMIESYEFLFNQIYLIYKSNRYERQFYESLESFINKGVIKQIPIDTSL
KDILDYFSKGDKLKLLKFLIFNLDKSFINYSLIKEFCIQSNLQSILIYIPPKDIEDYKTP
ILTIFEIYQSCLNNNSQVLQHYFKSTKLDITSLSQKQIDEQIQCLGYKCIWFMSLIFKGE
SLSQEKIPEKYWPQIVIEILQWLLESEVLERFLQIDAGIFLNELLLILKDNKTYNKLQGF
KDALDKQQGELSEIIIRNIYTKIKKLNIVSQFNCFILEIMKLGYQISYEDFLQVMIYNLR
CPYENLKVFVDKSNFKFQKMEYKLQEDMTDQDKIKRDNLLIQYITFFTTQLLGDDQQLQS
ILSEASCSILSCSRIQSEIYCLKGDWIKCIGTMLASSSLIDKEYIFNYIDRILNSNQFYN
QKEEIIKFCVTIVQQLADVSVEKLKILLQYFPNYLYKQAIVKLDNHPNFKLYLLNQIIQD
SRNKNEIIDKQIMISYIRLLCKHHPQDVYDELQFGDFPQEDCMIICKEYKIMKGVAFLKE
RSGCLQEALDIYFDVIRTDFIALESGHSQLELQQQLLILILPCLKICRENCSNEDDNFQY
WLTCVNRMLILRLEFRLQTNKFNSINKLFQEILMEMFESVHPKLIISNLSQLLKPFTHIE
ELRRTTVTLQKLCFFQLITHEQFIGNQTYQNFKRLEILYGQEQKGTLLMDRCLVCSQENE
KYMYAFMSCCHIFHKQCLRLIKNVKVCKICLDKGIHSDQLNVQLEILVDNDYVQPGDQLI
KQPTIEEQLQLSKQEQRQLRINKLKMLDMENEIKEILY
NT seq 4077 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatagatgaaattattgctaatccaaatttatgccctcctaaggaaagaaaatca
acaactccaaatagcaaggaatagataaataaattagattaactactcaaagggaatttg
attgagaacaaagtaaatgcaatagaatcaaaaaaagaaatttcataatataaataaatc
gataagaaaatgccttttaaggataactactcattattgtataacttatcaattggaaat
aaaaaaatagattaatatacaaatcaaaaataagtttaagaaataaaagaaattccatat
gtattagagaatattggaaaacaagaaaggtaataattttagatacaatcataattcgat
taaacagagatgttgaaggcttttgaaaaaaaaatacacactttagagttatttaaagaa
gtaaaggtttcgaataaataagaggaattttatgaaaaaaataaaggattgttgataact
agtataacttgttttgaaaatatggtagcctttggaactaacagagctgtaatctatatc
taatttaataaccaaataaattagttggagcaaaacaaaaaaattaatcatagtccaatt
atttgtctaagatttttagataaaggcactaaattaataggtatttcggagaaataagtg
ttattgtacgttaaaaatgaatttgtaaaggcattttaattgaaaatagaaagtattcct
atttcaatgactgtttgttaaaagtcgaaaaactttaagatttagttattgatggctgat
tcattgggtaatgtgtatggaattagaattaaataaaccctattaaaatatggaatgtag
atgaaattagaattaaaagagaatattttatgtcattagattgaatctataaatttttaa
gattaggaatacatcctattaacatttaaagactaaatacaattagtcaatttgaaacca
gaatatcaactactaatgaaattaaattataaggttcaagagaatagaatcatttaagtt
aaatggtaaattgaaaagaagacactcttaatagcagttggtaatgataacacattagaa
gttctatcaatttaatttgagaagtaaaatgatagattgaaatctaatttaaacttgtta
tgtcaatacagttttaataactaatatatatagtattttacttggctgagcaatgatatt
atatttgttaaacatgaaagaaagttgtattctttaataggaatatcagagattctaaaa
taaaaagtagatataatttaaaaatctttaagtcaggatattatgagttaaaaaattgga
gaactattagtttttgagaattcaatttgtaatttttaaaattaactgttctttatttcc
aatgaagaaaagatatataaatcaagaatagtataatataaattaaatacttgggaagat
tagatgtaataattccaattaaataatgagttgaaggaataatttggaatgggattgtat
ttgtattcaggaaaactcataaaattagggaatcttccaagaattggacgataagagtat
ctaaaacctcatttacacaccttagtatcaagatttgttgaaagtagtgtaaaatcttaa
