Rickettsia typhi Wilmington: RT0438
Help
Entry
RT0438 CDS
T00193
Symbol
sca3
Name
(GenBank) cell surface antigen Sca3
Organism
rty
Rickettsia typhi Wilmington
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAU03915
UniProt:
Q68WS7
LinkDB
All DBs
Position
556234..563229
Genome browser
AA seq
2331 aa
AA seq
DB search
MKKSKILRKFLATASLCGTLFTNSNATGAIIPNSGSVSLNTGAGLVGGVFQNGDIIQIVN
GGREIKISADKANAVIGGISALRELPDFGGVEVSQNVSIGPLSAGENLNTNFGPLKFISN
NVTSIITGVDTQTFSNIDFAGKNATLQINKDLNITTKIDNTVAGNNGTITFEGSGVISNH
IGFTNSLLGINVGNGEAKIDASRANNITINAKNINLTHNNSIFTLCDCNITTLKGNINNT
TGIDGQGILNLAYDPDSSNIITGDICNIGSLDTINVLRGSATLNSTIVKATNINLQHDTA
TLNLGDNIIVIGNIKGINNEEERLNLKVNDQIDNEMIIPINKGMSGKLNLQGNATLNGNI
DNLRILKFSGGHDKILNLQGNTEVEHIIFEDSILNSGTITVNGLLNTHVVTFNKSNANGG
TLIINAKNTISASLLNAIKAKIQINANLTINHPSAGHIGDIRIADNTTYTINADIGHVNL
LQNGAKIMFEGADAMLALINTSFTDRTFTIYNNLNQSGNDEYGIVKIEAITKGITISNHS
EPYTIGQDNTHRLKELIVEGGGNIIVDNTVFTKLLSINSTGQITFNRTLDLGAGGNIAFG
KNGTLVVHGVAGSITTSENNQGILTINSGNVTGTIGANGLGLKLVNIGAGSVTCSANVFA
PVALTNPSSILILADGVTLTGTVTTHNNTKGILSLGIGSNVTGLIGENNATLEKINIGAG
ASNIDNNIYAGSMVLTDKTSELILNTNVVVNGNITTIAGNNSGKLVFTGNGDITGNIGAN
GAALQEVVFNGTTNIGGTANSQNFTVAHSEANVVITGLTTGSLKYKDTGTIIANGGLVGD
IDFNNKAGKFILGDGTTIDGSVLCTGGIAGTLHFIGDGNVTQNIGSDTENSISTINIQGD
NTKNVTITNDIFVNNIYFTNGGVLQLGGNLTTHNIDFGANGGTLEFNGNNTYNLNAIIVN
GQNGILNAFTNLKATDDTIGTVKIINIGQIGTPQNFTIQVNNKNLTLVSNINSSINFCDS
NSQLILSAPVDQTIKFINNLNGTGGGIITLDGNGNNLTISGNNGIKLGSRDNELSSLNIK
GKVTVTHNLDVQNIHQLNINNGAFFNDHSLTSAKIKNINIGEETGEATYTLDAINCDFDL
NTSGMVFKHQDSVLELKNSSNTNDRIITLTSVLDPGNGQSGIIKLITDTNKLTIDNNGNV
AYTLGTANHMLKQLTFTSINNGAIALKVGINVENITLNIKDIELNEVNANVLFNKNVTYT
ATGNINGHVDFQGNAGVINLDDGIKIDGSVTSTNDVNGTLNLNGSGEVTGLITNIAMLQA
GAGDVSLSASGNYSITEIQGNGNNNLTFAANSHLTTDINKTDGQAVNLVFINGGSVSGSV
GLSKAVGDIIIHAGNVTFNNTVKSSNVVISDGSTMQVNNNITANDISGKNINNGTLKLNN
HTPIIITSTLGHNNSIGTIEVANNDVTITGALKAQNIHFSNAAQETTLTLGAASQVTNIT
TAGNNIHTLEITDLDTGNDGTIGTENNRLKSIELTGNGTITINSKHVYSSITTANNEQGN
VKLNIEGGIAYDLGSEIRSLANVQISEDSTVKGDVYSKYLNIDAGKTINFDRGDNNMNPK
NLDIPDAIIDLDVLPRSLSLFNYFTDIKADNLNFVDGTATANFKDAVVIDARIDNGGTLK
FNNNVWLTQEIKNANSIEIASNKFMLLQKNIKAATLIADKANLVLLDNVEINTNLNVRDI
VLDLANYELKYTGNVTHNGLLTIITYFDTALQKGGHILVGQGSNVDMSDLDNLIIKIKSR
SDITNITSDTKHQVVKLEAGAIYNPVPQTKVIIDASGEQNKFVKWVTDANGFVLLTNTDT
IGQNNTDNGSLDNGYVGNSSNNNSSNGVVGPSKDKDHGITDIAPIFDPSPILDYTKNNYV
ASSIANQLINHVKGFGNTTDAGKLLNDLGFMLPNRVTETLDRLSHRTNINGLNEGVAGLN
GIEIENFLTDIAINMDNFTAEGIGNRLEELIDAGTVNGLNRTNASLNNNNLNLRRLAANN
QTVIAAGDEDNTVTGIWGMSFYSKIKQNSKNSASGYQSNTGGGIIGFDYNIDNSIVIGAA
