Streptococcus thermophilus LMG 18311: stu0237
Help
Entry
stu0237 CDS
T00213
Symbol
snf
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase
Organism
stl
Streptococcus thermophilus LMG 18311
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
AAA_22
HDA2-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAV59961
UniProt:
Q5M643
LinkDB
All DBs
Position
241081..244176
Genome browser
AA seq
1031 aa
AA seq
DB search
MAKLIPGRVRNEGIKLFEKGLIAISQVSETQLDTTVGQHHLIYALDDPEIMCDCDFFAQK
GYCSHLAAVEYYLKNAKEGQRLLAKLEEKQESAQDQERGRSFGGLFLESLSLNEDDTVRY
SLTVEGEESTFGSEIWWSLRLRRLPDERSYVVRDIPAFLKLIETEGYYQIGKNYYEPLSL
IQFDQASQAFLDFLGRMIPDEAKTNLTFILPNNARHLNLPYGFFEEGLRLMQDLDGFRFE
WEGIEYRSFLVEDLTAEANLFSFDICVEPKMIELTVTEKNSQIFFNNRIIFYQGVFYRLN
RKQQKILLGLRSLPIGSDLNKHVSFNLEEQAILAASLSDFKTMGPVKAPKAFNIKDFTPR
FRFDLKGEREVVLTLAFDFDGYVVDNRYELSHLGFTSNYRNEQAIFRLMVKHGFTPDFQS
SKRLNSNQELYDFFINTLPAFENAGPVSIGQELRDLRVEQSPQIQVERQGNLLEISFDFS
SLDDEDVDHALEALMDRAPYFVNRSGQLIVFDEGTQRISESLRTLRARYSGEGHLELHQL
AAYQLMDSLSENDSVRFSEDFQQLAQHLRKPEKFDLPSYHVEVDLRPYQERGVQWLSMLH
HYGFGGILADDMGLGKTLQTIAYLSAHLEDGQRVLILSPSSLIYNWQDEFKKFAPQLDVA
VSYGLKPKRDEIIAEDHQIIITSYASFRQDFDVYKAGQYDYLILDEAQVMKNTQTKIAQY
LRDFSVPHCLALSGTPIENHLLEIWSIFQIVLPGLLPAKKTFLKLTPMEVARYITPFILR
RKKDEVLPDLPDLIEITHQSELSDSQKAIYLAQLQQMQQGLISASDQEINRRKVEILSGI
TRLRQICDTPALFMDYAGDSGKLDSLRDLLSQIKESDHRVLIFSQFRGMLDITEELLQEL
GISSYKLTGSTPSDSRQEMTRAFNQGSRDAFLISLKAGGVGLNLTGADTVILIDLWWNPA
VEMQAISRAHRIGQKQNVEVFRLITRGTIEEKILELQEGKKNLVTTVLDGNESCASMTVE
DIKEILGIAIS
NT seq
3096 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaaattgattccgggtagagtccgtaatgagggaattaaactttttgaaaagggt
ttaattgccattagtcaggtctcagaaactcagttggacacgacggttggccaacatcat
ttaatttatgcactcgatgatcctgaaatcatgtgtgactgtgattttttcgctcaaaaa
ggctattgctcccatttggcagcagttgagtactatctaaaaaatgctaaggagggccag
cgtctcttagcaaaattagaggagaaacaagagtccgcccaggaccaagagcgggggcgt
tcttttggtggtttatttttagagagcctttctctgaatgaggatgatacagttagatat
agcctcacggtagagggagaggaatctacctttggttcagagatttggtggagtttacgt
ttacgtcgcttaccggacgaacgttcttacgttgttcgagatatcccagccttcctcaag
cttatagagactgaaggctattatcagataggtaagaattactatgaacctctatcactc
attcagtttgaccaggcttcacaagcatttttagactttttaggacggatgattccagat
gaagccaaaacaaatttaacctttattttaccgaataatgcacgacaccttaatctcccc
tatggtttttttgaggagggattgaggttgatgcaagatttggatggcttcaggtttgaa
tgggaaggtattgaatatcgcagctttttggtagaggacttgactgctgaagccaatctt
ttctcgtttgatatttgtgtcgagcccaaaatgattgaattgactgttactgagaaaaat
