Search common motifs in selected sequences


  
Motifs : pf:Amphi-Trp
 pf:BPA_C
 pf:Bac_rhamnosidBacterial alpha-L-rhamnosidase
 pf:Bact_surface_Ig-like
 pf:Big_1Bacterial Ig-like domain (group 1)
 pf:Big_12
 pf:Big_13
 pf:Big_3Bacterial Ig-like domain (group 3)
 pf:Big_3_3Bacterial Ig-like domain (group 3)
 pf:Big_3_5Bacterial Ig-like domain (group 3)
 pf:Big_4Bacterial Ig-like domain (group 4)
 pf:Big_5Bacterial Ig-like domain
 pf:Big_8
 pf:BsuPIIntracellular proteinase inhibitor
 pf:CE2_N
 pf:CW_binding_2Putative cell wall binding repeat 2
 pf:CopCCopC domain
 pf:CorACorA-like Mg2+ transporter protein
 pf:CrtCCrtC N-terminal lipocalin domain
 pf:DBBDof, BCAP, and BANK (DBB) motif,
 pf:DNA_pol3_betaDNA polymerase III beta subunit, N-terminal domain
 pf:DUF1842Domain of unknown function (DUF1842)
 pf:DUF2288Protein of unknown function (DUF2288)
 pf:DUF2460Conserved hypothetical protein 2217 (DUF2460)
 pf:DUF2500Protein of unknown function (DUF2500)
 pf:DUF2808Protein of unknown function (DUF2808)
 pf:DUF3244Domain of unknown function (DUF3244)
 pf:DUF3642Bacterial lipoprotein
 pf:DUF371Domain of unknown function (DUF371)
 pf:DUF4140N-terminal domain of unknown function (DUF4140)
 pf:DUF4469Domain of unknown function (DUF4469) with IG-like fold
 pf:DUF5121Domain of unknown function (DUF5121)
 pf:DUF5627
 pf:DUF5977
 pf:DUF6385
 pf:DUF6751
 pf:FAD_synFAD synthetase
 pf:FKBP26_C
 pf:FliWFliW protein
 pf:GEVED
 pf:GLEYA
 pf:Gln-synt_CGlutamine synthetase, catalytic domain
 pf:GspHType II transport protein GspH
 pf:GvpKGas vesicle protein K
 pf:HET-s_218-289Het-s 218-289
 pf:HOASNHaem-oxygenase-associated N-terminal helices
 pf:HYRHYR domain
 pf:InlK_D3
 pf:LAMININ_IV_B
 pf:MG2
 pf:PLipase_C_C
 pf:PapC_CPapC C-terminal domain
 pf:PapC_NPapC N-terminal domain
 pf:Phage_holin_2_3Bacteriophage holin family HP1
 pf:Por_Secre_tail
 pf:PromininProminin
 pf:R2K_2
 pf:RNase_P-MRP_p29
 pf:Reovirus_bridge
 pf:RicinB_lectin_2Ricin-type beta-trefoil lectin domain-like
 pf:RnfC_NRnfC Barrel sandwich hybrid domain
 pf:RodZ_C
 pf:SLHS-layer homology domain
 pf:SSrecogStructure-specific recognition protein (SSRP1)
 pf:SWM_repeatPutative flagellar system-associated repeat
 pf:SbsC_C
 pf:Shr-like_HID
 pf:Tap-RNA_bindTap, RNA-binding
 pf:Toprim_4Toprim domain
 pf:UPF0240Uncharacterised protein family (UPF0240)
 pf:aBig_2
 pf:dCache_3Double sensory domain of two-component sensor kinase
 pf:fn3Fibronectin type III domain
 pf:nlz1NocA-like zinc-finger protein 1
 pf:phiKZ_gp29PR
 pf:tRNA_Me_trans_C

acai:ISX45_14470 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:DUF4140

afl:Aflv_2634 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:LAMININ_IV_B pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:FliW pf:Big_5

aia:AWH56_006025 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_4

anl:GFC29_2519 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:aBig_2

anm:GFC28_2915 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:aBig_2

baco:OXB_1611 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:R2K_2 pf:Big_5 pf:Big_5

bagr:BA6348_05195 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

bal:BACI_c09260 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:RnfC_N pf:DUF2500 pf:CopC

balu:QRY64_06840 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:DUF2460 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

bayd:BSPP4475_01335 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:GEVED

bbad:K7T73_18550 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:SWM_repeat pf:Big_5 pf:SWM_repeat

bcer:BCK_03785 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:CopC pf:SSrecog

bcf:bcf_04560 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:SWM_repeat pf:DUF2500 pf:SWM_repeat pf:CopC

bcop:JD108_20255 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:nlz1

bcq:BCQ_0973 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_12 pf:SSrecog pf:CopC

bcr:BCAH187_A1064 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:DUF371 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:SSrecog pf:Big_5

bcu:BCAH820_0974 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:RnfC_N pf:DUF2500 pf:CopC

beo:BEH_24470 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Tap-RNA_bind pf:Big_5 pf:Big_3_3 pf:Big_13 pf:Big_13 pf:Big_3_3 pf:Big_5

bhui:LOK74_19135 pf:Toprim_4

bif:N288_23360 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:BPA_C pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

bmet:BMMGA3_15740 pf:SbsC_C pf:Big_5 pf:Big_5

bmob:MLA2C4_04795 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:DUF6751 pf:GspH

bnc:BCN_0883 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:DUF371 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:SSrecog pf:Big_5

bnt:GSN03_04870 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:UPF0240

bou:I5818_04670 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_4 pf:RNase_P-MRP_p29 pf:CopC

