KEGG   ORTHOLOGY: K02223
Entry
K02223                      KO                                     

Name
CLOCK, KAT13D
Definition
circadian locomoter output cycles kaput protein [EC:2.3.1.48]
Pathway
ko04710  Circadian rhythm
ko04711  Circadian rhythm - fly
ko04728  Dopaminergic synapse
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09150 Organismal Systems
  09156 Nervous system
   04728 Dopaminergic synapse
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
  09159 Environmental adaptation
   04710 Circadian rhythm
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
   04711 Circadian rhythm - fly
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
   03036 Chromosome and associated proteins
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.3  Acyltransferases
   2.3.1  Transferring groups other than aminoacyl groups
    2.3.1.48  histone acetyltransferase
     K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Basic helix-loop-helix (bHLH)
   Factors with PAS domain
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Histone modification proteins
   HATs (histone acetyltransferases)
    K02223  CLOCK, KAT13D; circadian locomoter output cycles kaput protein
Other DBs
GO: 0004402
Genes
HSA: 9575(CLOCK)
PTR: 461312(CLOCK)
PPS: 100986920(CLOCK)
GGO: 101140472(CLOCK)
PON: 100172630(CLOCK)
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MCC: 697532(CLOCK)
MCF: 102131896(CLOCK)
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MMU: 12753(Clock)
MCAL: 110294104(Clock)  
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RNO: 60447(Clock)
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HGL: 101725536(Clock)
CCAN: 109702259(Clock)
OCU: 100349684(CLOCK)
TUP: 102478751(CLOCK)
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OBI: 106876780
LAK: 106155407
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Reference
PMID:9630223
  Authors
Allada R, White NE, So WV, Hall JC, Rosbash M
  Title
A mutant Drosophila homolog of mammalian Clock disrupts circadian rhythms and transcription of period and timeless.
  Journal
Cell 93:791-804 (1998)
DOI:10.1016/s0092-8674(00)81440-3
  Sequence
Reference
  Authors
Kaeffer B, Pardini L
  Title
Clock genes of Mammalian cells: practical implications in tissue culture.
  Journal
In Vitro Cell Dev Biol Anim 41:311-20 (2005)
DOI:10.1007/s11626-005-0001-7
Reference
  Authors
Isojima Y, Okumura N, Nagai K
  Title
Molecular mechanism of mammalian circadian clock.
  Journal
J Biochem 134:777-84 (2003)
DOI:10.1093/jb/mvg219
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K09026
Entry
K09026                      KO                                     

Name
NPAS2
Definition
neuronal PAS domain-containing protein 2
Pathway
ko04710  Circadian rhythm
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04710 Circadian rhythm
    K09026  NPAS2; neuronal PAS domain-containing protein 2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K09026  NPAS2; neuronal PAS domain-containing protein 2
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Basic helix-loop-helix (bHLH)
   Factors with PAS domain
    K09026  NPAS2; neuronal PAS domain-containing protein 2
Genes
HSA: 4862(NPAS2)
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CHX: 102187586(NPAS2)
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SSC: 100521893(NPAS2)
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CDK: 105099118(NPAS2)
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ECB: 100059275(NPAS2)
EPZ: 103553240(NPAS2)
EAI: 106839387(NPAS2)
MNA: 107532690(NPAS2)
HAI: 109395482(NPAS2)
DRO: 112315183(NPAS2)
PALE: 102893672(NPAS2)  
RAY: 107517010(NPAS2)
MJV: 108405159(NPAS2)
LAV: 100665127(NPAS2)
TMU: 101345073
MDO: 100015652(NPAS2) 100617889(PASD1)
SHR: 100913900(PASD1) 100925342(NPAS2)
PCW: 110200003(PASD1) 110212838(NPAS2)
OAA: 100076285(NPAS2) 100082318(PASD1)
GGA: 395433(NPAS2) 422384(PASD1)
MGP: 100540366(NPAS2) 100547638
CJO: 107306962(NPAS2) 107312935(PASD1)
NMEL: 110402991(PASD1) 110406594(NPAS2)  
APLA: 101798730(NPAS2) 101801580(PASD1)
ACYG: 106037713(PASD1) 106049075(NPAS2)
TGU: 100217821(PASD1) 100223816(NPAS2)
LSR: 110474893(NPAS2) 110480131(PASD1)
SCAN: 103812640(NPAS2) 103816367(PASD1)
GFR: 102035734(NPAS2) 102043397(PASD1)
FAB: 101806593 101818351(NPAS2)
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FPG: 101913231(NPAS2) 101923252
FCH: 102054665(PASD1) 102058972(NPAS2)
CLV: 102087158(NPAS2) 102088724
EGZ: 104124084(PASD1) 104126410(NPAS2)
NNI: 104019079(PASD1) 104019392(NPAS2)
ACUN: 113479990(PASD1) 113482698(NPAS2)
PADL: 103918866(NPAS2) 103922815(PASD1)
AAM: 106487554(PASD1) 106493930(NPAS2)
ASN: 102382695 102383395(NPAS2)
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XTR: 100486786(pasd1) 101731519(npas2)
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CCAR: 109061883
IPU: 108259764
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AMEX: 103024900
TRU: 101065307
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NCC: 104953098
MZE: 101475433
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OLA: 101172430
XMA: 102229614
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PRET: 103475715
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ALIM: 106516415
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SDU: 111234344
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ELS: 105025034
LCM: 102345945(NPAS2) 102356983(PASD1)
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RTP: 109916311(npas2) 109935260
CCAL: 108624636
OBB: 114876900
DQU: 106750930
PCF: 106791735
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SPIS: 111321899
DGT: 114521393
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