KEGG   ORTHOLOGY: K03900
Entry
K03900                      KO                                     

Name
VWF
Definition
von Willebrand factor
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04610  Complement and coagulation cascades
ko04611  Platelet activation
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05171  Coronavirus disease - COVID-19
Disease
H00219  Hemophilia
H01740  Macrothrombocytopenia
H02092  von Willebrand disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K03900  VWF; von Willebrand factor
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K03900  VWF; von Willebrand factor
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K03900  VWF; von Willebrand factor
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04610 Complement and coagulation cascades
    K03900  VWF; von Willebrand factor
   04611 Platelet activation
    K03900  VWF; von Willebrand factor
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05171 Coronavirus disease - COVID-19
    K03900  VWF; von Willebrand factor
   05165 Human papillomavirus infection
    K03900  VWF; von Willebrand factor
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03110 Chaperones and folding catalysts
    K03900  VWF; von Willebrand factor
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K03900  VWF; von Willebrand factor
Chaperones and folding catalysts [BR:ko03110]
 Intramolecular chaperones
  Others
   K03900  VWF; von Willebrand factor
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
   K03900  VWF; von Willebrand factor
Genes
HSA: 7450(VWF)
PTR: 451773(VWF)
PPS: 100985238(VWF)
GGO: 101135657 101142333(VWF)
PON: 100434817(VWF)
NLE: 100580759(VWF)
MCC: 722019(VWF)
MCF: 102132631(VWF)
CSAB: 103218442(VWF)
RRO: 104680130(VWF)
RBB: 108536508(VWF)
CJC: 100396684(VWF)
SBQ: 101044155(VWF)
MMU: 22371(Vwf)
MCAL: 110295806(Vwf)
MPAH: 110316106(Vwf)
RNO: 116669(Vwf)
MUN: 110548579(Vwf)
CGE: 100750531(Vwf)
NGI: 103727534(Vwf)
HGL: 101696988(Vwf)
CCAN: 109682788(Vwf)
OCU: 100009165(VWF)
TUP: 102483687(VWF)
CFA: 399544(VWF)
VVP: 112917517(VWF)
AML: 100468710(VWF)
UMR: 103656237(VWF)
UAH: 113257990(VWF)
ORO: 101385961(VWF)
ELK: 111159823
FCA: 493760(VWF)
PTG: 102965421(VWF)
PPAD: 109276146(VWF)
AJU: 106965451(VWF)
BTA: 280958(VWF)
BOM: 102282731(VWF)
BIU: 109558606(VWF)
BBUB: 102397126(VWF)
CHX: 102191119(VWF)
OAS: 101110931(VWF)
SSC: 399543(VWF)
CFR: 102505067(VWF)
CDK: 105098230(VWF)
BACU: 103021101(VWF)
LVE: 103073004(VWF)
OOR: 101277710(VWF)
DLE: 111176651(VWF)
PCAD: 102980033(VWF)
ECB: 100059472(VWF)
EPZ: 103546989(VWF)
EAI: 106831485(VWF)
MYB: 102248658(VWF)
MYD: 102769477(VWF)
MNA: 107544091(VWF)
HAI: 109373317(VWF)
DRO: 112321736(VWF)
PALE: 102891539(VWF)
RAY: 107519777(VWF)
MJV: 108404459(VWF)
LAV: 100671560(VWF)
TMU: 101349323
MDO: 100014453(VWF)
SHR: 100933673(VWF)
PCW: 110213728(VWF)
OAA: 103166232(VWF)
GGA: 419031(VWF)
MGP: 100540162
CJO: 107318080(VWF)
NMEL: 110397366(VWF)
APLA: 101800806(VWF)
ACYG: 106045477(VWF)
TGU: 100228828(VWF)
LSR: 110475724(VWF)
SCAN: 103819672(VWF)
GFR: 102043317(VWF)
FAB: 101807556(VWF)
PHI: 102110108(VWF)
PMAJ: 107204805(VWF)
CCAE: 111923395(VWF)
CCW: 104696117
ETL: 114066532
FPG: 101921387(VWF)
FCH: 102052513(VWF)
CLV: 102094798(VWF)
EGZ: 104124217(VWF)
NNI: 104021755(VWF)
ACUN: 113490952(VWF)
PADL: 103917229(VWF)
AAM: 106488669(VWF)
ASN: 102378714(VWF)
AMJ: 102568241(VWF)
PSS: 102446530(VWF)
CMY: 102938529(VWF)
CPIC: 101953722(VWF)
ACS: 100560975(vwf)
PVT: 110074979(VWF)
PBI: 103058879(VWF)
PMUR: 107298567(VWF)
TSR: 106548389
PMUA: 114596909(VWF)
GJA: 107108141(VWF)
XLA: 108710813(vwf.L)
XTR: 100492314(vwf)
NPR: 108792025(VWF)
DRE: 570643(vwf)
SRX: 107736173(vwf)
SANH: 107662885(vwf)
SGH: 107600553
CCAR: 109110555
IPU: 108264049(vwf)
PHYP: 113526338(vwf)
AMEX: 103041546(vwf)
EEE: 113580514(vwf)
TRU: 101063204(vwf)
NCC: 104957243(vwf)
MZE: 101481554(vwf)
ONL: 100710915(vwf)
OLA: 101162365(vwf)
XMA: 102221825(vwf)
XCO: 114135853(vwf)
PRET: 103466661(vwf)
CVG: 107102395(vwf)
NFU: 107388831(vwf)
KMR: 108230107(vwf)
ALIM: 106514310(vwf)
AOCE: 111571921(vwf)
CSEM: 103380069(vwf)
POV: 109624060(vwf)
LCF: 108875127
SDU: 111228525(vwf)
SLAL: 111653371(vwf)
HCQ: 109528086(vwf)
BPEC: 110169224(vwf)
MALB: 109967704(vwf)
SASA: 106561856
ELS: 105029375(vwf)
SFM: 108920936(vwf)
PKI: 111837788(vwf)
LCM: 102356867(VWF)
CMK: 103185564(vwf)
RTP: 109930160(vwf)
CIN: 104266451
DME: Dmel_CG7002(Hml)
DER: 6545611
DSE: 6605606
DSI: Dsimw501_GD14459(Dsim_GD14459)
DAN: 6506118
DSR: 110190187
DPE: 6602157
DWI: 6639247
DAZ: 108613824
DNV: 108651797
DHE: 111595151
DVI: 6622864
MDE: 101888148
 » show all
Reference
PMID:3489923
  Authors
Bonthron D, Orr EC, Mitsock LM, Ginsburg D, Handin RI, Orkin SH
  Title
Nucleotide sequence of pre-pro-von Willebrand factor cDNA.
  Journal
Nucleic Acids Res 14:7125-7 (1986)
DOI:10.1093/nar/14.17.7125
  Sequence
[hsa:7450]
Reference
  Authors
Luo GP, Ni B, Yang X, Wu YZ
  Title
von Willebrand Factor: More Than a Regulator of Hemostasis and Thrombosis.
  Journal
Acta Haematol 128:158-169 (2012)
DOI:10.1159/000339426
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K16857
Entry
K16857                      KO                                     

Name
THBS1
Definition
thrombospondin 1
Pathway
ko04015  Rap1 signaling pathway
ko04115  p53 signaling pathway
ko04145  Phagosome
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04350  TGF-beta signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05144  Malaria
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05205  Proteoglycans in cancer
ko05206  MicroRNAs in cancer
ko05219  Bladder cancer
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04015 Rap1 signaling pathway
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
   04350 TGF-beta signaling pathway
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04145 Phagosome
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09143 Cell growth and death
   04115 p53 signaling pathway
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05206 MicroRNAs in cancer
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
   05205 Proteoglycans in cancer
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09162 Cancer: specific types
   05219 Bladder cancer
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09174 Infectious disease: parasitic
   05144 Malaria
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
   04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
Membrane trafficking [BR:ko04131]
 Endocytosis
  Phagocytosis
   Opsonins
    K16857  THBS1; thrombospondin 1
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K16857  THBS1; thrombospondin 1
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:ko04990]
 Thrombospondin domain-containing proteins
  Thrombospondins
   K16857  THBS1; thrombospondin 1
Genes
HSA: 7057(THBS1)
PTR: 453319(THBS1)
PPS: 100994890(THBS1)
GGO: 101135507(THBS1)
PON: 100453386(THBS1)
NLE: 100603886(THBS1)
MCC: 705413(THBS1)
MCF: 102130245(THBS1)
CSAB: 103245860(THBS1)
RRO: 104659681(THBS1)
RBB: 108526966(THBS1)
CJC: 100390178(THBS1)
SBQ: 101029602(THBS1)
MMU: 21825(Thbs1)
MCAL: 110310932(Thbs1)
MPAH: 110319023(Thbs1)
RNO: 445442(Thbs1)
MUN: 110564049(Thbs1)
CGE: 100760878(Thbs1)
NGI: 103727450(Thbs1)
HGL: 101701581(Thbs1)
CCAN: 109700113(Thbs1)
OCU: 100350430(THBS1)
TUP: 102497602(THBS1)
CFA: 487486(THBS1)
VVP: 112919933(THBS1)
AML: 100465724(THBS1)
UMR: 103673473(THBS1)
UAH: 113242050(THBS1)
ORO: 101376329(THBS1)
ELK: 111161597
FCA: 101092689(THBS1)
PTG: 102969748(THBS1)
PPAD: 109263182(THBS1)
AJU: 106979757(THBS1)
BTA: 281530(THBS1)
BOM: 102278109(THBS1)
BIU: 109564916(THBS1)
BBUB: 102401160(THBS1)
CHX: 100860971(THBS1)
OAS: 101106433(THBS1)
SSC: 492313(THBS1)
CFR: 102519986(THBS1)
CDK: 105096896(THBS1)
BACU: 103019307(THBS1)
LVE: 103080694(THBS1)
OOR: 101283920(THBS1)
DLE: 111181763(THBS1)
PCAD: 102995420(THBS1)
ECB: 100057478(THBS1)
EPZ: 103556716(THBS1)
EAI: 106835162(THBS1)
MYB: 102250983(THBS1)
MYD: 102758170(THBS1)
MNA: 107543012(THBS1)
HAI: 109384080(THBS1)
DRO: 112311111(THBS1)
PALE: 102898784(THBS1)
RAY: 107514453(THBS1)
MJV: 108400147(THBS1)
LAV: 100667431(THBS1)
TMU: 101344047
MDO: 100031767(THBS1)
SHR: 100926698(THBS1)
PCW: 110202873(THBS1)
OAA: 100092988(THBS1)
GGA: 373987(THBS1)
MGP: 100542373(THBS1)
CJO: 107314919(THBS1)
NMEL: 110401369(THBS1)
APLA: 101793322(THBS1)
ACYG: 106031773(THBS1)
TGU: 100230636(THBS1)
LSR: 110475265(THBS1)
SCAN: 103826589(THBS1)
GFR: 102031762(THBS1)
FAB: 101818592(THBS1)
PHI: 102103663(THBS1)
PMAJ: 107206295(THBS1)
CCAE: 111930312(THBS1)
CCW: 104684025(THBS1)
ETL: 114063733(THBS1)
FPG: 101915773(THBS1)
FCH: 102054866(THBS1)
CLV: 102091738(THBS1)
EGZ: 104122092(THBS1)
NNI: 104020294(THBS1)
ACUN: 113480732(THBS1)
PADL: 103914353(THBS1)
AAM: 106482797(THBS1)
ASN: 102374383(THBS1)
AMJ: 102568233(THBS1)
PSS: 102447926(THBS1)
CMY: 102943153(THBS1)
CPIC: 101940307(THBS1)
ACS: 100552734(thbs1)
PVT: 110080127(THBS1)
PBI: 103054107(THBS1)
PMUR: 107296464(THBS1)
TSR: 106542050(THBS1)
PMUA: 114593635(THBS1)
GJA: 107119648(THBS1)
XLA: 379508(thbs1.S) 779026(thbs2.L)
XTR: 100170153(thbs1)
NPR: 108796832(THBS1)
DRE: 100332237(thbs1a) 561901(thbs1b)
IPU: 108257932(thbs1) 108270370
PHYP: 113530102(thbs1) 113531877
AMEX: 103029184(thbs1) 103031445
TRU: 101061772(thbs1) 101062487
NCC: 104957017(thbs1) 104963041
ONL: 100533981(thbs1a) 100533982(thbs1b)
OLA: 100302438 100302441(thbs1)
XMA: 102222883 102236898(thbs1)
PRET: 103457638 103458518(thbs1)
NFU: 107377820 107392441(thbs1)
KMR: 108233501(thbs1) 108236340
ALIM: 106522431(thbs1) 106535463
HCQ: 109516072 109523753(thbs1)
MALB: 109962404 109967980(thbs1)
SFM: 108919589(thbs1)
PKI: 111838851(thbs1)
LCM: 102358103(THBS1)
CMK: 103175202(thbs1)
RTP: 109918114(thbs1)
SPU: 577806
APLC: 110979481
SKO: 100375408
NVE: 5513940
AQU: 100632678
 » show all
Reference
PMID:2430973
  Authors
Lawler J, Hynes RO
  Title
The structure of human thrombospondin, an adhesive glycoprotein with multiple calcium-binding sites and homologies with several different proteins.
