Paramecium tetraurelia: GSPATT00038275001
Help
Entry
GSPATT00038275001 CDS
T01055
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ptm
Paramecium tetraurelia
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
NACHT
Pentapeptide_4
Pentapeptide
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5023012
NCBI-ProteinID:
XP_001437227
Genoscope:
GSPATT00038275001
UniProt:
A0CGB3
LinkDB
All DBs
Position
undetermined
AA seq
3262 aa
AA seq
DB search
MIKTCIVHCRTNSGKSQELAISIMCGLMSSISQLKPSDELINSIIEGGKLLLLNFYDKQI
QNPLKIYEIYYFFENLKWSILSQLTLGYSIQNIIITIQDAYLKYIKFSQDWMLHYCWINL
ISDLMCFRPIIQKNQIASFTQQGTSDQEVWELLINENAIIQLPYKKFVAKLKIFEEKIII
FKKFRALKLFQEYLIHNQEEIQLLPNYINFNFNVKKGEQLNHLELFIQLLTNQSNLEILK
ALITQLRTSKEQIISNLEAVKQQVSQHNALLSKNNQIEIKINRQEIMFLMRQIKQSSFLL
QCLTNEINLLINKEILTNSIIQKIVLNNVENLDEKQNVQKLQILAAIQEVENKHMIEFLN
NLQLVSRFWIQICQFTTISHDELIINDLQLEQYFEPQINQNIIIINNINNYLDNFVVQVS
TIKRNVLSILGQKQLKGFMKEHISQKNIAKQITKLLNPNLILFMVNEIQVHFQAMLNDTL
QIEQESDIRKILMMIYSNLNIYKGLIMILKLHQRKIISLETSLKGVFANTNFEVERQFQN
EKDINEYIKSQIIDKKEKLQIVFKKYQNVEFTNDILIDFNKISNQIIKEKIEIQKKDWQE
QIKVHYTLLLSKIQMKLELIGLVQDRNVIYQEIITLLDNQLQLINQIDKKQDIKQSTKDQ
VELHQAEILKLQMKDLFDFDRVFQMIDSLINKSKMLKRIFQQHLLDASCQNQQLNLQLLS
NLKNAFKESLNQAFLDLVKQTLECCQKINKDEQLILDEDFMIKLQSQPNLEQVPVITQMI
NFNTLFLENQEVQDKDAKVDKIQDMIMQFTNAMKMNYKEGLSDMFQNSSYKVRELLVFNL
IKMQSIVQEQTISGFCDNLLRQIWIIEKHPSVRNLLKNEEMIMMQKGLFSKDLQNFSDEL
KKEMQSRLRQIQQLETQVLLSENQDEMKIKLQQAYDNYEIYLDNITDMSQRLDISLIFLR
EISKDLKNIKSSIDQVLESVKRVQDDVRRLRGKNFQELLNIRKQKVQISMHEQQLDQVHI
QITTQDYDPITGNKKTNSNGEFITFLIANRYDNFDGEVNEFLWSDYEKNKDIMLIKGKAG
SGKSRASRNIEELIWSCDMIWPNWIPIYVSLPSLKDPNHNLIEQALESENYNFDKIQVRE
FKDAIINGNLKVVIILDSYDEMKFKCIGTNLYQTNRLIQDLNIQTSGQSVKIIITTREEI
LNSIGYQTWFYGQSIETLKEVEILPFSQEQSFQYIKIYVQISIKRTIKKFYEFLKQLKGQ
NFSLDEFRLVWSQLESTIYSIIQQQQNSEVLFQTQDVERFLQKIQQVEFFNFLSSNQMVS
LKKELLQLWGEQRFLKVIYNINIFHLMGTPFMMEIIVYILPKMLQYYSQSNIIRVELQKN
FMILKTEAQKSKDMIEKYCKRKINQVQNTEEQNYMKINPNEQKLELVILEQFTQIIEDLD
NQNFFESFSLANSIEYINDTTLISNKHFKVRQDANFIVSAFNLNQFTAFDFYEIFVDFYH
NQQLQKLKDLGKSLSHESFLSDLLDFSIYLALDMSQRQITQVNYKQKGKLHIQQAEEERR
VEASWEDAYFSENQDDFEYKAILRKSMLINSKSGIYAFNHKSIQEYFVAYYLLNLITRIF
IKEKLIVDEMALYKSSFNKDQFNLSQEHYSGTLDLLKPKVLKIEEIKNKLIQIVSLSKLD
SDRKFIRSASNSLYLLSYLRAYFENFDLSNICLADTKLNGISFYKCNLNHTQFNNVEIDS
CNFNCATIENSTWKNIICKEKPSLFGHKSKINQIAFSDDGNNLISSSEDGVITLWKLQGD
