KEGG   ORTHOLOGY: K03142
Entry
K03142                      KO                                     

Name
TFIIH2, GTF2H2, SSL1
Definition
transcription initiation factor TFIIH subunit 2
Pathway
ko03022  Basal transcription factors
ko03420  Nucleotide excision repair
ko05203  Viral carcinogenesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03022 Basal transcription factors
    K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05203 Viral carcinogenesis
    K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Basal transcription factors
    TFIIH
     K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TFIIH complex
     K03142  TFIIH2, GTF2H2, SSL1; transcription initiation factor TFIIH subunit 2
Other DBs
GO: 0016251
Genes
HSA: 2966(GTF2H2) 728340(GTF2H2C) 730394(GTF2H2C_2)
PTR: 461830(GTF2H2C)
PPS: 100987487(GTF2H2)
GGO: 101152873
PON: 100456237
NLE: 100582721
MCC: 700737(GTF2H2)
MCF: 101926395(GTF2H2)
CSAB: 103222816(GTF2H2)
RRO: 104675637(GTF2H2)
RBB: 108541125(GTF2H2)
CJC: 100386966(GTF2H2)
SBQ: 101052010
MMU: 23894(Gtf2h2)
MCAL: 110307932(Gtf2h2)
MPAH: 110328940(Gtf2h2)
RNO: 294693(Gtf2h2)
MUN: 110566802
CGE: 100771702
NGI: 103738728(Gtf2h2c)
HGL: 101705678(Gtf2h2)
CCAN: 109685703(Gtf2h2c)
OCU: 100338745
TUP: 102488277
CFA: 478089(GTF2H2)
VVP: 112906917
AML: 100465141
UMR: 103663603(GTF2H2C)
UAH: 113255248
ORO: 101378935(GTF2H2)
ELK: 111155330
FCA: 101094730
PTG: 102972834(GTF2H2)
PPAD: 109275038
AJU: 106977079
BTA: 511829(GTF2H2)
BOM: 102285488(GTF2H2)
BIU: 109574990
BBUB: 102407872
CHX: 102185505(GTF2H2)
OAS: 101118051
SSC: 100625544(GTF2H2)
CFR: 102503506
CDK: 105084772
BACU: 103000259(GTF2H2)
LVE: 103088908(GTF2H2)
OOR: 101289805
PCAD: 102986844
ECB: 100073305
EPZ: 103564226
EAI: 106838053
MYB: 102248866(GTF2H2)
MYD: 102772382(GTF2H2)
MNA: 107537796(GTF2H2)
DRO: 112321134(GTF2H2)
PALE: 102883057(GTF2H2)
RAY: 107498713
MJV: 108384354
LAV: 100657525(GTF2H2)
TMU: 101344622
MDO: 100010571(GTF2H2) 100015833
SHR: 100934072(GTF2H2)
PCW: 110216536(GTF2H2)
OAA: 100081699(GTF2H2)
GGA: 100858972(GTF2H2)
MGP: 100546474
CJO: 107306658
NMEL: 110389752(GTF2H2)
APLA: 101792131(GTF2H2)
ACYG: 106049386
TGU: 100217858
LSR: 110475048
SCAN: 103821212(GTF2H2)
GFR: 102039711(GTF2H2)
FAB: 101820645(GTF2H2)
PHI: 102106458(GTF2H2)
PMAJ: 107216343(GTF2H2)
CCAE: 111941273(GTF2H2)
CCW: 104689776(GTF2H2)
ETL: 114056950(GTF2H2)
FPG: 101913658(GTF2H2)
FCH: 102057779(GTF2H2)
CLV: 102083503(GTF2H2)
EGZ: 104135074(GTF2H2)
NNI: 104019894(GTF2H2)
ACUN: 113490268(GTF2H2)
PADL: 103921064(GTF2H2)
ASN: 102386783(GTF2H2C)
