Rickettsia parkeri: MC1_04010
Help
Entry
MC1_04010 CDS
T01785
Name
(GenBank) preprotein translocase SecA subunit-like protein
Organism
rpp
Rickettsia parkeri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecA_DEAD
P-loop_SecA
SecA_PP_bind
Helicase_C
TPR_21
Spo0A_C
DUF2977
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFC74896
LinkDB
All DBs
Position
702483..709154
Genome browser
AA seq
2223 aa
AA seq
DB search
MKRNLARNINKDNKKVNEQIAEASVKVSDVGNKLLIGDALTLENINELGQRIAEQQEYDK
NQLIVCDITALNERLELHKDDDINEKPIFIICHSEHNVRATFCIVKQLDKTICLYQDFSN
IQIPENIKNILAQYFDKDIEFKIHAKIAEIKNQKDEDILSLTTLKTMMVYLKSDNKKDFI
EGFANPKKTFFGWFKNGITSLKKELFSLVEEGYYKIIASDIDQLSRETEFKKAIKELINN
IPLIEEVDHFKSYQLLLKEFVEMEENEIDTVKIKELEKKLEEAREKAFSKTKALKIGVSK
NKEGNQQLDIVKNFPTQMDKFIKIFEPLTNSTVDEKLDKVLEEISSKLDLEYDKLKGFFR
VTEEKKQDDNYNTSSVRNIEDVISVLPKAKSYDTNLINTNKPFEKLLSEIGEESDVLNIK
SSKEGYNKVKEFYELWENKEALEINQWAVSKKGQLADTEIYEALAIMDRANELVTGGHKL
RDTQILAILTFLQQKDKGQLSQIQTGEGKTTIVSILAAIKALQGGAVDVITSNPVLASDG
IKDKKLFYDLLNLNATTNNLDENYKSGERECYKSDIVYGSISNFQFDYLKDSFLGLGTRA
GRAFESIILDEVDSMIIDNASHIAKLSGPLAGMESLKYVYIKIWQALYKAEEKIVEEFQK
ELKRKAQELPDSEEAQLLYEQFENELQDSIIPKIKDYIKSSNPTKIDIIPSHIQEYADNS
LDRWINSAIDAKFNYHEDEQYIIRSKDGEEIIQPVDYANTGITLKNTIWQYGLHQFLQLK
HNLHLTSESLTSCFISNLSYINKYGQKIFGLTGTLGSTAEQELLSSIYNVGYAKIPTYKE
KKFIEINGEVVDDEIFSKKVADDTIAEIKSGRSSLIICETIKDAKTIQEILKSKNQDIII
RTFFDEENAHITKEEIKPGEVVIATNIAGRGTDFKTSVELENNGGLHVCVAFLPCNKRVE
DQAFGRTARQGNNGTAKLMIKKSEVEKLGINSYIFTDIKLVRDLREEDRIAQIKEIKILE
LKFQDRLFELFSDLYRKLKREGQSKGEYKYVLDDLKEFWAFWLEKQNFKGLELANKSPEE
EFRNFESEACKTISGEIKFNPYYSIQQAEHFISNAELDKAEQALNHAIVISKNPEILHSA
YIKLFEIAIEKGRVFIEKCQKAVGDVFVIPAIGKPDGGYKENAKKYLEQAKAALKKELDY
IENLFKTEEFTNILKSDDNNESRNLFIKHIVSKQQALNLNMQHVDSLVQQIDNHKGGISI
GGRVSDYFANLKPQNDHEEKIKDTIANSELSELAAVGTNTTYTLREVHDVCPEIAQGAQI
QIGGGIALLATGFCFPPALPITSAIGGTMITEGVCDVAIELINKNSDGKFHKEAYIKGKV
ISYGVSILTMGISAAMQCIKILNIAKKACRWISETLHKCPFLQIACKFLATKFDKLGNWF
EKMETIAKFSNMSKVEKLKYVQDLEKSKDLTQLKYLGENIKQIQDLMKELKEVGRLTELT
HFEKCISTLQQVAISTVKNVTTRTVENAIMGKVVTPALSSLMSGLKPTIKKHVDKSIREN
IDQEKLKSSSYEDMQNIIKEIRESIDYETVMGIFKDTVLGITKYCSNWQVQLGALAVDQY
ISWKEVYNYAKDLCKKINDKLKSTGKSINQNIDELINQLIEQLSEEMYSQVVSTTTKTCK
DVYLVGKSAYTNYKQEKQEEAKCLEVNKDFKEGGLAGQEQAKALSDVIKRPVHIYEESGN
IIVIGEQYLGAPIKVSYFPADEHNPTGHYVPYGKNENWSSSNGKNNCLFDAVGSQIGKDS
SELRTQTIQRIESDATSYIASNVLGVFGTELLLKGGTPCQYESDNTSSDAGEILDGSQYK
PSQSQVDVAKKKNIKLAKGHPRAHALSNSLNIISKEEDFDSEDQISCAENITKATQSTKT
