KEGG   Schistosoma mansoni: Smp_169540
Entry
Smp_169540        CDS       T01095                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-related
  KO
K14947  epithelial splicing regulatory protein 1/2
Organism
smm  Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:smm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:smm03041]
    Smp_169540
Spliceosome [BR:smm03041]
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   Other SAPs
    Smp_169540
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RNase_T
Other DBs
NCBI-GeneID: 8355349
NCBI-ProteinID: XP_018647393
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1009 aa
MRPPSTAARKNSLDFQQGGAEFQQFIKPCQITYHDSKEFSLSKIKQPYVKLESDEIYPQD
NNGSSITDRIIQSDVNGENYSVKIIGPTEECQKVTSVNTQILTEAPLLEKALKDFNQWIQ
DNNLYCFQNDHSTVNGRHLDQNSSPFCCSTANSRTTINTNSTTTEKMECDENLKSFILLV
DGPYGLRLTLHPETTIKSIDITNYPYFYQFIDIKKSFAKFYKLATIPNTINEMMEYLQID
DDYSPPYSTIQHKESFLLKSQLEKIDNHYEYQYCNSEIQLPRNIATTTNLSQDHLISSTI
QEPHTSNQDYQQFNSKLIGLKRQPGYWPIQHCRILVKVIQKMTLDGMEWTEFETVNREYY
PAIISKTDTINDNVVVRARGLPWQATDLEIFQFFSGINIAKGGISLVLSKIGRRNGEALI
QFADAEQQSLALRKHKHHVGKRYIEVYAATGSDFISIAGGESQEAMNFLGKLTTPNQTLI
RMRGLPYTTTPEQIVRFLCILIKIVQFNANGILFVNKPDGRATGDAFVIFETKIVAEKAL
ENNKQHIGSRYIELFKSTPAEVNQVMNSILSSTCEEQIHCWNNHLTECNNSVFTANNSSV
YMPHFTETNNNLIYSDYNLKLLSNPSTIPEFTYSPHLISGQPIGEAMIQFVTELSAQTVC
EQKHKSIFIKYGLPIPVGAYVDVIQCTREDLNHLLSNMSRNIGIFTNNLISSSSTSTLSN
LMNPIILTQLHNLDDITTMLKSSIPLQSGYGIEQTNFLHIKTPEFRLNPFISNEELSNFN
VLPPTLPNLPNYITGINSTFSFPTPLIDNNITNALIQCTPPLSNMLGFQIPNLIYQTSFP
NFFTNNSLLNNHESTELLSTSIPYLTNCHKNKNNNISNGYNLPEFEGNSDWANSWSNNHK
AEQITIMNSPEMQVFKTNDLVASKTENKPIIVTVQGFPKEMTPNDFTKWLEKKINNVKIL
SVQFEHSLLNEISNGFAKVYLQHNSDAELIVQEFNNTTLNNSRISAQIN
NT seq 3030 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagaccacctagtacggcagccagaaaaaattcgcttgattttcagcaaggtggtgca
gaatttcaacagtttattaaaccttgtcaaataacctatcatgattctaaagagtttagt
ctgtcaaaaattaaacaaccgtatgttaagttagaaagtgacgagatctatccacaagat
aataatggcagttcaataacagataggataattcaatctgatgttaatggagaaaattat
agtgtgaaaataattggaccaactgaagagtgccagaaagtgacttcagtaaacactcaa
attctaaccgaagctccactacttgaaaaggctttaaaggactttaaccagtggattcaa
gacaataatctgtattgtttccaaaatgatcattccacggtgaatggtagacatcttgat
cagaattcttctccattttgttgctcaactgctaattctagaactaccattaatactaat
agtaccactacggagaaaatggaatgtgatgaaaatttgaaaagttttattttgctggtc
gatggaccgtacggcctacgtttaacacttcatccagaaactaccataaaatcaattgac
attacaaattatccttatttttatcaatttattgacataaaaaaatcttttgcaaaattc
