Rickettsia rhipicephali: MCC_07580
Help
Entry
MCC_07580 CDS
T01786
Name
(GenBank) outer membrane protein OmpA
Organism
rre
Rickettsia rhipicephali
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFC72956
UniProt:
A0AA85YSF6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1275649..1281330)
Genome browser
AA seq
1893 aa
AA seq
DB search
MAMTNISPKLFQKAIQQGLKAALFTTSTAAIMLSSSGALGVAVGVISTNNNAAFSDLAVA
NNWNDITAKGVANGTPVDGPQNGMAFTYGGDHTITADEAGCIITAINVAGTTPVGLNITQ
NTVVGSIVTGGNLLPVTITAGKSLTLNGTNAVAANHGFDAPADNYTGLGNITLGGANAAL
IIQSVTPAKITLAGNIDGGGIITVNTDVAINGTIGNVNPAAQISVGASPLSLGGAVIKAT
TTDLTDAASVLTLTNANAVLTGVIDNTTGVDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISV
GAGTATLGGAVIKATTTDLTDAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGVDNVGVLNLNGALSQV
TGNIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKATTTDLTDAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGV
DNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKATTTDLTDAASVLTLTN
ANAVLTGAIDNTTGVDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKAT
TTDLTDAASVLTLTNANAVLTGVIDNTTGVDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISV
GAGTATLGGAVIKATTTDLTDAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGVDNVGVLNLNGALSQV
TGNIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKATTTKLTDAASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNAN
NGIATFTGNSTVTGNIGNTAALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNVSAVTFTNPVV
VTGAIDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTAALATVNVGAGITLQAGGSLAANNIDFGV
GSTLEFNGPLDGGGNTIPYYFKGAIANGNNAILNVNTKSLTAYHSTIGTVAEINIGAGNL
FAIDASAGDVTILNAQDINFGAPDSALALSNLTGVGVKNILLAADLVAPGANGGDVVFNG
GVNGLNIGSNVVGTARNIGDGGGDKFNTLLIYNAVTITDDVNLEGIQNVHINNNAAFTSS
TAFNAGAIQINDATYTIDANNGNLNVPAGNIQFAHANAQLILQNTSGNDRTITLGANIDP
DNDDEGIVTLNSVTAGKKLTIAGGKTLGGAHKLHTIVFKGAGDFGAAGTTFNTTNIVLDT
TGRLELGATTANVVLLNDAIQLTQTGGNIDGFLDFNAKNGTVTLNNNVNVAGAVQNTGGT
NNGTLIVLGASNLNSVNGIAMLKVGAGNVTIAKGGDVKIGEVQGTGTNTLTLPANFNLTG
SINKTGGQALKLNFTNGGSVSGVVGTAANLVGDITTAGATSFASSVNAKGTATLGGTTSF
ADTFTNTGAVTLAKGSITNFAKNVTATSFVANSATINFGNSLAFNSNITGSGTTLTLGAN
QVTYTAGTGSFTDTLTLNTTFDGAAKSGGNILIKSGSTLDLSGVSTLALVVTATNFDINN
ISPDTKYTVISAETVGGLKPTPEENVKITINNDNRFVDFTFDASTLTLFAEDIAADVIDE
AFEPGGPLANIPNAANIKKSLELMEDAPNGSDARQAFNNFGLMTPLQEADATTHLMQDVV
KPSDTIAAVNNQVVASNISSNITALNARMDKVQAVNKGPVSSGDEDMDAKFGAWISPFVG
NATQKMCNNISGYKSDTTGGTIGFDGLVSDDLALGLAYTRADTDIKLKNNKTGDKNKVES
NIYSLYGLYNVPYENLFVEAIASYSDNKINSKSRRVIATALETVGYQTANGKYKSESYTG
QLMAGYTYMMPENINLTPLAGLRYSTIKDKGYKETGTTYQNLTVKGKNYNTFDGLLGAKV
SSNINVNEIVLTPELYAMVDYAFKSKVPAIDARLQGMTAPLPTNSFKQSKTSFDVGVGVT
AKHKMMEYGINYDTNIGSKYFAQQGSVKVRVNF
NT seq
5682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctatgacgaatatttctccaaaattatttcaaaaagcaatacaacaaggtcttaaa
gccgctttattcaccacctcaaccgcagcgataatgctgagtagtagcggggcactcggt
gttgctgtaggtgttatttctactaataataatgcagcatttagtgatcttgctgttgcc
aataattggaatgatataacggctaaaggggtagctaatggtactcctgttgacggtcct