AMJ: 102560483(GTF2H2C)
PSS: 102446125(GTF2H2)
CMY: 102941100(GTF2H2)
CPIC: 101940890(GTF2H2)
ACS: 100558064(gtf2h2)
PVT: 110077355
PBI: 103062189
PMUR: 107289745
PMUA: 114606445
GJA: 107112781
XLA: 443754(gtf2h2.S)
XTR: 496493(gtf2h2)
NPR: 108801654
DRE: 323239(gtf2h2)
SRX: 107744463(gtf2h2c) 107752507
SANH: 107672775
IPU: 108255545(gtf2h2c)
PHYP: 113542214(gtf2h2c)
AMEX: 103032811(gtf2h2c)
EEE: 113583510(gtf2h2c)
LCO: 104926566
NCC: 104942172
MZE: 101466805
ONL: 100696048
OLA: 101167715
XMA: 102217136
XCO: 114155197
PRET: 103470674
CVG: 107093675
NFU: 107396147
KMR: 108232507
ALIM: 106531760
AOCE: 111570533
CSEM: 103397561
POV: 109633670
LCF: 108878580
SDU: 111229339
SLAL: 111647896
HCQ: 109506821
BPEC: 110168483
MALB: 109959671
SASA: 100196672
OTW: 112262528(gtf2h2c)
SALP: 112068933(gtf2h2c)
ELS: 105025392(gtf2h2c)
SFM: 108938969(gtf2h2c)
PKI: 111850286(gtf2h2c)
LCM: 102353559(GTF2H2)
CMK: 103182693(gtf2h2)
RTP: 109925322
BFO: 118430593
CIN: 778950(zf(c2h2)-114)
SPU: 589616
APLC: 110979183
SKO: 100369953
DME: Dmel_CG11115(Ssl1)
DER: 6544264
DSE: 6616609
DSI: Dsimw501_GD15058(Dsim_GD15058)
DAN: 6493871
DSR: 110190354
DPE: 6596169
DMN: 108151431
DWI: 6645522
DNV: 108651907
DHE: 111592865
DVI: 6622844
MDE: 101901177
LCQ: 111688077
AAG: 5568688
AME: 411526
BIM: 100743113
BTER: 100649692
CCAL: 108629502
OBB: 114871158
SOC: 105207825
MPHA: 105832484
AEC: 105152855
ACEP: 105624970
PBAR: 105424682
VEM: 105561961
HST: 105187846
DQU: 106744436
CFO: 105256649
LHU: 105667375
PGC: 109864116
OBO: 105276825
PCF: 106787519
NVI: 100114652
CSOL: 105359817
MDL: 103572123
TCA: 656126
DPA: 109545068
ATD: 109601980
NVL: 108566529
BMOR: 101744339
BMAN: 114252532
PMAC: 106710527
PRAP: 110995120
HAW: 110374693
TNL: 113498441
PXY: 105388296
API: 100162535
DNX: 107170586
AGS: 114126974
RMD: 113548447
BTAB: 109033717
CLEC: 106668282
ZNE: 110840592
FCD: 110852529
PVM: 113809950
TUT: 107366119
DPTE: 113799162
CSCU: 111641258
PTEP: 107442743
CEL: CELE_T16H12.4(gtf-2H2C)
CBR: CBG09887
BMY: Bm1_30170
TSP: Tsp_04726
PCAN: 112556207
CRG: 105345292
MYI: 110462731
OBI: 106875921
SHX: MS3_05051
EPA: 110245070
ADF: 107343083
AMIL: 114955039
PDAM: 113683499
SPIS: 111328835
DGT: 114520489
HMG: 100200565
AQU: 100636837
ATH: AT1G05055(GTF2H2)
ALY: 9328325
CRB: 17897174
BRP: 103836541
BOE: 106307591
RSZ: 108818895
THJ: 104801004
CPAP: 110808556
TCC: 18590083(GTF2H2)
GRA: 105799309(GTF2H2)
GAB: 108454522
DZI: 111303871
EGR: 104421682
VRA: 106753698
VAR: 108327743
VUN: 114164432
CCAJ: 109796803
CAM: 101499964
LJA: Lj1g3v4107020.1(Lj1g3v4107020.1)
