KEGG   ORTHOLOGY: K03144
Entry
K03144                      KO                                     

Name
TFIIH4, GTF2H4, TFB2
Definition
transcription initiation factor TFIIH subunit 4
Pathway
ko03022  Basal transcription factors
ko03420  Nucleotide excision repair
ko05203  Viral carcinogenesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03022 Basal transcription factors
    K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05203 Viral carcinogenesis
    K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Basal transcription factors
    TFIIH
     K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TFIIH complex
     K03144  TFIIH4, GTF2H4, TFB2; transcription initiation factor TFIIH subunit 4
Other DBs
GO: 0016251
Genes
HSA: 2968(GTF2H4)
PTR: 462549(GTF2H4)
PPS: 103784210(GTF2H4)
GGO: 101135417(GTF2H4)
PON: 100445828(GTF2H4)
NLE: 100602212(GTF2H4)
MCC: 714285(GTF2H4)
MCF: 101926545(GTF2H4)
CSAB: 103221812(GTF2H4)
RRO: 104666205(GTF2H4)
RBB: 108522581(GTF2H4)
CJC: 103792347(GTF2H4)
SBQ: 104650362(GTF2H4)
MMU: 14885(Gtf2h4)
MCAL: 110312547(Gtf2h4)
MPAH: 110335539(Gtf2h4)
RNO: 294236(Gtf2h4)
MUN: 110557132(Gtf2h4)
CGE: 103160241(Gtf2h4)
NGI: 108491187(Gtf2h4)
HGL: 101698842(Gtf2h4)
CCAN: 109693527(Gtf2h4)
TUP: 102492935(GTF2H4)
CFA: 100856712(GTF2H4)
VVP: 112913577(GTF2H4)
AML: 105241836(GTF2H4)
UMR: 103665011(GTF2H4)
UAH: 113264346(GTF2H4)
ORO: 101364032(GTF2H4)
ELK: 111152186
FCA: 101097482(GTF2H4)
PTG: 102960946(GTF2H4)
PPAD: 109249522(GTF2H4)
AJU: 106966622(GTF2H4)
BTA: 100137723(GTF2H4)
BOM: 102280062(GTF2H4)
BIU: 109577069(GTF2H4)
BBUB: 102400837(GTF2H4)
CHX: 100861324(GTF2H4)
OAS: 101102343(GTF2H4)
SSC: 100144458(GTF2H4)
CFR: 102508101(GTF2H4)
CDK: 105087489(GTF2H4)
BACU: 103011804(GTF2H4)
LVE: 103078718(GTF2H4)
DLE: 111170695(GTF2H4)
PCAD: 102981001(GTF2H4)
ECB: 100630479(GTF2H4)
EPZ: 103565580(GTF2H4)
EAI: 106825499(GTF2H4)
MYB: 102248213(GTF2H4)
MYD: 102756910(GTF2H4)
MNA: 107538527(GTF2H4)
HAI: 109376109(GTF2H4)
PALE: 102883568(GTF2H4)
RAY: 107498089(GTF2H4)
MJV: 108409887(GTF2H4)
LAV: 100663281(GTF2H4)
TMU: 101343306
MDO: 103093721(GTF2H4)
OAA: 103164668(GTF2H4)
PHI: 102099247(GTF2H4)
CLV: 102098994(GTF2H4)
NNI: 104011611(GTF2H4)
ASN: 102376084(GTF2H4)
AMJ: 102562719(GTF2H4)
PSS: 102454006(GTF2H4)
CMY: 102939007
CPIC: 101940531(GTF2H4)
ACS: 100556108(gtf2h4)
PVT: 110070653(GTF2H4)
PBI: 103061391(GTF2H4)
PMUR: 107295942(GTF2H4)
TSR: 106553928(GTF2H4)
PMUA: 114592105(GTF2H4)
GJA: 107117334(GTF2H4)
XLA: 432181(gtf2h4.S)