AFISRKQQNSIANEVLKMPESRDAIERLNQGELEVVVSVPTSRLEKNKAPMMYTVSKGNV
KQQQQAKKITTILGHHAGKQDDPNVYPHIKTMYPTNKEPPSGLQGIDLMSSNIGWICSYF
GEYTIKAIEEILKLRINNVSLEDVNIVRGYILQENCNNLQRMISDLIQTKSKITLAPLNL
YNKHAVGVICIKDQGNNLQLYYLDSSNEHIPETLKQMFIDNSLQIIQLPTKQQSYANCGP
ELIENFILYLTGDRASEDKAIELHSKLVENELLEKGDLKSYLLFGQSTELLGEISSGTIP
EFA
NT seq
6672 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaatttagcacggaatattaataaagataataaaaaagttaatgaacagata
gcagaagctagtgtaaaggtaagtgatgttggtaacaaactcttaataggtgatgcgtta
actcttgaaaatattaatgaattaggacaacgtattgccgagcaacaagaatacgataaa
aatcaacttattgtttgtgatattaccgcattaaatgaacggttagagttacataaggat
gatgatattaatgaaaaaccaatttttattatttgtcatagcgagcacaacgttagagct
actttttgtattgttaaacaattggataaaactatttgtttatatcaggatttttcaaat
atacaaattccagaaaatatcaaaaatattttagcacagtattttgataaagatatagag
tttaagatacatgctaaaatagcagagataaaaaatcaaaaagatgaggatattttatct
ttaacaactctaaaaactatgatggtttatttaaagtcagataacaagaaggattttatt
gaaggttttgctaatcctaaaaaaacattttttggatggtttaagaatggaattacaagt
ttaaaaaaagagttattttccctagtggaagaaggttattataaaataattgctagtgat
attgatcaactatcaagagaaacagagttcaaaaaagcaattaaagaacttattaataat
attccattaatagaagaagttgatcacttcaaaagctatcaacttcttttgaaagaattc
gtagaaatggaagaaaatgaaatcgatactgttaaaatcaaagaactggagaaaaaacta
gaggaggcaagagaaaaggcttttagcaaaactaaggcactaaaaataggggtgtctaaa
aataaagaaggtaatcaacaattagacattgtcaaaaattttccaactcaaatggataaa
tttataaaaatttttgagccacttacaaactctacagtagatgaaaagttagataaggta
cttgaagagattagctcaaagttagatcttgaatatgacaagttaaaaggtttttttaga
gtcacagaagaaaaaaaacaagatgataattataatacttctagtgtcagaaatattgaa
gatgttattagtgttttaccaaaagctaaatcttacgatactaacctgataaatacaaac
aaaccgtttgagaagttattatcagagataggagaagaatcagatgttttaaatattaaa
tcttcaaaggaaggttataacaaagtcaaagagttttatgaattatgggaaaataaggaa
gcattggaaattaatcaatgggcagtttctaagaagggacaacttgccgacactgaaatt
tatgaagcattagctataatggatagggctaatgagcttgtgacgggaggacataaactg
cgcgatactcagattttagctatacttacatttttacaacaaaaagataagggacaatta
tctcaaattcaaacaggagaaggaaaaactactattgtatcaatacttgcagctattaaa
gctttgcaaggtggagctgtagatgttatcactagtaatcctgttttagcatctgatgga
attaaagataaaaagctcttttatgacttattgaatttgaatgcgacaacaaataattta
gatgaaaactataagagtggtgaaagagaatgttataaatctgacattgtatacggaagt
attagcaattttcagtttgattatctaaaagattcatttttaggtcttggaacacgtgca
ggtagggcatttgagagtattattcttgatgaagtagatagtatgattattgataatgca
agtcatattgctaaattatctggaccattagctggcatggaaagcttaaaatatgtttat
ataaagatatggcaagcactttataaagcagaagaaaagattgtagaagaatttcaaaaa
gaattaaaacgaaaagctcaagaattaccagatagtgaagaagctcaactattatacgaa