YTMADSKVKHKNDKSGDKTKAKSNIYSIYGLYHWLNNNFFVEAIGVYGRNKIKNYEKRIT
AITDQTAIGKFINTFYSYELLGGYNYLVSNRTTITPMFGIRYTTLKNNSYKENNTTFQNL
SIKKNYHDKFETILGLNGATHYLAQDIIIKPELHWFINYQYKNKLPNIDARLDGIDEPLT
TIRFKSAKITYNLGGGISTKNNMIEFGIRYNLSLAKKYTAHQGSLKIKVKL
NT seq
6996 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatcaaaaattttaagaaaatttttagcaacggcatcactatgcggaacatta
tttactaactctaatgcaacaggagcaataattcctaatagtggtagtgtaagcttgaat
actggcgcaggtcttgttggaggagtattccaaaatggtgatattattcaaatagttaat
ggagggcgtgaaattaaaatatctgcagataaagcaaatgctgtgattggaggaatcagt
gcattaagagagctacctgattttggtggtgttgaagtaagtcaaaatgtttcaataggc
cctcttagtgcaggagaaaatcttaatactaattttggtcctctgaaatttattagtaat
aatgttacgtcaattattacaggagtcgatactcaaacatttagtaatatcgattttgca
ggtaaaaatgctactttacaaattaataaagatttaaatattacaactaaaatagataat
acagtagccggaaataatggtacaataacatttgaaggtagcggcgttatatcaaatcac
ataggcttcactaactctcttttaggaataaatgtaggaaacggagaagccaagattgat
gcatcaagagcaaataatattacaattaatgctaaaaatataaatcttactcacaataac
tctatattcactctttgtgactgtaatataactacattaaaaggtaatatcaataatact
acaggcattgacggtcaaggtatattgaatctagcgtatgatcctgatagtagtaacata
ataacaggtgatatatgtaatataggctcattagacacaataaatgttttgcgtgggtct
gcaacattgaattctacaatagtaaaagcgactaatattaatttacaacatgatactgca
acgctcaatttaggtgacaacataattgttattggtaatataaaaggtattaataacgaa
gaagagagattaaatttaaaagtgaatgatcaaatagataacgaaatgattattcctatt
aataaaggtatgagcggtaaattaaatttgcaagggaatgctacacttaatggaaatata
gataatttaaggatacttaagtttagtggaggtcacgataaaattttgaatttacaaggg
aatactgaagtagagcatattatttttgaagatagtattttaaattcaggtactataact
gttaatggtttattaaatacacacgttgtgacttttaataaaagtaatgctaacggaggc
acattaataataaatgccaaaaacacaatcagtgcatcattattaaatgctataaaagca
aaaatacaaatcaatgctaatttgacaattaatcatccaagtgctggacatataggtgat
attagaatagcggataacacaacatacacaataaatgcagacatagggcatgtaaatttg
ctacagaacggtgcaaagataatgtttgaaggagctgatgctatgttagctttaatcaat
actagttttacagatagaacctttacaatatataataatctaaatcaatctggcaatgat
gaatatggaatagtaaagatagaagcaattacaaaaggaatcactatatcaaatcacagt
gaaccttatactatagggcaggataatacacatcgtcttaaggaattgatagtcgaagga
ggtggtaatatcatagtggataatacggtatttacgaagttacttagtataaacagtaca
ggacaaataacatttaatcgtactttagatttaggtgcaggcggtaatattgcatttgga
aagaatggcacgttagtagtacacggtgtagcaggttcaatcacgacttctgaaaataat
caaggaatattaacaatcaatagtgggaatgttactggtacaattggtgctaatggactc
ggcttaaaacttgtaaatattggcgcaggttctgttacgtgttcagcaaatgtatttgca
ccggtagctttaactaatccaagttctatattaattttagcggatggtgttacgctaaca
ggtacagtaaccacacataataatacaaaaggtatattatcgcttggaataggaagtaat
gtaacaggtctaatcggtgagaataacgcaactcttgagaaaataaatattggggccggc