  Journal
J Cell Biol 103:1635-48 (1986)
DOI:10.1083/jcb.103.5.1635
  Sequence
[hsa:7057]
Reference
  Authors
Christopherson KS, Ullian EM, Stokes CC, Mullowney CE, Hell JW, Agah A, Lawler J, Mosher DF, Bornstein P, Barres BA
  Title
Thrombospondins are astrocyte-secreted proteins that promote CNS synaptogenesis.
  Journal
Cell 120:421-33 (2005)
DOI:10.1016/j.cell.2004.12.020
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K04659
Entry
K04659                      KO                                     

Name
THBS2S
Definition
thrombospondin 2/3/4/5
Pathway
ko04145  Phagosome
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05144  Malaria
ko05165  Human papillomavirus infection
Disease
H00476  Multiple epiphyseal dysplasia
H00477  Pseudoachondroplasia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04145 Phagosome
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  09174 Infectious disease: parasitic
   05144 Malaria
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
   04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
Membrane trafficking [BR:ko04131]
 Endocytosis
  Phagocytosis
   Opsonins
    K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
   K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  Exosomal proteins of colorectal cancer cells
   K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
  Exosomal proteins of bladder cancer cells
   K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:ko04990]
 Thrombospondin domain-containing proteins
  Thrombospondins
   K04659  THBS2S; thrombospondin 2/3/4/5
Genes
HSA: 1311(COMP) 7058(THBS2) 7059(THBS3) 7060(THBS4)
PTR: 450172(THBS4) 457359(THBS3) 463138(THBS2) 469068(COMP)
PPS: 100967906(COMP) 100978289(THBS4) 100985431(THBS3) 100991072(THBS2)
GGO: 101128581(THBS4) 101149083(THBS3) 101150111(THBS2) 101152032(COMP)
PON: 100443331(THBS3) 100447159(COMP) 100455895(THBS2) 100461836(THBS4)
NLE: 100580032(THBS2) 100582320(COMP) 100588927(THBS4) 100593174(THBS3)
MCC: 574276(THBS4) 708165(THBS2) 717572(THBS3) 720286(COMP)
MCF: 101867220(COMP) 102120028(THBS3) 102125342(THBS2) 102129227(THBS4)
CSAB: 103223769(THBS4) 103223887(THBS3) 103234192(COMP) 103240966(THBS2)
RRO: 104659600(THBS3) 104680172(THBS4) 104680632(COMP) 104681915(THBS2)
RBB: 108515625(COMP) 108526834(THBS3) 108528909(THBS4) 108542407(THBS2)
CJC: 100391538(THBS4) 100391690 100397101(THBS3) 100401976(THBS2)
SBQ: 101039744(THBS3) 101040437(COMP) 101043743(THBS2) 101046556(THBS4)
MMU: 12845(Comp) 21826(Thbs2) 21827(Thbs3) 21828(Thbs4)
MCAL: 110290706(Thbs3) 110300418(Comp) 110307848(Thbs4) 110312609(Thbs2)
MPAH: 110319825(Thbs3) 110329282(Thbs4) 110336430(Comp) 110338098(Thbs2)
RNO: 25304(Comp) 29220(Thbs4) 292406(Thbs2) 681309(Thbs3)
MUN: 110549169(Comp) 110552573(Thbs2) 110556884(Thbs3) 110561302(Thbs4)
CGE: 100752022(Thbs2) 100756924(Thbs3) 100762358(Thbs4) 100766091(Comp)
NGI: 103726858(Comp) 103742336(Thbs2) 103750279(Thbs4) 103750946(Thbs3)
HGL: 101696497(Thbs2) 101703996(Comp) 101704466(Thbs3) 101726773(Thbs4)
CCAN: 109680095(Thbs4) 109687973(Thbs3) 109688824 109694649(Comp) 109700790(Thbs2)
OCU: 100343910(THBS3) 100357137(THBS4) 100357972(THBS2)
TUP: 102476294(COMP) 102485527(THBS4) 102489246(Mucin-1) 102502758(THBS2)
CFA: 476665(COMP) 484087(THBS2) 488930(THBS4) 610359(THBS3)
VVP: 112913266(COMP) 112918914(THBS3) 112919585(THBS4) 112922696(THBS2)
AML: 100471588(THBS4) 100475917(THBS3) 100479895(COMP) 100481026(THBS2)
UMR: 103660792(THBS2) 103668378(THBS3) 103674931(COMP) 103681497(THBS4)
UAH: 113245270(THBS3) 113247125(THBS2) 113255163(THBS4) 113256730(COMP)
ORO: 101367458(THBS3) 101379053(THBS4) 101379820(COMP) 101381226(THBS2)
FCA: 101087199(THBS4) 101088820(COMP) 101093580(THBS3) 101100567(THBS2)
PTG: 102961939(THBS4) 102970054(THBS2) 102970726(THBS3) 102971808(COMP)
PPAD: 109245441(THBS2) 109247641(COMP) 109256247(THBS3) 109274929(THBS4)
AJU: 106969137(COMP) 106972141(THBS4) 106978641(THBS2) 106981523(THBS3)
BTA: 281088(COMP) 338092(THBS2) 504323(THBS3) 541281(THBS4)
BOM: 102267028(COMP) 102271065(THBS3) 102277745 102284714(THBS4)
BIU: 109553708(THBS3) 109561393(COMP) 109564125(THBS2) 109564670(THBS4)
BBUB: 102396797(THBS3) 102398782(THBS4) 102402152(COMP) 102407341(THBS2)
CHX: 102179674(THBS2) 102179675(THBS4) 102190117(COMP) 102190652(THBS3)
OAS: 101107864(COMP) 101115211(THBS4) 101116784(THBS3) 101116840(THBS2)
SSC: 100153940(THBS2) 100155108(THBS3) 100513005(THBS4) 396554(COMP)
CFR: 102511726(COMP) 102513826(THBS2) 102520625(THBS3) 102524625(THBS4)
CDK: 105084831(THBS4) 105088884(THBS3) 105091818(THBS2) 105101885(COMP)
BACU: 102998613(THBS4) 102999752(THBS2) 103007252(COMP) 103007962(THBS3)
LVE: 103068905(THBS3) 103083668(THBS4) 103086398(THBS2) 103090939(COMP)
OOR: 101271822(THBS3) 101272205(THBS2) 101274051(COMP) 101284998(THBS4)
DLE: 111166713(COMP) 111166972(THBS3) 111167894(THBS2) 111184890(THBS4)
PCAD: 102975576(COMP) 102977227(THBS4) 102979827(THBS2) 102986739(THBS3)
ECB: 100033911(COMP) 100050044(THBS2) 100063449(THBS3) 100073261(THBS4)
EPZ: 103546470(THBS2) 103552847(THBS3) 103556665(THBS4) 103565076(COMP)
EAI: 106828497(THBS3) 106841151(THBS4) 106846480(COMP) 106846766(THBS2)
MYB: 102242389(THBS2) 102248184(THBS4) 102249845(COMP) 102250634(THBS3)
MYD: 102752804(THBS4) 102759156(THBS3) 102759906(THBS2) 102770367(COMP)
MNA: 107535067(THBS4) 107535388(COMP) 107537025(THBS2) 107543851(THBS3)
HAI: 109381904(THBS4) 109382454(COMP) 109391677(THBS2) 109393407(THBS3)
DRO: 112297305(THBS2) 112305111(COMP) 112307475(THBS4) 112316816(THBS3)
PALE: 102880862(THBS2) 102885384(COMP) 102890277(THBS3) 102898345(THBS4)
RAY: 107497251(THBS4) 107500162(THBS2) 107503719(COMP) 107505455 107521448
MJV: 108390191(THBS4) 108406027(COMP) 108406777(THBS2) 108407292(THBS3)
LAV: 100657841(THBS3) 100667600(COMP) 100673862(THBS4) 100677407(THBS2)
MDO: 100016186(COMP) 100022025(THBS3) 100032579(THBS4) 100032659(THBS2)
SHR: 100913793(THBS2) 100926884(THBS4) 100928896(THBS3) 100934583(COMP)
PCW: 110197976(THBS2) 110211956(THBS3) 110216602(THBS4) 110223419(COMP)
OAA: 100082089(THBS2) 100087962(THBS4) 100092744(COMP) 107546926(THBS3)
GGA: 396306(THBS4) 414837(THBS2) 420120(COMP)
MGP: 100541177(THBS4) 100545155(THBS2) 100548314(COMP)
CJO: 107305921(THBS4) 107311485(THBS2) 107325349(COMP)
NMEL: 110388912(COMP) 110390104(THBS4) 110396493(THBS2)
APLA: 101797964(THBS2) 101801619(THBS4) 101803344(COMP)
ACYG: 106042117(THBS4) 106044590(THBS2) 106047968(COMP) 106048533(THBS3)
TGU: 100217632(THBS3) 100218446(COMP) 100221289(THBS2) 100223523(THBS4)
LSR: 110471001(THBS4) 110471498(THBS3) 110477384(THBS2) 110482833(COMP)
SCAN: 103818488(THBS2) 103819500(THBS4) 103824037(THBS3) 103824527(COMP)
GFR: 102035426(COMP) 102041416(THBS3) 102042662(THBS2) 102043756(THBS4)
FAB: 101807800(COMP) 101812668(THBS4) 101813407(THBS2) 101822081(THBS3)
PHI: 102105229(THBS2) 102107320(COMP) 102111962(THBS3) 102113828(THBS4)
PMAJ: 107201101(THBS2) 107214594(THBS3) 107215384(COMP) 107216117(THBS4)
CCAE: 111926911(THBS2) 111939534(THBS3) 111940269(COMP) 111941434(THBS4)
CCW: 104683533 104684330(THBS2) 104695692(THBS4) 104697387(COMP)
ETL: 114056830(THBS4) 114067663(THBS2) 114073186(THBS3)
FPG: 101920098(THBS4) 101921164(THBS3) 101923157(THBS2) 101923991(COMP)
FCH: 102046521(THBS3) 102049450 102058509(COMP) 102059472(THBS2)
CLV: 102088266(THBS2) 102095550(THBS3) 102097761(THBS4) 102098894(COMP)
EGZ: 104124903(THBS4) 104128875(THBS2) 104129782(COMP) 104134863(THBS3)
NNI: 104009111(THBS4) 104013690(COMP) 104017909(THBS2) 104020504(THBS3)
ACUN: 113478616(THBS2) 113489279(COMP) 113489640(THBS4) 113490844(THBS3)
PADL: 103915142(THBS3) 103919769(THBS4) 103921257(THBS2) 103923272(COMP)
AAM: 106487359(THBS2) 106494326(THBS3) 106496803(COMP)
ASN: 102368490(THBS2) 102376216(COMP) 102384190(THBS4) 102388282(THBS3)
AMJ: 102573791(THBS4) 102576627(THBS2) 106737012(COMP) 106737441
PSS: 102447492(THBS4) 102453824 102459232(THBS2) 102462619(COMP)