XTR: 548562(gtf2h4)
NPR: 108793558(GTF2H4)
DRE: 334839(gtf2h4)
SRX: 107754830(gtf2h4)
CCAR: 109098412(gtf2h4)
IPU: 108272880(gtf2h4)
PHYP: 113543717(gtf2h4)
AMEX: 103042913(gtf2h4)
EEE: 113569258 113583415(gtf2h4)
LCO: 104931066(gtf2h4)
MZE: 101487923(gtf2h4)
ONL: 100711889(gtf2h4)
OLA: 101173874(gtf2h4)
XMA: 102223591(gtf2h4)
XCO: 114156526(gtf2h4)
PRET: 103472137(gtf2h4)
CVG: 107103843(gtf2h4)
NFU: 107383255(gtf2h4)
KMR: 108244445(gtf2h4)
ALIM: 106531002(gtf2h4)
AOCE: 111582922(gtf2h4)
CSEM: 103394478(gtf2h4)
POV: 109642047(gtf2h4)
LCF: 108896382(gtf2h4)
SDU: 111220877(gtf2h4)
SLAL: 111645586(gtf2h4)
HCQ: 109528051(gtf2h4)
BPEC: 110164230(gtf2h4)
MALB: 109974575(gtf2h4)
SASA: 106570683(gtf2h4)
OTW: 112229405(gtf2h4)
SALP: 112071921(gtf2h4)
ELS: 105012338(gtf2h4)
SFM: 108935640(gtf2h4)
PKI: 111842830(gtf2h4)
LCM: 102354862(GTF2H4)
RTP: 109923359(gtf2h4)
BFO: 118420742
CIN: 100187369
APLC: 110978400
SKO: 102800746
DME: Dmel_CG7764(mrn)
DER: 6544533
DSE: 6605796
DSI: Dsimw501_GD12553(Dsim_GD12553)
DAN: 6493262
DSR: 110176193
DPE: 6597018
DMN: 108150875
DWI: 6645815
DAZ: 108613941
DNV: 108652565
DHE: 111594369
DVI: 6623805
MDE: 101895061
LCQ: 111685864
AAG: 5567888
AME: 412010
BIM: 100747453
BTER: 100648701
CCAL: 108627379
OBB: 114872804
SOC: 105201956
MPHA: 105837014
AEC: 105149373
ACEP: 105627099
PBAR: 105427761
VEM: 105561593
HST: 105192296
DQU: 106747090
CFO: 105253092
LHU: 105672127
PGC: 109863570
OBO: 105280984
PCF: 106789614
NVI: 100118816
CSOL: 105359217
MDL: 103574164
TCA: 659751
DPA: 109546892
ATD: 109599340
NVL: 108566369
BMOR: 101745815
BMAN: 114249034
PMAC: 106718856
PRAP: 110995525
HAW: 110377909
TNL: 113501999
DNX: 107166874
AGS: 114130696
RMD: 113553066
BTAB: 109032797
CLEC: 106662293
ZNE: 110832778
FCD: 110856157
TUT: 107366933
DPTE: 113799249
CSCU: 111613307
PTEP: 107445537
CEL: CELE_Y73F8A.24(Y73F8A.24)
CBR: CBG13719
BMY: Bm1_39045
TSP: Tsp_05888
PCAN: 112576370
CRG: 105336692
MYI: 110452962
OBI: 106879324
LAK: 106161714
SHX: MS3_10526
EGL: EGR_06711
NVE: 5510514
EPA: 110254906
ADF: 107335447
AMIL: 114964795
PDAM: 113683496
SPIS: 111327864
DGT: 114518839
HMG: 100211920
AQU: 100632485
ATH: AT4G17020
ALY: 9304163
CRB: 17879452
BRP: 103868966
BOE: 106325608
RSZ: 108827553
THJ: 104814462
CPAP: 110817799
CIT: 102607298
TCC: 18596870
GRA: 105777878
GAB: 108487365
VRA: 106765355
VAR: 108336424
CCAJ: 109805331
CAM: 101502894
LJA: Lj4g3v0451070.1(Lj4g3v0451070.1) Lj4g3v0451070.2(Lj4g3v0451070.2)
ADU: 107480809
AIP: 107631238
LANG: 109333170
