Rickettsia philipii: RSA_01100
Help
Entry
RSA_01100 CDS
T01759
Name
(GenBank) outer membrane protein omp1
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
rph
Rickettsia philipii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rph00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
rph03029
]
RSA_01100
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rph02000
]
RSA_01100
Mitochondrial biogenesis [BR:
rph03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
RSA_01100
Transporters [BR:
rph02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RSA_01100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
POTRA_2
POTRA_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFB25826
UniProt:
H6PWC3
LinkDB
All DBs
Position
complement(210568..212874)
Genome browser
AA seq
768 aa
AA seq
DB search
MTIRSISKLTILLLTIFYYHISLADSVIRKITIEGNHRVERSTIESYLKLKVGETYNNSK
EDEVIKRLYATSLFRNINMHITNDGNLIVNVTETPFISSIVFSGNSKIKTNILAKEIYTM
SGESLSQAKIELDVKKILEIYKRSGRFATTVTPKIENLENNRVKVIFDIAEGPKTGINYI
YFSGNENYSDSELKSIVLTKESRWFRFLESNDTYDPDRMEYDKELLREFYQSVGFADFRV
ISALAELNNTKEYFTLTYSIEEGEKYSFGNITIDNKLTNIDITPLNKIVNIKQGKVFNMK
KVNDIAEKIGEYFTANGYPAVNVYPDIMKNANHTADIKFIIEKADKVYINTINIINNLKT
EDPVIRREFKIEEGDIINRSYIEKGERNIRNLDYFEKVAISLAPTKAKDKYDVNVEVDEK
STSSIGFDLGYNTAGGLFGRFSFLERNLVGTGKLLNAGVQVSKNTTSYYGGITAPHFLDR
DLSLGVNMFRNYTGRGASVLNTTDQSYKLHSIGVKTSLGYEIKEDLGHEIDYLIKRDILS
APTPSSSIFLKEQMGRFITSAIGHTITYDQTDNKIVPKNGYLVSGTQEFAGVGGDNKYIK
HEVDGKYYKSFIHNKLTLKLSASGGNIAGLGGKIIRISDRFNLGDYSLRGFASGGVGPRE
KVTNEGLGGERYYTFSTELNFPTPIPEEFNLISTVFMDLGSVWGVGLNKKQYQTPNGFYN
DKSLRASIGFGFIWVTRFAPIRMDWGFPVKKKKYDDTQHFHLRFSTHL
NT seq
2307 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgacaatcagatcaattagtaagttaacaattttattattaacgattttttattatcat
atttcattagctgactctgtaattcgtaaaataactatcgaaggtaatcatagggttgag
cgttctactattgagagctatttaaagcttaaggtaggagaaacctataataattctaaa
gaagatgaggtaataaaacgtttatatgccacctcactttttagaaatataaatatgcat
ataacaaatgatggtaatttaatagttaacgttactgaaacgccttttataagtagtata
gtatttagcggtaattctaaaatcaaaactaatattctcgctaaagaaatttacacaatg
tcgggtgaatctcttagccaagctaaaattgaattagatgtaaagaaaatattagaaatt
tataaacgtagcggacgttttgctactacggtaacacctaaaatcgaaaatttagaaaac
aacagagttaaggttatttttgatatagcagaaggaccaaaaaccggtattaactatatt
tattttagcggtaatgaaaattatagtgattcagaacttaaatctattgttttaactaaa
gaatctcgttggtttcgttttttagaaagtaacgatacttatgatcctgatagaatggag
tatgataaagaattactgagagagttttatcaatctgtaggttttgcagattttagagta
atttcggcattagcagaactcaataatactaaagaatatttcacccttacctattccatt
gaagagggagaaaaatatagcttcggtaatattacaatagacaataaattaactaatata
gatataacaccgcttaataaaattgttaatattaagcaaggcaaggttttcaatatgaaa
aaggttaatgatatagctgaaaaaattggagaatattttacagcgaacggttaccctgcg
gtaaatgtttatccggatataatgaaaaatgctaatcatactgcagatattaaatttatt
attgaaaaagccgataaggtttatattaatacaattaatattattaataaccttaaaacc
gaagaccctgttataagaagagaatttaaaatagaagaaggtgatataattaatcgttca
tatattgaaaaaggtgagcgtaatattagaaatttagattattttgagaaagtagcaatt
agcttagctccgactaaagctaaagataaatatgatgttaacgttgaagttgatgaaaaa
tctacttcctctataggttttgatttaggatataatactgccggcggtttattcggacgt
ttctctttcttagagcgtaatttagtcggtaccgggaaactgcttaatgccggtgtgcaa
gtaagtaaaaacactacaagctattacggtggtattaccgcaccgcactttttagatcgt
gatttatcacttggcgtaaacatgtttagaaactataccggacgcggtgctagtgtatta
aatacaactgatcaaagctataagttacactctataggagtcaaaacttctcttggttat
gaaattaaagaggatttaggtcacgaaatagattatttaatcaaacgtgatattttaagt
gctccaactccatcaagctcaatattcttaaaggagcaaatgggaagattcattacttct
gctataggacatactattacttatgatcaaaccgataataaaattgttccaaagaacggt
tatttagtaagcggcacacaagaatttgccggcgttggaggtgataacaaatatataaag
catgaagttgacggtaaatattataaatctttcatacataacaagcttactttaaaatta
tctgcttccggaggcaatattgcagggcttggaggaaaaattattagaatttccgatcgc
tttaatttaggtgattatagtttaagaggctttgcaagcggtggtgtaggacctcgtgaa
aaggtcactaacgaaggacttggtggtgagcgatattacacattttcaacagagcttaat
ttcccaacacctatacctgaggaatttaatttaatcagtacagtctttatggatttagga
agcgtttggggagtaggcctaaataagaaacaatatcaaactccaaacggtttttataac
gataaatctcttagagcttccattggtttcggctttatttgggtaacacgttttgcacca
atcagaatggattggggtttcccggttaagaagaagaaatatgacgatacgcagcatttc
catttaagattttcgacgcatttataa
DBGET
integrated database retrieval system