Sulfuricurvum kujiense: Sulku_0710
Help
Entry
Sulku_0710 CDS
T01370
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor
Organism
sku
Sulfuricurvum kujiense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
Pkinase
AAA_16
PK_Tyr_Ser-Thr
GGDEF
TPR_12
GAF
TPR_2
ABC1
GAF_2
RsgA_GTPase
PPR
nSTAND1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADR33376
UniProt:
E4U172
LinkDB
All DBs
Position
700646..706234
Genome browser
AA seq
1862 aa
AA seq
DB search
MKIKNYNVLSTLYNNGRTIVYQAISPNGDIVAIKTVLDDSDQNYANKLYREFSIAKNLNN
KFTDHYIELLEEDKIYLVKSFESGKNLSDVIPSDGMDIDTFIAYAISITEAIDYIHQNSV
LHLDLNPGNIICNEVQKSIKLLDFGESISNININKSPQKNIQITGGAAYSAPEQTGLSNQ
NLDERSDLYSLGVVFYEMLSGRLPFEGENTIQMAHAHLAQIAEDLHTIKPSIPIVLSNIV
KKLLAKDKHERYQHAFSLKHDLIQFSQDPSADFLIDSQDISDKLIYPQKLYGRDQELALV
SNKIMSVIGDKPKLMMISGYSGIGKSSFISELSPVVLRKNGYFVKGKFDQYNRTTSYVAF
VQIFMNLINIINSMPPDLKQKKINELIEFLGESKNALIKIIPELKVFFKVDHTPIVEQAQ
LKNQLFIAVERFFGFFASQEHPLVVFLDDMQWADLASLEILELIYASSKLESFLIIGAYR
SNEVSLTHPMKLSLDNIAKKIGHVEDIELLPLDISAVNQLLRDMLKKEDVEALGQLLIQK
TEGNPFFLKQFIYTMAKRDLLRFNNDTRSWEWNIEQIKHEDLTNNVIDHLVSKISTMSED
AQNFIKTASVLGDTCDMEVISTLSQSEPESIDHIVSEVFYEGMMEVSTDESMIGIKMVQY
CHFVHDKIRQAAYLMLSLEEKQQTHLKVLKYFLMQKEQSPKAILGTAKHIIEVVDLIKEE
EAEFVLSILSQASHLAKESLAYEEAIKYAQAAISLFPENSWRENYEITCSIYLNLLESLS
QARRYQEALVLFEQLLSNGLLKKIDIAKIYNLRLTYHFSQGLLSEAIEDGRQALRVLNQE
IPNDTSELLLLKKDEIDWLSSNIKSIEDLQYLNEMEDETIELCMNILVNMGIPAFVSRQD
MFGVVTLRMVRLSFLYGNCDVSPYGYMLCGMIIGAGLRHYEEGYRYGQVAIALQEKFDNK
AIECKLLRVYGAYVASWVQPHEQTLKILHKAYMSGVENGDFSYSAYCVNHIFTREFLSSI
SLDILEQKAVSYVDFITESKEPYILEIQYLFINIVKCLRGNTYALNSLSSEAFDEHKVVE
DLIRINFKTLLAYYYIYKLQICYIHEYYGEAVEHAINAKEYLENIKGNILETEWTFYYAL
SVFKQSSGTVEQQDIDLLSGFEKSFERWAELCPQNFRARYLIIKGINAYSHTSFDDAFKN
FEEALSYQDESAPTLLKAITLELMGTCWESRSNWRIAKMYLQEAYTIYYNLKAIAKAKLL
FNTQSELLHREAQIQVSVTPSPQNTNDLNIFDEDTILKATQLISGKVDRSELIEKFTYII
AQSFGIQIGGLILKENDAFYLEGLFNINDNPKIIIDHQPLDVSNAIPKSIVNEVLANNNV
LIVDDALNDARFAMDQIVIERKIISVICAPIYLKDKLIGLVYMENNLIKGFFDNTREKVL
NILLTQTAVTLELESLYSHDKLTGCLSRQKLDEVLMKNDFSALLLININNLDSVNSTYGY
AIGDEILKSFVNFLYRLLEDTKSLFRLSSDEFVVIVDKNSSTDKEMLAATIIKSLQDYKF
IIEDFLIILSCTIGITANTVEDSDESPLVRAHAAMKEARQSGTNKFLTYTSDSLFIRHQK
NNIEWMLKVKDAIANNVIVPFFQPIIDNETNQIVKYECLARLVENSNIIAPIHFIEPARL
AGLLPKITEIIFAKSFQYFQDKSYDFTINISEEDLKEKYLLDLLKTLTQKHNIAPNRVTL
EILENISAYESEAAIEQLLELKMNGYKIALDDFGSEKSNFLRLQKMNVDYIKIDGSFIKD
IHENKNNLNICKTIVHLAQALKCEVIAEFVHSSDVHEVVKQIGIKYSQGYYFGMPKEGIV
DV
NT seq
5589 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaaaaattataatgttctctctactctctacaataacggacggacaattgtc
tatcaagctatttcgccaaatggcgacatagtagcaatcaagacagtcctcgatgacagt
gaccaaaattatgccaataagttataccgcgaattttccattgcaaaaaatctaaacaat
aaatttacggatcattatattgaattattggaagaggacaagatatatttggtcaagtct
ttcgaatcgggtaaaaatttatcagacgtaatcccctctgatgggatggacatagatact
