Streptococcus pneumoniae R6 (avirulent serotype 2): spr1093
Help
Entry
spr1093 CDS
T00060
Name
(GenBank) Conserved hypothetical protein
Organism
spr
Streptococcus pneumoniae R6 (avirulent serotype 2)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YxiJ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAK99896
UniProt:
Q8DPM8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1087705..1090890)
Genome browser
AA seq
1061 aa
AA seq
DB search
MEDDLNYENLMDDVTEAIKKFNLVIFIGAGVSIAQGYPNWNNYIEHLIKYWQGQVLSVSG
EKRLGREHHVVFDLISKSSISNKRKVDLVNYELKKVFGEDFEKRRLDFEKGYFKNLLPYS
IVNQTVESLASLNAIFITSNYDYEIENHIKRLKNAVVTINDLNEFTKNKNGKLQFGDVLH
IHGTPDCDVKYFVSSSADYSKTYLKNRENFENLVTWFKETKPTVLFVGAGLEEDEILSLL
CKDSKNYALMKSENTGNQRVDEHYRGVVEGFFSSENHTQIIWYGDEFEKLPLFVKKLVAD
INEKLGTHDFYNQWNNLLNPSINQEEYNKNLDSISNDFKYLSSVLDKVIENDNNQLDQLM
LNALLRSETLTVIKKNFVLAFWRFIVKNIEKLSDNEWDVIYKIIYEGSQNYFIDDVFFVY
NYAIDNKISSFTNNNKLNELREIISKDGYIVNSNFNKDKTLLGYWLVSAFEQQNRDLYIK
EDSEVEVNLNYECVNKLMSILNNPEFLSYNYYSIEHQLKEYDVVKFLYELVKSKKLFIEE
EKFLESDSEDLISTILIQKLLVQLDNEINLDLEFIKRLIDKIDFSNIHFGEELNTFIKEH
RSIIREKNIEIPKKPYRNWISSLEGGFVSQFSYLTQENLVEYDESRVLEILVNAEKEQRG
SSFLEEKTINETENFFITVLKESNEISKKVSDLLKNHIDDLYPKYKRLYVKIISFPEIEE
NLRKIVREKYLKRFNKESFDSNDRKFFEYHIKQQNTDIDIFEKLLSINVNELSTPKGDNK
QLDILHFINSEMGSYFQCLISLFINHSSYRDVIIQIINSVTDTDYREFAQGILLNEYNPN
RINVTYNTFLGFAYYHSIITIEAADVFTDVVRDILNKKIEDNQILNKVYLVALERVDPTI
ESFSLSKNNYSQMINIIFTGDYEFRYSKEWLGALFKFDSSANYLVTIFYLLYNENLKKNR
FALFIEELSDYLTTYNQKLSLRGMNYKLNHEELNNFDLLKKMFLKLMETDKIENDIFYLD
GIKSILPLLSLDDRRNVLQHIQKQNNCPPPEIEELQRIIVN
NT seq
3186 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatgatcttaattatgaaaatttgatggatgatgtaaccgaggctataaaaaag
tttaacttagtaatttttattggcgcaggagtttcaattgctcaaggttatcctaattgg
aacaattatattgaacatcttattaagtattggcaaggacaagttttatcggtaagtggt
gaaaaaaggcttggaagagaacatcacgtagtttttgatttaattagcaaatctagtatt
agtaataaacgtaaagtggatcttgtaaactatgaattaaaaaaagtttttggtgaagat
tttgaaaagcgacgactagattttgaaaaaggatattttaaaaatctattaccatattca
atagttaatcaaacagtagaatctttagcaagtttgaatgcaatatttattacttctaac
tacgactatgaaattgaaaatcatattaaacgtttaaagaatgctgtagttactattaat
gatctcaatgaatttactaagaacaagaatgggaaactacaatttggtgatgttctacat
atccatggaacaccagattgtgatgtaaagtattttgtaagttcatccgcagattattca
aaaacctatttaaaaaatagggaaaattttgaaaatttagtaacatggtttaaagagaca
aaacctactgttttatttgttggagcaggtcttgaagaagatgaaattttatctttactt
tgtaaagatagtaagaactatgccttgatgaagtcagagaacacaggtaatcagagagtt
gatgaacattatagaggtgttgttgaaggattttttagctcagaaaatcatactcagatt
