Treponema primitia: TREPR_1884
Help
Entry
TREPR_1884 CDS
T01507
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
tpi
Treponema primitia
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4116
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF84389
UniProt:
F5YL47
LinkDB
All DBs
Position
complement(2366628..2369609)
Genome browser
AA seq
993 aa
AA seq
DB search
MNEYFEFEDGTFWAARSLGNQFFIEQGEINNYLDPECMVYDTDSNPRYHSVLIKTFSNEK
EVESEGQQEANEKAKTALLKDALFWEEALFRNPLLLFFMPSELKTSELCLKLVKRNGLVL
RYIESEKKSELPCFYAVRENPRALEFVPDQIKCCGVPGIKLCMMAVKDYGKTLQFVPESV
KSEGSQGIEICKLAVFSDGYALRYVPEKLKDKDLCINAVKNNAFAINYVPQKLKTKQLCG
LVFKSKQRNWGYFDKDIPPLLSSVPEEYISKEMCFEAVDIDPPSLKYVPNKFLNDKVFIK
KLYKVAVERNGCEALKHIPANFIDSELCILAVNYPIDIDINLIPEQFRTRQLYLDAIKND
QCADVIKQIPEEFKTFDFYHDAVKLNGNALQYIPLKYQNEEMYFDAVRETGCAIKFVPLE
YQTAKLALEAIKHEKYGMAFSYIKDNLKTKKMCYDVIKKNGLMIQDVPKKYLTKSFCLLA
VKNHFNVFKYLPREFKTEEFALAAVSKFSMGLQEIPEELRTKKVCLKAIKNSSLDKNVLK
YVPEKYLTPNFCLKTVNQSPDSLKYIPEHFKSLGLCFAAVLAGKWEGNVLSYIPNEIKTR
TFCMMAIKIDRGNLKNIPDEYRTKDLYVNLVKNDGLALKYVPGNYINKEMCLSAVKQNGY
ALADVPVSFQDAKLCLAAVQNDFNAFGFVNKAYLTQELCFAAIQDWTAGLVFRQIPDEFK
SFELCLKALQKCYYMVGISQEITDYLREHYNIPNLLIDMVQTNAFVLEVLTPEDKTYDLC
LKAVQQNGKVLEYVNEEFMDFNLCYSAVSEEGVALQFVPKNLVNKELCLRALQNNPYALK
WIPSHYLNTEIIIDAIMREGTNLQYINEDQRTIELCKIALEQNPYALEFIPEQFKSDGPE
AFDLHFSAVSREGYTLNYVPKQLRTSELCLMAVQNSSIALEFIPAKMRTPNIYAEAFKSN
KFDLNIFKDLTFSVKQYEKLYMELLSIYKDDLK
NT seq
2982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaatattttgaatttgaagatggtacattttgggcggctcgttctcttggcaat
caattttttatcgaacaaggtgaaattaacaattacctggatccggaatgcatggtttac
gatacagatagcaatcctcgctatcattctgttttaatcaagactttctcaaatgagaaa
gaagttgaatctgaaggacagcaggaagctaatgaaaaagctaaaactgctcttttgaaa
gatgctctcttttgggaggaagcgttgttcagaaatcctctgctgcttttttttatgcca
tcggaacttaagacatcagaattatgtttgaagcttgttaaacgcaatgggttagttctg
cgatatattgaatctgaaaaaaaatcagaattgccttgtttttatgcagtacgtgaaaat
cctcgtgcacttgaatttgtacctgatcaaattaaatgctgtggggtacctggtattaaa
ttatgtatgatggctgtaaaagattacggtaaaacattgcaatttgttccggaatctgta
aaatcagaaggatcacaagggattgaaatttgtaaattagcggtattttccgatggttat
gccctacgttatgtccctgaaaaattaaaagataaagacttatgtataaatgctgttaaa
aataatgcttttgccattaactatgtacctcagaaacttaaaacaaaacaattgtgcggg
ttagtattcaaatctaaacaaagaaattggggttactttgataaagatatacctccgctt
ttaagttcagtccctgaagaatatatatcaaaagaaatgtgttttgaagctgttgatatc
gatccaccttctttgaagtatgtacccaataaatttttaaatgataaagtgtttattaaa
aaactttataaagtagctgtggaaaggaatggatgtgaagcattaaagcatatacccgcc
aattttatagattcagaattatgtattttagcagttaattaccctattgatattgatatt
aatttgattcccgaacagttcagaaccaggcaattgtatcttgatgcaattaaaaatgat
caatgtgctgatgttattaaacaaattccggaggaatttaaaacctttgatttttatcat
gatgcggttaaacttaatggtaatgcattacaatatattccgttaaaatatcaaaatgaa
gagatgtattttgatgctgtacgagaaacaggatgtgctataaaatttgtgcccttagaa
tatcaaactgctaaacttgctcttgaggcaattaaacatgagaaatatggcatggcattt
tcttatattaaggataatcttaaaacaaaaaaaatgtgttatgatgtcataaagaaaaat
ggactaatgattcaagatgtaccaaaaaaatatctcacaaagagtttttgccttcttgcg
gtaaagaatcatttcaacgtttttaaatatttaccacgtgaatttaagacagaggaattt
gcacttgcggcagtaagtaaattcagcatgggattgcaggaaattccggaagaattaaga
acaaaaaaagtatgtcttaaagcaataaaaaattcgtcattggacaaaaatgtacttaaa
tatgtaccagaaaaatacttaactccaaatttctgtttgaaaaccgttaatcaaagccct
gatagtttaaaatatatacccgaacatttcaaaagcttaggactgtgttttgctgcagtt
cttgcaggaaaatgggaaggaaatgttttgagttatatccctaatgagataaaaaccaga
acattctgcatgatggctattaaaatagacagaggcaatttaaaaaacattcctgatgag
tataggacaaaagacctttacgtgaatttagttaaaaatgatggtttagcattaaagtat
gtacccggtaattatattaataaggagatgtgtttatctgctgttaaacaaaatggctat
gcattagccgatgttccggtttcttttcaggatgcaaaactttgtcttgctgctgtacaa
aacgatttcaatgcttttggatttgtcaataaagcatatttaactcaagaactgtgtttt
gcggccattcaagattggactgccggactggtttttagacaaattcccgatgaatttaag
agttttgaattgtgcttaaaagctctacagaaatgttattatatggtgggtatttcacaa
gaaataactgattacctccgtgagcattataatatacctaatttgttaattgatatggta
caaactaatgcatttgttcttgaagttttaacgcctgaagataaaacatatgatctatgt
cttaaagcggtacaacaaaatgggaaagttttagagtatgtaaatgaagagtttatggac
tttaatctttgttattccgctgtctctgaagagggtgtcgcacttcaatttgttcccaaa
aatttagttaataaagaattatgtcttcgggcactgcaaaataatccttatgcattaaag
tggattccttctcattatttaaataccgaaattattattgatgcaattatgcgtgaagga
actaatctacaatatattaacgaagatcaaagaactattgaattatgtaaaattgcacta
gagcagaatccatatgcattagaatttattcctgagcaatttaaatcagatggaccagaa
gcttttgatttacatttctccgcagtaagcagagaaggatatactttaaattatgtacct
aagcaattgcgaactagcgaattatgtctcatggcagtacaaaattcatcaattgctttg
gaatttatccctgccaagatgcgtactccaaatatttatgcagaagcttttaaatcaaac
aaatttgatttaaatatttttaaagatcttacattttccgttaaacaatatgaaaaactc
tatatggaattattatcaatctataaggatgatttgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