CMY: 102939257(COMP) 102941449(THBS2) 102942106(THBS3) 102946626(THBS4)
CPIC: 101930762(THBS2) 101934649(THBS4) 101937108(THBS3) 101937854(COMP)
ACS: 100559567(thbs3) 100563584(thbs2) 100563715(thbs4) 100564230(comp)
PVT: 110072531(COMP) 110073932(THBS4) 110080993(THBS3) 110083084(THBS2)
PBI: 103049428(THBS3) 103057878(THBS4) 103065576(THBS2) 103067390(COMP)
PMUR: 107282855(COMP) 107293307(THBS2) 107296697(THBS3) 107300595(THBS4)
PMUA: 114586306(THBS3) 114588672 114594352(THBS2) 114606486(THBS4)
GJA: 107106668(THBS2) 107115485(THBS4) 107117080(THBS3) 107125775(COMP)
XLA: 108695262 108700446(thbs3.S) 108706910 108716699 108717845 380339(thbs3.L) 397943(thbs4) 446985(thbs4.S)
XTR: 100494714(comp) 100494997(thbs2) 496875(thbs3) 780130(thbs4)
NPR: 108789855(THBS2) 108794774(THBS3) 108796348 108797516(THBS4)
DRE: 100318854(comp) 100535241(thbs2a) 252849(thbs3a) 252850(thbs4b) 563429(thbs4a) 566325(thbs2b) 571317(thbs3b)
PRET: 103463136(comp) 103470407(thbs4) 103473457 103477036(thbs2) 103477525(thbs3) 103481557
CSEM: 103381578 103387278(thbs2) 103388114(thbs3) 103390445 103395640(comp) 103398290(thbs4)
LCM: 102345222(THBS4) 102349677(THBS3) 102360244(COMP) 102363612(THBS2)
CMK: 103174809(thbs2) 103177771(thbs4) 103182059(comp)
RTP: 109912653 109923247(thbs3) 109927173(thbs4)
CIN: 100169670(thbsb) 100169671(thbsbi) 100178764
DME: Dmel_CG11326(Tsp)
DER: 6543052
DSI: Dsimw501_GD22550(Dsim_GD22550) Dsimw501_GD27031(Dsim_GD27031)
DMN: 108163627
DAZ: 108610263
DNV: 108650045
DHE: 111602188
MDE: 101901673
LCQ: 111674557
AALB: 115255865
AME: 413782
BIM: 100750023
BTER: 100650650
CCAL: 108627663
OBB: 114881071
SOC: 105205371
MPHA: 105830540
AEC: 105153996
ACEP: 105618023
PBAR: 105427393
VEM: 105563034
HST: 105181268
DQU: 106741866
CFO: 105250842
LHU: 105675000
OBO: 105283641
PCF: 106786939
NVI: 100114667
CSOL: 105362827
MDL: 103577865
TCA: 655453
DPA: 109534068
ATD: 109602774
NVL: 108568621
BMOR: 101743002
BMAN: 114239446
PMAC: 106716790
PRAP: 111002663
HAW: 110376123
TNL: 113502927
API: 100168802
DNX: 107166897
RMD: 113551054
BTAB: 109031376
CLEC: 106670689
ZNE: 110838833
FCD: 110863343
TUT: 107360433
DPTE: 113799571
CSCU: 111628402
PCAN: 112554573
OBI: 106872747
ABO: ABO_1526
APAC: S7S_07600
SCL: sce2642
 » show all
Reference
PMID:1559694
  Authors
LaBell TL, Milewicz DJ, Disteche CM, Byers PH
  Title
Thrombospondin II: partial cDNA sequence, chromosome location, and expression of a second member of the thrombospondin gene family in humans.
  Journal
Genomics 12:421-9 (1992)
DOI:10.1016/0888-7543(92)90430-Z
  Sequence
[hsa:7058]
Reference
  Authors
Christopherson KS, Ullian EM, Stokes CC, Mullowney CE, Hell JW, Agah A, Lawler J, Mosher DF, Bornstein P, Barres BA
  Title
Thrombospondins are astrocyte-secreted proteins that promote CNS synaptogenesis.
  Journal
Cell 120:421-33 (2005)
DOI:10.1016/j.cell.2004.12.020
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K05717
Entry
K05717                      KO                                     

Name
FN1
Definition
fibronectin 1
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04810  Regulation of actin cytoskeleton
ko04933  AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
ko05100  Bacterial invasion of epithelial cells
ko05135  Yersinia infection
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05205  Proteoglycans in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H01260  Glomerulopathy with fibronectin deposits
H02185  Spondylometaphyseal dysplasia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K05717  FN1; fibronectin 1
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09142 Cell motility
   04810 Regulation of actin cytoskeleton
    K05717  FN1; fibronectin 1
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K05717  FN1; fibronectin 1
   05205 Proteoglycans in cancer
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09167 Endocrine and metabolic disease
   04933 AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09171 Infectious disease: bacterial
   05135 Yersinia infection
    K05717  FN1; fibronectin 1
   05100 Bacterial invasion of epithelial cells
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K05717  FN1; fibronectin 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking
    K05717  FN1; fibronectin 1
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K05717  FN1; fibronectin 1
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K05717  FN1; fibronectin 1
   04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified
    K05717  FN1; fibronectin 1
Membrane trafficking [BR:ko04131]
 Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
  Forward pathways
   ER-Golgi intermediate compartment (ERGIC) proteins
    K05717  FN1; fibronectin 1
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of bladder cancer cells
   K05717  FN1; fibronectin 1
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K05717  FN1; fibronectin 1
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:ko04990]
 Fibronectin (FN) domain-containing proteins
  Fibronectin type I domain-containing proteins
   K05717  FN1; fibronectin 1
Genes
HSA: 2335(FN1)
PTR: 459926(FN1)
PPS: 100992555(FN1)
GGO: 101138168(FN1)
PON: 100449704(FN1)
NLE: 100601303(FN1)
MCC: 613269(FN1)
MCF: 102119232(FN1)
CSAB: 103217800(FN1)
RRO: 104669238(FN1)
RBB: 108543178(FN1)
CJC: 100405983(FN1)
SBQ: 101045340(FN1)
MMU: 14268(Fn1)
MCAL: 110283623(Fn1)
MPAH: 110321151(Fn1)
RNO: 25661(Fn1)
MUN: 110557288(Fn1)
CGE: 100751189(Fn1)
NGI: 103727691(Fn1)
HGL: 101718570(Fn1)
CCAN: 109697804(Fn1)
OCU: 100328589(FN1)
TUP: 102490245(FN1)
CFA: 403845(FN1)
VVP: 112922455(FN1)
AML: 100464134(FN1)
UMR: 103662788(FN1)
UAH: 113250491(FN1)
ORO: 101365197(FN1)
ELK: 111143733
FCA: 101081746(FN1)
PTG: 102970250(FN1)
PPAD: 109265107(FN1)
AJU: 106970125(FN1)
BTA: 280794(FN1)
BOM: 102280180(FN1)
BBUB: 102410593(FN1)
CHX: 102182645(FN1)
OAS: 100216462(FN1)
SSC: 397620(FN1)
CFR: 102518759(FN1)
CDK: 105086605(FN1)
BACU: 103018975(FN1)
LVE: 103084224(FN1)
OOR: 101275475(FN1)
DLE: 111171803(FN1)
PCAD: 102978142(FN1)
ECB: 100034189(FN1)
EPZ: 103563053(FN1)
EAI: 106832715(FN1)
MYB: 102244892(FN1)
MYD: 102753951(FN1)
MNA: 107524737(FN1)
HAI: 109380590(FN1)
DRO: 112307828(FN1)
PALE: 102891509(FN1)
RAY: 107513401(FN1)
MJV: 108407058(FN1)
LAV: 100667853(FN1)
TMU: 101361092
MDO: 100014118(FN1)
SHR: 100927509(FN1)
PCW: 110219415(FN1)
OAA: 100078116(FN1)
GGA: 396133(FN1)
MGP: 100551213(FN1)
CJO: 107316471(FN1)
NMEL: 110399842(FN1)
APLA: 101800175(FN1)
ACYG: 106034457(FN1)
TGU: 100231676(FN1)
LSR: 110474100(FN1)
SCAN: 103814579(FN1)
GFR: 102039500(FN1)
FAB: 101807963(FN1)
PHI: 102104961(FN1)
PMAJ: 107207628(FN1)
CCAE: 111931693(FN1)
CCW: 104694587(FN1)
ETL: 114060672(FN1)
FPG: 101911302(FN1)
FCH: 102054264(FN1)
CLV: 102090641(FN1)
EGZ: 104124152(FN1)
NNI: 104010144(FN1)
ACUN: 113482082(FN1)
PADL: 103921663(FN1)
ASN: 102381879(FN1)
AMJ: 102569824(FN1)
PSS: 102450093(FN1)
CMY: 102932170(FN1)
CPIC: 101948945(FN1)
ACS: 100563512(fn1)
PVT: 110081893(FN1)
PBI: 103048603(FN1)
PMUR: 107292554(FN1)
TSR: 106544514(FN1)
PMUA: 114583263(FN1)
GJA: 107121182(FN1)
XLA: 397744(fn1.S)
XTR: 595087(fn1)
NPR: 108789839(FN1)
DRE: 100005469(fn1a) 334613(fn1b)
IPU: 108258550(fn1) 108266812
NCC: 104962002 104967072(fn1)
OLA: 100529198(fn1) 101159085
PRET: 103460487 103462008(fn1)
NFU: 107381665(fn1) 107390187
ALIM: 106513936(fn1) 106523165
SASA: 100380696(finc) 106582526
OTW: 112225680(fn1) 112239140
ELS: 105019714(fn1) 105030358
PKI: 111840678(fn1) 111858354
LCM: 102367537(FN1)
CMK: 103176556(fn1)
RTP: 109922629(fn1)
CIN: 100180297
APLC: 110989168
PCAN: 112572161
CRG: 105341006
MYI: 110462249
OBI: 106882604
LAK: 106165850
 » show all
Reference
  Authors
Kay RA, Ellis IR, Jones SJ, Perrier S, Florence MM, Schor AM, Schor SL
  Title
The expression of migration stimulating factor, a potent oncofetal cytokine, is uniquely controlled by 3'-untranslated region-dependent nuclear sequestration of its precursor messenger RNA.
