SSDB Paralog Search Result

KEGG ID :ehi:EHI_111060 (685 a.a.)
Definition:DNA ligase; K10747 DNA ligase 1
Update status:T00238 (abp,abv,adl,bamt,bans,bor,bpsd,bpsm,bsc,ccf,ccoi,ccy,clt,cput,ctec,ctfw,dav,dsq,ecoh,fme,gbc,gbs,gtr,hlr,jag,lmoq,lmox,mlr,mrr,mtq,mtut,mtuu,npa,oas,paei,paeo,pco,pes,pfp,psq,rpj,rus,sauj,sauk,sauq,saut,sauv,sauw,saux,sauy,shs,sla,ssuy,tms,wse,zmr : calculation not yet completed)
Show : Best-best Best Paralogs Gene clusters
Sort by : SW-score SW-score by species KEGG-species
Search against:All organisms Selected organism group
Threshold:

Search Result : 77 hits

       Entry                                                 KO       len  SW-score  bits  identity overlap
-------------------------------------------------------------------  ----------------------------------------
ehi:EHI_086030 hypothetical protein                                 629     178      46    0.226    552     
ehi:EHI_079960 hypothetical protein                      K10866    1241     150      40    0.203    701     
ehi:EHI_093890 hypothetical protein                                1144     137      37    0.211    446     
ehi:EHI_025880 hypothetical protein                                 916     132      36    0.204    505     
ehi:EHI_078580 hypothetical protein                                2123     131      36    0.314    86      
ehi:EHI_147440 hypothetical protein                                2415     126      35    0.220    296     
ehi:EHI_038870 Rho guanine nucleotide exchange factor               618     124      34    0.247    381     
ehi:EHI_199130 hypothetical protein                                 856     123      34    0.202    500     
ehi:EHI_068700 hypothetical protein                                 680     121      33    0.225    377     
ehi:EHI_066720 hypothetical protein                                2089     119      33    0.192    500     
ehi:EHI_072050 Viral A-type inclusion protein repeat               1813     119      33    0.206    671     
ehi:EHI_129310 DNA repair/transcription protein Mms19    K15075     868     119      33    0.218    266     
ehi:EHI_148160 cullin                                    K10609     706     118      33    0.196    515     
ehi:EHI_197320 hypothetical protein                                 573     117      33    0.217    345     
ehi:EHI_129520 hypothetical protein                                1248     116      32    0.215    382     
ehi:EHI_156340 hypothetical protein                                 386     116      32    0.391    69      
ehi:EHI_000600 hypothetical protein                                 648     115      32    0.219    269     
ehi:EHI_025370 hypothetical protein                                 831     115      32    0.179    537     
ehi:EHI_068410 hypothetical protein                                 499     113      32    0.193    352     
ehi:EHI_007320 hypothetical protein                                 959     112      31    0.212    292     
ehi:EHI_093850 Viral A-type inclusion protein repeat               1387     112      31    0.205    655     
ehi:EHI_014150 hypothetical protein                                 701     111      31    0.197    441     
ehi:EHI_033700 structural maintenance of chromosomes pr            1023     111      31    0.187    481     
ehi:EHI_070560 hypothetical protein                                 288     111      31    0.225    218     
ehi:EHI_084660 hypothetical protein                                1034     111      31    0.241    291     
ehi:EHI_166040 hypothetical protein                                 288     111      31    0.225    218     
ehi:EHI_006870 protein kinase domain containing protein             911     110      31    0.196    511     
ehi:EHI_140610 hypothetical protein                      K03252     614     110      31    0.214    370     
ehi:EHI_087710 hypothetical protein                      K11883     518     109      31    0.232    276     
ehi:EHI_118620 HEAT repeat domain containing protein     K16803    1589     109      31    0.218    427     
ehi:EHI_138430 hypothetical protein                                 628     109      31    0.209    550     
ehi:EHI_141900 chromodomain-helicase-DNA-binding protei  K11367    1262     109      31    0.272    158     
ehi:EHI_142240 hypothetical protein                                 327     109      31    0.235    204     
ehi:EHI_199700 SMC4 protein                              K06675    1226     109      31    0.194    681     
ehi:EHI_076780 hypothetical protein                                 886     108      30    0.221    402     