bpac:LMD38_21590 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:DUF3642

bpf:BpOF4_06075 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:DUF5121

btf:YBT020_04715 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:RnfC_N pf:DUF2500 pf:CopC

btk:BT9727_0789 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:DUF2460 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

btl:BALH_0800 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:SWM_repeat pf:DUF2500 pf:SWM_repeat pf:CopC

bwd:CT694_04935 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:CopC pf:DUF2500 pf:FKBP26_C pf:CopC

cck:Ccar_22565 pf:Big_4

cspg:LS684_18970 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:HOASN pf:Big_5 pf:MG2

csua:IM538_21535 pf:SbsC_C

dmt:DESME_14400 pf:CW_binding_2 pf:CW_binding_2 pf:CW_binding_2 pf:Big_5 pf:SWM_repeat pf:Big_5 pf:Big_5 pf:SWM_repeat

dom:RRU94_10130 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5

emm:PTI97_11100 pf:GLEYA

epf:OE059_03155 pf:phiKZ_gp29PR

exm:U719_14470 pf:Big_4 pf:Big_4 pf:PapC_C

far:ABE41_017330 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Por_Secre_tail pf:Big_5 pf:Big_3 pf:Big_5

gej:A0V43_13765 pf:SbsC_C pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5

gjf:M493_16440 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

gka:GK3186 pf:SbsC_C pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5

gli:GLN3_08570 pf:SLH pf:SLH pf:SLH

gmc:GY4MC1_0278 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

gte:GTCCBUS3UF5_35660 pf:SbsC_C pf:Prominin

gth:Geoth_0292 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:CrtC

gtn:GTNG_3091 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:PapC_N

gza:IC807_12000 pf:SbsC_C pf:Prominin pf:CopC

lagr:FJQ98_03790 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:PLipase_C_C pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

lcap:ICJ70_17765 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:HET-s_218-289 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5

lfu:HR49_17175 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:HET-s_218-289 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5

lgy:T479_02955 pf:SLH pf:SLH pf:Big_1 pf:Big_1 pf:DUF6385

liu:OU989_06330 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Gln-synt_C pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

llb:R6U77_01795 pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5

lmac:I6G82_11640 pf:SLH pf:SLH pf:SLH

lpak:GDS87_03080 pf:SLH pf:SLH

lsp:Bsph_1041 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

lyb:C3943_03690 pf:SLH pf:SLH

lyc:FH508_0002950 pf:SLH pf:SLH pf:Amphi-Trp

lyg:C1N55_04415 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:DUF1842 pf:Big_5 pf:DUF5627

lys:LBYS11_06470 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:HET-s_218-289 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5

lyz:DCE79_02655 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:CorA

mcui:G8O30_11680 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Bact_surface_Ig-like pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:CopC pf:Por_Secre_tail pf:FAD_syn pf:HYR

mlit:KDJ21_007125 pf:SbsC_C pf:CopC pf:DNA_pol3_beta

ntm:BTDUT50_02860 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC

paea:R70723_30470 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

paef:R50345_28675 pf:SLH pf:SLH pf:DBB pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC

paeh:H70357_32770 pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

paek:D3873_03165 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Shr-like_HID

parg:PspKH34_02780 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:RodZ_C

pasa:BAOM_4825 pf:SbsC_C pf:GvpK pf:tRNA_Me_trans_C

pbd:PBOR_33650 pf:SLH pf:SLH

pcal:BV455_02102 pf:SLH pf:SLH pf:DUF3244 pf:SWM_repeat pf:Big_8

pdh:B9T62_29420 pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5

pdu:PDUR_25335 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

pfae:AJGP001_13670 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:BsuPI pf:Big_5

pgm:PGRAT_30055 pf:SLH pf:SLH

pks:IE339_22535 pf:SLH pf:SLH pf:SLH

pku:AUO94_03870 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:BsuPI pf:Big_5

ppsr:I6J18_09715 pf:SbsC_C

pri:PRIO_6295 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

psab:PSAB_22390 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:RicinB_lectin_2

pson:JI735_06250 pf:SLH pf:SLH

psop:KP014_00945 pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Phage_holin_2_3 pf:Big_5 pf:Big_5

psyb:KD050_14785 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:CopC pf:CE2_N pf:Big_5 pf:Big_5 pf:DUF2808 pf:Big_5

ptj:JRJ22_26995 pf:SLH pf:Bac_rhamnosid pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:dCache_3 pf:Big_5

ptl:AOT13_01510 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:DUF5977 pf:Big_5 pf:CopC pf:Big_5 pf:Big_5 pf:CopC pf:DUF4469

ptri:KDC22_30605 pf:SLH pf:SLH

siv:SSIL_3324 pf:SLH pf:SLH

sob:CSE16_02815 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:DUF2288 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

spoo:J3U78_07205 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Bact_surface_Ig-like pf:HYR pf:InlK_D3 pf:CopC

spop:SporoP37_12140 pf:SLH pf:SLH pf:Big_1 pf:Big_1 pf:DUF6385

spor:SporoP33_11745 pf:SLH pf:SLH pf:Big_1 pf:Big_1 pf:DUF6385

spsy:AZE41_19240 pf:SLH pf:SLH pf:SLH

ssil:SOLI23_01905 pf:SLH pf:SLH pf:CopC pf:Big_12 pf:CopC

sure:SporoP32a_12375 pf:SLH

tae:TepiRe1_2638 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Reovirus_bridge pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

tep:TepRe1_2453 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Reovirus_bridge pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

thep:DYI95_002995 pf:SLH pf:SLH pf:SLH pf:Big_5 pf:Big_5 pf:fn3 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5 pf:Big_5

uth:DKZ56_05680 pf:SLH pf:SLH pf:Big_3_5