agccaaatattttttaataatcgtattatcttttatcagggtgttttctatcgtcttaat
agaaaacagcaaaaaattttgcttggcttacgttctctccctatcggaagcgatttgaat
aaacatgtcagttttaatctagaagaacaagctatcttagctgctagtctttctgatttt
aagactatgggaccggttaaagccccaaaagcgtttaatatcaaagatttcaccccgaga
tttcgctttgatttgaaaggtgaacgcgaggttgtgctcacattggcttttgattttgat
ggatatgttgtggataatcgttatgagttaagtcatttaggctttactagtaactatcgt
aatgaacaggctatttttcgtttgatggttaaacatggatttacccctgattttcagtca
tctaaacgcttaaatagcaatcaagagctctatgatttctttataaatactctaccagct
tttgaaaatgcagggccagtttctattggacaggagttgcgtgacttacgtgttgaacag
agtccacaaattcaggtagagcgtcaaggaaatctattagagatttcgtttgatttttca
agtctcgatgatgaggatgtggatcatgctttagaagctttgatggacagagcgccctac
tttgttaatcgtagtggtcagttgattgtctttgatgaggggacacaacgtatcagtgag
agtctaagaactttgagggcccgttattcgggggaagggcatctagaactccatcaatta
gccgcctatcaattgatggactctctttcagaaaatgattctgttcgtttttcagaagat
tttcaacagctagcgcaacatttgagaaaaccggaaaaattcgacttgccatcctatcat
gtagaagttgaccttcgtccttaccaagaaagaggagttcaatggctatcaatgttgcat
cactatggttttggtggtattttagccgacgatatggggttggggaaaactttacagacc
attgcttatctttctgcacatttagaggatggacaacgagtcttgattctatcgccatcg
agtttaatttacaattggcaggatgagtttaaaaaatttgctcctcagttagatgtagca
gtttcttatggacttaagccaaaacgtgatgagatcattgcagaagaccatcagattatt
attactagctatgcttcattccgtcaggattttgatgtttataaggctggtcagtatgat
tatctcattctagatgaggcacaggtcatgaagaatactcagacgaagattgctcaatat
ttacgtgatttttctgttccgcattgcctagctctatctggaacgcctattgaaaatcat
ttgttggagatttggtctattttccagattgttttaccggggcttttaccagctaagaaa
acttttcttaagctaacacctatggaagtggcccggtacattactccatttattcttaga
cgtaaaaaagatgaggttcttcctgatttaccggacctgattgaaattacacaccaaagt
gaattgtcggatagtcaaaaggctatttatttagcacaattgcaacagatgcaacaaggt
ttaatttcagcaagtgatcaggaaatcaatcgtcgtaaggtggaaatcttgtcaggaatt
acccgcttacgccaaatctgtgacacgccagccctctttatggattacgctggtgatagt
gggaaattagatagtcttagagacctacttagtcaaattaaggaatcagaccatcgtgtc
cttattttttcacaatttcgtgggatgttagatattacagaggaacttttacaagagtta
ggtatttcctcttataagctaacagggtcgaccccatctgatagtcgtcaggagatgacc
agagccttcaatcaggggagtcgagatgcctttttgatttctttaaaagcagggggggta
gggctcaacttgactggtgctgatacagttattctgattgacctttggtggaatccagcg
gtggaaatgcaggctattagtcgtgctcatcgtataggtcagaaacaaaatgtcgaagtt
ttccgtttgattacaagaggtactatcgaagagaagattcttgagcttcaagaaggtaag
aaaaatctcgttacaacagtattagatggcaatgaaagctgtgctagcatgacagttgag
gatattaaagaaattcttggtattgcaatatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system