GEPKSVCLPQNEKLQTFLKSNNFLVCLTQNSIYCFNSNDLSQMGQQLLQNYRYHNLYLSQ
DGKYLATKSSSEEIYFWQMQNLLKLQQQKYLSKGKNKDSIKCIAISSDSQLLATGGTKIK
IWNANNIKDIQEIIEFQQQQQPINAIVFSKDSKVLVIGGNKRLDFLNIENLYQVYLLFSL
DQQVTTNQISFSFDSKMIASMSKKNSLKLYDVQQILDQQDSFRIDTQLKIYLIEISPNSE
ILACCNQKNSEKEVLQIQIWGLNNLHQIRMLSKFVEQTEDILCLKFRNDNLVLGSASKDS
TICLWDLQKQRLIIRLEAHTNQVLDFGFSIDGTKMVSCSLDKTIIFWNIINLDQKQVEIQ
MQLPIESNKICFWPNSQFAVSLQFKQSKEIKLLNSIECSLIQSLEIEEILLDIGFSQDGS
IMASLSEIEILRIWKIFEKSIQIEKKIRLSNLQNIQKILYLNTQSIILSNYVAFQLNIQD
EENIYMQHQFQFSSTSSYCLSVAQNQKFIAMGNSDGFEIINIEKQISPNNLYITTNCMDF
QFSNDSSLLAVATISGAFIKHLKTNNIIHKLEQNCCCLSICFISQNQIVIGLDNNSLVLY
DIKDSQSIEKLVNIQLPNNPQKMVFLEKRQQICIYSEIQCILLNLSILDQIQLIQIDKGN
TSTDLIFDQDQLFIGIGYENHICFQSLQDAIRIEKTLKGDELKNCYYQNFSQNNSNLFII
VSQESIYTEFEINSAVILKQIDLKLKNFNFFTLNPQETQLIAIESYYCYKDDKQKQKSAL
IDLETNKIIQFFEVIEDATIQKLKQVIFSQDGLYFISSYSDLVIKLWDAKTCKLLSMFKS
YTPTIEIIQVSKRGIIAQVSEKVIKLWNLKALKQQFEMDGHSDSVKSLCISPDGFQLISI
SNFEIIRWDLIELKKIDTLLKGRRLPTQVCFSPNCQYFTALDDQLGIHIWKLNTKYIIEH
FYVVSCLSESDLALKIEQTQLFCKYKNPKLLIINLDQVCKQNKKLIFQENLSFPSRSFIL
SKNILIKTNPLEVIQINQSELKNEQMQGIQVNKVKYVAICENTLKLAIQDQDSIIIWSID
KKQKESILQEPQVSNKEVMSLVFSGNGKLLFSCYIDNKIYIWDVNDRFVLIKVQELFNLK
LDYTIDNLSFYDTKSLQIFPVKDEEYGVLSQKYYGMYGFLSAMIVFQLGEVRILEETFDD
PSILNNYSAGFNEANNLIAIQFDTYFNLYDISSKKSQLIAKLEGNSFKQKYQSQILAFSQ
NGNMLLSLGRNHTIRLWDIVDKNSIKVKINLTKPVEALSFQFLDSQTIRIFSKSGELIHQ
TISDFTEIGVIEDKQGFDFSTLNQQNEKPKYFCTFKYREDLKIFDTEKNELKYTLNNFSS
RIMDLQFTPSKKQFIIGMDDGSILLYQIDKQTLKNYKLPICYYKFTKSSLIEAFYCRINQ
SIIQNNENENLEKLFIEKGAIK
NT seq
9789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaagacttgcattgttcattgtaggacaaactctggaaaaagttaagaattagca
atctctattatgtgtgggttgatgtcttcaatctcctaactaaaacctagtgacgaatta
ataaattcaataattgaaggaggaaaacttttacttttgaatttctatgataagcaaata
taaaatcctctaaaaatatatgaaatttattattttttcgaaaacctcaaatggtcaata
ttgagttaattaacattaggatactccattcagaatattattattacaatctaagatgcg
tacttaaagtacatcaaattttcataggattggatgttacattattgttggatcaatttg
atatctgatctaatgtgtttcagacctataatccaaaagaattaaatagcaagttttact
taataaggaacctctgattaagaagtttgggaattactaataaatgaaaatgcaataatt
taattgccatataaaaaatttgttgccaaactaaagatttttgaagaaaaaattataatc
tttaaaaagtttagagcattgaaattattttaagagtatttgattcataattaagaggaa
atttaactattaccaaactatatcaattttaattttaatgtaaaaaaaggagagtaatta
aatcatttggaactttttattcaactgttaacaaattaatcaaacttagaaatactgaaa
gcattaataacctaattaagaacttctaaagagcagataataagtaatttagaagctgtt