gctagtaatattgataataatatatatgcaggttctatggtactaacagataaaacatcg
gaattaattttaaacactaatgtagtcgttaacggtaacatcacgactattgctggaaac
aatagtggaaagttagtatttacaggtaatggtgacataacaggaaacataggcgcaaat
ggtgcagctttgcaagaagtggtatttaacggtactaccaatataggcggtacagcgaat
tcacaaaactttactgttgcgcattctgaagcaaatgtagtgattacaggacttactact
ggttcattaaaatacaaagatactggtacaattatagctaatggaggattggtaggagat
attgattttaataataaagctggtaaattcattttgggtgatggtactacgattgatggc
tcagtgttatgtactggagggattgctgggacattgcattttataggtgacggtaatgta
actcaaaatataggttcagatactgaaaatagtatttcaactatcaacattcaaggagat
aatacaaaaaatgtaactataacaaatgatatatttgtaaataatatttattttacaaac
ggtggggtattacaacttggtgggaatctcacaactcataatatagattttggagcaaat
ggtggtactttagaatttaatggtaataatacatataacttaaatgctattattgtaaac
ggacaaaatggtatattaaatgccttcacaaacttaaaagctactgatgatactattggt
acggttaaaataattaatataggacaaataggaacgccacaaaactttactattcaagtt
aataataaaaatttaacgctagtaagtaacataaatagtagcattaatttttgtgattct
aattcacaattaatattatctgcaccggtagatcaaacgattaaatttattaataattta
aacggaactggaggtggtattatcactttagacggtaatggtaataatttaactataagt
ggtaataatggaataaagcttggtagtagagataatgagttatctagcttaaatatcaaa
gggaaagttactgtaactcataatttagatgtacaaaatattcatcaattaaatataaac
aatggtgcattctttaatgaccacagtctaacatctgctaaaatcaaaaatataaatatc
ggtgaagaaacaggtgaagctacttatactttagatgctataaattgtgacttcgattta
aatacaagtggtatggtatttaaacatcaagattcagtattagaattgaaaaatagttca
aatactaacgaccgcattataacactaacatctgttttagatccaggtaatggtcaatcc
ggtataattaaactaataacagatactaacaaattaactatagataataatggtaatgtg
gcttatacactcgggacagcaaatcatatgttgaaacaattaacttttactagtatcaat
aatggggctatagctttaaaagtagggatcaatgttgaaaatattaccttaaatattaag
gatatagagttgaacgaggtaaatgcaaatgttctgtttaacaaaaatgtaacatatacc
gcaacaggtaatataaatggtcatgtagattttcaaggtaatgcaggtgtaataaatctt
gatgacggtataaaaattgacggtagtgttacaagtaccaatgatgtaaacggtacatta
aatttgaatggatcaggtgaagtaactggtttaatcactaatatagcaatgctgcaagca
ggagcgggtgatgtatcgctatctgctagcggtaattattctattactgaaattcaaggt
aacggtaataataatttgacatttgctgctaattcacacttaacaactgatattaacaaa
acagatggtcaagctgtaaatttagtcttcattaatggtggtagcgttagcggttctgtc
ggcttaagtaaagcagtgggtgatattatcatacacgcaggaaatgtaactttcaataat
actgttaaaagcagtaatgttgttatatcggatggttctacgatgcaagttaataataat
ataactgctaatgatatctcaggcaaaaatataaataacggtactttaaaactaaataat
catacacctattattattacaagtacacttggtcataataattctatagggacaatagaa
gttgcaaataatgatgttacaattacaggagcactaaaagcacaaaatattcatttttca
aatgctgctcaggaaaccaccttaactttaggtgcagcatcacaagttactaatattacc
acggcaggaaataatattcatactttagaaataacagatttggataccggtaacgacggc
acaataggaactgaaaataatagattaaaatcaatagaattaacaggaaatggtacaata