FVE: 101297997
RCN: 112165407
PPER: 18780698
PMUM: 103324745
PAVI: 110766805
PXB: 103930366
ZJU: 107423855
CSV: 101206831
CMO: 103485310
MCHA: 111012326
CMAX: 111477843
CMOS: 111433104
CPEP: 111803566
RCU: 8275581
JCU: 105649526
HBR: 110649159
MESC: 110605606
POP: 7456803
PEU: 105128051
JRE: 108990627
SLY: 101244148
SPEN: 107011063
SOT: 102597627
CANN: 107859397
NSY: 104214900
NAU: 109244121
INI: 109170741
SIND: 105171210
OEU: 111377899
HAN: 110926314
LSV: 111917253
CCAV: 112523203
DCR: 108199997
BVG: 104900717
SOE: 110796840
NNU: 104587159
OSA: 4337426
DOSA: Os04t0680000-00(Os04g0680000)
OBR: 102707868
BDI: 100827851
ATS: 109748778(LOC109748778)
SBI: 8085882
ZMA: 103645755
SITA: 101777488
PDA: 103698213
EGU: 105059003
MUS: 103978675
DCT: 110102304
ATR: 18423104
PPP: 112279971
MNG: MNEG_1330
APRO: F751_1984
SCE: YPL122C(TFB2)
KMX: KLMA_50042(TFB2)
NCS: NCAS_0C01390(NCAS0C01390)
NDI: NDAI_0E02130(NDAI0E02130)
TPF: TPHA_0A01010(TPHA0A01010)
TBL: TBLA_0E04140(TBLA0E04140)
TDL: TDEL_0A05660(TDEL0A05660)
KAF: KAFR_0H02850(KAFR0H02850)
PIC: PICST_29855(TFB2)
CAL: CAALFM_CR05560WA(CaO19.5846)
SLB: AWJ20_980(TFB2)
NCR: NCU05523
NTE: NEUTE1DRAFT87562(NEUTE1DRAFT_87562)
MGR: MGG_00397
SSCK: SPSK_02439
MAW: MAC_04811
MAJ: MAA_02366
CMT: CCM_04364
BFU: BCIN_01g08930(Bctfb2)
MBE: MBM_05998
ANI: AN7015.2
ANG: ANI_1_86124(An14g00480)
ABE: ARB_03925
TVE: TRV_00272
PTE: PTT_08708
SPO: SPBC13G1.13(tfb2)
CNE: CNN01190
CNB: CNBN1180
TASA: A1Q1_07170
MRR: Moror_975
ABP: AGABI1DRAFT114851(AGABI1DRAFT_114851)
ABV: AGABI2DRAFT191077(AGABI2DRAFT_191077)
MGL: MGL_1397
MRT: MRET_3962
DDI: DDB_G0293228(gtf2h4)
DFA: DFA_01523(gtf2h4)
EHI: EHI_192400(7.t00062)
PCB: PCHAS_145980(PC000320.04.0)
TAN: TA16710
TPV: TP01_0989
BBO: BBOV_IV008020(23.m06454)
CPV: cgd2_2060
TGO: TGME49_214520(GTF2H4)
SMIN: v1.2.036961.t2(symbB.v1.2.036961.t2)
SPAR: SPRG_04339
GTT: GUITHDRAFT_104031(TFB2)
 » show all
Reference
PMID:7961739
  Authors
Svejstrup JQ, Feaver WJ, LaPointe J, Kornberg RD
  Title
RNA polymerase transcription factor IIH holoenzyme from yeast.
  Journal
J Biol Chem 269:28044-8 (1994)
  Sequence
[sce:YPL122C]
Reference
PMID:8631896
  Authors
Sung P, Guzder SN, Prakash L, Prakash S
  Title
Reconstitution of TFIIH and requirement of its DNA helicase subunits, Rad3 and Rad25, in the incision step of nucleotide excision repair.
  Journal
J Biol Chem 271:10821-6 (1996)
DOI:10.1074/jbc.271.18.10821
  Sequence
[sce:YPL122C]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system