aaataataagtgagttagcataatgccttgctatcaaaaaataattaaatagaaatcaaa
ataaacagataggaaataatgtttctaatgcgttaaataaaataatccagtttcttatta
caatgcttaaccaatgagataaatttattaataaataaagaaattttgacaaattctatt
atttaaaaaatagttttaaataatgttgaaaatttggacgagaaacaaaatgtataaaag
ctataaatattagcagctatttaagaagttgaaaacaaacatatgatagaatttttaaat
aatttataactagtatctaggttttggatataaatttgttaatttacaactatttcccat
gatgaattaattatcaatgatctttaattggaataatattttgaaccttaaataaattaa
aatatcattattattaataatatcaacaattatttagataattttgttgtataagtgtcg
accataaagagaaatgttttatcaattttagggtagaaataattaaaaggttttatgaag
gaacatatttcttaaaaaaatatagcaaaatagataactaaactacttaatccaaatttg
atattatttatggttaatgaaattcaggtgcatttttaagctatgttaaacgatacgtta
taaattgaataagagagtgatataagaaaaattttgatgatgatttattctaatttaaac
atttacaaaggattaataatgattcttaaattacatcaaagaaaaattatatctttagaa
acttcattaaaaggggtgtttgcaaatacaaattttgaagttgaaaggtaattttaaaac
gaaaaagatataaacgaatacatcaaatcgtaaataatcgataagaaggaaaagttgtaa
atagtattcaaaaaatatcaaaatgtagaatttacaaatgatatattaatagatttcaat
aaaatatcaaatcaaattattaaagaaaaaattgaaatataaaaaaaggattggtaagaa
caaatcaaagttcattatacattattattatcgaaaattcaaatgaaattagaattaatt
ggtttagtttaagatagaaatgttatatattaagaaattattacattattagataatcag
ctttagttaataaatcaaattgataaaaaacaagatattaaataatcaaccaaagatcaa
gtagaattacaccaagccgaaatattgaagttgtaaatgaaagatttatttgattttgat
agagtattttaaatgatagacagtttaattaataaatccaaaatgttaaagcgaatattt
taataacatcttcttgatgcaagttgttaaaattaataattaaatttataattactcagt
aatttaaagaatgcctttaaagaaagtttaaatcaagcattccttgatttagtgaaataa
actttagaatgttgttaaaagattaataaagatgaacaacttattttagatgaggatttt
atgataaagctacaaagtcaacctaatttagaataagttcctgtaattacataaatgatt
aactttaatactctctttttagaaaattaggaagtctaagataaagatgcaaaggttgat
aaaatataagatatgattatgcaatttacaaatgcaatgaagatgaattacaaagaagga
ttgtctgatatgtttcaaaattcttcatataaagttagggaattactagtattcaattta
attaagatgtaatcaatagtttaagaataaactatatcaggattttgtgacaatttatta
agacaaatttggataattgagaaacatccaagtgttagaaatcttctgaaaaatgaagaa
atgataatgatgtagaaggggttgttctctaaagatttacagaatttctcagatgaattg
aaaaaggaaatgcaatcaagattaagatagatataataactagaaacctaggtattactt
agtgaaaattaagatgaaatgaaaataaaactctaacaagcctatgataattatgaaata
tatttggataatattacagatatgtcataaagattagacattagtttaatatttttaaga
gaaattagtaaagacttgaaaaatattaaatcttctatcgattaggttttagaaagcgta
aaacgggtttaagatgatgtaagaagattaagagggaagaatttttaagagttgttaaat
atacgaaaacaaaaggtttaaatatcaatgcacgagtaacagttagattaagttcatata
