Shewanella frigidimarina: Sfri_3628
Help
Entry
Sfri_3628 CDS
T00395
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI73455
UniProt:
Q07X09
LinkDB
All DBs
Position
4305902..4307068
Genome browser
AA seq
388 aa
AA seq
DB search
MESPFTYILITLFFSSILLSIIFFMTWQTMGKQKYALMFSLSFLASTVLWANSLFKSLFL
SHELYWMIGCSVSMLSVVLGTWGHCLRTNTKIHPATLLGIGVFGMMLTYYFTYISPHLGL
RMSLYLYVDVLLLMITSVVIIKHRTKSRPAEIGASLMHFIFAMCILVAASIALSQGKEMD
VELIKLYAIVNFTALPAAYVGMSVFVIYMLASDLAEEMKLLAMTDPLTDCFNRRGFYSHA
KQKLLELQKQPQHACLIYWDIDKFKAINDQFGHAGGDQVLISITQLIKQHIKKDDLIGRM
GGEEFVILIERSNYQEAINVAERLRAMINQTPIVYCGQQISVTASFGVVELSNQDIPIEQ
AIDLADSALYQAKSSGRNKVVFSELSSR
NT seq
1167 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaagtccgtttacgtatattttaatcaccttgtttttttctagcattctgctgtcg
ataatctttttcatgacatggcaaaccatgggaaaacaaaaatatgcgttaatgttttca
ttatcttttttagcctcaacagtgctgtgggctaatagtctgtttaaaagcttatttctt
tctcacgaactgtattggatgataggttgcagtgtttccatgctgtcggtggtgctcggg
acatgggggcattgcttacgcactaacactaaaatccatcccgcaacactgctaggcata
ggcgtatttgggatgatgctaacctattactttacgtatattagcccccacctaggctta
agaatgtcgttgtatttatacgttgatgtgttgttattgatgatcaccagcgtggtgatt
attaaacaccgcaccaaatcacgccctgccgaaattggtgcgtcgttaatgcatttcata
tttgcaatgtgcatattggttgcagcgagtatcgcactatcccaaggtaaagagatggat
gtagaacttataaagctctacgccattgttaactttaccgccctacctgcggcttatgtt
gggatgtcagtatttgtgatttatatgctggcttctgatttggccgaagaaatgaagttg
ctggcgatgacagatccgctgactgattgctttaatcgtcggggattttatagccacgca
aaacaaaaattacttgagttacaaaagcagccgcaacatgcgtgcctcatttattgggat
atagataagtttaaagcaattaacgatcagttcggccatgctggcggcgatcaagtatta
atcagcattacccagttaatcaaacaacatataaaaaaagacgacttaatcggccgcatg
ggcggtgaagagtttgttatattaatcgagcgcagcaattatcaggaggctatcaatgtc
gccgagcgattaagggccatgattaaccaaacacctattgtttattgcggtcagcaaatt
agcgtgaccgccagttttggggtcgttgaactcagtaaccaagacataccaatagaacaa
gcaatcgatctcgccgacagcgcgttatatcaagccaaaagcagtggcagaaacaaagta
gtctttagcgaactcagctcaagatag
DBGET
integrated database retrieval system