Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 (MSSA): ST398NM01_2024
Help
Entry
ST398NM01_2024 CDS
T02043
Name
(GenBank) Transposase
Organism
sud
Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 (MSSA)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_integrase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFH70162
LinkDB
All DBs
Position
complement(1916749..1918812)
Genome browser
AA seq
687 aa
AA seq
DB search
MSIPINLPTNSTLINELCTLQSRTINIKGEVLITEIYDDYFLKNDEWHISAFNKFKQFQD
SIKNYKDKRKNIFFRIKSKNLNLEFKYLFLKLIVKEDWSLSNVFNTGAVKLNKIAEFFNE
VYPNLNSLLDCDINMLEKYWFSWLTKNNIPIKRKSSTIVFGDYEYKSALASFLKNMYINL
NKFIDKREEWEKDKWDIRNLEKYGLSYNKTLTGNYLNFEKIESIKMREAAKIYLKNRLIT
GDIAFATARFYIRVLTRFFQNISKNKETRNSLNELDRCHIEAYIEFLFEYATNKNLQSTK
NFVREELKTIRRFLNDIITQNYAIAPYQDIRFLIYPQDLPKHEKKNSSQIDYIPDFVLEQ
LFEHINDLHKDLIPVVWIAFKTGLRISDVLTLKNNCLAKVNGKFSIITDIAKTFVKGHRI
PIDNELADIVAVLIANSKIKSTKDNNPNNYIFAIYKGKRKGMPFTQHMVRAHLNHLAKTK
NIVDEQGEIFHFKTHQFRHTYAVKLLNGGADILTIQELLAHASPEMTLRYAKLLDDTKRK
AFESVIDQGAFSFDVDGKIKNIQHSSELSEKALNSLWQEHKLNAMDNPYGTCHARLSGDC
PYMEAPPCLTCNSGKPCKDLAIGFSDLDVEKYELHIKSTVKSIELAKNNNRQDMVEKHTN
ILNKYEEILGNIKDGNIIFGRSNRIKV
NT seq
2064 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaataccaattaatttacctacaaacagtactctgattaatgaattatgtacatta
caaagtagaactataaacataaaaggagaagtgttaataactgaaatatatgatgattac
tttttaaaaaatgatgaatggcacatttcagcttttaacaagttcaagcaatttcaagat
agtatcaagaactataaagacaaaagaaaaaatattttctttagaattaaaagcaaaaat
ttgaatttagaatttaaatacctttttttgaaacttatagttaaagaggattggtcttta
tctaatgtatttaatactggagcagtgaaacttaacaagattgctgagttctttaatgaa
gtttatccaaatttaaattctttactagattgtgatattaatatgctagaaaagtactgg
tttagttggttgactaaaaataatatacctataaaaagaaaatcatcaacaatagttttt
ggtgattatgaatacaaaagtgcactagcttcttttttaaagaatatgtatattaatcta
aataaatttattgataagcgagaagaatgggaaaaagataaatgggatattagaaattta
gaaaaatatggattgagttataataaaacactaactggtaattatttgaactttgaaaaa
attgagtcaattaaaatgcgagaagcagcaaaaatatatttaaaaaatcgtttgataact
ggtgatatagcatttgctacagcaaggttttatataagagttttaactaggttttttcaa
aatatatctaaaaataaagaaacaaggaatagtttaaatgaactagatagatgtcatatc
gaagcatatatagaatttttatttgaatatgcaactaataaaaatttgcaaagtactaag
aactttgtgagggaagaattaaaaacaattagaagattcttaaacgatattataactcaa
aactatgctatagcaccgtaccaagatatacgatttttaatttatccacaagacttacct
aaacacgaaaagaaaaatagtagccaaatcgattatatcccagattttgtattggaacag
ctttttgagcatataaatgatttgcacaaagatttaatacctgtagtttggatagctttt
aaaacaggactaagaatttctgatgtattaacattaaaaaataattgccttgcaaaagtt
aatggaaagttttcaataatcactgatattgctaaaacctttgttaaaggacataggata
ccaatcgataatgaattagctgatatagtagcagttttaatagccaattctaaaattaaa
agtacaaaagataacaaccctaataattatatttttgctatttataaaggaaaaagaaaa
ggaatgccttttacacaacatatggtcagagcacacttaaatcatttagcaaaaacaaaa
aatattgttgatgaacaaggagaaattttccatttcaaaactcatcaatttagacatact
tatgcagtaaaattactaaatggtggagcagatatattaacgatacaagaattattagca
catgcctcaccagaaatgactctcagatatgctaagttacttgatgatacaaaaagaaag
gcttttgaatcagttattgatcaaggggcttttagtttcgatgttgacggtaagattaaa
aatattcagcatagtagtgaactatcagaaaaagcattgaattctttatggcaagagcat
aaattaaacgcaatggataatccttacggtacttgtcatgctagattgagtggtgattgt
ccatacatggaagctccgccatgcttaacttgtaattctgggaaaccatgtaaggattta
gctattggtttttctgatttagatgtggaaaaatatgaattacatatcaaatcaacggtc
aaatctatagaattggctaagaataataataggcaagatatggttgaaaagcatactaat
atattgaataaatacgaagaaatattaggtaatataaaggatggaaacattatattcggg
agaagtaatagaataaaagtatag
DBGET
integrated database retrieval system