tagattacaactcaggattatgatcctataactggaaataagaagactaatagtaatggt
gaattcatcacatttttaatagcaaatcgatatgataattttgatggagaagtaaacgaa
ttcttatggagtgattatgaaaagaataaggatattatgttaattaaaggcaaagcaggt
tcagggaaaagtagagcatcccgtaatatagaagaattaatatggagttgcgatatgatt
tggcctaattggattccaatttatgtgtcactcccttctttaaaagatcctaatcacaat
ttaattgagcaagccctcgaatctgaaaattataactttgataaaattcaagtaagagaa
tttaaggatgcaataataaatggaaatctaaaagtagtaattatattggatagctatgat
gagatgaaatttaaatgtattggaacaaacctttaccaaacaaatagactgatttaggat
ctcaatatataaacatcagggtaatctgttaaaattattattactacgagagaagaaata
ttaaattcaatcggatattaaacatggttttatggttagagtattgaaactctaaaagag
gttgaaatattaccatttagtcaagaataaagtttttaatatattaaaatatacgtttaa
ataagcattaaaaggacgattaagaagttttatgaatttcttaagtaattaaaaggctag
aacttttctttagatgaatttagattggtttggagccaattagaaagcacaatatattct
attatttaacaacaacaaaattctgaagtcttattttagacttaggacgttgaaaggttc
ttatagaaaatataataagttgaattttttaattttttatcatcaaattaaatggtttct
ttaaaaaaggaactgctttagttatggggagaacaaagatttttaaaagtgatttataat
attaatatatttcatttaatgggcactccttttatgatggaaataattgtttacatatta
ccaaaaatgttataatattactcacaatcaaatataataagagttgaattgtaaaaaaac
tttatgattttgaaaacagaagcttagaaatcgaaagatatgattgaaaaatattgtaaa
aggaaaattaattaagtttagaacactgaggagtaaaattatatgaaaatcaatcctaat
gagcaaaaattagaacttgtaatattagaataatttacttaaattatagaagatttagat
aattaaaacttttttgaatcattttctttagctaattctatagaatacattaatgatact
acgttaatttcgaacaaacactttaaagtgaggcaagatgccaactttattgtttcggct
tttaatttaaattaatttactgcttttgatttttatgaaatatttgtagatttctatcac
aattagtaattataaaaattgaaagatttagggaaaagtctttcacacgaaagtttttta
tcagacttattagacttttctatttatttggctttagatatgtcctaaagataaattaca
caagtaaattataaataaaaaggaaaattacatatataataagcagaagaagagaggaga
gttgaagcctcttgggaagatgcatattttagtgaaaattaagatgattttgaatacaaa
gctattttaagaaagagtatgttgattaattctaaaagtggtatttatgcattcaatcat
aaatccatttaggaatattttgtggcttactatcttctgaatttgattacgagaatcttt
attaaggagaaactaatagttgatgaaatggcattatataaaagcagctttaataaggat
taatttaatctatcataagaacattattcaggcactttagatttattaaaaccaaaagta
ttaaagatagaagaaattaaaaataaactaatataaatagtctcattatcaaagttagat
tccgatcgtaaatttattagatctgcttctaattcactttatcttttaagctatctaagg
gcttattttgaaaattttgatttaagtaacatatgcctagcagatacaaaattaaatgga
atcagtttttataagtgtaatttgaaccatacataatttaataatgttgagatcgattca
tgtaattttaattgtgcaactatagagaattcaacttggaaaaatataatttgcaaagag
