Solibacillus sp. R5-41: CSE16_01005
Help
Entry
CSE16_01005 CDS
T05144
Name
(GenBank) class II histone deacetylase
Organism
sob
Solibacillus sp. R5-41
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hist_deacetyl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATP38722
UniProt:
A0A2D1SNM2
LinkDB
All DBs
Position
complement(204203..205324)
Genome browser
AA seq
373 aa
AA seq
DB search
MKKTGFICDESYFWHDTGNGALFMQPGGYIESDVHSENPATKRRFKNLLEVSGLMEKLEQ
VKPRPASVEEIKFFHGESYINKVKELSAIGFGDAGDLALVGKGSYEIALLSAGGAITAVE
AVVSGQVDNAYALTRPPGHHAEADLGMGFCLFNNVAIAAKYARNVLGLERVMVLDWDVHH
GNGTESAFYDDPNVLFVSLHQERLFPPGRGNAEDIGTGEALGRTVNIPLPAGTGNAGYLH
ALQEVVGPIADQFKPELIIISAGQDAGMFDPLARMMVNAEGFRQMTRFMLDLANKHCEGK
LVACHEGGYSAAYVPFCSLAIVEEMSGQRTDVNDPFAEAFSGLPIEELFDIQKDYVAKVK
EVQSAHWNLAVKA
NT seq
1122 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaacaggatttatttgtgatgagagttatttctggcatgatacaggaaatggt
gcgttatttatgcaacctggaggatatatcgaaagcgatgttcactcagaaaatcctgct
acaaaacgacgctttaaaaatctacttgaagttagtggattaatggaaaagttagaacaa
gtaaagcctcgccctgcatctgttgaagagattaaattcttccatggtgaatcgtatata
aataaagtaaaagaattaagtgcgattggatttggagatgcaggtgatttagcgcttgta
ggtaaaggatcttatgaaatcgcattgttatctgctggtggagcaattacagcagttgaa
gcagttgttagcggtcaagttgataacgcttatgctttaacgcgtcctccaggtcaccac
gcagaagccgatttaggtatgggattctgcttattcaataatgttgctattgcagcaaaa
tatgctcgtaatgtacttggtcttgaaagagtaatggttctcgattgggatgtgcatcac
ggtaatggtacagaatcagctttctatgatgatccaaatgtattgtttgtttccctacat
caagagcgattgttcccaccaggacgtggaaacgcagaagatatcggtacaggtgaagct
cttggtcgcactgtaaacattccactccctgctggaacaggtaatgctggatacttacat
gcattacaagaagtggtaggacctatcgctgatcaatttaaaccagagttaattattatt
tcagcaggtcaagatgctggcatgttcgaccctcttgcacgaatgatggtgaatgcagaa
ggtttccgccaaatgacacgctttatgcttgatttagctaataaacattgcgaaggtaaa
ctcgttgcttgtcacgaaggtggatacagtgcagcatacgtaccattctgttctttagcg
attgttgaagaaatgagtggtcaacgaacagatgttaatgatccatttgctgaagcattt
agtggccttccaatcgaagaattatttgatattcaaaaagattatgtagccaaagtaaaa
gaagtacaatcagcacattggaaccttgctgttaaggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