actattaattctaaacatgtttattcatctattactactgcaaataacgagcaaggtaat
gtcaaactcaatatagaaggcggtattgcttatgatttaggaagtgaaataagaagttta
gcaaacgtacaaattagtgaggatagtactgttaaaggtgacgtatattctaaatatctt
aatatagacgcaggtaaaactataaattttgatagaggtgataataacatgaatccaaaa
aatttagatataccagatgctataatagatttagatgtattacctcgctcactctcacta
tttaattacttcactgatattaaagcagataatttaaattttgtagatggtactgctaca
gcaaattttaaagatgctgttgtaatagatgcgcgtattgataatggtggtactttaaaa
tttaataacaatgtgtggttaacacaagaaattaaaaatgctaacagcatagaaattgca
tctaataaatttatgttgcttcagaaaaacattaaagcagctactttaatagctgataag
gcaaacttagtattattagataatgtagaaataaatactaatctaaatgttagagatatt
gtattagatttagctaattatgaattaaaatataccggcaatgttacgcataacggacta
ctgactattatcacttattttgatactgcattacaaaaaggtgggcatatattagttggt
caaggatctaatgtcgatatgtctgatttagataatttaataattaaaattaaatcacgc
tccgatatcactaacattacctcagatactaaacaccaagtagtaaaactggaagcaggt
gcaatatataatccagtaccgcaaactaaagtcattattgatgcaagcggggaacaaaat
aaatttgtaaaatgggtcactgatgcaaacggttttgtattactgactaatactgatact
atagggcaaaacaatactgataatggtagtctggataatggttatgtaggaaatagcagt
aataataatagtagtaatggagtagtgggaccaagtaaagataaagatcatggcataact
gatatagcaccaatttttgatccatctccgatcttagattatactaaaaacaattatgta
gcttctagtatagcaaaccaacttattaatcatgttaaaggttttggtaatactactgat
gcaggtaaattattaaatgatttaggttttatgctaccgaatagagttactgaaacatta
gatagacttagtcatagaacaaatattaatggacttaatgaaggagtagcagggttaaat
ggtatcgagattgagaattttttaacagatatagcaataaatatggataattttactgct
gaagggattggtaatagattagaagaattaatcgacgcaggtactgtaaatggtctaaat
agaacaaatgcatcgcttaacaataataatcttaatctaagaagacttgctgctaataat
cagacagtaattgctgcaggtgatgaagataatacagtaacaggcatttggggcatgtca
ttttatagtaaaataaaacaaaactctaaaaatagtgcaagcggttatcaatctaataca
ggtggcggtataataggttttgactataatattgataattctatagttataggtgctgct
tatactatggctgatagtaaagttaagcacaaaaatgataaaagtggtgataaaaccaaa
gctaaaagtaatatatattccatctatgggctttatcattggcttaataataactttttt
gttgaagctataggtgtgtatggtagaaataaaatcaaaaattatgaaaagcgtataact
gctattactgatcaaaccgcaattggtaaatttattaatactttttatagctatgaatta
ctaggtggatataactatctagtatctaatcgtactactataacgccaatgtttggtatt
cgttatactacattgaaaaataatagttacaaagaaaataatactactttccaaaattta
tctataaagaaaaattatcatgataaatttgaaactatattaggtttaaatggggcaact
cattatttagcacaagatataataataaaacccgaattacattggtttataaattatcaa
tataaaaataagttaccaaatattgatgcgcgtcttgatggcatagatgaaccgctgaca
acaattagatttaaatctgcaaagatcacatataatttaggtggtggtatttctactaaa
aataatatgatagaatttggtattagatataacttatctcttgcgaaaaaatatacagca
catcaaggatctttaaagattaaagtgaaactataa
DBGET
integrated database retrieval system