  Journal
Cancer Res 65:10742-9 (2005)
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-2038
  Sequence
[hsa:2335]
Reference
  Authors
Yi M, Ruoslahti E
  Title
A fibronectin fragment inhibits tumor growth, angiogenesis, and metastasis.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 98:620-4 (2001)
DOI:10.1073/pnas.98.2.620
Reference
PMID:3031656
  Authors
Dean DC, Bowlus CL, Bourgeois S
  Title
Cloning and analysis of the promotor region of the human fibronectin gene.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 84:1876-80 (1987)
DOI:10.1073/pnas.84.7.1876
  Sequence
[hsa:2335]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06236
Entry
K06236                      KO                                     

Name
COL1A
Definition
collagen type I alpha
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04611  Platelet activation
ko04926  Relaxin signaling pathway
ko04933  AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
ko04974  Protein digestion and absorption
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05205  Proteoglycans in cancer
Disease
H00506  Osteogenesis imperfecta
H00613  Infantile cortical hyperostosis
H01593  Osteoporosis
H02241  Ehlers-Danlos syndrome cardiac valvular type
H02243  Ehlers-Danlos syndrome arthrochalasia type
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04611 Platelet activation
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09152 Endocrine system
   04926 Relaxin signaling pathway
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09154 Digestive system
   04974 Protein digestion and absorption
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05205 Proteoglycans in cancer
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09167 Endocrine and metabolic disease
   04933 AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K06236  COL1A; collagen type I alpha
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K06236  COL1A; collagen type I alpha
Other DBs
GO: 0030020
Genes
HSA: 1277(COL1A1) 1278(COL1A2)
PTR: 104001053(COL1A1) 455117(COL1A2)
PPS: 100974826(COL1A2) 100991060(COL1A1)
GGO: 101130610(COL1A1) 101142769(COL1A2)
PON: 100438152(COL1A1) 100439107(COL1A2)
NLE: 100595865(COL1A2) 100604090(COL1A1)
MCC: 574201(COL1A1) 700359(COL1A2)
MCF: 102128759(COL1A1) 102130586(COL1A2)
CSAB: 103226536(COL1A2) 103242558 103242943(COL1A1) 103243871
RRO: 104680270(COL1A1) 104682783(COL1A2)
RBB: 108516437(COL1A1) 108517180(COL1A2)
CJC: 100386176(COL1A1) 100411438(COL1A2)
SBQ: 101045518(COL1A2) 101051510(COL1A1) 104651959
MMU: 12842(Col1a1) 12843(Col1a2)
MCAL: 110296014(Col1a2) 110304196(Col1a1)
MPAH: 110316202(Col1a2) 110332508(Col1a1)
RNO: 103689932(NEWGENE_621351) 29393(Col1a1) 84352(Col1a2)
CGE: 100759814(Col1a1) 100766269(Col1a2)
NGI: 103725222(Col1a2) 103738382(Col1a1)
HGL: 101703193(Col1a1) 101722393(Col1a2)
CCAN: 109679536 109686230(Col1a2) 109691407(Col1a1)
OCU: 100008997(COL1A2) 100347598(COL1A1) 103351483
TUP: 102469999(COL1A1) 102496034(COL1A2)
VVP: 112917855(COL1A1) 112923896(COL1A2)
AML: 100474885(COL1A2) 100476237(COL1A1)
UMR: 103658736(COL1A2) 103660945(COL1A1)
UAH: 113260108(COL1A2) 113265614(COL1A1)
ORO: 101368204(COL1A1) 101374645(COL1A2) 105757317
FCA: 101089428(COL1A2) 101092216(COL1A1) 102901092 105261147
PTG: 102967512(COL1A1) 102971076(COL1A2)
PPAD: 109246104 109247299(COL1A1) 109263702(COL1A2)
AJU: 106969999(COL1A2) 106985166(COL1A1) 113595914
BTA: 282187(COL1A1) 282188(COL1A2)
BOM: 102265105(COL1A1) 102267202(COL1A2)
BIU: 109558214(COL1A2) 109573749(COL1A1) 109575219
BBUB: 102391895(COL1A1) 102414428(COL1A2)
SSC: 100626716(COL1A2) 100738123(COL1A1)
CFR: 102510097(COL1A1) 102520737(COL1A2)
CDK: 105088734(COL1A2) 105104820(COL1A1)
OOR: 101278764(COL1A1) 101289458(COL1A2)
DLE: 111166407(COL1A1) 111181088(COL1A2)
PCAD: 102974557(COL1A2) 102984195(COL1A1)
ECB: 100033877(COL1A1) 100051715(COL1A2) 111768712 111772992
EPZ: 103549571(COL1A1) 103553631(COL1A2)
EAI: 106826321(COL1A1) 106838933(COL1A2)
MYB: 102253918(COL1A2) 102254069 102259707(COL1A1)
MYD: 102770947(COL1A2) 102772822(COL1A1)
MNA: 107539184(COL1A1) 107541704(COL1A2)
HAI: 109371948(COL1A2) 109380648(COL1A1)
DRO: 112316389(COL1A1) 112319841(COL1A2)
PALE: 102878069(COL1A2) 102886463(COL1A1)
RAY: 107517613(COL1A1) 107518820(COL1A2)
MJV: 108385124(COL1A1) 108398405(COL1A2)
LAV: 100668620(COL1A2) 100671297(COL1A1) 104847114
MDO: 100019354(COL1A1) 100032285
SHR: 100916041(COL1A2) 100924667(COL1A1)
PCW: 110196562 110215826(COL1A1) 110217565(COL1A2)
OAA: 100078516(COL27A1) 100079519(COL1A1) 100084260(LRRC32) 100681278(COL1A2)
GGA: 395532(COL1A1) 396243(COL1A2)
MGP: 100540436(COL1A2)
CJO: 107309082(COL1A2) 107325218(COL1A1)
NMEL: 110388398 110394035(COL1A2)
APLA: 101794718(COL1A2)
ACYG: 106039681(COL1A2) 106049842
TGU: 100221003(COL1A2) 115490616(COL1A1)
LSR: 110474735(COL1A2) 110474802(COL1A1)
SCAN: 103812824(COL1A2) 103823046
GFR: 102033823(COL1A2)
FAB: 101814652(COL1A2)
PHI: 102100227(COL1A2) 102104738(COL1A1)
PMAJ: 107199012(COL1A1) 107200743(COL1A2) 107211448
CCAE: 111924397(COL1A2)
CCW: 104689333(COL1A2)
ETL: 114069045(COL1A1) 114072794(COL1A2)
FPG: 101921645(COL1A2) 101924780(COL1A1)
FCH: 102046312(COL1A1) 102047033(COL1A2)
CLV: 102090396(COL1A2) 102092022(COL1A1)
EGZ: 104129008(COL1A2) 104131410
NNI: 104012250(COL1A1) 104014017(COL1A2)
ACUN: 113477097(COL1A2)
PADL: 103922378(COL1A2)
AAM: 106483393(COL1A2) 106487646
ASN: 102372309(COL1A2) 102376361(COL1A1)
AMJ: 102565404(COL1A1) 102568819(COL1A2)
PSS: 102445411(COL1A1) 102457083(COL1A2)
CPIC: 101942871(COL1A2) 101949941(COL1A1)
ACS: 100559991(col1a2) 100565711(col1a1)
PVT: 110074712(COL1A2) 110079135(COL1A1)
PBI: 103053762(COL1A2) 103055359(COL1A1)
PMUR: 107282605(COL1A1) 107283645(COL1A2) 107291014
TSR: 106541913(COL1A2) 106544700(COL1A1)
PMUA: 114581566(COL1A1) 114606812 114607350(COL1A2)
GJA: 107112523(COL1A1) 107118003(COL1A2)
XLA: 108700840(col1a1.L) 108719903(col1a2.S) 380419(col1a2.L) 380515(col1a1.S)
XTR: 496414(col1a1) 780175(col1a2)
NPR: 108784001(COL1A1) 108790501(COL1A2)
DRE: 325675(col1a1b) 336471(col1a2) 337158(col1a1a)
EEE: 113569930(col1a1) 113574298 113578661(col1a2)
MZE: 101475669 101476419(col1a1) 101486099(col1a2)
ONL: 100694532 100702721(col1a1) 100710094(col1a2)
OLA: 100144368(col1) 101162163 105355091(col1a2)
XMA: 102219489(col1a2) 102229978 102232000(col1a1)
XCO: 114147802(col1a1) 114151867 114155637(col1a2)
LCM: 102345189(COL1A2) 102349893(COL1A1)
CMK: 103190072
RTP: 109926041 109934289(col1a1)
BFO: 118427568
APLC: 110987416
SKO: 100313725
DHE: 111595910
HAW: 110376234
TNL: 113502395
API: 100168286
DNX: 107169478
AGS: 114127802
RMD: 113560937
PVM: 113805419
CRG: 105325221
EPA: 110234744
PDAM: 113685694
HMG: 100201106(col3)
AQU: 100638905
ATS: 109784851(LOC109784851)
SLB: AWJ20_5068(NRG1)
CNB: CNBL2350
HPAZ: K756_03395
SCL: sce5460
MDI: METDI1739
MCH: Mchl_1323
MPO: Mpop_0272
RVA: Rvan_0318
ACR: Acry_1166
BLI: BL03072
BLD: BLi00800
BTM: MC28_2872
BPUS: UP12_09245
BCL: ABC0473
PMW: B2K_38910
CBEI: LF65_06295
CKL: CKL_2427
CKR: CKR_2141
CPY: Cphy_1694
SALQ: SYNTR_1564
PFT: JBW_01495
SCT: SCAT_5655
STRE: GZL_07344
SFK: KY5_5457c
SRO: Sros_8401
FAL: FRAAL5894
PSEA: WY02_23560
PAUT: Pdca_17930
ACTI: UA75_07845
ACAD: UA74_07865
PUV: PUV_05930
 » show all
Reference
PMID:2394758
  Authors
Weil D, D'Alessio M, Ramirez F, Eyre DR
  Title
Structural and functional characterization of a splicing mutation in the pro-alpha 2(I) collagen gene of an Ehlers-Danlos type VII patient.
