KEGG   ORTHOLOGY: K00787
Entry
K00787                      KO                                     

Name
FDPS
Definition
farnesyl diphosphate synthase [EC:2.5.1.1 2.5.1.10]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ko05164  Influenza A
ko05166  Human T-cell leukemia virus 1 infection
Module
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
M00367  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, non-plant eukaryotes
Disease
H01933  Porokeratosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
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   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05166 Human T-cell leukemia virus 1 infection
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
   05164 Influenza A
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
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    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Other DBs
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Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9
Reference
PMID:8631820
  Authors
Cunillera N, Arro M, Delourme D, Karst F, Boronat A, Ferrer A
  Title
Arabidopsis thaliana contains two differentially expressed farnesyl-diphosphate synthase genes.
  Journal
J Biol Chem 271:7774-80 (1996)
DOI:10.1074/jbc.271.13.7774
Reference
PMID:1968462
  Authors
Wilkin DJ, Kutsunai SY, Edwards PA
  Title
Isolation and sequence of the human farnesyl pyrophosphate synthetase cDNA. Coordinate regulation of the mRNAs for farnesyl pyrophosphate synthetase, 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, and 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase by phorbol ester.
  Journal
J Biol Chem 265:4607-14 (1990)
  Sequence
[hsa:2224]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K00795
Entry
K00795                      KO                                     

Name
ispA
Definition
farnesyl diphosphate synthase [EC:2.5.1.1 2.5.1.10]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K00795  ispA; farnesyl diphosphate synthase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K00795  ispA; farnesyl diphosphate synthase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K00795  ispA; farnesyl diphosphate synthase
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K00795  ispA; farnesyl diphosphate synthase
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K00795  ispA; farnesyl diphosphate synthase
Other DBs
RN: R01658 R02003
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Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
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PMID:2089044
  Authors
Fujisaki S, Hara H, Nishimura Y, Horiuchi K, Nishino T
  Title
Cloning and nucleotide sequence of the ispA gene responsible for farnesyl diphosphate synthase activity in Escherichia coli.
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  Sequence
[eco:b0421]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K00804
Entry
K00804                      KO                                     

Name
GGPS1
Definition
geranylgeranyl diphosphate synthase, type III [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
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Module
M00367  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, non-plant eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
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 Terpene biosynthesis
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 » show all
Reference
PMID:7665600
  Authors
Jiang Y, Proteau P, Poulter D, Ferro-Novick S
  Title
BTS1 encodes a geranylgeranyl diphosphate synthase in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
J Biol Chem 270:21793-9 (1995)
DOI:10.1074/jbc.270.37.21793
  Sequence
[sce:YPL069C]
Reference
  Authors
Kainou T, Kawamura K, Tanaka K, Matsuda H, Kawamukai M
  Title
Identification of the GGPS1 genes encoding geranylgeranyl diphosphate synthases from mouse and human.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1437:333-40 (1999)
DOI:10.1016/S1388-1981(99)00028-1
  Sequence
[hsa:9453]
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K13789
Entry
K13789                      KO                                     

Name
GGPS
Definition
geranylgeranyl diphosphate synthase, type II [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
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     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Other DBs
RN: R01658 R02003 R02061
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