Staphylococcus lugdunensis N920143: SLUG_21310
Help
Entry
SLUG_21310 CDS
T01951
Name
(GenBank) AraC family regulatory protein
Organism
sln
Staphylococcus lugdunensis N920143
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCB54655
LinkDB
All DBs
Position
complement(2254421..2256589)
Genome browser
AA seq
722 aa
AA seq
DB search
MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIK
QNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNEN
YIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSK
SNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLGFSNSASYTKMFKSY
IGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVK
TKQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGIGTLINNLSDAEIGDMF
KKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELK
EIYRLILKIQNKQFGLRFGLDISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLL
EDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNIENHQFLNNENDLSNSA
PLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTI
KDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEAAEQSIRLIKSEKVDEK
NGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKI
FK
NT seq
2169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatactttttttcgaatcctcactaaagaagaatatcaaccaacacgatgtatc
gatggtattattgtcattttacctatacaaggggatctgacgattcagcattttgctaat
tctactacgattagtgatgaaatatatatcataaataataaagatatttttacaattaaa
cagaatcataaatcattaatgctttacattacgagcgattggtttaaaaatcacgattat
gtattttttgattataagtattctgtgaacttaataaaatcaatcaataaattaaaacaa
ctgatgcttaaaattgcgattaactatattaatcaaatgcccataactagtaatgaaaac
tacattaaacaaatggtggaagtaatagcaacagaaggaagtgttgatttagaaacggct
gaaaatcaatataaatttttattttatggggaacttagccaaatactagaatatattaat
aaacactctcatgaaaaactaacgttaaatgcgctatctcaaaatttattcacctcaaaa
tccaacatttccgcacagtttcaccaaaacttaaacatgggttttaaacaatacgttgat
tcactaaaaattgctgaatcaattgaatacttgttaactgaaaattcaaccattagtcat
attagcgataaattagggtttagtaattcggctagctatacgaaaatgtttaaaagttat
attggtattacacctaatgattatcgaagtttaaatataaaggataaatatttattaatg
aattatgaagtgttaagtgaggataatgaacaacatttaaaaacagtactcagacaacag
attaattattatcaagaaaatattgaacgtaaaatatttatagacaacaataaagtaaaa
acaaagcaaaattttgaacttgtaactcagattaatactgttgaagagtttaaagagtta
ttctttattaaaatcaaaggaaaagctaatattaatacagaaaatttaattatctatgtt
aattttggtattggaacattaattaataatctgagtgatgctgaaattggagatatgttt
aaaaaaattgcggcaaataatttgcatattgcctttaaaattcaatcattagaaattatg
gattatatcgagcgcatttatgtacaagtagtagaacgtttaaactataagaaatcatta
gcaaatggtgatcgtggtattatcatgcttgtatttgatatggaagtaatagaactaaaa
gaaatttatcggcttattttaaaaattcaaaataagcaatttggtttaagatttggttta
gacattagctgtttgcttaacgaaacagtcatgtttaaaacattagaatcacaaataaaa
cgtatcggttttgattatttatttattgataatgctcaccttgaacaaccatatttacta
gaagatagtcaacatttattattaaaaaatattttagagtatcagaatatcgaaaaaata
ttaacacaaattgatttatcatatagcaaagttatatttttaaatatagagaaccaccaa
tttttaaatatagagaaccaccaatttttaaataatgaaaacgacttgagtaacagtgcc
ccattaattattgaaacctttttgaaaacggcagagttatttgatggtatgggtgttaac
ttatattttagtagaaattcgtttaatgcaattcatatctttgatgaaaatggttttaaa
acggtgttaggcatcatcattggtcaaattaagtggatgatgaaccagtccagaacaatt
aaagataattatattgtagtagaaaatgaggcacagtatacattattcttatatgattgg
agagtatttgaaagcgaagcatcaattacctatttcggtgatacagaagtattaattcat
tttgaagaagcagctgaacaatcgattcgattaattaagtcggaaaaagttgacgagaaa
aatggtaatatcaatcacatcattaatcgccatattcgtgaaaaatacaattggactcag
gaattattaaaagaaattgaagatcatttacatacgactatgagaattattgaacatgac
ttcaggaaagactattttaaagttaatttaggttatgattcattaagaatcataaaaata
ttcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