caaaatggtatggcatttacttacggtggtgatcatactatcactgcagatgaagccggt
tgtattattacggctataaatgttgcgggtactactcccgtaggtctaaatattactcaa
aataccgtcgttggttcgattgtgacgggaggtaacttgttgcctgttactattactgct
ggcaaaagcttaactttaaacggtactaatgctgttgctgcaaatcatggttttgatgct
cctgccgataattatacaggtttaggaaatataactttagggggagcgaatgctgcacta
attatacaatctgtaaccccggcaaagataacacttgcaggcaatatagatggaggaggt
ataataactgtcaatacagatgttgccattaacggaacaataggtaatgttaacccagca
gctcaaataagcgttggggcaagccccctttctcttgggggagcggttattaaagctact
acgactgatttaacagatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtatta
acaggtgtgattgataacactacaggcgttgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggt
gcattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataagtgta
ggagcaggtacagccacgttagggggagcggttattaaagctactacgactgatttaaca
gatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaacaggtgcgattgat
aacactacaggcgttgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgcattgagtcaagta
accgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataagtgtaggagcaggtacagcc
acgttagggggagcggttattaaagctactacgactgatttaacagatgctgcgtcggta
ttaacccttacaaatgcaaatgcagtattaacaggtgcgattgataacactacaggcgtt
gataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgcattgagtcaagtaaccgggaatataggt
aatacaaattcattagccacgataagtgtaggagcaggtacagccacgttagggggagcg
gttattaaagctactacgactgatttaacagatgctgcgtcggtattaacccttacaaat
gcaaatgcagtattaacaggtgcgattgataacactacaggcgttgataatgtaggtgtc
ttaaatttaaatggtgcattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatacaaattcatta
gccacgataagtgtaggagcaggtacagccacgttagggggagcggttattaaagctact
acgactgatttaacagatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtatta
acaggtgtgattgataacactacaggtgttgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggt
gcattgagtcaagtaaccgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataagtgta
ggagcaggtacagccacgttagggggagcggttattaaagctactacgactgatttaaca
gatgctgcgtcggtattaacccttacaaatgcaaatgcagtattaacaggtgcgattgat
aacactacaggcgttgataatgtaggtgtcttaaatttaaatggtgcattgagtcaagta
accgggaatataggtaatacaaattcattagccacgataagtgtaggagcaggtacagcc
acgttagggggagcggttattaaagctactacgactaaattaacagatgctgcgtcagca
gtgacatttacgaatcctgtagtggtgaccggagcgatagataataccggtaatgcaaat
aatggtatagcaacgtttaccggtaatagtacagtaactggcaatataggtaatacagca
gcattagcaacagtgaatgtaggagcaggtttgttacaagtacaaggcggagtggtaaaa
gcgaatgcaataaacttaacggataatgtgtcagcagtgacatttacgaatcctgtagtg
gtgaccggagcgatagataataccggtaatgcaaataatggtatagcaacgtttaccggt
aatagtacagtaactggcaatataggtaatacagcagcattagcaacagtgaatgtagga
gcaggaataacattacaagctggaggaagcctagctgcgaataatatagattttggagtc
ggaagtactttagagtttaacggacctcttgatggtggtggtaacacaatcccttattat
tttaaaggagctatagcaaacggcaataacgctatattaaatgttaatacaaagtcactt
acggcatatcattccactataggaacagttgcagaaatcaatattggagccggtaacctt
tttgcaattgatgcaagtgctggtgatgttactatattaaatgctcaagatattaatttt
ggagctccagattctgctttagcactttctaacttaaccggagtcggagtaaaaaatata
ttattagcagctgatttagtagctcccggtgctaatggaggtgatgtagtctttaatggt
