Schistosoma mansoni: Smp_133690
Help
Entry
Smp_133690 CDS
T01095
Name
(RefSeq) putative discoidin domain receptor
Organism
smm
Schistosoma mansoni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DDR1-2_DS-like
F5_F8_type_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8341100
NCBI-ProteinID:
XP_018650546
LinkDB
All DBs
Position
2:29378251..29496111
Genome browser
AA seq
1302 aa
AA seq
DB search
MYILCKGWITLIFMSLFIWRANTYKAEQIIRRGPGQDPQCADPLIKSVDTFPDTSFSSSS
VWKNATDFQPFRARLTEVYGSNEHTSGYAWCPNTHVEDGLREWIQAEFSHLVIISVIFTA
GRGDGNVKEYMPNFVLRYQREDNGVWYEHVKTDGTRVLKANNDPRNIARTTLDSVVIAKR
IRIYPYSHRSRQQVCLRFALYGCNFPDGVISYSMPQGDTITYGRQLLFGSPYSTIPQNFQ
DLTYDGQLIELENQLVGGIGQLMDNIAYLGNVTQHSDSHPAQPGFHFIGWNVPNKSLRIL
FKFDEVRTFIWLRIFTFDSVPLKSRVFSQAIVEFSMDGKNFDKSIEISTNHARLIDPNQT
NPTRLSISDNDIQLSSSSSLSRLKRASNSMDNGLIQDTIIYNNHEWDGALVVQIPLASYR
ARYVSLTLTSADSWILLSEVQFNSTIVQPQSLLPLSSNEEINNGNKSLDNADDTSNHLDN
SQKKLFNTDENSFRASPIIGDHSEMLNKQDLRNPNKPMNPEIHSPMSVGNEKSLTSNHEI
RSAEENLGNHNEKYYSASSSSTSISSSSSSSTQLSQIIVIVSYVLGAILSLFILLAIIII
IQRKCKHYLHFKHQCCKQLKVETTGGISSNQSGGFYSPISLIGTCGSTNHHPHGVNSLLN
YNVVNTMNIPEAAKLLQSLSTLSPNTRTTLTTTTTDNFVHNNNNCLPNNSGNVGGVGVGV
NHAVLHHPNNILQYTVNNNNSNNLATENNSIIVKNNNNRLFGTTCANGIAGVGDGRISKL
DYASTIGQPLPPPPPPSLPNGLLLPCIPQTGVVVGGIGMNHHNHPGTTDQHHHQIIEQPT
SMYIQTNAANRLTTTTTLVGNDLNSLNGMSPEYASASIFGFTPPPSDLSDGASIHCGENN
NNSGNNNIPSNYYRPIISRLGNNQHYPISGLTSNLNPNYNGPLSTLSNTGGPTYEMHTKM
HILPNDIINNNNSNSEQFYSSTVNQPNAATGFLFLPRSQIGNFGGGEGGTIMNRMSFPTN
QFPQLNHNGFISVTSGDLYNIYQTTGINLPIQSNLQTSLQQQQQQQMYCQQQQPNEYKDD
NTTWQLASTLSNNRQSMIINSTPPQISPFTEQCLDSSWTGTVNNNNNNNNNNNNNNNNNN
SHRITNMTDTNIMGTMKANYFLPIMNTSYYEYFNYTRNNNNNNNPKHDEQQAAQSYFLAN
HQQGKQQQITYPSFPPPPPRILTSINSGIISTTSPSTTITSQTSSNELNFSCSSPVSATV
AITTMSTESGATNGDGGGGGGYTIIDENTISDPPVPFYSVCL
NT seq
3909 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacattctatgtaaaggttggataactttaatatttatgagcttatttatttggaga
gcgaatacatataaagcagaacaaattatacgtcggggtcctggtcaagatccacaatgt
gcagatcctttaatcaaatcagttgatacatttccagatacttcattttcatctagtagt
gtgtggaagaatgccactgattttcaaccatttcgggctagattaacagaagtttatgga
agtaatgagcatacaagtggttatgcatggtgtccaaatacacatgttgaagatggtctg
cgtgaatggattcaagcagaattttcacatttagtcattattagtgttatatttacagct
ggacgtggtgatggaaatgtaaaagaatatatgccaaattttgttttacgttaccaacgg
gaagataatggtgtatggtatgaacatgtaaaaactgatggtacacgagtcctaaaagct
aataatgatccacgaaatattgctagaactacacttgattcagtagttattgctaaacgt
atacgtatttacccttatagtcatcggtcaaggcaacaagtttgcttgcgatttgcattg
tatggatgtaatttcccagatggtgtcatatcttattcaatgcctcaaggtgatactatc
acatatggtcgacaattattattcggttcaccttattctactattccacaaaattttcaa
gatttaacttatgatggtcaattgattgaattagaaaatcaattagtcggtggtataggt
caattaatggataatattgcctatttaggcaatgttactcaacattcagattctcatcca
gctcaacctggttttcattttattggttggaatgttccaaataaaagtttacgtattctt
tttaaatttgatgaagttcggacttttatttggttacgtatatttacattcgattctgtt
ccattgaaatcacgtgtattttcacaagctatcgttgaattcagtatggatggaaagaat
tttgataaatccattgaaatttcaactaatcatgcacgtctaattgatccaaatcaaacc