ADU: 107471506
AIP: 107623549
FVE: 101309025(GTF2H2)
RCN: 112167057
PPER: 18774985
PMUM: 103324920
PAVI: 110771269
MDM: 103422116
PXB: 103930639
CSV: 101212151
CMO: 103504674
MCHA: 111024539
CMAX: 111493405
CMOS: 111452792
CPEP: 111789279
RCU: 8286024
JCU: 105628123
MESC: 110613446
POP: 18097674
PEU: 105107264
JRE: 108990087
VVI: 100253554(GTF2H2)
SLY: 101268093
SPEN: 107018273
SOT: 102581609 102601591(GTF2H2)
NSY: 104227221
NTO: 104120729
NAU: 109237298
INI: 109160268
SIND: 105170318
OEU: 111400172
HAN: 110927083
LSV: 111877504
CCAV: 112520761
DCR: 108218907
BVG: 104884127
SOE: 110791949
NNU: 104597477
OSA: 4336358
DOSA: Os04t0508900-00(Os04g0508900)
OBR: 102705432
BDI: 100833758
ATS: 109749369(LOC109749369)
SBI: 8064457
ZMA: 100274342
SITA: 101765342
MUS: 103976531
DCT: 110101134
PEQ: 110029586
AOF: 109837187
ATR: 18435639
PPP: 112276815
CRE: CHLREDRAFT_127751(TF2H2)
APRO: F751_6740
SCE: YLR005W(SSL1)
KMX: KLMA_80072(SSL1)
NCS: NCAS_0D02890(NCAS0D02890)
NDI: NDAI_0I02010(NDAI0I02010)
TPF: TPHA_0E02960(TPHA0E02960)
TBL: TBLA_0C03620(TBLA0C03620)
TDL: TDEL_0E03990(TDEL0E03990)
KAF: KAFR_0J00710(KAFR0J00710)
CAL: CAALFM_C201490CA(CaO19.1457)
SLB: AWJ20_5137(SSL1)
NCR: NCU01831
NTE: NEUTE1DRAFT84011(NEUTE1DRAFT_84011)
MGR: MGG_06690
SSCK: SPSK_01566
MAW: MAC_02014
MAJ: MAA_04765
CMT: CCM_00271
BFU: BCIN_15g03450(Bcssl1)
MBE: MBM_05585
ANI: AN4283.2
ANG: ANI_1_1576084(An09g06810)
ABE: ARB_06903
TVE: TRV_05937
PNO: SNOG_01225(SNOG_01224)
PTE: PTT_12637
SPO: SPCC1682.07(ssl1)
CNE: CNI01660
CNB: CNBH1580
ABP: AGABI1DRAFT71744(AGABI1DRAFT_71744)
ABV: AGABI2DRAFT204710(AGABI2DRAFT_204710)
MGL: MGL_0773
MRT: MRET_0044
DDI: DDB_G0272362(gtf2h2)
DFA: DFA_04777(gtf2h2)
EHI: EHI_182880(35.t00002)
PCB: PCHAS_141520(PC000769.01.0)
TAN: TA04780
TPV: TP03_0481
BBO: BBOV_IV001810(21.m02816)
CPV: cgd3_3110
TGO: TGME49_294920(GTF2H2)
PTI: PHATRDRAFT_54326(TFIIH-p44)
SPAR: SPRG_09130
GTT: GUITHDRAFT_139251(TFIIH)
 » show all
Reference
PMID:7961739
  Authors
Svejstrup JQ, Feaver WJ, LaPointe J, Kornberg RD
  Title
RNA polymerase transcription factor IIH holoenzyme from yeast.
  Journal
J Biol Chem 269:28044-8 (1994)
  Sequence
[sce:YLR005W]
Reference
PMID:8631896
  Authors
Sung P, Guzder SN, Prakash L, Prakash S
  Title
Reconstitution of TFIIH and requirement of its DNA helicase subunits, Rad3 and Rad25, in the incision step of nucleotide excision repair.
  Journal
J Biol Chem 271:10821-6 (1996)
DOI:10.1074/jbc.271.18.10821
  Sequence
[sce:YLR005W]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system