Aliivibrio salmonicida: VSAL_II0879
Help
Entry
VSAL_II0879 CDS
T00782
Name
(GenBank) NifS-related protein, putative aminotransferase
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_5
Cys_Met_Meta_PP
Aminotran_1_2
C_LFY_FLO
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ81633
UniProt:
B6ESE4
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(963735..964898)
Genome browser
AA seq
387 aa
AA seq
DB search
MVFLDGPGGSQVPSSVLSAMTGYLGYANSNLGGHFFSSHVTDAVLKQARQSCAVFLNAPT
EDNIVFGANMTSLTFQLSRTISRAWKAGDEIIVTALDHYSNVSSWQQAAEDKGVIVHQVR
VNLDDCTLDMDHFYSLLSPKTRLVATTYASNTTGSLVDVKSMILAAHNVNAMVYVDAVHY
APHHLIDVQELDCDFLACSAYKFFGPHVGIAYVSTRWLRELTPYKVEPATNIGPERFETG
TQSFEGLAGIVAAIEYLAQWGSEGSSLRDRLIDSFEQFNKHELQLTHYFLSKLTSRSYIQ
LYGIKNSENLCSRTPTFALRFSGYTPEYVATVLGKENVCVWSGHFYALGLIRQLVLEESG
GVVRIGLMHYNTTEEIDYLFSLLDSLA
NT seq
1164 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtttttctggatggtcctgggggctctcaagttcctagttctgtgttgtctgcaatg
actggttatctagggtatgcaaattcaaacttaggaggtcactttttttcaagccatgtc
acagatgctgtgcttaaacaggctcgtcaatcgtgtgctgtatttttaaatgctccgact
gaagataatattgtgtttggtgccaatatgacgtcattaacgtttcaattgagccgtacg
atcagccgagcttggaaagctggagatgaaattattgtgacggcattagatcattattct
aatgtatcaagttggcagcaagcagcagaagataagggcgttatcgttcaccaagtgaga
gtgaatctcgatgattgcacattggatatggatcatttttactcattactttcaccaaaa
actcgccttgttgcaaccacctatgcttcaaataccacgggatcattagtggatgtaaaa
tcaatgattttggcagcacataacgtgaatgcaatggtttatgtagacgcagtacattat
gcacctcaccatttgatcgatgttcaagaactcgattgtgattttcttgcatgttctgcc
tataagttttttggaccacacgttgggatcgcctatgtgtcaacaagatggttaagggaa
ttaaccccttataaagttgaacctgcaacaaacataggcccagagcgatttgaaacagga
actcagagctttgaaggtctagctgggattgtcgccgctattgagtatttagcgcagtgg
ggaagtgaaggaagcagcttaagagataggttaatcgacagttttgagcaatttaataag
catgaactgcaattgactcactattttttaagtaagttaacttcgcgcagttatattcaa
ttatatggaattaaaaacagtgaaaacctgtgctctcgtacgcctacatttgcgcttagg
tttagtggttatacgcccgaatacgtagcgacagtactaggaaaagaaaatgtttgcgta
tggagtgggcatttttatgcgctaggtttaattcgtcaattagtgttggaggaaagcggt
ggtgttgttcgtattggattaatgcattacaacacaacggaagagatagattatttattc
tcgttattagattcactcgcataa
DBGET
integrated database retrieval system