aatccaacacgattatctatatctgataatgatatacaattgtcatcatcatcatcatta
tctagattgaaaagagcatcaaattcaatggacaatggattaattcaagatactataatt
tataataatcatgaatgggatggtgcattagtggtacaaatcccattagccagttataga
gcacgttatgttagcctgactttaacatcagctgattcatggattttattatctgaagta
caatttaattcaactattgtacagcctcaatctctactaccattatcatccaatgaagag
attaataatggtaataaatcacttgataatgctgatgatacttcgaaccatttagataat
tcacagaagaaattattcaatacagatgaaaattcatttcgtgcttctccaataattggt
gatcattcagaaatgttaaataaacaagatctaagaaaccctaataaacccatgaatcca
gaaattcattcaccaatgagtgtaggcaatgagaaatcgcttacatcaaatcatgaaatt
cgttcagctgaagaaaatcttggtaatcataatgaaaagtattattctgcatcttcttca
tcaacatcaatctcatcatcgtcatcatcatcaacgcaattatctcaaattattgtcatt
gtatcttatgtactaggcgctatactctctttattcatcttgctagctataattattatc
atacaaagaaaatgcaaacattatttacattttaaacatcaatgttgtaaacaattaaaa
gttgaaacaacagggggaatttcatcgaatcaatccggtggattttattcaccaatttct
ttaattggtacttgtggaagtactaatcatcatcctcatggagttaatagtttattgaat
tataatgttgtaaatacaatgaatataccggaagctgcaaaacttttacaatctttgtct
acactatcacctaatacaagaacaacgttaacaactacaacaacagataattttgtacat
aataataataattgtttaccgaataatagtggaaatgttggcggcgtcggcgtcggcgtc
aatcatgctgttctacatcatccaaataacatattacaatatactgtgaataataataat
agtaataatttagccacagaaaataattcaatcattgtaaagaataacaataatcgatta
ttcggtacaacatgtgctaatggtattgctggggttggggatggccgtataagtaaatta
gattatgcatctacaattggtcaacccctaccacctccacctcccccctcactaccaaat
ggtttattactgccttgtatacctcaaactggtgttgttgtcggcggtattggcatgaac
catcataatcatcctggaacaactgatcagcatcatcatcaaatcattgaacaaccaaca
agtatgtatatacaaactaatgctgctaatcgattgactactactactacattggttgga
aatgatttgaatagtttaaatggaatgagtcctgaatatgctagtgcatctatattcggt
ttcacaccgccaccatcggatctatcagatggagcatctattcattgtggagagaataat
aataatagtggtaataataatattccatcgaattattaccgtccaattatttcaagactt
ggtaataatcaacattatccaatatctggtttgacgtctaatttaaatcccaattacaat
ggacctcttagtacattatcgaatacaggaggaccaacttatgaaatgcatacaaaaatg
catattttacctaatgacataatcaataataataatagtaatagtgaacaattttattca
tcaaccgtaaaccaaccaaatgctgcaacaggatttttatttcttccacgttcacaaatt
ggaaattttggaggaggcgaaggtggcaccataatgaatcgaatgtcatttcctactaat
caatttccacagttaaatcataatggatttatatctgtaacaagtggagatttatataat
atctatcaaacaactggaataaatctaccaattcaatcaaatttacagacatctctacaa
caacaacaacaacagcaaatgtactgtcaacaacaacagccaaatgaatataaggatgat
aatacaacatggcaattagcatcaacattatcgaataatcgacaatcaatgattatcaat
tcgacacctccgcagatatcaccatttaccgaacaatgtttggattcttcatggactggt
accgtaaataacaataataataataataataataataataataataataataataataat
tctcatagaataacaaatatgacagatacaaatataatgggtacaatgaaagctaactat
tttcttcctattatgaatacttcctattatgaatacttcaactacactagaaataataat
aataataataatcctaaacatgatgaacaacaagctgcacagtcatattttcttgcaaat
catcaacaagggaaacagcaacaaattacttatccttcatttcctcctccaccgccaaga
atacttacttcaataaattcagggataatatcaactacatcaccatcaacaaccattaca
tcacagacatcatcaaatgaactaaatttctcttgtagtagtccagttagtgcaacagtg
gcaataacaacaatgtcaacagaatctggagctacgaatggggatggaggtggtggtggt
ggttatacaataattgatgaaaatacaatatctgatcctcctgtaccattttattctgta
tgtttatga
DBGET
integrated database retrieval system