KEGG   ORTHOLOGY: K02927
Entry
K02927                      KO                                     

Name
RP-L40e, RPL40, UBA52
Definition
ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
Pathway
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ko05131  Shigellosis
ko05167  Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
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  09164 Neurodegenerative disease
   05012 Parkinson disease
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   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
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  09172 Infectious disease: viral
   05167 Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
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 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03011 Ribosome
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   04121 Ubiquitin system
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Ribosome [BR:ko03011]
 Ribosomal proteins
  Eukaryotes
   Large subunit
    K02927  RP-L40e, RPL40, UBA52; ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
  Archaea
   Large subunit
    K02927  RP-L40e, RPL40, UBA52; ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitins and ubiquitin-like proteins
  Ubiquitins
   K02927  RP-L40e, RPL40, UBA52; ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
Other DBs
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Reference
  Authors
Komander D
  Title
The emerging complexity of protein ubiquitination.
  Journal
Biochem Soc Trans 37:937-53 (2009)
DOI:10.1042/BST0370937
  Sequence
[hsa:7311] [mmu:22186]
Reference
  Authors
Odintsova TI, Muller EC, Ivanov AV, Egorov TA, Bienert R, Vladimirov SN, Kostka S, Otto A, Wittmann-Liebold B, Karpova GG
  Title
Characterization and analysis of posttranslational modifications of the human large cytoplasmic ribosomal subunit proteins by mass spectrometry and Edman sequencing.
  Journal
J Protein Chem 22:249-58 (2003)
DOI:10.1023/a:1025068419698
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K02977
Entry
K02977                      KO                                     

Name
RP-S27Ae, RPS27A, UBA80
Definition
ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
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   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04137 Mitophagy - animal
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05012 Parkinson disease
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
  09171 Infectious disease: bacterial
   05131 Shigellosis
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  09172 Infectious disease: viral
   05167 Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03011 Ribosome
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
   04121 Ubiquitin system
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
Ribosome [BR:ko03011]
 Ribosomal proteins
  Eukaryotes
   Small subunit
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
  Archaea
   Small subunit
    K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitins and ubiquitin-like proteins
  Ubiquitins
   K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of haemopoietic cells  (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
   K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
  Exosomal proteins of colorectal cancer cells
   K02977  RP-S27Ae, RPS27A, UBA80; ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
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MOL: YLM1_0977
METH: MBMB1_1386
MFC: BRM9_0612
MCUB: MCBB_1629(rps27ae)
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AFU: AF_1113
FPL: Ferp_2229
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GAH: GAH_01875
TAC: Ta1093
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THS: TES1_1966
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PPAC: PAP_00770
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MBAK: MSBR3_2795
MAC: MA_3696
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MBU: Mbur_2284(rps27ae)
MMET: MCMEM_0433
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MHI: Mhar_1915
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MEMA: MMAB1_1816
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RCI: RCIX627(rps27ae)
HAL: VNG_2047G(rps27ae)
HSL: OE_3868R(rps31e)
HHB: Hhub_3344(rps31e)
HALH: HTSR_1919(rps27ae)
HHSR: HSR6_1988(rps27ae)
HSU: HLASF_1981(rps27AE)
HSF: HLASA_1967(rps27AE)
HMA: rrnAC2489(rps27AE)
HHI: HAH_2921(rps27AE)
NPH: NP_5072A(rps31e)
NMO: Nmlp_1552(rps31e)
HUT: Huta_1955
HTI: HTIA_1711
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NMG: Nmag_1272(rps31e)
NAT: NJ7G_2245
SALI: L593_13920
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ACJ: ACAM_0722(rps27ae)
SMR: Smar_0837
IHO: Igni_0270
TAG: Tagg_1371
IAG: Igag_1101
HBU: Hbut_0435
STO: STK_03625(rps27ae)
SSO: SSO5844(rps27AE)
SOL: Ssol_1409
SSOA: SULA_03265
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SAI: Saci_0852(rbsS27AE)
SID: M164_1719
SII: LD85_1929
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SIR: SiRe_1568
SIC: SiL_1560
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PIS: Pisl_1894
PCL: Pcal_0307
PAS: Pars_1439
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ACIA: SE86_00330
NMR: Nmar_0534
NID: NPIRD3C_1742(rps27ae)
NIN: NADRNF5_1647(rps27ae)
NCT: NMSP_1139
NGA: Ngar_c26980(rps27ae)
NVN: NVIE_016060(rps27ae)
NEV: NTE_00783
NFN: NFRAN_3128(rps27ae)
NCV: NCAV_1219(rps27ae)
NBV: T478_1096
NDV: NDEV_0525(rps27ae)
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VG: 15012904(MPVG_00214) 2700326(CNPV096)
 » show all
Reference
  Authors
Komander D
  Title
The emerging complexity of protein ubiquitination.
  Journal
Biochem Soc Trans 37:937-53 (2009)
DOI:10.1042/BST0370937
  Sequence
[hsa:6233] [mmu:78294]
Reference
PMID:8706699
  Authors
Vladimirov SN, Ivanov AV, Karpova GG, Musolyamov AK, Egorov TA, Thiede B, Wittmann-Liebold B, Otto A
  Title
Characterization of the human small-ribosomal-subunit proteins by N-terminal and internal sequencing, and mass spectrometry.
  Journal
Eur J Biochem 239:144-9 (1996)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K04551
Entry
K04551                      KO                                     