  Journal
J Biol Chem 265:16007-11 (1990)
  Sequence
[hsa:1278]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K19719
Entry
K19719                      KO                                     

Name
COL2A
Definition
collagen type II alpha
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04974  Protein digestion and absorption
ko05165  Human papillomavirus infection
Disease
H00445  Osteoarthritis with mild chondrodysplasia
H00476  Multiple epiphyseal dysplasia
H00519  Spondyloepiphyseal dysplasia congenita
H00520  Type II collagenopathies
H00805  Vitreoretinal degeneration
H01526  Legg-Calve-Perthes Disease
H01529  Avascular necrosis of femoral head
H01709  Glucocorticoid-induced osteonecrosis
H02066  Achondrogenesis type II
H02070  Kniest dysplasia
H02071  Czech dysplasia
H02072  Stickler syndrome
H02187  Spondyloepimetaphyseal dysplasia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
 09150 Organismal Systems
  09154 Digestive system
   04974 Protein digestion and absorption
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K19719  COL2A; collagen type II alpha
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K19719  COL2A; collagen type II alpha
Other DBs
GO: 0030020
Genes
HSA: 1280(COL2A1)
PTR: 451860(COL2A1)
PPS: 100983139(COL2A1)
GGO: 101127576(COL2A1)
PON: 100433193(COL2A1)
NLE: 100588525(COL2A1)
MCC: 704851(COL2A1)
MCF: 102134921(COL2A1)
CSAB: 103238216(COL2A1)
RRO: 104654840(COL2A1)
RBB: 108515958(COL2A1)
CJC: 100400909(COL2A1)
SBQ: 101041402(COL2A1)
MMU: 12824(Col2a1)
MCAL: 110310133(Col2a1)
MPAH: 110335075(Col2a1)
RNO: 25412(Col2a1)
MUN: 110560093(Col2a1)
CGE: 100755037(Col2a1)
NGI: 103740626(Col2a1)
HGL: 101707672(Col2a1)
CCAN: 109691615(Col2a1)
OCU: 100009005(COL2A1)
TUP: 102470303(COL2A1)
CFA: 102152155 403826(COL2A1)
VVP: 112921081(COL2A1)
AML: 100474711(COL2A1)
UMR: 103675428(COL2A1)
UAH: 113257484(COL2A1)
ORO: 101370480(COL2A1)
ELK: 111157855
FCA: 101087493(COL2A1)
PTG: 102956312(COL2A1)
PPAD: 109249029(COL2A1)
AJU: 106969351(COL2A1)
BTA: 407142(COL2A1)
BOM: 102284180(COL2A1)
BIU: 109559169(COL2A1)
BBUB: 102403678(COL2A1)
CHX: 100860743(COL2A1)
OAS: 100196905(COL2A1)
SSC: 397323(COL2A1)
CFR: 102516074(COL2A1)
CDK: 105103802(COL2A1)
LVE: 103078299(COL2A1)
OOR: 101276952(COL2A1)
DLE: 111174067(COL2A1)
PCAD: 102984074(COL2A1)
ECB: 791241(COL2A1)
EPZ: 103546826(COL2A1)
EAI: 106836837(COL2A1)
MYB: 102248763 102254720(COL2A1)
MYD: 102768294(COL2A1)
MNA: 107528223(COL2A1)
HAI: 109372512(COL2A1)
DRO: 112318365(COL2A1)
PALE: 102894333(COL2A1)
RAY: 107499897(COL2A1)
MJV: 108392454(COL2A1)
LAV: 100675826(COL2A1)
TMU: 101343281
MDO: 100027887
SHR: 100915177(COL2A1)
PCW: 110201505(COL2A1)
OAA: 100091569(COL2A1) 114807425
GGA: 395069(COL2A1)
MGP: 100540311
CJO: 107306964(COL2A1)
NMEL: 110390877(COL2A1)
APLA: 106014712(COL2A1)
ACYG: 106049583(COL2A1)
TGU: 100219722(COL2A1)
LSR: 110480541(COL2A1)
GFR: 102031754(COL2A1) 102034431
PHI: 102111968(COL2A1)
PMAJ: 107198731(COL2A1)
CCAE: 111940513(COL2A1)
ETL: 114073615
FPG: 101919991(COL2A1)
FCH: 102059900(COL2A1)
CLV: 102092442(COL2A1)
EGZ: 104126835
NNI: 104017542(COL2A1)
ASN: 102371324(COL2A1)
AMJ: 102576638(COL2A1)
PSS: 102455782
CMY: 102932287(COL2A1)
CPIC: 101949909(COL2A1)
ACS: 100553016(col2a1)
PVT: 110071756(COL2A1)
PBI: 103059733(COL2A1)
PMUR: 107288503(COL2A1)
PMUA: 114586408(COL2A1)
GJA: 107120677
XLA: 397738(col2a1.L) 397739(col2a1.S)
XTR: 394828(col2a1)
NPR: 108800103(COL2A1)
DRE: 503730(col2a1b) 562496(col2a1a)
IPU: 108265655(col2a1)
PHYP: 113527853
OLA: 100529192 100682394(col2a1a)
LCM: 102345734 102359526(COL2A1)
CMK: 103189017(col1a2) 103189947(col2a1)
BFO: 118432715
CIN: 619229(fcol1)
SPU: 115917878 373267(COLP1alpha) 575353 583083(clmdn)
DPE: 6597673
MDE: 101889347
LCQ: 111684368
AAG: 110678066
AALB: 109421144
AME: 410038
BIM: 100743696
BTER: 100649253
CCAL: 108622864
OBB: 114872707
SOC: 105208111
MPHA: 105837322
AEC: 105154648
ACEP: 105622491
PBAR: 105432212
VEM: 105564766
HST: 105190388
DQU: 106750023
CFO: 105250620
LHU: 105673720
PGC: 109851614
OBO: 105285658
PCF: 106791787
NVI: 100120054
CSOL: 105362561
TCA: 660112
DPA: 109540705
NVL: 108568888
BMOR: 101746136
BMAN: 114253068
PMAC: 106712876
PRAP: 110999882
HAW: 110375333
TNL: 113496840
API: 100164192
DNX: 107169123
RMD: 113551888
BTAB: 109038179
CLEC: 106669954
ZNE: 110840376
FCD: 110856657
TUT: 107368669
CRG: 105325218
MYI: 110443072
OBI: 106868320
EGL: EGR_01301
NVE: 5521252
HMG: 100199754(HT1) 100211987(col2) 100212826(HT3)
AQU: 100634948
MNG: MNEG_1869
ABP: AGABI1DRAFT128802(AGABI1DRAFT_128802)
BCA: BCE_4868
BNC: BCN_4635
BCER: BCK_11550
BTT: HD73_5035
DAE: Dtox_3124
PSEH: XF36_06695
PAUT: Pdca_28680
RXY: Rxyl_2445
 » show all
Reference
  Authors
Gordon MK, Hahn RA
  Title
Collagens.
  Journal
Cell Tissue Res 339:247-57 (2010)
DOI:10.1007/s00441-009-0844-4
Reference
  Authors
Muller S, Soder S, Oliveira AM, Inwards CY, Aigner T
  Title
Type II collagen as specific marker for mesenchymal chondrosarcomas compared to other small cell sarcomas of the skeleton.
  Journal
Mod Pathol 18:1088-94 (2005)
DOI:10.1038/modpathol.3800391
  Sequence
[hsa:1280]
Reference
PMID:2587267
  Authors
Su MW, Lee B, Ramirez F, Machado M, Horton W
  Title
Nucleotide sequence of the full length cDNA encoding for human type II procollagen.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:9473 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.22.9473
  Sequence
[hsa:1280]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06237
Entry
K06237                      KO                                     

Name
COL4A
Definition
collagen type IV alpha
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04926  Relaxin signaling pathway
ko04933  AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
ko04974  Protein digestion and absorption
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H00579  Hereditary angiopathy with nephropathy, aneurysms, and muscle cramps (HANAC)
H00581  Alport syndrome
H00582  Benign familial hematuria
H00839  Porencephaly
H00877  Brain small vessel disease with hemorrhage
H01209  Deafness, X-linked
H01640  Uterine leiomyoma
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
 09150 Organismal Systems
  09152 Endocrine system
   04926 Relaxin signaling pathway
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09154 Digestive system
   04974 Protein digestion and absorption
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09167 Endocrine and metabolic disease
   04933 AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K06237  COL4A; collagen type IV alpha
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other cancer cells
   K06237  COL4A; collagen type IV alpha
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K06237  COL4A; collagen type IV alpha
Other DBs
GO: 0030020
Genes
HSA: 1282(COL4A1) 1284(COL4A2) 1285(COL4A3) 1286(COL4A4) 1287(COL4A5) 1288(COL4A6)
PTR: 452659(COL4A1) 452661(COL4A2) 459986(COL4A4) 459988(COL4A3) 465804(COL4A6) 465805(COL4A5)
PPS: 100972511(COL4A4) 100972868(COL4A3) 100976901(COL4A1) 100977235(COL4A2) 100983653(COL4A6) 100984686(COL4A5)
GGO: 101128311(COL4A1) 101130790(COL4A6) 101133910(COL4A5) 101136942(COL4A4) 101137308(COL4A3) 101149355(COL4A2)
PON: 100443710(COL4A4) 100444077(COL4A3) 100444160(COL4A1) 100444523(COL4A2) 100457450(COL4A6) 100457807(COL4A5)
NLE: 100584285(COL4A2) 100587255(COL4A6) 100588259(COL4A5) 100598507(COL4A4) 100598848(COL4A3) 100603791(COL4A1)
MCC: 100429807(COL4A2) 700281(COL4A1) 703707(COL4A6) 703814(COL4A5) 708287(COL4A4) 712444(COL4A3)
MCF: 102118598(COL4A4) 102122146(COL4A3) 102122606(COL4A1) 102125366(COL4A6) 102127262(COL4A5) 102131342(COL4A2)
CSAB: 103214793(COL4A2) 103214795(COL4A1) 103217991(COL4A3) 103217992(COL4A4) 103232468(COL4A5) 103232470(COL4A6)
RRO: 104658850(COL4A6) 104665145(COL4A5) 104671965(COL4A3) 104671966(COL4A4) 104679242(COL4A1) 104679243(COL4A2)
RBB: 108522717 108527057(COL4A1) 108527058(COL4A2) 108538728(COL4A3) 108538749(COL4A4)
CJC: 100388461(COL4A4) 100388823(COL4A3) 100394953(COL4A6) 100400812(COL4A1) 100405184(COL4A2) 100409842(COL4A5)
SBQ: 101034927(COL4A3) 101035241(COL4A4) 101035708(COL4A5) 101038957(COL4A1) 101044518(COL4A2) 101051846(COL4A6)
MMU: 12826(Col4a1) 12827(Col4a2) 12828(Col4a3) 12829(Col4a4) 12830(Col4a5) 94216(Col4a6)
MCAL: 110286219(Col4a5) 110286404 110289599(Col4a3) 110295504(Col4a4) 110299671(Col4a1) 110299672(Col4a2)
MPAH: 110313307(Col4a5) 110313365(Col4a6) 110321532(Col4a3) 110321617(Col4a4) 110337115(Col4a2) 110337116(Col4a1)
RNO: 102557498 290905(Col4a1) 306628(Col4a2) 363265(Col4a3) 363457(Col4a5) 363458(Col4a6)
MUN: 110542202 110547507(Col4a4) 110547508(Col4a3) 110548883(Col4a2) 110548884(Col4a1)
NGI: 103727826(Col4a4) 103727827(Col4a3) 103750029(Col4a6) 103750063(Col4a5) 103751683(Col4a2) 103751684(Col4a1)
HGL: 101709004(Col4a3) 101709338(Col4a5) 101709839(Col4a4) 101710396(Col4a6) 101718501(Col4a1) 101721657(Col4a2)
CCAN: 109675075 109675515 109685428 109687712(Col4a2) 109687757(Col4a1) 109696747(Col4a4) 109696748(Col4a3)
OCU: 100338437(COL4A6) 100357427(COL4A5) 100357900(COL4A4) 100358256(COL4A1) 100358522(COL4A2) 108176892(COL4A3)
TUP: 102478229(COL4A3) 102479923(COL4A1) 102480773(COL4A2) 102486100(COL4A5) 102489000(COL4A6) 102494131(COL4A4)
CFA: 403466(COL4A5) 403496(COL4A1) 403840(COL4A6) 403841(COL4A4) 403842(COL4A3) 403843(COL4A2)
VVP: 112909799 112925468(COL4A3) 112925530(COL4A4) 112927466(COL4A2) 112927467(COL4A1) 112932053(COL4A5) 112932054(COL4A6)
AML: 100478660(COL4A3) 100478752(COL4A1) 100478914(COL4A4) 100479004(COL4A2) 100479688(COL4A6) 100480195(COL4A5)