tttattgcgtatgcgatatcgatcacggaagcgatagactatatacatcaaaacagcgtt
ctccacctagatttgaatccgggaaatatcatttgcaatgaagtccaaaaatcgatcaaa
ttgcttgatttcggtgaaagtatctccaatattaatatcaataaatctccccaaaaaaat
attcaaataacggggggtgccgcatattctgcaccggaacaaaccggattatcgaatcaa
aatctggatgaacgaagtgatctctactcactgggtgtcgttttttatgaaatgctcagc
gggagactgccgtttgaaggggaaaatactatccaaatggcacatgctcatttagcacag
atcgctgaagatttgcatacaataaaaccctctattcctatcgttttatcaaatattgtt
aaaaaactgctggcaaaagataagcatgagcgatatcagcatgcatttagtctaaaacac
gatttaatacaattttcccaagacccttcggccgattttctcatcgatagtcaagatata
tcggataaattgatttatcctcaaaaattatacggcagggaccaagagttagcgttagtc
agcaacaaaataatgtcggttatcggcgacaagcctaaactcatgatgatcagcggatat
tccggtatcgggaagtcttcatttattagcgaattaagtccggttgtgcttagaaaaaac
ggttattttgtaaaagggaagtttgatcaatacaatcgtacgacttcgtatgttgcgttt
gttcaaatttttatgaatttaatcaatatcataaatagcatgccgccagatttaaaacaa
aagaaaatcaatgaactgattgaatttttgggcgaaagtaaaaatgcgttaattaaaatt
atccctgaattaaaagtatttttcaaagtagaccatacccctattgtcgagcaggcacag
ttaaaaaatcagctatttattgcggttgaacgctttttcggcttttttgcctcacaagag
catcccctcgtcgtttttttagatgatatgcaatgggccgatttggcatcgcttgagata
ttagaattgatctatgcttcaagcaaactggagagttttttaattatcggcgcatacaga
agcaatgaagtctcattaacacatcctatgaagttgtcgcttgataatattgccaaaaaa
ataggacatgttgaagatatcgaactcctgccgctggatataagtgccgtcaatcagtta
ttacgtgacatgttgaagaaagaagatgttgaagcactcggacagttactgattcaaaaa
acagaaggcaatccattttttctgaaacaatttatttacactatggcaaagcgtgattta
ttgcgattcaataacgatacgcgctcttgggaatggaatattgaacaaatcaaacatgaa
gatttgacaaacaatgttattgaccatcttgtatcaaaaatcagtacgatgtccgaagat
gcccaaaactttattaaaacggcatcggtactcggagatacatgtgatatggaggtgatc
tcaacgttaagccaaagtgagccggagagtattgatcacattgtcagtgaagtattttat
gaaggtatgatggaagtctctaccgatgaaagcatgatcggcatcaagatggttcaatat
tgccattttgtgcatgataaaatcagacaggctgcctatttaatgttgagcttagaagaa
aagcagcagacccatctaaaagttttaaaatattttctgatgcaaaaagaacagtcgcca
aaagcgattctcgggacggcaaaacatattatagaagttgtagatcttataaaagaagag
gaagccgaatttgttttgagcatcctcagtcaagcctctcatctcgcaaaagaatctttg
gcatacgaagaggcgattaagtacgctcaagccgcgatttcccttttccctgagaacagt
tggcgtgaaaattatgagatcacctgttcgatttatctaaatctcctggaatcattaagt
caagcacgaagatatcaagaggctttagtgctttttgaacaattgctctctaatgggctt
ttgaaaaaaatcgatatcgcaaaaatatacaatcttcgtctgacctatcacttttcacaa
gggctgctctcagaagccatcgaggatggacgccaagcactgcgggttctcaatcaagag
attccgaacgatacgtcagagttactgcttttgaaaaaggatgagatcgattggctgagc
tcaaatatcaaatcgattgaagatcttcaatacctaaatgagatggaagatgagactatt
gaactgtgcatgaatattcttgtcaatatgggaattcccgcatttgtcagcagacaagat
atgttcggtgtcgtaacgcttagaatggttcgtctttcttttctatacggaaattgtgat
gtttccccatatggatatatgctctgcggaatgattatcggtgcgggacttagacactat
gaagagggataccgatacgggcaggttgcaatagcgcttcaggaaaagtttgataacaaa
gctattgaatgcaaactgctgcgtgtatacggagcgtatgtcgcctcatgggtacaacct