Name
UBB
Definition
ubiquitin B
Pathway
ko04120  Ubiquitin mediated proteolysis
ko04137  Mitophagy - animal
ko05012  Parkinson disease
ko05022  Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
ko05131  Shigellosis
ko05167  Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    K04551  UBB; ubiquitin B
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04137 Mitophagy - animal
    K04551  UBB; ubiquitin B
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05012 Parkinson disease
    K04551  UBB; ubiquitin B
   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
    K04551  UBB; ubiquitin B
  09171 Infectious disease: bacterial
   05131 Shigellosis
    K04551  UBB; ubiquitin B
  09172 Infectious disease: viral
   05167 Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
    K04551  UBB; ubiquitin B
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system
    K04551  UBB; ubiquitin B
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K04551  UBB; ubiquitin B
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitins and ubiquitin-like proteins
  Ubiquitins
   K04551  UBB; ubiquitin B
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of breast milk
   K04551  UBB; ubiquitin B
  Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
   K04551  UBB; ubiquitin B
  Exosomal proteins of colorectal cancer cells
   K04551  UBB; ubiquitin B
  Exosomal proteins of bladder cancer cells
   K04551  UBB; ubiquitin B
Genes
HSA: 7314(UBB)
PTR: 468372(UBB)
GGO: 101144449(UBB)
PON: 100451913
NLE: 100593565(UBB)
MCC: 696110(UBB)
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RRO: 104681436(UBB)
RBB: 108539645
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MMU: 22187(Ubb)
RNO: 192255(Ubb)
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CCAN: 109692310(Ubb)
OCU: 100351347(UBB)
TUP: 102484915(UBB)
CFA: 479513(UBB)
VVP: 112924926(UBB)
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EPZ: 103545744
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APLA: 101797590(UBC)
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LSR: 110467687(UBB)
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FPG: 101912114(UBB)
FCH: 102046542(UBB)
CLV: 102096418(UBB)
ACUN: 113487383(UBB)
PADL: 103920796(UBB)
AAM: 106493745(UBB)
ASN: 102388213(UBB)
AMJ: 106739025(UBC)
PSS: 102448158(UBB)
CMY: 102935450(UBB)
CPIC: 101946221(UBB)
PVT: 110087399(UBC)
GJA: 107108405
AMEX: 103028238
AOCE: 111566116(ubb)
BPEC: 110165017(ubb)
CMK: 103184273(ubc)
BFO: 118409505
DWI: 6648626
DNV: 108652308
DVI: 6634507
AAG: 5566847
DPA: 109534144
ATD: 109595173
CSCU: 111617790
AQU: 100636532
BBO: BBOV_IV010030(23.m06318)
CPV: cgd5_2550
 » show all
Reference
PMID:3029682
  Authors
Baker RT, Board PG
  Title
The human ubiquitin gene family: structure of a gene and pseudogenes from the Ub B subfamily.
  Journal
Nucleic Acids Res 15:443-63 (1987)
DOI:10.1093/nar/15.2.443
  Sequence
[hsa:7314]
Reference
  Authors
Komander D
  Title
The emerging complexity of protein ubiquitination.
  Journal
Biochem Soc Trans 37:937-53 (2009)
DOI:10.1042/BST0370937
  Sequence
[hsa:7314] [mmu:22187]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K08770
Entry
K08770                      KO                                     