ggggttaatggcctgaatatcgggagtaatgtagtaggtaccgctagaaatatcggtgat
ggaggcggtgataaatttaacactttacttatttataatgccgttacaataaccgacgat
gtaaatttagaaggtatacagaacgtgcatattaacaataatgcagcttttactagtagt
acagcatttaatgctggtgctatacaaataaacgatgctacttatacgattgatgcaaat
aatggtaatttaaatgtaccagcaggaaatattcaatttgcacatgcgaatgctcaatta
atattacaaaatacttcaggaaacgaccgtacgatcacactaggtgcgaatatagaccct
gataatgacgatgagggtatagtaacattaaattctgtaactgcaggaaaaaaattaacg
atagccggaggcaagacgcttggtggagctcataagttacacactatagttttcaaagga
gcgggagatttcggcgcggcaggtaccacttttaatacaacaaatatagtgcttgatact
acaggtcgattagaacttggagctactacggcaaacgtagttttacttaatgatgctatt
caattaactcaaaccggtggtaatattgacggtttcttagactttaatgcaaaaaacggt
acggtaacattaaataacaatgtaaatgttgcgggagcagtccaaaataccggcggtact
aataacggtacgttaatagttttaggtgcaagtaatcttaatagcgtaaacgggattgct
atgttaaaagtaggtgcaggaaatgtaactattgccaaaggcggtgacgttaaaatcggc
gaagtccaaggtacaggcacaaatactttaacattacctgcaaactttaacttaacaggc
agcataaataaaaccggtggtcaggctctgaagctaaacttcacgaacggcggtagtgtt
agcggtgttgtagggactgcggctaatttggttggtgatatcacaacggcaggtgctaca
agttttgcaagcagtgttaacgcaaaaggtacggcgacacttggcggtactacaagtttt
gccgatacattcactaatacaggtgcggttactttagccaaaggttctatcactaatttt
gctaaaaatgtaacggctaccagctttgtagctaacagtgctactattaatttcggcaat
agcctagcctttaatagtaatataacaggtagcggtactacacttactttaggtgcaaat
caagtaacatatactgctggcaccggtagttttaccgatacgctaaccttaaatactact
tttgacggagcagctaagtcaggtggtaatatcttaattaaatcaggtagtactcttgat
ttatcaggggtttcaactttagcacttgttgttactgctactaatttcgacattaataat
ataagtccagatacaaaatatacggtaatatctgcagaaacagtaggtggtttaaagcct
actcctgaagagaatgttaaaataactattaataatgacaaccgttttgttgactttact
tttgatgcatcgactttaacgttatttgcagaggatatagctgcagatgttatagatgaa
gcttttgaaccgggtggaccgcttgcaaatatcccaaatgctgcaaatataaagaaatcg
cttgagttaatggaggatgctcccaatggttcagatgcacgtcaagctttcaataacttt
ggtctaatgacaccactacaggaagcagatgctacaactcacctcatgcaagatgttgta
aaacctagcgatactatagctgccgttaataatcaagttgtagcgagtaatatatcaagt
aatataactgctctaaatgctagaatggataaagtacaagcagtgaataaaggtcctgtt
tcttccggtgatgaagatatggatgctaagtttggtgcgtggataagcccgtttgtcggt
aatgcaacgcagaagatgtgtaacaatataagtggttataagtctgatacaactggtggc
actataggttttgacggcttagttagcgatgatctagcactcggacttgcatatacaaga
gccgatactgacattaagctaaaaaataataaaacgggcgataagaataaggtagagagc
aacatctattctttatacggtttatataatgtaccttatgagaatctcttcgttgaagct
atagcatcttactcagataataagataaacagcaaatcaagacgtgttattgcaacggca
ctagagactgtcggttatcaaactgcaaacggtaagtataaatctgaaagctatacaggt
cagttaatggctggttatacctatatgatgcctgagaacattaacttaacaccgctagct
gggcttagatattcgactatcaaagataagggctataaggaaaccggtactacttaccaa
aatcttaccgttaaaggcaagaactataatactttcgacggtttactcggtgctaaagta
tcaagtaatatcaatgtcaatgaaatagtgctaacacctgagctttacgcaatggtcgat
tatgcattcaagagtaaagttccggcgattgatgcaagattacaaggtatgactgctcct
ctcccaaccaacagctttaagcaaagcaaaacaagttttgatgtcggtgtcggtgttact
gctaagcataaaatgatggaatacgggattaactacgataccaatatcggaagtaagtat
ttcgctcagcaaggtagtgtaaaagttcgtgttaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
