Shewanella baltica OS117: Sbal117_0168
Help
Entry
Sbal117_0168 CDS
T02013
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)
Organism
sbs
Shewanella baltica OS117
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
CHASE
PAS
PAS_4
PAS_8
MASE1
PAS_3
DUF4131
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH11971
UniProt:
A0A7U3Z781
LinkDB
All DBs
Position
191092..194739
Genome browser
AA seq
1215 aa
AA seq
DB search
MCQLEGLHIKSFIPYFKVNIFIALAYIVVGKLGLMIALPPGYSAAIWPAAGIAIAACILW
KEYVPWVGVFIGSLLININIGGHIHFGWLPFAISIGSCIQAVLSAHVLGRVDHLFTLDNP
NTVIKSCLSLALTCIVATVFGNSALVINGTIPPSDLLGSLVNWWTGDLLGAVIFIPLTML
LFDKRTIWRARRIQTGIPLLVGFLFCVGIYYYSDMNQRQQLQDKFQIQSNAVISNIESFQ
EANLQQIVALASLFDNSEQVSEDEFVQFGKRNMLQQDGFRAWSWSPLVAAADLPSFEAST
RSAIGGPYKVTRPQGWQNNTDGWLVPVMYIQPIRGNEAALGLDLNSEPTRAAAIAKVRAT
LAPVMTAKIQLAQDPNGPGGTLLIAPAFDRLGRISGFCSAVIDLQSIINDVESVKGLQWK
LSDMSAGGALLYSNTQKSFPAFSSKLFSDKTGQYFQANLMLADRHWHIVIYQSYAVLMGD
TFSLSLLMLLLAFITCAVVGGMTLVSSGERQRIAEKVTEKTMALSKEIARRQAFQATLVQ
SEQRYRNLFDKAPVGHVLKRLDDGQFVAINPAFEAMTGYSLDELNQLDPWDLTPKRYQLS
ETEQLERLKQTRRYGPYQKHYVHKNGQLVAVRLNGALVTGADGEQLILFIVEDITEQERT
VARVNLLAQVFQQSGEGITIMDANDIIVDVNSAFSQITGYSREEIIGKNCRFLEAERTDK
GIDPQVRAALEQTGFWQGEVWDRHKHGYDFPKWLMMSVVRDDAGAVSHYIGSFTDISERK
VSEERIHFLAHHDSLTLLPNRLSLQSRLEVVFREALASDCQIAVMFIDMDHFKNINDTLG
HHVGDQLLLEVARRLKNIVGDTDTVARLGGDEFVVALSDTNHDEVASLAEALRSGLSQTY
IINNQALHSSPSIGISLFPTDGDSVEALMKNADMAMYRAKSAGRNNYQFFTAAMNTLITE
RQQIETGLRQVLANDELRLHYQPQIDIRTGQVVSVEALVRWQHPEFGMVAPDRFIPIAEE
IDMIIPIGQWVLETAMAQLAAWRAAGATELRMAVNLSAHQLRKDSIVADITNVLLKHKLG
KGALELEITESVAMQYPEQNARLLAELRQHGIELAIDDFGTGYSSLSYLKLLPLDRLKLD
RSFVKDIESDPNDAAISAATISMSHELGLTVVAEGVENEAQLVLLSSMGCDLVQGFYFSK
PLAAEECFRFIQRNL
NT seq
3648 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgccagcttgaaggactacacataaagtcatttattccatactttaaggtaaacatt
ttcatcgccttagcttacattgttgtaggtaaattaggcttgatgattgctttgccgcct
ggatattctgcggcgatttggcctgccgcagggattgctattgccgcatgtatcctgtgg
aaagaatatgtcccttgggttggcgtgttcatcggttccctgctgatcaacatcaatatt
ggtgggcatatccattttggttggttaccctttgctatctcgattgggtcttgtatacag
gctgtgctttcagcccatgttcttggccgagtcgatcatttattcaccttagataatcct
aataccgttattaaatcctgcttgagcttagccttaacttgtattgtggcgaccgttttt
ggcaacagtgccttagtgatcaacggtacgattccaccatctgatttactgggaagttta
gtgaattggtggacgggggatttgctcggcgccgtgatctttatccctttgactatgttg
ctatttgataagcggactatctggcgtgctcgccgcattcagacgggcattcctttgctg
gtgggctttttattttgtgtggggatttattactactcggatatgaaccagcgccaacag
ttgcaggataagtttcagatccaatctaatgccgtgattagcaatattgaaagttttcaa
gaggctaacctgcagcaaatcgtcgccctagcgagcttgttcgataatagcgagcaggtt
tcagaggatgagtttgtgcaatttggcaaacgtaacatgctgcagcaagatggctttaga
gcttggtcttggtcgccgttagtggcggctgccgatctgcccagttttgaggcatcgacc
cgctcagccattggcggcccttacaaagtcacgcggcctcaaggctggcaaaataatacc
gatggctggctagtgcctgtgatgtatattcagccaatcagaggcaatgaggcggcgctg
