Trichinella spiralis: Tsp_02151
Help
Entry
Tsp_02151 CDS
T01609
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
tsp
Trichinella spiralis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CC
EB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
10907470
NCBI-ProteinID:
XP_003377887
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
698 aa
AA seq
DB search
MKTLLAFCLSINGTLSEKNGKWQKYECKGRSIKDCMEMAANLTHLDSVQNDFDVDYDMLA
NYNAKRISAPYAMSFANVARPSEGRCKVTEPAIPGGPCCLEAFSRLEPDLKYPQYYLQCS
STQKDDEMGQWVRMQCPDGLVFDSPSQMCINSISASAQGSGSGRKIPSEYNNANLNPFST
MSQNYLRPSYTSCPDGSTAKLNCLNGQCPTGQKCINNLCCEISRNVCDDGTVGIKSCTKN
EECTLGYYCAQNKRLCCRLRTSMNNPRSFTYALSIVHMYIEGTCPDGTAALAYPTKCTSN
TQCPMKCYCALHLNSCCVLPVVPPPQPANFRFCPDGSPATSISCTVDSTCPNGYYCPGSL
GYCCRIPSNTGICPDGSAPTHTCTHGQCMPDYVCLGGVCCPQLTNKLPCLDGSQPIGLCI
NGRCGNGFVCTDGNYCCRQISSPGLPRCADGSTAFCQCSNGRCPMGLTCTDKNICCPQSQ
GIAKLCPNGLQPQGKCVKGQCGPGFTCTADNVCCPVSIIPGLCPDGKQPAGACINGLCGA
GFTCLAGANICCTGATQPTCPAGTMYYGLCVNSLCPDGMQCISGQCCGPPTTSKAFLTSD
TGSGSNVRMLGVPIAKSPGSKCTNSEECNGAKSKLASCHNQLCTCLTPAKPMRGTCVLRP
PPKASGQCIVRVRNPTEQCMLITSGMAIDRKYRFLDAS
NT seq
2097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactttattagcattctgtttaagcattaatgggactctgtctgaaaaaaatgga
aaatggcaaaaatacgaatgcaaaggtcgttcaataaaagactgcatggaaatggcggcc
aacttaacccatctggacagtgtgcaaaatgattttgatgttgattatgacatgctagca
aattataatgcaaaaagaatcagtgccccatatgcaatgtcatttgcaaacgtagctaga
ccttcagaaggacgatgcaaagtcactgaaccagcaattccaggtggaccgtgttgctta
gaggcgttcagcaggctggaaccagatttaaaatatccccaatattatttgcagtgttca
tctacacaaaaggatgatgaaatgggacaatgggttcgaatgcaatgccctgatggtttg
gtgtttgatagccctagtcaaatgtgtattaacagcatcagtgccagtgcgcaagggtct
ggatcagggagaaaaattccatcagagtataacaatgcaaacctaaatccatttagtacc
atgtcacaaaattatttaagaccaagctacacttcttgtccagatggtagcacagcaaaa
ttaaactgcttgaatggtcagtgccccactggacagaaatgcatcaacaatttatgctgt
gaaatatcaagaaatgtttgcgatgatggcactgttggcataaagagctgcacaaaaaat
gaagaatgcacactaggatattattgcgcgcagaataaaagattatgttgtcgacttcgc
acttcaatgaataatccaaggtcttttacttatgcattaagcattgtgcacatgtacatt
gaagggacttgtcctgatggtacagccgctttggcttacccaacgaaatgcacaagtaat
acacaatgtcctatgaagtgctattgcgcacttcatttaaactcttgctgcgtgctgccg
gttgtaccaccgccacagccagctaactttcgattttgcccagatggttcaccagcaact
tcaattagctgtactgtggatagcacatgcccaaacggctattactgccctggtagcctt
ggctattgctgtcgcattccttccaatactggtatatgccctgatggaagtgcgcccaca
catacatgcactcatggacagtgcatgcctgattatgtttgtcttggtggcgtctgttgc
ccacagttaacaaacaaattaccttgtcttgatggtagtcagcctatagggttatgcatc
aacggacgctgtggaaatggctttgtatgtactgacggaaattactgctgccgacagata
agctcccctggactgcctcgatgtgcagatggtagtacagccttttgccagtgttcaaat
ggtcgatgtccaatgggtttaacctgcactgataaaaatatttgctgtcctcaatcacaa
gggatcgcaaaactttgtccaaatgggcttcaacctcaaggtaaatgtgttaaagggcaa
tgtggacctggttttacatgcactgctgacaacgtctgctgccctgtttcgattatacct
ggactatgtcctgatgggaaacagcctgctggagcttgcattaatggtttatgtggagct
ggctttacttgtttagccggcgcaaacatatgttgcacaggtgcaactcaaccaacttgt
ccagctggtacaatgtattatggcctttgtgtaaacagcttgtgtccagatggcatgcaa
tgcatttctggacaatgttgcggacctcctacaacttcgaaagcattcttgacatctgat
actggatcaggaagtaatgtcagaatgttaggagttccaattgcaaaatcaccaggaagc
aaatgcacaaattcagaagaatgcaatggagccaaaagtaaattagccagctgtcacaat
cagctgtgtacttgcttaacacctgcaaagccaatgagagggacttgtgttcttcgtcca
cctccaaaagcatcaggacaatgcatcgttcgggtcagaaatccgactgaacagtgcatg
ctgattacatctggtatggccatagacagaaaatatcgctttctggatgcaagctga
DBGET
integrated database retrieval system