UMR: 103657624(COL4A2) 103657625(COL4A1) 103662858(COL4A3) 103662859(COL4A4) 103668926(COL4A5) 103668927(COL4A6)
UAH: 113241173(COL4A5) 113241234(COL4A6) 113250384(COL4A4) 113250386(COL4A3) 113251538(COL4A2) 113251539(COL4A1)
ORO: 101366517(COL4A3) 101367094(COL4A4) 101373537(COL4A5) 101373882(COL4A6) 101378777(COL4A1) 101381103(COL4A2)
FCA: 101087512(COL4A3) 101089498(COL4A6) 101091469(COL4A4) 101093002(COL4A5) 101096030(COL4A1) 101096282(COL4A2)
PTG: 102951304(COL4A6) 102951890(COL4A5) 102962233(COL4A4) 102965883(COL4A3) 102965922(COL4A2) 102966202(COL4A1)
PPAD: 109253654(COL4A6) 109253658(COL4A5) 109263959(COL4A1) 109264069(COL4A2) 109264961(COL4A4) 109264962(COL4A3)
AJU: 106967336(COL4A6) 106967337(COL4A5) 106972295(COL4A3) 106972327(COL4A4) 106986354(COL4A2) 106986355(COL4A1)
BTA: 282191(COL4A1) 317711(COL4A3) 407107(COL4A4) 508632(COL4A2) 511602(COL4A5) 523526(COL4A6)
BOM: 102265778(COL4A4) 102271607(COL4A5) 102272072(COL4A6) 102282491(COL4A2) 102282767(COL4A1) 102285223(COL4A3)
BIU: 109555197(COL4A6) 109555345(COL4A5) 109566959(COL4A1) 109567101(COL4A2) 109571374(COL4A3) 109575895(COL4A4)
BBUB: 102389047(COL4A4) 102399306(COL4A5) 102403266(COL4A2) 102405654(COL4A1) 102410702(COL4A6) 102416276
CHX: 102171079(COL4A1) 102171347(COL4A2) 102176677(COL4A6) 102176947(COL4A5) 102190083(COL4A4) 102190364(COL4A3) 108633195
OAS: 101102790(COL4A3) 101112706(COL4A5) 101113128(COL4A6) 101115552(COL4A1) 101115805(COL4A2) 101118172(COL4A4)
SSC: 100153454(COL4A2) 100515336(COL4A1) 100620724(COL4A6) 100621403(COL4A4) 100621504(COL4A3) 100737091(COL4A5)
CFR: 102508830(COL4A2) 102509068(COL4A1) 102520494(COL4A6) 102521464(COL4A5) 102524319(COL4A3) 102524585(COL4A4)
CDK: 105088289(COL4A4) 105088300(COL4A3) 105094076(COL4A2) 105094080(COL4A1) 105095427(COL4A6) 105099555(COL4A5)
BACU: 103009501(COL4A5) 103009884(COL4A1) 103009983(COL4A6) 103010470(COL4A2) 103010606(COL4A4) 103020723(COL4A3)
LVE: 103070575(COL4A6) 103074830(COL4A3) 103078804(COL4A4) 103088369(COL4A1) 103089438(COL4A2) 103091674(COL4A5)
OOR: 101270978(COL4A3) 101276186(COL4A2) 101278113(COL4A4) 101280233(COL4A1) 101289595(COL4A6) 101289846(COL4A5)
DLE: 111165780(COL4A5) 111165781(COL4A6) 111171889(COL4A4) 111171891(COL4A3) 111176383(COL4A2) 111176384(COL4A1)
PCAD: 102975365(COL4A5) 102978518(COL4A2) 102978798(COL4A1) 102984824(COL4A6) 102988692(COL4A4) 102992563(COL4A3)
ECB: 100037402(COL4A3) 100054545(COL4A5) 100060112(COL4A6) 100062160(COL4A4) 100066148(COL4A1) 100066264(COL4A2)
EPZ: 103547138(COL4A3) 103547140(COL4A4) 103556641(COL4A2) 103556643(COL4A1) 103559208(COL4A5)
EAI: 106827857(COL4A4) 106827859(COL4A3) 106838202(COL4A2) 106838209(COL4A1) 106839712(COL4A5) 106839714(COL4A6)
MYB: 102242641(COL4A6) 102243536(COL4A2) 102248314(COL4A3) 102249405(COL4A4) 102249508(COL4A1) 102256779(COL4A5)
MYD: 102752490(COL4A2) 102752777(COL4A1) 102764359(COL4A4) 102764638(COL4A3) 102768696(COL4A5) 102774545(COL4A6)
MNA: 107525529(COL4A3) 107525530(COL4A4) 107526032(COL4A5) 107526046(COL4A6) 107530382(COL4A1) 107530384(COL4A2)
HAI: 109383910(COL4A1) 109383936(COL4A2) 109390501(COL4A3) 109393347(COL4A6) 109393353(COL4A5) 109396325(COL4A4)
DRO: 112296845(COL4A5) 112296867(COL4A6) 112307731(COL4A3) 112307910(COL4A4) 112321420(COL4A2) 112321451(COL4A1)
PALE: 102879139(COL4A3) 102879385(COL4A4) 102891781(COL4A5) 102895248(COL4A6) 102898083(COL4A2) 102898331(COL4A1)
RAY: 107497217(COL4A3) 107497225(COL4A4) 107501441(COL4A6) 107504788 107506968 107511115(COL4A1) 107511116(COL4A2)
MJV: 108391617(COL4A1) 108395182(COL4A6) 108397219(COL4A4) 108397237(COL4A3) 108401312(COL4A2) 108406100(COL4A5)
LAV: 100664111(COL4A3) 100664398(COL4A4) 100667607(COL4A5) 100667893 100677472(COL4A1) 100677754(COL4A2)
MDO: 100021663(COL4A3) 100021728(COL4A4) 100023678(COL4A2) 100023705(COL4A1) 100025514
SHR: 100917328(COL4A3) 100917586(COL4A4) 100923249(COL4A2) 100923506(COL4A1) 100931618(COL4A5)
PCW: 110194741(COL4A5) 110196697(COL4A2) 110196698(COL4A1) 110197222(COL4A3) 110200243(COL4A4)
OAA: 100073948(COL4A4) 100078067(COL4A5) 100078102(COL4A6) 100084401(COL4A1) 100084415(COL4A2) 103170730(COL4A3)
GGA: 395530(COL4A1) 418752(COL4A2) 422348(COL4A5) 422350(COL4A6) 424797(COL4A3) 424799(COL4A4)
MGP: 100539562 100539715 100540855(COL4A5) 100541005(COL4A6) 100548601(COL4A2) 100550138(COL4A1)
CJO: 107307933(COL4A2) 107307934(COL4A1) 107312780(COL4A5) 107312782(COL4A6) 107318047(COL4A4) 107318048(COL4A3)
NMEL: 110398034(COL4A4) 110398035(COL4A3) 110403266(COL4A5) 110403268(COL4A6) 110407454(COL4A1) 110407460(COL4A2)
APLA: 101797440(COL4A4) 101797613(COL4A3) 101799662(COL4A5) 101800228(COL4A6) 101803874(COL4A2) 101804910(COL4A1)
ACYG: 106036183(COL4A3) 106036184(COL4A4) 106038545(COL4A6) 106038546(COL4A5) 106044442(COL4A1) 106044448(COL4A2)
TGU: 100218909(COL4A2) 100221489(COL4A3) 100224679(COL4A1) 100226545(COL4A5) 100227313(COL4A4) 105759150(COL4A6)
LSR: 110478752(COL4A2) 110478753(COL4A1) 110480058(COL4A5) 110480078(COL4A6) 110483658(COL4A3) 110483659(COL4A4)
SCAN: 103812408(COL4A1) 103812664(COL4A2) 103815656(COL4A3) 103815657(COL4A4) 103816521(COL4A5) 103816522(COL4A6)
GFR: 102034561(COL4A1) 102041212(COL4A6) 102041386(COL4A5) 102044225(COL4A2) 102044746(COL4A4) 102044913(COL4A3)
FAB: 101807691(COL4A5) 101807885(COL4A6) 101810620(COL4A4) 101810814(COL4A3) 101814446(COL4A1) 101814637(COL4A2)
PHI: 102100218(COL4A1) 102101909(COL4A4) 102102271(COL4A3) 102106135(COL4A6) 102106323(COL4A5) 102111682(COL4A2)
PMAJ: 107201901(COL4A2) 107201911(COL4A1) 107203714(COL4A6) 107203715(COL4A5) 107208754(COL4A4) 107208755(COL4A3)
CCAE: 111922729(COL4A2) 111928689(COL4A6) 111928695(COL4A5) 111933540(COL4A4) 111933625(COL4A3) 111944813(COL4A1)
CCW: 104686326(COL4A2) 104686327(COL4A1) 104693432(COL4A4) 104693493(COL4A3) 104694452(COL4A5) 104694483(COL4A6)
ETL: 114059691(COL4A5) 114059817(COL4A2) 114059824(COL4A1) 114065833 114066308(COL4A3) 114068748(COL4A4)
FPG: 101918166(COL4A6) 101918345(COL4A5) 101922424(COL4A4) 101922604(COL4A3) 101924055(COL4A2) 101924227(COL4A1)
FCH: 102046549(COL4A2) 102046717(COL4A1) 102051664(COL4A3) 102051835(COL4A4) 102052258(COL4A5) 102052429(COL4A6)
CLV: 102083797(COL4A4) 102083978 102085871(COL4A6) 102088881(COL4A1) 102089261(COL4A2) 102090256(COL4A5)
EGZ: 104127064(COL4A4) 104127065(COL4A3) 104132467(COL4A2) 104132468(COL4A1) 104133137(COL4A6) 104133297(COL4A5)
NNI: 104012564(COL4A1) 104012565(COL4A2) 104016493(COL4A3) 104016495(COL4A4) 104023605(COL4A5) 104023616(COL4A6)
ACUN: 113478513(COL4A1) 113479911(COL4A6) 113479912(COL4A5) 113480197(COL4A2) 113483234(COL4A3) 113483293(COL4A4)
PADL: 103915656(COL4A2) 103915657(COL4A1) 103917905(COL4A4) 103917906(COL4A3) 103920153(COL4A5) 103920223(COL4A6)
AAM: 106482661(COL4A5) 106482670 106485842(COL4A3) 106485911(COL4A4) 106493997(COL4A1) 106493998(COL4A2)
ASN: 102371381(COL4A3) 102375031(COL4A1) 102375357(COL4A4) 102380122(COL4A5) 102380767(COL4A6) 102388567(COL4A2)
AMJ: 102558085(COL4A6) 102558315(COL4A5) 102558707(COL4A1) 102559838(COL4A4) 102577197(COL4A3) 106736939(COL4A2)
PSS: 102443377 102445225(COL4A3) 102455715(COL4A1) 102455954(COL4A2) 102458094(COL4A5) 106731762
CMY: 102933966(COL4A2) 102934197(COL4A1) 102942604(COL4A6) 102942829(COL4A5) 102946071(COL4A4) 102946297(COL4A3)
CPIC: 101933552(COL4A3) 101944666(COL4A1) 101944934(COL4A2) 101945224(COL4A4) 101951592(COL4A5) 101952404(COL4A6)
ACS: 100552050(col4a2) 100554629(col4a6) 100554823(col4a5) 100564708(col4a3) 100564906(col4a4)
PVT: 110074283(COL4A6) 110078449(COL4A3) 110078450(COL4A4) 110080661(COL4A2) 110090761(COL4A1)
PBI: 103050392(COL4A1) 103053883 103056355(COL4A3) 103056584(COL4A4) 103056708(COL4A6) 103057504(COL4A5)
PMUR: 107284270(COL4A2) 107284271(COL4A1) 107286669(COL4A4) 107287766(COL4A3) 107303140(COL4A6) 107303151(COL4A5)
TSR: 106538546(COL4A4) 106543193 106549569 106550350(COL4A1)
PMUA: 114589308(COL4A6) 114589441(COL4A5) 114593452(COL4A1) 114593454(COL4A2) 114597811(COL4A3) 114597812(COL4A4)
GJA: 107109155 107113382(COL4A2) 107114009(COL4A5) 107115995(COL4A3) 107115996(COL4A4) 107120742
XLA: 108698394 108698395(col4a5.L) 108700098(col4a5.S) 108700099 108709738(col4a2.S) 108709739 108709740 373763(col4a2.L) 373764(col4a1.L)
XTR: 100124870(col4a1) 100486079(col4a2) 100492984(col4a5) 100493153(col4a6)
NPR: 108787443(COL4A1) 108787444(COL4A2) 108788810(COL4A6) 108788813(COL4A5)
DRE: 323561(col4a5) 553354(col4a3) 553355(col4a2) 554268(col4a6) 554269(col4a1) 554270(col4a4)
NCC: 104944130 104951518(col4a3) 104951520 104955105(col4a1) 104955107(col4a2)
BPEC: 110158306(col4a5) 110158307 110173190(col4a2) 110173192(col4a1) 110173582
LCM: 102346118(COL4A5) 102346381(COL4A6) 102348817(COL4A3) 102349091 102351071(COL4A2) 102351330(COL4A1)
CMK: 103175983(col4a3) 103175991(col4a4) 103177556(col4a1) 103177608(col4a2) 103179092(col4a5) 103179614 103182601 103182603
SPU: 115922489 373182(COLP3alpha) 373268(COLP2alpha) 373269(COLP4alpha)
DME: Dmel_CG16858(vkg) Dmel_CG4145(Col4a1)
DSI: Dsimw501_GD11984(Dsim_GD11984) Dsimw501_GD23318(Dsim_GD23318)
BMOR: 101736620 693056(CPR146)
CEL: CELE_F01G12.5(let-2)
CBR: CBG10116(Cbr-emb-9) CBG16372(Cbr-let-2)
OBI: 106877515
ADF: 107328816
MGR: MGG_02729
PNO: SNOG_10073(SNOG_10072)
MGL: MGL_1332
SMIN: v1.2.019093.t1(symbB.v1.2.019093.t1)
DAE: Dtox_3121
MVA: Mvan_2552
MGI: Mflv_3843
MVQ: MYVA_2444
FTJ: FTUN_7345
 » show all
Reference
  Authors
Colorado PC, Torre A, Kamphaus G, Maeshima Y, Hopfer H, Takahashi K, Volk R, Zamborsky ED, Herman S, Sarkar PK, Ericksen MB, Dhanabal M, Simons M, Post M, Kufe DW, Weichselbaum RR, Sukhatme VP, Kalluri R
  Title
Anti-angiogenic cues from vascular basement membrane collagen.