tcatttaattcaatttacatagctatggatttcttaataatgattgaatcatatgagttt
ctatttaactaaatatatttaatctataaaagtaatagatatgaaaggtaattttatgaa
agtttggaatcttttataaacaaaggagttattaaataaataccaatagatacttcattg
aaggatatacttgactattttagtaaaggcgataagttaaaattattgaagtttttgatt
tttaatctagacaaaagctttattaattattctcttatcaaagaattctgtattcaatcc
aacttacagagtatattgatatacattccaccaaaagatattgaagattataagacacct
atattgactatttttgagatttatcaatcctgcttaaataacaattcttaagttttatag
cattattttaaatcaacaaagttggatataacaagtctaagccaaaaataaattgatgag
tagatataatgtttaggttataaatgtatttggtttatgagtttaatatttaaaggagaa
tcactttcttaggagaagattcctgaaaaatattggcctcagatagtaattgagatatta
taatggcttttagaaagtgaagtattggagaggttcttataaatagatgctggaatattt
ttgaatgaactcttgttaattttaaaggataataagacttataacaaattataaggtttt
aaggatgcattagataaataacaaggtgaactttctgagatcatcatcagaaatatatat
acgaaaattaagaaattaaatatagtaagctaattcaattgttttattttggaaataatg
aagttaggttattaaatatcttatgaggatttcttgtaagttatgatttacaatttaaga
tgcccatatgagaatttaaaggtgtttgtagacaaaagtaactttaagttttaaaagatg
gaatataaattataagaggacatgacagattaggataaaataaaaagagataatttactg
atttaatatataacatttttcacaacccagttattaggagatgattagtaattgtagagc
attttatcagaagcttcttgttcaatactttcatgttcaagaattcaatctgaaatatat
tgtttaaaaggagattggataaaatgtattggtactatgctagcatcgtcatctctaatt
gataaggaatacatattcaattatattgataggatactcaattcaaattaattttacaat
tagaaagaggaaattattaaattttgtgtgactattgtttaataattggctgatgtaagt
gttgagaaattgaagatacttttgcaatattttcctaactatttatataaataagcaata
gttaagttggataaccatcccaattttaaactatatttgctgaatcaaataatataagat
tctaggaataagaatgaaataattgataaataaattatgatctcctatataaggttattg
tgcaagcatcacccataggatgtatacgatgaattgcaatttggagatttcccataagaa
gattgtatgattatctgtaaagaatataaaataatgaaaggagttgcatttctaaaagaa
agaagtggatgcttataagaagctctagacatatattttgatgttatcagaacagatttt
attgctctagagagtggacactctcaactcgaattacaataacaattactaatattaata
ttaccttgtttaaaaatatgcagagaaaactgttctaacgaagatgataattttcaatat
tggttgacctgtgttaatagaatgctaattttacgtttagaattccgtttatagacgaat
aagtttaattccattaataaattattctaagagatcttaatggaaatgtttgagagtgtc
catcccaagttgattattagtaatttaagttaactattaaaaccttttacccatattgaa
gaactgagaagaacaactgtaacattgcagaagttatgctttttttaattaattacacat
gaacaatttataggaaatcaaacttattaaaattttaaaagattagagatattatatggt
taagaataaaaagggactcttttaatggatagatgtctggtatgctcacaggaaaatgaa
aagtatatgtatgcatttatgtcatgttgtcacatttttcataagtaatgtttgagacta
attaaaaatgtaaaagtgtgtaagatttgtttagataaagggattcattctgattaatta
aatgtataattagaaatattagtagacaacgattatgtataacctggtgattaattaata
aagtaacctacaatagaagagtagctacaattatcaaagtaggagtagagataattacga
attaataaattgaaaatgctggatatggaaaatgagattaaagaaattttgtactga

DBGET integrated database retrieval system