ggattagatctcaatagcgagccgacacgagccgctgccattgccaaagtgcgcgctacc
ttagcgcctgtgatgacggctaagattcaattagctcaagatcccaatggcccgggtggt
actttactcattgcgcccgcgttcgaccgactaggcagaatctcaggattttgttcagct
gtgattgatttgcaaagcattattaatgatgttgagagcgtgaagggattgcagtggaaa
ctctccgacatgagtgcgggcggtgcattactttatagcaatacccagaagtcgtttccc
gcgtttagcagcaagttatttagcgataaaaccggccagtattttcaagcaaacctgatg
ctagcggatcggcattggcacatagtgatttatcaatcctatgctgtgctgatgggcgat
acttttagcttatcgctacttatgctgctcctcgcctttatcacttgtgctgttgtgggt
ggtatgacgctggtttcctccggcgagcgccaacgtattgccgagaaagtgactgaaaaa
accatggccttgtcgaaggaaattgcccgccgtcaggcttttcaggccaccttggtacaa
agcgagcaaagatatcgtaacttgtttgataaggcgcctgtagggcatgtgcttaaacgt
ttagatgatggtcagttcgtggcgattaaccccgcattcgaagccatgacgggttactca
ctcgatgagttaaatcagctcgacccttgggatctcacgccaaagcgttatcaattaagt
gaaactgagcaattagaacgcctaaagcaaacccgtcgttatggcccctatcagaagcat
tatgttcataagaacggccagttagtggcagtgcgcctcaacggtgcgttagtcaccggc
gccgatggtgagcagcttattctctttatcgttgaagatattaccgagcaggagcgcacc
gttgcgcgggtaaatctattggcgcaggtgttccagcagagtggtgaaggcatcactatc
atggatgccaacgacattattgtggatgtgaatagtgcattttctcagataaccggttat
tcccgagaagaaatcattggtaaaaactgtcgctttttagaggccgagcgtaccgacaaa
ggtatcgatcctcaagtgcgtgccgccctagaacaaacgggtttctggcaaggcgaagtt
tgggacaggcataagcatggttacgatttccctaaatggttgatgatgtctgtggtgcgc
gatgacgcaggtgcggtgagccattacatcggcagctttaccgatatcagcgagcgtaaa
gtcagtgaggaacggattcatttcctcgcccaccatgattctttgacgctactgcctaat
cgactcagcttgcagtcgcgcctcgaagtggtattcagggaggcgctggcatccgactgc
caaattgcggtgatgtttatcgacatggaccactttaaaaatatcaacgataccttgggc
catcatgtgggcgaccaactgttgttagaagttgcgcgtcgtttgaaaaacattgttggt
gatactgacactgtggcgcgtctgggtggcgatgagtttgtggtcgcattatctgatacg
aaccatgatgaggtggccagtttagccgaggcgctgcgcagtggtttgagtcaaacctat
atcattaataatcaagcattacattcatcgccaagtataggcatcagtttattcccgacc
gatggcgacagtgttgaagccctaatgaaaaacgccgatatggccatgtaccgcgccaaa
tcggcggggcgcaataactatcaattctttactgcggcgatgaataccttgatcactgag
cgccagcaaattgaaactggcctcaggcaagtgctcgctaacgatgaattgcggctgcat
tatcagccacaaattgatatccgtactgggcaagtggtcagtgttgaagccttagtgcgc
tggcaacatcccgaatttggcatggtagcgccagaccgctttattcccattgctgaagag
atcgacatgatcattcctatcggccaatgggtgttagaaaccgcgatggcgcagcttgcc
gcttggcgcgctgcgggtgcgaccgagctgcgaatggcggtgaatttgtcggcgcatcaa
ctccgcaaagatagcattgtcgccgatatcaccaatgtgcttttaaagcataagttaggc
aaaggggcattggagctcgaaatcaccgagagtgtggcaatgcaatatccggagcagaat
gcgcgcctgttagcggaattgcgccagcatggtatcgaacttgcgattgatgatttcggt
acgggttattcctcgttatcctatttgaaactcttgcccttagacagattgaagctcgac
cgctcctttgtgaaggatattgaaagcgatccgaacgatgctgctatcagtgctgcgacc
atttctatgtcccatgagttggggttaactgtggtggccgaaggggttgaaaacgaggcg
cagttggtattattgtcgagcatggggtgcgacttagtgcaagggttttactttagtaaa
cccttagcggcagaagagtgtttccgctttatccagcgtaatttataa
DBGET
integrated database retrieval system