| Entry | SW_score | bits | identity | overlap |
| ppa:PAS_chr3_1022 | 163 | 43.0 | 0.251 | 255 |
| ppa:PAS_chr4_0800 | 160 | 42.3 | 0.282 | 181 |
| ppa:PAS_chr1-4_0409 | 153 | 40.7 | 0.352 | 91 |
| ppa:PAS_chr4_0278 | 131 | 35.7 | 0.321 | 81 |
| ppa:PAS_chr2-1_0646 | 124 | 34.1 | 0.349 | 86 |
| ppa:PAS_chr4_0450 | 121 | 33.4 | 0.324 | 102 |
| ppa:PAS_chr1-1_0476 | 121 | 33.4 | 0.310 | 84 |
| ppa:PAS_chr4_0451 | 120 | 33.1 | 0.378 | 74 |
| ppa:PAS_chr1-4_0696 | 114 | 31.8 | 0.411 | 56 |
| ppa:PAS_chr3_0420 | 114 | 31.8 | 0.303 | 119 |
| ppa:PAS_chr3_0340 | 109 | 30.6 | 0.330 | 91 |
| ppa:PAS_chr4_0716 | 107 | 30.2 | 0.327 | 110 |
| ppa:PAS_chr2-2_0188 | 106 | 30.0 | 0.306 | 108 |
| ppa:PAS_chr1-1_0255 | 104 | 29.5 | 0.355 | 76 |
| ppa:PAS_chr1-1_0217 | 104 | 29.5 | 0.314 | 86 |