KEGG   Shewanella sp. MR-4: Shewmr4_2467
Entry
Shewmr4_2467      CDS       T00388                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
she  Shewanella sp. MR-4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:she00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:she02000]
    Shewmr4_2467
Transporters [BR:she02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Shewmr4_2467
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec Plug OMP_b-brl_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABI39538
LinkDB
Position
complement(2931349..2934072)
AA seq 907 aa
MHKSNLLAKSVRLALISGVAVTTLNAPAVFAADEDGAKVERIEVTGSRIKRTDLETASPI
SVFSSEDIAASGAVTLEDFVQNIPAINGGAEGSSVNNGSRGYATASLRGLGSGRTLVLIN
GRRFASGDLNSIPTAYVERIEVLRDGASTVYGSDAIAGVINFITKKNFEGAEFNVQYDIT
GEGDGDKTLFSLTTGTSSERGNVVLSLQYTDRKAIGQGDRDFSSCPISENANGKYCGGSG
TIPQGQFFYADGTPTSDGYVKDKTTGQVRLFDPTKDAYNFSPASYMVTPQEVFSINGAGR
YEITDTLSTFIEGGFTNRQSDQLMAPEGTFWGPLMPASNPYNVTGEDIYVVRRLSETGGR
GFSQDFSDYRMVFGFEGSLGNYDWDLAYNFARYVDTRLDTGRVNPTRVDTMLDPDLCAAD
SDCPGVWNILEENTLTDAMLAYMLVPNSPVVRGETRQLQGNISGGVGIELPGGEIMFAAG
FEKRWEEYSNTPDGAASIGQIYSVAGEPTSGKYSVNELYTELDLPILEGVAFAESLRATA
AVRYSDFDFLDDSSTNTKFGLEWVPVDGLMLRTTIASGFRAPGIGELFSPQSETNLAYTE
PCKQYATGSQSAIVKANCAAEGLPGNFTLSSDQSSTVVGGNPDLKPEESDSFTAGFVYSH
DVGITMSVDYFNIEITNGIGTAGTDNVINGCWSSENFSSPLCQFVKGPSLTGDAPHATSP
YRSALGTVAGVLLTNANLSTFETAGYDFDFTYKTDLMSGSFSATLNGTYLEKYDYTPFDG
ADKVEAAGKVAADQWETTLAVFSKLRTNLNLTYTMDNWSVGWQTRYQSEGEDLYASASNL
DNIADAVWYHDVQGTYYVFENTALTVGVRNLFDQEAPYITNNQDMNTIPVSYDTAGQYWY
AKVNVKF
NT seq 2724 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcataagagtaatttacttgcgaaatcagtgcgtttagcgttgattagcggtgtggca
gtgacaacattaaatgcaccagcagtatttgcagctgatgaagatggtgcgaaggttgaa
cgaattgaagtaacaggttctcgcatcaaacgtacagacttagaaactgctagccctatt
tctgtgttttcttcggaggatattgctgcttctggggcagtaactttagaagattttgtg
cagaatattcctgcaatcaacggtggtgccgaaggctcctcggttaacaatggtagccgt
ggctatgcgactgcatcattgcgtgggttaggttcaggtcgtacgttagttttaattaac
ggtcgtcgatttgcatctggagacttaaactccattcctactgcatatgttgagcgtatt
gaggttttacgtgatggtgcttcgacggtatatggttctgatgcgattgctggtgtaatt
aactttattaccaaaaagaacttcgaaggtgccgaatttaatgttcagtatgacattact
ggtgaaggtgatggtgataaaacattattttctctaacaactggaacatcgtctgaacgt
ggtaacgtagttttatctctgcaatatacagatcgtaaggctattgggcagggagaccgt
gatttttcttcatgtccaatctctgaaaatgctaacggtaaatattgtggtggttctggc
actattccgcaagggcagtttttttacgcggatggaactccaacctcagatggctatgta
aaagataaaacaacaggacaagttcgtttatttgatcctacaaaagatgcatataacttc
tctccagctagttacatggtaacaccacaagaagtatttagtattaatggtgcgggaaga
tatgaaataacagatacactgtctacttttattgaaggtggtttcactaaccgtcaatct
gatcaattaatggctcctgaaggaactttctggggaccattaatgcctgcgtctaatcct
tacaacgtcacaggtgaagatatttacgtagtacgccgtttatctgaaactggtggccga
ggattttctcaagacttttctgattatagaatggtgtttggctttgagggctctcttggt
aattatgactgggatttagcatataactttgctcgttatgttgatactcgcttagatacc
ggtcgagttaacccaactcgtgtggatacaatgctagatcctgatttatgtgcggctgac
tctgattgtcctggagtatggaatatattagaagaaaatacgcttactgacgcaatgtta
gcatacatgttagtacctaactcacctgtcgtgcgtggtgaaacacgtcaattacaaggt
aacatctctggtggcgtgggaattgaattacctggtggtgaaattatgtttgctgcgggt
tttgaaaaacgttgggaagagtactcgaatacacctgatggtgctgcatcaattggtcaa
atatattctgttgcaggtgagccaacctccggtaaatattctgtgaatgagctttataca
gagttagaccttcctattttagaaggcgtcgcttttgctgaatcattacgtgcaacggca
gctgttcgttattctgattttgacttcttggacgatagttcaacgaatactaaatttgga
ttggaatgggttcctgttgatggtttaatgctacgtactacgatagcgtcaggcttcagg
gctcccggtattggtgaattattttctcctcaaagtgaaacaaacttagcatatactgaa
ccttgtaaacagtatgccacaggttcgcaatctgccatcgttaaggcaaactgtgccgcg
gaaggattacctggtaactttacgctatcatccgaccagtctagtacagttgtaggcggg
aaccctgatctaaaaccagaagaatctgatagttttactgctggctttgtatatagccat
gatgttggtattactatgagcgttgattatttcaatattgaaattacaaacggcattgga
actgctggtactgataacgtcatcaatggttgttggagttctgaaaacttctctagtcca
ttgtgccaatttgttaaggggccaagtttaactggcgatgctccacatgcaacctcacca
taccgctctgcacttggtactgttgcaggggtattattgacaaatgctaacttatcaaca
tttgaaactgctggctatgatttcgattttacttataaaactgatttaatgagtggtagt
ttttcagcaaccttaaatggaacataccttgagaagtatgattacacaccatttgatggt
gctgataaagtcgaagctgcaggaaaagttgcagcggatcaatgggaaacaactcttgca
gttttctctaagttacgcacaaacttaaatttaacttatacaatggataattggtcagtg
ggttggcaaactcgttaccaatctgaaggtgaagatttatacgcaagtgctagtaattta
gataatattgctgatgctgtatggtatcacgatgttcaaggtacttattatgtctttgaa
aatacagctttgacggtgggtgttcgtaatttatttgaccaagaagcaccatatattact
aataaccaagacatgaatactatccctgtttcttacgacactgcaggccagtattggtat
gctaaagtgaacgttaagttctaa

DBGET integrated database retrieval system