Snodgrassella alvi: SALWKB2_0060
Help
Entry
SALWKB2_0060 CDS
T03063
Name
(GenBank) Putative adhesion and penetration protein
Organism
salv
Snodgrassella alvi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN27442
UniProt:
X2H8M9
LinkDB
All DBs
Position
81353..83149
Genome browser
AA seq
598 aa
AA seq
DB search
MNQHKGELEIRDTDGSNDIRIVVKDPEGFNAIQAIAGKVIIDGKSEIIGDIVSSENDELR
DKGVVKLTLADGSMLLSSLDNDGGAGEINLGLFGSHSQWKMTGSSNINSLELSDDAKVSF
GYDYATPDAVTSLNGNNAMVLETDSLKGNNGVFKMRAAIGKNIDNDLLKITGLQQAKGNH
KIAVIDAKTGSATVTGKEKIKLVETNGGDAKFSLSSSAVDIGGYEFNTLDEFDNSNPDGK
DWILSASSNSDGNQGGETSGGSDSNNDNGSAGDSGSGMKPKPKPDSKPNLTNTAKNAANI
LNSNYLMSYVETQTLLQRMGQIRTDDTASGKVWGRIYTGKLNSFNDNRLSGFDMDYYGLQ
MGLDRKLNYDKVNLYYGLMGGLSRGEVDHNVGDGSTKSYSLGLYGTLQSQNGFYLDGLVK
YMHMTNKFNTLTGGGYRVNGDGHTNGFSLGAEMGKRIRLTSAEEAEQGWYLEPQAQLTFS
HQNGATINATNGLRTRLGSYNSLIGRASLILGYTIQNNKNPVDIYFKTGYLREFDGKTSY
TFNRIAKEKYDFGGNWWDNGIGINVRLNGKHHIYGDMVYSAGNKFNQKQINAGYRYNF
NT seq
1797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccagcacaagggtgaattagagattagggatactgatggttcaaatgatatccgt
attgttgttaaggatcctgaaggctttaatgcgatacaagcaatagctggcaaagtgatt
attgatggtaaatcggaaattattggagatattgtttcaagtgaaaatgatgagcttcgg
gataaaggagtagttaaattaactctggctgacggatcaatgttattaagctctttggac
aatgatggtggtgcaggtgagattaatcttggccttttcggtagtcacagccagtggaaa
atgaccggcagctcaaatattaactctctggaactcagtgatgatgccaaagtcagtttt
ggttatgattatgctactcccgatgctgttaccagccttaacgggaacaacgcaatggta
ttagaaactgattcgttaaagggtaataatggcgtatttaaaatgcgagcagcgattggt
aaaaatatagataatgatttgctgaaaataaccggattacaacaggcaaagggtaatcat
aaaattgctgttattgatgctaaaactggctccgctacagtaactggcaaagaaaaaatt
aaactggttgaaaccaatggtggcgatgctaaatttagtttatcgtcctcagcagtagat
attggtggctatgagtttaatactttagacgaatttgacaattctaatcctgacggtaaa
gattggatattgtctgcatcttcaaattctgatggcaatcaaggtggggagacatcaggc
ggctcagatagcaataatgacaacgggtcagcaggagattcaggttcaggtatgaaacca
aaaccaaaaccagattccaaaccgaatttaactaatacagcgaaaaatgcggccaatatt
cttaattcaaattatttaatgagttatgttgaaacacaaactttattgcagcgtatggga
caaatccgtaccgatgatacagcgagcggtaaagtatgggggcgtatatatacagggaaa
ctgaactcatttaatgataatcggttgtctggttttgatatggattattatggattacag
atggggctggaccgtaaactgaattacgataaagtgaacctatattatggtttaatgggc
ggattaagccgtggtgaagttgatcacaacgttggtgacggcagtactaaaagttattct
ctaggattatatggtacgttacaaagccagaatggtttttatcttgatggtttagtcaag
tatatgcatatgaccaacaagtttaatactttgacaggtggtggttaccgagtgaatggt
gacggtcataccaatggtttttctctgggcgctgaaatgggcaaacgtatccgtctgact
tctgcagaagaggcagaacagggttggtatttagaaccacaggctcagcttactttttcg
catcagaatggtgccactattaatgcaaccaatgggttaagaaccagactgggtagttat
aattcattaatagggcgggcgagtcttattttaggctataccattcaaaacaataaaaat
ccggtagatatttattttaaaacaggttatctgagggagtttgatggaaaaacttcttat
acctttaatcgtattgcaaaagaaaaatatgattttggtggtaactggtgggataacggt
ataggaattaatgtgcggctgaatgggaaacatcatatttatggtgatatggtttattct
gcaggaaacaaatttaatcagaagcagattaatgcgggatatcgttacaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system