Name
UBC
Definition
ubiquitin C
Pathway
ko03320  PPAR signaling pathway
ko04120  Ubiquitin mediated proteolysis
ko04137  Mitophagy - animal
ko05012  Parkinson disease
ko05022  Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
ko05131  Shigellosis
ko05167  Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    K08770  UBC; ubiquitin C
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04137 Mitophagy - animal
    K08770  UBC; ubiquitin C
 09150 Organismal Systems
  09152 Endocrine system
   03320 PPAR signaling pathway
    K08770  UBC; ubiquitin C
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05012 Parkinson disease
    K08770  UBC; ubiquitin C
   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
    K08770  UBC; ubiquitin C
  09171 Infectious disease: bacterial
   05131 Shigellosis
    K08770  UBC; ubiquitin C
  09172 Infectious disease: viral
   05167 Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection
    K08770  UBC; ubiquitin C
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system
    K08770  UBC; ubiquitin C
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitins and ubiquitin-like proteins
  Ubiquitins
   K08770  UBC; ubiquitin C
Genes
HSA: 7316(UBC)
PTR: 467151(UBC)
GGO: 101151508(UBC)
PON: 100460673(UBC)
MCC: 712934(UBC)
MCF: 102143130(UBC)
RRO: 104666337(UBC)
MMU: 22190(Ubc)
RNO: 50522(Ubc)
CGE: 100689267(Ubc)
CCAN: 109700514(Ubc)
FCA: 101099660(UBC)
BTA: 444874(UBC)
BOM: 102286294(UBC)
BIU: 109571204(UBC)
BBUB: 102410559(UBC)
CHX: 102178199(UBC)
OAS: 101115230(UBC)
SSC: 396966(UBC)
BACU: 103003816(UBC)
ECB: 100059289(UBC)
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MNA: 107524502(UBC)
MDO: 100021198
PCW: 110222103
OAA: 100074541(UBC) 100077981
MGP: 100539110(UBB)
APLA: 101799068
CCW: 104691179(UBC)
ETL: 114061234(UBC)
FCH: 102046927(UBC)
PSS: 102444875(UBC)
ACS: 100552299(ubc)
PMUR: 107282827(UBC)
PMUA: 114585290
GJA: 107118501(UBC)
XTR: 100485835(ubb) 448120(ubc)
NPR: 108787682(UBC) 108787937
DRE: 550134(ubb) 777766(ubc)
AMEX: 103030683(ubb)
TRU: 101062855(ubb)
ONL: 100702223(ubb)
OLA: 101172100(ubc)
XMA: 102218444(ubb)
AOCE: 111575192(ubc)
LCF: 108893221(ubb)
SDU: 111222381(ubc)
SLAL: 111663901(ubc)
HCQ: 109531088(ubc)
SASA: 106603500(ubc)
ELS: 105015226 105030977(ubc)
SFM: 108930049(ubc)
CIN: 100175058
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DME: Dmel_CG11624(Ubi-p63E) Dmel_CG11700(CG11700) Dmel_CG32744(Ubi-p5E)
DHE: 111596862
DVI: 6636823
MDE: 101893413
BIM: 100747610
OBB: 114879432
CFO: 105254295
PGC: 109857435
OBO: 105276415
CSOL: 105367471
MDL: 103574248
TCA: 641546(Pub)
ATD: 109596552
NVL: 108556541
BMOR: 101742698 692376(Ubi3)
BMAN: 114248257
PXY: 105388041
BTAB: 109036602
CLEC: 106668099
FCD: 110863592
CSCU: 111636494
PTEP: 107439902
CEL: CELE_F25B5.4(ubq-1)
CBR: CBG09037(Cbr-ubq-1)
PCAN: 112553780
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NVE: 5503649
HMG: 100203041
AQU: 100636368
ATH: AT1G53930 AT1G65350(UBQ13) AT3G09790(UBQ8) AT4G02890(UBQ14) AT4G05050(UBQ11) AT4G05320(UBQ10) AT5G03240(UBQ3) AT5G20620(UBQ4) AT5G37640(UBQ9)
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VUN: 114178413
CAM: 101495031
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LANG: 109341354
FVE: 101306154
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PPER: 18772021
PAVI: 110750709
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MCHA: 111010432
CMAX: 111476894
CMOS: 111442621
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SOE: 110795716
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DOSA: Os02t0161900-01(Os02g0161900) Os04t0628100-01(Os04g0628100) Os10t0475900-01(Os10g0475900)
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SPAA: SPAPADRAFT_51800(UBI4)
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Reference
  Authors
Komander D
  Title
The emerging complexity of protein ubiquitination.
  Journal
Biochem Soc Trans 37:937-53 (2009)
DOI:10.1042/BST0370937
  Sequence
[mmu:22190]
LinkDB

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