aaaccttcattatttgggcataaatcaaaaatcaattaaattgctttcagtgatgatggt
aataatttaatatcaagcagtgaagacggagttataactctctggaagttataaggcgat
ggggaacctaagagtgtatgcttaccataaaatgaaaaattgtaaactttccttaaaagt
aacaattttttagtatgtcttacttaaaatagcatatactgctttaattcaaacgatttg
agttaaatgggatagtaattattataaaattatcgttaccataatctttatttatcttaa
gatggtaaatatttagcaacaaaatcaagttcagaagaaatatatttttggcaaatgcaa
aatctgctaaaattataataataaaaatatctatcaaaaggaaagaataaagattcaata
aagtgtattgcaatttcttctgattcttaacttttagctacaggaggcactaaaattaaa
atttggaatgctaacaatataaaagatatctaagaaataatagagtttcaataatagtaa
taacctatcaacgcaatcgtattttcaaaagattctaaagtcttagtaattggaggaaac
aagagattagatttcttgaatattgagaacctatatcaggtttatttgttattttcttta
gattaataagttactacaaattaaatatcattttcgtttgacagtaaaatgattgcttca
atgtctaaaaagaattcactgaagttatatgatgtataatagatacttgatcaataagac
tcttttagaatagatacttaattaaaaatttatttaattgagatatctccaaattctgaa
atattagcttgctgcaattagaaaaacagtgaaaaggaagtcctctaaatccaaatatgg
ggcttaaataaccttcatcaaataaggatgctctcaaagtttgtcgaataaactgaggat
attttatgcttaaaattcagaaatgataatttagttttaggttcagctagcaaagatagt
actatttgtctatgggatttataaaaacagagactaattataagactagaagctcataca
aattaggttttagattttggattctcaattgatggaacaaaaatggtatcgtgcagttta
gataaaacaattattttttggaatatcataaatttggattaaaaataagttgaaatataa
atgtaattgccaatagagtccaataaaatttgtttttggccaaattcataatttgctgtg
tctttgtaatttaaataatccaaagaaatcaagttattgaattcaattgaatgtagtttg
atttaaagtttagaaattgaagaaatattgttagatataggttttagttaagatggcagt
attatggcatcattaagtgagatagaaattctaaggatatggaaaatatttgaaaaatcg
attcaaattgaaaaaaaaattagattaagcaatttgcagaatattcaaaaaatcctatat
ttaaatacctaaagtattattttatctaattatgttgcttttcaattaaacattcaagat
gaagagaacatctatatgtaacattaattttaattttcgagtacttcttcttattgctta
tcagtagcataaaattaaaaatttatagcgatgggaaattcagatggtttcgagattata
aatattgaaaaataaatcagtccaaataatttatacattaccactaactgcatggacttc
taattttctaatgattcctctcttttggctgtagccacaatttctggagcatttatcaag
catctaaaaactaataacataatacataaattggaataaaattgttgttgtctctctatt
tgttttataagttaaaattaaatagtgattggattagataacaattcgttggtattatat
gatataaaagattcttaatcaatagaaaagttggtgaatatctaattgcccaataatcca
caaaaaatggtatttttagaaaaaagataataaatttgtatttatagcgaaatataatgt
atattgctaaatttatcaatattagactaaatttaattgatctaaattgataagggtaat
acatcaacagatttaatattcgattaggattaattatttataggtattggttatgaaaat
catatttgttttcaatcactataagatgctattagaatcgaaaaaacattaaaaggagat
gaattaaaaaattgttattatcagaacttttcttaaaataatagtaatttgttcataata