tataaacttgctactatcccaaatacaattaatgaaatgatggaatacttacaaatagac
gatgattattcaccaccttattcaactattcaacataaagaatcattcttgttaaaatct
caacttgaaaagattgataatcattatgaatatcagtattgtaattcagaaatacaatta
ccaagaaatattgctactactacaaatctttcacaagatcatcttatttcttcgacaata
caagaaccacatacatcaaatcaagattaccaacagttcaattctaagttgattggatta
aaacgtcaaccaggttattggcctattcaacattgtcgaatattagtaaaagtgatacag
aaaatgacattagatggaatggaatggacagaattcgaaacagttaatcgtgaatattat
ccagctataatatctaaaaccgacacaatcaatgacaatgttgttgttcgagctcgtgga
ctaccatggcaagctacagatttggaaatatttcagtttttcagtggtataaatattgct
aaaggtggtatatcattagtattgagtaagattggacgtagaaatggtgaagcactaata
caattcgcagatgcagaacaacaaagtttagctttaagaaaacataaacatcatgttggt
aaacgatatattgaagtttatgctgcaactggttctgatttcatttcgatagctggaggt
gaatctcaagaggcaatgaattttttgggaaagttaacaacacctaatcagacattgatt
cgaatgcgtggtttaccttatacaacaacaccggaacaaattgtaagatttttgtgtata
ctaataaagattgtgcaatttaatgctaatgggattctttttgttaataaacctgatgga
cgggcaactggtgatgcctttgtcatctttgagacaaaaattgtagctgaaaaggcactt
gaaaataataaacaacatattggtagtcgttatattgaattgtttaaatcgactccagct
gaagtcaatcaggtgatgaatagtattttaagttcaacttgtgaagaacaaattcattgt
tggaataatcatttaacagaatgtaataattctgtatttactgcaaataatagtagtgtt
tacatgccacatttcactgaaaccaataataatttaatttattcagattacaatttgaaa
ttactgtctaatccatcaactattccagaatttacatattctccacatctaatttcaggc
caacctatcggtgaagctatgattcaatttgtaacagaattatccgctcaaactgtttgc
gaacaaaagcataaaagtattttcattaaatatggattaccaattccagtcggtgcatat
gttgatgtaattcaatgtacaagagaagatttaaatcacctattatctaatatgtcaaga
aatattggaatatttacaaataacctcatttcatcatcatcaacctcaacgttgtctaat
ctaatgaatccaataattttaactcagttgcataatttagatgatattactactatgcta
aaatcatcaataccattacagtcaggttatggtattgaacaaactaattttttacatata
aaaactccggaatttcgcttgaatccatttattagtaacgaagaattgagcaatttcaat
gtgctaccaccaacattaccaaatttaccaaattatatcactggaataaacagtacattt
tcatttccaacacctttaattgataataatataactaatgcattaattcagtgtactcct
ccattatcaaatatgctaggatttcaaataccaaatttgatttatcaaacgtcatttccg
aatttctttacaaacaattcattattaaataatcatgaatcgactgaactactttcaact
tcaatcccctacttaacgaattgtcataagaacaaaaataacaatatcagtaatggttac
aacttacccgaattcgaagggaattctgattgggcaaattcatggtcaaataatcataag
gcagagcaaataacaattatgaatagtcctgaaatgcaggtgtttaagacaaatgatctg
gtcgcttccaaaacagaaaataaaccaataattgtaactgttcaaggctttccaaaagaa
atgaccccaaatgattttacaaaatggttggagaaaaaaattaacaatgtaaaaatatta
tctgtacaattcgaacactctttattgaatgaaatatctaatggctttgctaaagtttat
ctacaacataattcagatgcggaattaattgtccaagaatttaacaatacaacattgaac
aattctcgaattagcgcacaaatcaattga

DBGET integrated database retrieval system