SSDB Gene Cluster Search Result

KEGG ID :mir:OCQ_30550 (332 a.a.)
Definition:DNA polymerase LigD ligase subunit (EC:6.5.1.1); K01971 DNA ligase (ATP)
Include: best hitsGap size:
Sort by: SW-score KEGG-species
Search against:All organisms Selected organism group
Threshold:

mirOCQ_30450OCQ_30460OCQ_30470(K14340)OCQ_30480OCQ_30490(K03702)OCQ_30500(K08884)OCQ_30510OCQ_30520(K09146)OCQ_30530OCQ_30540(K03412)OCQ_30550(K01971)OCQ_30560(K01971)OCQ_30570(K10563)OCQ_30580OCQ_30590(K00859)OCQ_30600(K02945)OCQ_30610
mmm  W7S_14790(K14340)W7S_14795W7S_14800(K03702)W7S_14805(K08884)W7S_14810W7S_14815(K09146)W7S_14820W7S_14825(K03412)W7S_14830(K01971)W7S_14835(K01971)W7S_14840(K10563)W7S_14845W7S_14850(K00859)W7S_14855(K02945) 
mitOCO_29790OCO_29800OCO_29810(K14340)OCO_29820OCO_29830(K03702)OCO_29840(K08884)OCO_29850OCO_29860(K09146)OCO_29870OCO_29880(K03412)OCO_29890(K01971)OCO_29900(K01971)OCO_29910(K10563)OCO_29920OCO_29930(K00859)OCO_29940(K02945)OCO_29950
miaOCU_29700OCU_29710OCU_29720(K14340)OCU_29730OCU_29740(K03702)OCU_29750(K08884)OCU_29760OCU_29770(K09146)OCU_29780OCU_29790(K03412)OCU_29800(K01971)OCU_29810(K01971)OCU_29820(K10563)OCU_29830OCU_29840(K00859)OCU_29850(K02945)OCU_29860
myoOEM_29020 OEM_29030(K14340)OEM_29040OEM_29050(K03702)OEM_29060(K08884)OEM_29070OEM_29080(K09146)OEM_29090OEM_29100(K03412)OEM_29110(K01971)OEM_29120(K01971)OEM_29130(K10563)OEM_29140OEM_29150(K00859)OEM_29160(K02945)OEM_29170
amm  AMES_7286 AMES_6030(K03702)  AMES_6033(K09146)  AMES_5142(K01971)AMES_5141(K01971)AMES_6906(K10563) AMES_6034(K00859)AMES_6039(K02945) 
amd  AMED_7397 AMED_6117(K03702)  AMED_6121(K09146)  AMED_5204(K01971)AMED_5203(K01971)AMED_7013(K10563) AMED_6122(K00859)AMED_6127(K02945) 
amn  RAM_38025 RAM_31355(K03702)  RAM_31375(K09146)  RAM_26510(K01971)RAM_26505(K01971)RAM_35975(K10563) RAM_31380(K00859)RAM_31405(K02945) 
amz  B737_7286 B737_6030(K03702)  B737_6033(K09146)  B737_5142(K01971)B737_5141(K01971)B737_6906(K10563) B737_6034(K00859)B737_6039(K02945) 
rci  LRC552      LRC570(K03412)RCIX1968(K01971)RCIX1966(K01971)   LRC294(K03237) 
mpd          MCP_2126(K01971)MCP_2125(K01971)   MCP_1535(K03237) 
bbt    BBta_1782(K03702)   BBta_1631BBta_6556(K03412)BBta_7782(K01971)BBta_7781(K01971)  BBta_0159(K00859)BBta_0103(K02945) 
dpb    BABL1_23(K03702)     BABL1_166(K01971)BABL1_167(K01971)   BABL1_7(K02945) 
hdt    HYPDE_35973(K03702)     HYPDE_32333(K01971)HYPDE_32328(K01971)  HYPDE_39693(K00859)HYPDE_34603(K02945) 
hmc  HYPMC_0571 HYPMC_0965(K03702)HYPMC_0239    HYPMC_2434(K01971)HYPMC_2433(K01971)  HYPMC_4562(K00859)HYPMC_0539(K02945) 
hdn  Hden_2295 Hden_2476(K03702)     Hden_1069(K01971)Hden_1070(K01971)  Hden_3271(K00859)Hden_2325(K02945) 
tmr    Tmar_0208(K03702)    Tmar_2099(K03412)Tmar_1128(K01971)Tmar_1127(K01971)  Tmar_0428(K00859)Tmar_1111(K02945,K03527) 
toc    Toce_1671(K03702)     Toce_0249(K01971)Toce_0250(K01971)  Toce_1652(K00859)Toce_1156(K02945,K03527) 
tco    Theco_0195(K03702)  Theco_1755 Theco_2082(K03412)Theco_3019(K01971)Theco_3020(K01971)  Theco_1334(K00859)Theco_1872(K02945) 
csd    Clst_1951(K03702)    Clst_1719(K03412)Clst_1550(K01971)Clst_1549(K01971)  Clst_0925(K00859)Clst_1457(K02945,K03527) 
pmq    PM3016_133(K03702)    PM3016_5679(K03412)PM3016_6910(K01971)PM3016_6911(K01971)  PM3016_1623(K00859)PM3016_3004(K02945) 
bco    Bcell_3579(K03702)     Bcell_3193(K01971)Bcell_3194(K01971)  Bcell_3211(K00859)Bcell_1851(K02945) 
dec    DCF50_p2847(K03702)     DCF50_p2126(K01971)DCF50_p2127(K01971)  DCF50_p970(K00859)DCF50_p1049(K02945,K03527) 
ded    DHBDCA_p2844(K03702)     DHBDCA_p2112(K01971)DHBDCA_p2113(K01971)  DHBDCA_p913(K00859)DHBDCA_p992(K02945,K03527) 
tjr    TherJR_2733(K03702)    TherJR_1518(K03412)TherJR_1554(K01971)TherJR_1553(K01971)  TherJR_0966(K00859)TherJR_1590(K02945,K03527) 
drs    DEHRE_14080(K03702)     DEHRE_05395(K01971)DEHRE_05390(K01971)  DEHRE_08980(K00859)DEHRE_09430(K02945,K03527) 
hor    Hore_16230(K03702)    Hore_20270(K03412)Hore_03420(K01971)Hore_03410(K01971)  Hore_04890(K00859)Hore_10450(K02945,K03527) 
aac    Aaci_0410(K03702)     Aaci_1649(K01971)Aaci_1648(K01971)  Aaci_2343(K00859)Aaci_1703(K02945) 

=> Graphics

[ SSDB | GENES | KEGG2 | KEGG | GenomeNet ]