catgaacaaacattgaaaattctgcataaagcttacatgtcgggtgttgaaaacggagac
ttttcctattcggcctattgtgtcaatcatatatttacgcgggaatttttatcaagtatc
tcattggatattctggagcaaaaggctgtcagttatgttgactttatcaccgagtcaaaa
gagccctatatcttggagatacaatacctttttatcaatatcgttaaatgtctgcgcggt
aatacgtatgccttaaactcgttaagctcagaggcgttcgatgaacataaagtcgttgaa
gatttaatacggataaattttaaaacactgttggcctattactatatttataaattgcag
atttgctatatccatgaatattacggtgaggcggtagaacacgctatcaatgcaaaagag
tatctggaaaatataaaaggaaatatccttgaaacggaatggacgttttattatgcatta
tcggtgttcaaacaatcgtccggtacagttgaacagcaggatatcgatttattgagcggt
tttgaaaagagttttgaacggtgggctgaactttgtccccaaaacttccgggcgagatac
cttatcattaaagggattaacgcctatagccatacctctttcgatgacgcgtttaaaaac
tttgaagaggcactcagttatcaagatgaaagtgctccgacccttttaaaggcgataacg
ttagagttaatgggaacatgctgggaatcaagaagcaactggcgtattgccaaaatgtat
ctgcaagaggcgtatacgatctattataatctgaaagctattgcaaaagcaaaactattg
ttcaatacccaaagcgaattgctgcatcgtgaagctcaaattcaggtgagtgtgacgccg
agtcctcagaatacgaatgatttaaatatttttgatgaagataccattttaaaagcgacg
caattgatttcaggaaaagtcgatagatccgagttaatagagaaatttacctatatcatt
gcgcaaagtttcggaattcagatcggaggattgatcttaaaagagaatgatgcgttttat
ttggagggattgttcaatattaatgataatccgaaaataatcatcgatcatcaaccgttg
gatgtatccaatgcaataccgaagtcaatcgtaaatgaggtactagccaataataatgtt
ctcattgttgatgatgcgttgaatgacgcaagatttgccatggatcaaatcgtcatagag
agaaaaattatttccgttatctgtgcacccatctatttgaaagataaactcattggattg
gtttatatggaaaacaaccttataaaaggttttttcgataatacacgtgaaaaagttctc
aatattttgttaacgcaaacggcagtcacgttggaacttgaaagtttatactcccacgat
aaactcacagggtgcctcagtcggcaaaaattggatgaggtgttgatgaaaaatgatttt
tccgcccttttactgataaatatcaataatctggattcggtcaattccacctacggatat
gcaatcggagatgaaattctaaaatcgtttgtaaattttttatatcgtttattagaagat
accaagtctttattcaggctatcaagcgatgagtttgttgttatagtcgataaaaactct
tcgaccgataaggaaatgttagcggctactattattaaatcgttgcaagactacaaattt
ataatcgaagatttcttaatcattttatcctgtacgatcgggataacggctaacactgtt
gaagactcagatgaaagccctttggttcgtgcgcatgccgctatgaaagaagcccgacaa
tcagggactaataagtttctgacctatacttctgattctctgtttatcaggcatcagaaa
aacaatattgagtggatgctaaaagtaaaagacgcgatagcaaataatgtaatcgtccct
ttctttcaacccattattgacaatgaaaccaatcagatcgtgaaatacgaatgtttggcg
cgattggtcgagaacagcaatattatagcccctatccattttattgaaccggccagactt
gcggggctattacctaaaattaccgaaatcatatttgcaaaatcgtttcaatactttcaa
gataagagttacgactttacgatcaatatttcagaggaagatctaaaagaaaaatatctc
cttgatctgcttaaaacattgacgcaaaaacataatattgctccgaatcgggtaacattg
gagattttagaaaacatttcggcatacgaaagcgaagcggcgatagaacagctgttggaa
cttaaaatgaacggttataaaattgctttggatgatttcggcagtgaaaaatccaatttt
ttaagacttcaaaaaatgaatgtcgattatattaaaattgacggttcgttcatcaaagat
attcatgaaaacaaaaataatctcaatatttgcaaaacgattgtccatttggcgcaagcc
ctaaaatgtgaggttatcgccgaatttgttcactcgagcgatgtccatgaagtcgtcaaa
caaatagggataaaatattcccaaggatactatttcggaatgccgaaagaggggatagtc
gacgtttag
DBGET
integrated database retrieval system