ehi:EHI_087350 hypothetical protein                                 493     108      30    0.228    171     
ehi:EHI_140720 myosin heavy chain                                  1312     108      30    0.214    467     
ehi:EHI_145970 hypothetical protein                                1424     108      30    0.238    261     
ehi:EHI_167140 hypothetical protein                                 488     108      30    0.216    305     
ehi:EHI_068450 hypothetical protein                                 796     107      30    0.216    245     
ehi:EHI_008000 hypothetical protein                                 548     106      30    0.233    172     
ehi:EHI_015430 hypothetical protein                                 257     106      30    0.224    223     
ehi:EHI_020360 hypothetical protein                                 264     106      30    0.247    219     
ehi:EHI_065480 hypothetical protein                                 932     106      30    0.214    397     
ehi:EHI_099770 hypothetical protein                                 270     106      30    0.197    218     
ehi:EHI_119940 hypothetical protein                                1263     106      30    0.224    352     
ehi:EHI_127690 hypothetical protein                                 288     106      30    0.220    218     
ehi:EHI_178780 hypothetical protein                                 894     106      30    0.189    359     
ehi:EHI_017000 hypothetical protein                                 563     105      30    0.216    273     
ehi:EHI_055970 hypothetical protein                                 861     105      30    0.197    564     
ehi:EHI_096800 hypothetical protein                                 288     105      30    0.245    269     
ehi:EHI_110180 myosin heavy chain                        K10352    2151     105      30    0.190    706     
ehi:EHI_013240 hypothetical protein                                2020     104      30    0.208    432     
ehi:EHI_045400 Arf GTPase activating protein                        598     104      30    0.244    160     
ehi:EHI_069360 hypothetical protein                                 406     104      30    0.240    283     
ehi:EHI_125650 PIWI                                      K02156     937     104      30    0.209    253     
ehi:EHI_165290 Rab GTPase activating protein                        618     104      30    0.209    393     
ehi:EHI_177310 hypothetical protein                                 731     104      30    0.201    383     
ehi:EHI_008370 hypothetical protein                                 385     103      29    0.207    334     
ehi:EHI_012990 hypothetical protein                      K10884     576     103      29    0.242    99      
ehi:EHI_048630 actin                                                713     103      29    0.328    58      
ehi:EHI_035610 hypothetical protein                      K13917     568     102      29    0.217    448     
ehi:EHI_092360 hypothetical protein                                2772     102      29    0.214    345     
ehi:EHI_146940 hypothetical protein                                 458     102      29    0.190    247     
ehi:EHI_017010 hypothetical protein                                 463     101      29    0.257    113     
ehi:EHI_029600 hypothetical protein                                1656     101      29    0.197    356     
ehi:EHI_035960 hypothetical protein                                 469     100      29    0.245    159     
ehi:EHI_040700 coatomer protein gamma subunit                       844     100      29    0.241    133     
ehi:EHI_118840 fibrillarin                               K14563     305     100      29    0.252    123     
ehi:EHI_131030 hypothetical protein                                1442     100      29    0.228    426     
ehi:EHI_140180 hypothetical protein                                 774     100      29    0.299    67      
ehi:EHI_145300 hypothetical protein                                 550     100      29    0.194    124     
ehi:EHI_153780 hypothetical protein                      K14572    4492     100      29    0.171    549     
ehi:EHI_158580 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase do            1298     100      29    0.204    382     
ehi:EHI_167940 hypothetical protein                                 886     100      29    0.278    176     
ehi:EHI_168320 hypothetical protein                                 358     100      29    0.215    339     
ehi:EHI_200820 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase               2181     100      29    0.211    199     

[ SSDB | GENES | KEGG2 | KEGG | GenomeNet ]