caatttgagaatgaattacaagactcaataattccaaaaatcaaagattatattaaatca
tctaatccaacaaaaattgatattattccttcacatattcaagaatatgctgacaactcg
ttagatagatggatcaatagtgctattgatgcaaaatttaattatcatgaagatgaacaa
tatattattcgtagtaaagacggagaggaaataatacaaccggtagattatgcaaataca
ggcattactttaaaaaataccatatggcaatatggtcttcaccaatttttacaactaaaa
cataatttacacttaacttccgaaagcttaactagttgcttcatttctaatcttagttac
attaataaatatgggcagaaaatatttggtctgacaggtactttaggttctacagcagaa
caagaattattatcttcaatttataatgtaggttacgcaaaaattccaacttataaagaa
aagaaatttatcgaaattaatggtgaggttgtagatgatgaaatctttagtaagaaagtt
gcagatgatactatagctgaaataaagagcgggcgatcttctttaattatttgcgaaaca
ataaaggatgcaaaaacaatacaggaaatattaaaaagcaaaaatcaagatatcattatt
aggactttttttgatgaggaaaatgcacatattactaaagaagaaataaagcccggtgaa
gtagttatagcaacaaatatagctgggagaggaacggattttaagacttctgtcgaactt
gaaaataatggtggactacacgtatgtgttgcttttttaccttgtaataaaagagtagaa
gatcaggcttttggtagaacagcacgtcaaggtaataatggtactgctaaattaatgatt
aagaaaagtgaagttgaaaaattaggtattaattcttatatctttacagacattaaactt
gtaagagatttaagagaagaggacagaattgcacaaattaaagaaattaaaatactggaa
cttaaatttcaagatagattatttgaacttttttctgatctgtatagaaaattaaaaaga
gaggggcaaagtaaaggagagtataaatatgttttggatgatttaaaagagttttgggct
ttttggttagagaaacagaattttaaaggattggaattagctaataaaagcccggaagaa
gaatttagaaatttcgaatctgaagcatgtaagacaattagtggagaaattaaatttaat
ccatattacagtatacaacaagctgaacactttatttcaaatgcagaattagataaagca
gaacaagccctaaaccatgcaattgtaataagtaaaaatccagaaatattacacagtgct
tatataaagctttttgaaattgcgattgaaaaaggcagagtgtttatagaaaaatgtcag
aaagcggtaggagatgtttttgttattccggcaattggtaaacctgatgggggatataaa
gaaaatgctaaaaaatatttagaacaagcaaaggcagcattgaagaaggagctagattac
attgaaaatctttttaaaactgaagaatttacaaacattctgaaaagtgatgataataat
gaatcacgaaacttatttataaagcacatagtgtcaaaacagcaagctttaaatcttaac
atgcagcatgtagatagcttggttcagcaaattgataatcataaaggaggtatttctata
ggcggtcgtgtttctgattattttgctaatttgaaaccacaaaatgatcatgaagagaaa
ataaaagataccattgctaactctgaattatctgagcttgcggctgttggtacaaataca
acttatactcttagagaagtgcatgatgtttgtccggaaatagctcaaggagcacaaatt
caaataggaggaggcattgcattacttgctactggattttgttttccgccggctctgcct
ataacatctgcaatcggcggaacaatgattacggaaggagtatgtgatgttgcaattgaa
ttaattaacaaaaatagtgacggtaaatttcataaagaagcttatattaagggtaaagtc
attagttatggtgtgtctattctgactatgggtattagtgccgctatgcaatgcattaag
attttaaatatagcaaaaaaagcatgtaggtggatatcggaaactttacataaatgtcct
tttttacagatagcatgcaaatttttagcaactaaatttgataaacttggtaattggttc
gagaaaatggaaactatagctaagtttagcaatatgagtaaagttgaaaagttaaaatat