  Journal
Cancer Res 60:2520-6 (2000)
  Sequence
[hsa:1282]
Reference
PMID:3311751
  Authors
Brazel D, Oberbaumer I, Dieringer H, Babel W, Glanville RW, Deutzmann R, Kuhn K
  Title
Completion of the amino acid sequence of the alpha 1 chain of human basement membrane collagen (type IV) reveals 21 non-triplet interruptions located within the collagenous domain.
  Journal
Eur J Biochem 168:529-36 (1987)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13450.x
  Sequence
[hsa:1282]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06238
Entry
K06238                      KO                                     

Name
COL6A
Definition
collagen type VI alpha
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04974  Protein digestion and absorption
ko05165  Human papillomavirus infection
Disease
H00431  Ossification of the posterior longitudinal ligament of spine
H00831  Primary dystonia
H01338  Myosclerosis
H01340  Bethlem myopathy
H01341  Collagen VI myopathy
H01358  Atopic dermatitis
H01778  Ullrich disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
 09150 Organismal Systems
  09154 Digestive system
   04974 Protein digestion and absorption
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins
    K06238  COL6A; collagen type VI alpha
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
   K06238  COL6A; collagen type VI alpha
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:ko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   K06238  COL6A; collagen type VI alpha
 Hyaluronan
  Extracellular matrix or blood plasma proteins
   K06238  COL6A; collagen type VI alpha
Other DBs
GO: 0030020
Genes
HSA: 1291(COL6A1) 1292(COL6A2) 1293(COL6A3) 131873(COL6A6) 256076(COL6A5)
PTR: 450204(COL6A1) 460045(COL6A3) 470923(COL6A5) 474056(COL6A2) 742913(COL6A6) 749971
PPS: 100967866(COL6A5) 100968217(COL6A6) 100976833(COL6A2) 100978062(COL6A1) 100978109(COL6A3) 100980925
GGO: 101129379(COL6A3) 101142723 101152234
PON: 100431604(COL6A5) 100434628(COL6A6) 100459849(COL6A3) 100460129(COL6A1) 100461602(COL6A2) 100461955
NLE: 100583380 100590247(COL6A3) 100598572(COL6A5) 100600267(COL6A6) 100602363(COL6A1) 100602701(COL6A2) 115834119
MCC: 693357 694701(COL6A3) 709493(COL6A2) 719319(COL6A6) 719331(COL6A5) 721855(COL6A1)
MCF: 102120608(COL6A3) 102137568 102137961(COL6A2) 102138836(COL6A1) 102138933(COL6A5) 102140059(COL6A6)
CSAB: 103218151(COL6A3) 103220301(COL6A2) 103221158(COL6A1) 103241696(COL6A6) 103241698(COL6A5) 103241700
RRO: 104656442 104658033(COL6A3) 104667404(COL6A5) 104667602(COL6A2) 104667603(COL6A1) 104675733
RBB: 108522239(COL6A5) 108522246(COL6A6) 108537207 108539763(COL6A2) 108539779(COL6A1) 108540980(COL6A3)
CJC: 100404862(COL6A2) 100407319(COL6A3) 100407758(COL6A6) 100408376(COL6A1) 100408489 100413876(COL6A5)
MMU: 12833(Col6a1) 12834(Col6a2) 12835(Col6a3) 245026(Col6a6) 665033(Col6a5) 68553(Col6a4)
MCAL: 110293615(Col6a3) 110301905(Col6a6) 110301934 110301979(Col6a5) 110302943(Col6a2) 110303716(Col6a1)
MPAH: 110322321(Col6a3) 110326286(Col6a1) 110326421(Col6a2) 110327826(Col6a6) 110328130(Col6a5) 110328273
RNO: 294337(Col6a1) 315979(Col6a6) 315981(Col6a4) 361821(Col6a2) 367313(Col6a3) 501047(Col6a5)
MUN: 110546347(Col6a2) 110546356(Col6a1) 110550171(Col6a5) 110550186(Col6a6) 110550189 110561134(Col6a3)
CGE: 100754390(Col6a2) 100755078(Col6a1) 100769833(Col6a6) 100770126(Col6a5) 100770413 103164567
NGI: 103726199(Col6a3) 103727287(Col6a6) 103727289(Col6a5) 103739958(Col6a1) 103739960(Col6a2) 103747522
HGL: 101710889(Col6a1) 101711621(Col6a2) 101715830(Col6a6) 101717072(Col6a3)
CCAN: 109679488(Col6a5) 109695884(Col6a2) 109695885(Col6a1) 109702133(Col6a3)
OCU: 100339915(COL6A6) 100340417(COL6A5) 100343947(COL6A1) 100356474(COL6A2) 103345754(COL6A3)
TUP: 102471230(COL6A2) 102473520(COL6A1) 102474421 102477630(COL6A6) 102478065(COL6A5) 102494068(COL6A3)
CFA: 100855471 100856491(COL6A2) 403582(COL6A3) 403668(COL6A1) 485659(COL6A5) 610614 610649(COL6A6)
VVP: 112908780(COL6A3) 112909516(COL6A1) 112909551(COL6A2) 112932527(COL6A5) 112932531(COL6A6) 112932544
AML: 100463941(COL6A6) 100464071(COL6A1) 100465530(COL6A3) 100483347(COL6A2) 100484892(COL6A5) 105241345
UMR: 103662830(COL6A3) 103679288(COL6A5) 103680680(COL6A2) 103680734(COL6A1) 103681822(COL6A6) 103681833
UAH: 113250298(COL6A3) 113253922 113253923(COL6A5) 113253925(COL6A6) 113260915(COL6A2) 113263194(COL6A1)
ORO: 101371920(COL6A3) 101376308(COL6A2) 101381689(COL6A1) 101383410(COL6A5) 101384542 101386561(COL6A6)
FCA: 101081156(COL6A1) 101081323(COL6A3) 101092138(COL6A5) 101095676(COL6A6) 101096163 101100658(COL6A2)
PTG: 102949405(COL6A3) 102950795 102954671(COL6A5) 102955253(COL6A6) 102965155(COL6A1) 102965452(COL6A2)
PPAD: 109258089(COL6A2) 109258106(COL6A1) 109258923 109258949(COL6A5) 109258972(COL6A6) 109264846(COL6A3)
AJU: 106968414(COL6A3) 106971585(COL6A6) 106971586(COL6A5) 106971588 106987515(COL6A1) 106987516(COL6A2)
BTA: 282194(COL6A2) 511422(COL6A1) 530102 530657(COL6A3) 785805(COL6A5)
BOM: 102268113 102271535(COL6A5) 102272379(COL6A6) 102278458(COL6A2) 102280323(COL6A1) 102283468
BIU: 109556565(COL6A3) 109561193(COL6A1) 109561279(COL6A2) 109561676(COL6A5) 109563454 109563465
BBUB: 102389816(COL6A1) 102391810 102392465(COL6A3) 102393741 102394387(COL6A5) 102397245(COL6A2)
CHX: 102169643(COL6A3) 102178401(COL6A6) 102178669(COL6A5) 102191085(COL6A1) 102191378(COL6A2)
OAS: 101106490(COL6A2) 101111424(COL6A6) 101111927(COL6A1) 101118494(COL6A5) 443051(COL6A3)
SSC: 100101551(COL6A3) 100101552(COL6A2) 100515967(COL6A5) 100516642(COL6A6) 100517188 100623720
CFR: 102517560(COL6A2) 102517804(COL6A1) 102518086(COL6A5) 102518337(COL6A6) 102518573 102522202(COL6A3)
CDK: 105088769 105088770(COL6A5) 105088773 105090586(COL6A1) 105090598(COL6A2) 105102875(COL6A3)
BACU: 103000682(COL6A6) 103000952(COL6A5) 103005784(COL6A2) 103006351(COL6A1) 103009925(COL6A3)
LVE: 103070306(COL6A6) 103071281(COL6A3) 103077986(COL6A2) 103084946(COL6A1) 103088616 103088885
OOR: 101273414(COL6A3) 101282272(COL6A5) 101283292(COL6A6) 101287775(COL6A1) 101288202(COL6A2)
DLE: 111168165(COL6A6) 111168189 111171971(COL6A3) 111186354(COL6A2) 111186385(COL6A1)
PCAD: 102976519(COL6A1) 102978896(COL6A5) 102979304 102984497(COL6A6) 102986665(COL6A3) 102987169(COL6A2)
ECB: 100050035(COL6A1) 100055332(COL6A2) 100064145 100064173(COL6A5) 100064285(COL6A6) 100066356(COL6A3)
EPZ: 103550795 103550797(COL6A5) 103550800 103557612(COL6A3) 103558411(COL6A1) 103558413(COL6A2)
EAI: 106832180(COL6A3) 106842751 106842753(COL6A5) 106842755 106842982(COL6A1) 106842984(COL6A2)
MYB: 102245872(COL6A2) 102251267(COL6A1) 102254080(COL6A6) 102255770(COL6A5) 102256069 102257789(COL6A3)
MYD: 102756186(COL6A2) 102758253(COL6A3) 102761570(COL6A1) 102761905 102768549(COL6A5) 102768839(COL6A6)
MNA: 107530028(COL6A3) 107536231(COL6A2) 107536232(COL6A1) 107546062(COL6A5) 107546063 107546119(COL6A6)
HAI: 109373828(COL6A1) 109373829(COL6A2) 109374373(COL6A6) 109374954(COL6A3) 109395820
DRO: 112306524(COL6A1) 112306535(COL6A2) 112308001(COL6A3) 112309556 112309687(COL6A6) 112309881(COL6A5)