gtttcataagagtcaatatatactgaatttgagattaattctgctgtgattctaaaataa
attgatttaaaattaaagaattttaattttttcacactcaatccccaagagacttaatta
attgcaatcgaatcttattattgctataaagatgacaaataaaaataaaaatcagctctt
attgatttagaaacgaacaaaataatttaattctttgaagtgattgaagatgccacaatt
caaaaattgaaacaggttatattttcttaggatggactttattttatatcaagttattct
gacttagtaattaaattatgggatgccaaaacttgtaaattgctatctatgttcaaaagt
tatactccaactatagaaattattcaagtctcaaaaagaggaataatagcttaagtaagt
gaaaaagtaataaagttatggaatttgaaagctttaaagtaataatttgaaatggatggt
cattccgattcagttaaatcattatgcatatccccagatggtttttaattgatatccatt
tcaaattttgaaatcatcagatgggacttaatagaactgaaaaaaatcgatactctttta
aaaggtcgaagacttccaacttaagtttgcttttcacctaactgtcaatattttactgca
cttgatgattaactaggaatccatatttggaaattaaatacaaaatacattatcgaacat
ttctatgtagtttcatgtttatctgaaagtgatctggcattgaaaattgagtaaactcaa
cttttctgtaagtacaaaaatcctaagttattgattataaatctagattaggtttgtaaa
taaaataaaaaattaatattttaagaaaacctgagctttccatcaagatcatttattcta
tcaaaaaatatactcataaaaacaaatccattagaagtaatttaaataaattaatctgaa
ttgaagaatgaataaatgcaagggatataagttaataaagtaaaatatgtagctatttgt
gaaaatactttaaaattggcaatttaagatcaagattctataatcatatggtcgatagat
aaaaaataaaaagaatctatattataggaaccataagtaagtaataaagaagtgatgtca
ttggttttttctggtaatggcaaattattattctcatgttatattgataataagatttat
atatgggacgtgaatgatagatttgttttgataaaagtttaagagttgtttaatctaaaa
cttgattatacaattgataatttatctttttatgatacaaagagtctataaattttccct
gtaaaagatgaagaatatggagttctatcttaaaaatattatggaatgtatggatttttg
agtgcaatgatcgtttttcaattaggagaggttagaatattagaagaaacatttgatgat
ccatctatattaaataattattcagctggatttaatgaagccaataatttgattgcaatc
taatttgatacctattttaatttgtatgatatatcatcaaaaaaaagttaattgattgca
aaattagaaggaaactcatttaaataaaaatattaatcttagattttagctttttcataa
aatgggaacatgctattatctttaggaagaaatcacacaataaggttgtgggatattgtt
gataagaactctataaaagttaaaattaatctaacaaaaccagttgaagcactatcattt
taatttttagattcataaacaattaggatttttagtaaatctggagaattaattcattaa
accatttctgattttacagaaattggggttattgaagacaaatagggttttgatttttct
actctaaattaataaaatgagaaaccaaaatatttttgtactttcaaatacagagaggat
ttaaagatttttgatacagaaaaaaatgaattaaagtacactttgaacaatttcagttct
agaataatggatttataatttactccttctaaaaagcaattcataattggaatggatgat
ggatcaatactattatattagattgataagcaaacattaaaaaactataaactaccaatt
tgttattataaatttacaaaaagttcgcttatagaagcattttattgtagaattaattaa
tcaataattcaaaataatgaaaatgaaaaccttgaaaaattatttattgagaaaggagca
atcaaatga
DBGET
integrated database retrieval system