gtgcaggatttagaaaaatccaaagatttaacacaattaaaatatttaggggaaaatata
aaacaaattcaagatttaatgaaagaattaaaagaagtgggtagattaacagaattaact
cattttgaaaaatgtatatcaactctgcagcaagtggcaattagtactgttaaaaacgta
acaactagaactgtggaaaatgcaataatgggtaaagttgttactccagcccttagttca
ttaatgtcaggattaaaaccaacaatcaaaaaacatgttgataaatctataagagaaaat
atagaccaagagaaattaaaatctagctcttatgaagatatgcaaaatataattaaagaa
ataagagagtctatagattatgaaactgtaatgggtatttttaaagacaccgtcttagga
ataactaagtattgtagtaattggcaagttcagctaggggctttagcagtagatcaatat
atttcctggaaagaggtttataattacgctaaagatctatgtaaaaaaataaatgataag
ttaaaatctactggtaagtctataaatcaaaatattgatgagctaataaatcagctcatt
gaacagctgtcagaagagatgtattctcaggttgtaagtactacaacaaaaacatgtaag
gatgtttatttggtaggaaaatcagcatacacaaattataaacaagaaaaacaagaagaa
gcaaaatgtcttgaagtaaataaagattttaaagaaggtgggttagcagggcaagaacaa
gctaaagctttaagtgatgtgatcaaaagacctgttcatatttatgaagaaagcggtaac
ataattgttataggagagcaatatttaggtgcccctataaaggttagttattttcctgca
gatgagcacaatcctactggtcattatgttccttatggcaagaatgaaaactggtcttca
agcaatggtaaaaataattgtcttttcgatgccgtaggatcacaaattgggaaagattca
agtgaattaagaacacaaactatacaacgaatagaatctgatgcaacaagttatatagct
tctaatgttcttggcgtatttggtacagagctgttattaaaaggtggtactccatgtcaa
tatgaatcagacaatacttctagtgatgcaggagaaattcttgatggatctcagtacaaa
ccaagccaatctcaagtagatgtagcaaaaaagaaaaacatcaagcttgcaaaaggacat
ccaagagcacatgctctaagcaattctcttaatataatatcaaaagaggaagatttcgat
tctgaagaccaaatctcatgtgctgaaaatattaccaaagcaacacaaagtacaaaaacc
gcttttatttcacggaaacaacaaaattctattgctaatgaagtcctgaaaatgccagaa
agcagagatgctatagagcgccttaatcaaggtgaactagaagtagtagtatcagtacca
actagtagacttgaaaaaaataaggctccaatgatgtatacagttagtaaaggtaatgtt
aaacaacaacaacaagcaaaaaaaattacaacaatattaggacaccatgcaggaaaacaa
gatgatccaaatgtgtatccccacattaagacaatgtatcctaccaataaagaacctccc
agcggtttgcaaggtatagatctaatgagttctaatattggttggatttgttcttatttt
ggtgagtataccattaaggctattgaagaaatattaaaattaagaatcaataacgttagt
ctagaagatgtaaacatagtaagaggttatatattgcaagaaaattgtaataatctacaa
agaatgatttctgatttaatccaaactaaatcaaaaattacactagctccactaaatttg
tacaataagcatgctgttggagttatatgtattaaagatcaaggaaataatttgcaattg
tattatctcgattcgtcaaatgaacacataccagagacgttaaagcaaatgtttatagac
aacagcttgcaaatcatacaactaccgactaaacaacaaagttatgctaactgtggtcct
gaattgatcgaaaattttatattatatttaactggtgatagggcttcagaagataaagct
atagagctgcactcaaaattagttgaaaatgaactacttgaaaaaggtgatttaaaatcg
tacttattatttggacaaagtactgagttattaggagagattagtagcggcactatccca
gaatttgcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system