atttggtacggagatgaatttgagaaactacctctttttgtaaaaaaattagttgctgat
attaatgaaaaattgggcacacatgatttttataatcagtggaacaatcttttgaatcct
tctataaatcaagaagagtataataaaaatctagatagtatttctaatgattttaagtat
ctaagctctgttttagataaggttattgaaaatgataataatcaactagatcagctaatg
ttaaatgctctgcttcggagtgaaactctaacagtaattaaaaaaaattttgtccttgca
ttttggaggtttattgttaagaatattgaaaagttaagtgataatgagtgggatgtgatt
tataaaataatttatgaaggctctcaaaattactttatagatgatgtattctttgtctat
aattatgcgatagataataaaatttctagttttacaaataataataagcttaatgaactg
agagaaattatatccaaagatggatatatcgttaattctaactttaataaagataaaact
cttttgggttactggctagtaagtgcttttgaacagcaaaatcgtgatttatatataaag
gaagatagtgaagtagaagttaacttaaattacgaatgtgttaacaaattaatgtccata
ctaaataatccagaatttttaagttataattactactctatagagcatcaattaaaagag
tatgatgttgttaaatttctttatgagcttgtaaagtccaaaaaattatttattgaagag
gaaaagtttttagaaagtgattctgaagacttaataagtactatattaattcaaaaattg
cttgttcaattggataatgaaattaatttggatttagaatttatcaagaggttaattgat
aaaattgatttttcaaatattcactttggagaggaattaaacacttttatcaaagaacat
agaagtattattagagaaaaaaatattgaaataccaaaaaaaccttatagaaattggata
tcttcactagaaggaggttttgtttcacaattttcatatttaactcaagaaaatcttgta
gagtacgatgaatctagagtattagagatattagtcaacgccgaaaaggaacaaagaggt
tcttcatttttggaagaaaagacgataaatgaaacggaaaatttctttattactgtttta
aaagaatcaaatgaaatatctaaaaaagtttctgatttattgaaaaatcatatagatgac
ttatatccaaaatataagagattatatgtaaaaattatcagttttcctgaaatagaagaa
aatttgagaaagattgttagagaaaaatatttaaaaagatttaacaaagaaagttttgat
tctaacgatcggaaattctttgaatatcatataaaacaacaaaatacggatatagatatt
tttgaaaaattacttagtatcaatgtgaatgaactctcaacaccaaaaggtgataataaa
caattagatatacttcattttataaatagtgaaatgggatcatattttcaatgtttaata
tcattatttataaatcattcaagttatagagatgtaattattcaaataataaattcagta
acagataccgattatagggagtttgctcaaggtattttattaaatgaatacaatccaaac
agaatcaatgtaacttacaacacctttttaggatttgcgtattatcattctataattact
atcgaagctgcggatgttttcacagatgtagtaagggatattctaaacaaaaaaattgag
gacaatcaaattcttaataaagtttatctagttgctttagagagggtagatccaactatt
gaatcattttctttatcaaagaataactatagtcaaatgataaacatcatttttacagga
gactatgaatttagatattctaaagaatggttgggagcattattcaaatttgactcaagt
gcaaattatttggtgacaattttttatttattatataatgaaaatcttaaaaaaaataga
tttgctttgtttatagaggaattgagtgattacttaacaacttataaccagaaattatct
ttacgagggatgaattataaattgaatcatgaagaacttaacaattttgatttgttgaaa
aaaatgtttctgaaattaatggagaccgataaaatagagaatgatattttttatttagat
ggcatcaaaagtatactcccattattatctttagatgacagacgaaatgtattacaacat
attcaaaaacagaacaattgtcctcctccagagattgaggaattacaaagaattatagtt
aattaa
DBGET
integrated database retrieval system