PALE: 102881112(COL6A3) 102881673(COL6A2) 102883628 102883890 102892412(COL6A5) 102896988(COL6A1)
RAY: 107508459 107508461(COL6A5) 107508462(COL6A6) 107510222(COL6A1) 107510223(COL6A2) 107510605(COL6A3)
MJV: 108402426 108406673(COL6A6) 108406785(COL6A3) 108409560(COL6A1) 108409564(COL6A2)
LAV: 100655197(COL6A3) 100662988(COL6A2) 100663273(COL6A1) 100664786 100665075 100665360(COL6A6)
MDO: 100017951(COL6A3) 100026420(COL6A2) 100030389(COL6A6) 100030416(COL6A5) 100030437 100617956(COL6A1)
SHR: 100920576(COL6A6) 100920836(COL6A5) 100922222(COL6A3) 100922223(COL6A1) 100933417(COL6A2) 111721183
PCW: 110198108(COL6A3) 110198828(COL6A2) 110198842(COL6A1) 110209064 110209065(COL6A5) 110209067(COL6A6)
OAA: 100076164(COL6A3) 100083653(COL6A2) 100083849(COL6A6) 100083893 100083924 100093454(COL6A1)
GGA: 396000(COL6A1) 396292(COL6A2) 396548(COL6A3) 428448(COL6A6)
MGP: 100544967(COL6A1) 100546041(COL6A2) 100549061(COL6A3) 100551157(COL6A6)
CJO: 107309331(COL6A6) 107316360(COL6A2) 107316361(COL6A1) 107316506(COL6A3)
NMEL: 110394081(COL6A6) 110399529(COL6A3) 110399575(COL6A2) 110400425(COL6A1)
APLA: 101789974(COL6A2) 101790433(COL6A1) 101794158 101802198(COL6A6) 106016943
ACYG: 106034517(COL6A3) 106046646(COL6A6) 106049609(COL6A1) 106049611(COL6A2)
TGU: 100224039(COL6A2) 100225004(COL6A3) 100226931(COL6A1)
LSR: 110473514(COL6A3) 110479761(COL6A1) 110479770(COL6A2)
SCAN: 103814584(COL6A3) 103814590(COL6A2) 103814591(COL6A1)
GFR: 102031525(COL6A1) 102031692(COL6A2) 102037459(COL6A3) 102038575(COL6A6)
FAB: 101810477(COL6A3) 101818502(COL6A6) 101819820(COL6A1) 101820018(COL6A2)
PHI: 102104058(COL6A3) 102111047(COL6A2) 102111230(COL6A1)
PMAJ: 107207216(COL6A2) 107207261(COL6A1) 107207729(COL6A3)
CCAE: 111923538(COL6A6) 111931825(COL6A2) 111931829(COL6A1) 111931858(COL6A3)
CCW: 104689285(COL6A6) 104694557(COL6A3) 104694583(COL6A2) 104694607(COL6A1)
ETL: 114064280(COL6A6) 114068090(COL6A1) 114068099(COL6A2) 114069880(COL6A3)
FPG: 101918577(COL6A1) 101918752(COL6A2) 101920384(COL6A6) 101922851(COL6A3)
FCH: 102048076(COL6A3) 102048570(COL6A6) 102051119(COL6A2) 102051465(COL6A1)
CLV: 102087195(COL6A1) 102087375(COL6A2) 102089916(COL6A3) 102093355(COL6A6)
EGZ: 104122533(COL6A1) 104122541(COL6A2) 104123243(COL6A3) 104127526 104127527
NNI: 104009120(COL6A2) 104009122(COL6A1) 104009985(COL6A3) 104018487(COL6A6) 104018488
ACUN: 113477236 113482203(COL6A3) 113482258(COL6A2) 113482321(COL6A1)
PADL: 103914157 103914218(COL6A1) 103921635(COL6A3) 103923021(COL6A6)
AAM: 106482282(COL6A1) 106482286(COL6A2) 106484387(COL6A3) 106491159
ASN: 102372620(COL6A6) 102376196(COL6A2) 102376414 102376655 102376782(COL6A1) 102376909 102382090(COL6A3)
AMJ: 102567053(COL6A1) 102567274(COL6A2) 102569986 102574154(COL6A6) 106736957(COL6A3)
CMY: 102929645 102943888(COL6A3) 102945351(COL6A1) 102945574(COL6A2) 102946934(COL6A6)
CPIC: 101937347 101937611(COL6A3) 101939666 101939949 101945768(COL6A2) 101946254(COL6A1) 101953884(COL6A6)
ACS: 100556168(col6a2) 100558915(col6a1) 100559509(col6a3) 100561835(col6a6) 100562030 103279150
PVT: 110083710(COL6A3) 110086129(COL6A6) 110086130 110091155(COL6A2) 110091157(COL6A1)
PMUR: 107286068 107286069 107286071 107291711(COL6A3) 107296179(COL6A2) 107296188(COL6A1)
PMUA: 114582149(COL6A3) 114582255(COL6A2) 114582265(COL6A1) 114607442 114607443 114607754
GJA: 107112804(COL6A3) 107114270(COL6A2) 107120736(COL6A1) 107123435
XLA: 108702277 108702278 108703023(col6a1.S) 108703024(col6a2.S) 108718494 108718495(col6a6.L) 108719692(col6a6.S) 380129(col6a1.L) 398368 734275(col6a2.L)
XTR: 100145523(col6a2) 100486063(col6a5) 100487679(col6a6) 100488707(col6a3) 100490352(col6a1)
NPR: 108788853(COL6A1) 108789838(COL6A3) 108792064 108795802(COL6A6) 108801821(COL6A2)
DRE: 100535278 556874(col6a3) 564005(col6a4a) 567771(col6a2) 569755(col6a1)
EEE: 113572774(col6a6) 113574620 113575505 113588259(col6a2) 113588261(col6a1)
XMA: 102219605 102221880(col6a6) 102227077 102227835(col6a3) 102234225(col6a1) 102234476(col6a2)
XCO: 114138521 114141967(col6a6) 114145822(col6a1) 114146438(col6a2) 114148196(col6a3) 114148319
CVG: 107091906 107095530 107097027(col6a2) 107097028(col6a1) 107099049(col6a3)
ALIM: 106517919(col6a1) 106517923(col6a2) 106523333 106524134 106533164(col6a6)
CSEM: 103388122(col6a6) 103392061 103392341 103396226(col6a2) 103396256(col6a1)
POV: 109631372 109637342(col6a3) 109643189(col6a6) 109644488(col6a1) 109644990(col6a2)
HCQ: 109506874 109512175(col6a6) 109512791(col6a1) 109512816(col6a2) 109517120(col6a3) 109523290
BPEC: 110153401 110158189(col6a3) 110160762 110166521 110170466(col6a2) 110170467(col6a1)
PKI: 111850193(col6a3) 111857822 111857834 111858313(col6a2) 111858349(col6a1)
LCM: 102346628(COL6A2) 102347619 102348142(COL6A1) 102350204(COL6A6) 102351679 102362500(COL6A3) 102365826
AQU: 100640739
 » show all
Reference
PMID:9107679
  Authors
Trikka D, Davis T, Lapenta V, Brahe C, Kessling AM
  Title
Human COL6A1: genomic characterization of the globular domains, structural and evolutionary comparison with COL6A2.
  Journal
Mamm Genome 8:342-5 (1997)
DOI:10.1007/s003359900436
  Sequence
[hsa:1291]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K08131
Entry
K08131                      KO                                     

Name
COL9A
Definition
collagen type IX alpha
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko04974  Protein digestion and absorption
ko05165  Human papillomavirus infection
Disease
H00476  Multiple epiphyseal dysplasia
H02072  Stickler syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
 09150 Organismal Systems
  09154 Digestive system
   04974 Protein digestion and absorption
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00535 Proteoglycans
    K08131  COL9A; collagen type IX alpha
Proteoglycans [BR:ko00535]
 Extracellular matrix (ECM) proteoglycans
  Collagen family
   K08131  COL9A; collagen, type IX, alpha
Other DBs
GO: 0030020
Genes
HSA: 1297(COL9A1) 1298(COL9A2) 1299(COL9A3)
PTR: 456791(COL9A2) 462810(COL9A1) 745218(COL9A3)
PPS: 100970548(COL9A2) 100972784(COL9A3) 100987158(COL9A1)
GGO: 101125128(COL9A2) 101130631(COL9A1)
PON: 100431991(COL9A3) 100445025(COL9A2) 100446946(COL9A1)
NLE: 100584023(COL9A3) 100601529(COL9A1) 100605476(COL9A2)
MCC: 694248(COL9A2) 714809(COL9A1) 719943(COL9A3)
MCF: 102120728(COL9A1) 102123592(COL9A2) 102131093(COL9A3)
CSAB: 103225034(COL9A2) 103242965(COL9A3) 103243930(COL9A1)
RRO: 104654892(COL9A2) 104663835(COL9A3) 104668793(COL9A1)
RBB: 108520396(COL9A1) 108530403(COL9A2) 108535286(COL9A3)
CJC: 100403892(COL9A1) 100403902(COL9A3) 100405504(COL9A2)
SBQ: 101031035(COL9A1) 101036456(COL9A2) 101049177(COL9A3)
MMU: 12839(Col9a1) 12840(Col9a2) 12841(Col9a3)
MCAL: 110290697(Col9a1) 110292982(Col9a2) 110307773(Col9a3)
MPAH: 110318270(Col9a3) 110322564(Col9a1) 110323049(Col9a2)
RNO: 305104(Col9a1) 362285(Col9a3) 362584(Col9a2)
MUN: 110549942(Col9a2) 110553533 110554672 110555733(Col9a1)
CGE: 100753027(Col9a2) 100755811(Col9a1) 100757317(Col9a3)
NGI: 103742245(Col9a3) 103752509(Col9a1)
HGL: 101707537(Col9a3) 101720556(Col9a2) 101726107(Col9a1)
CCAN: 109691585(Col9a2) 109692842 109695592(Col9a1)
OCU: 100338915(COL9A2) 100340815(COL9A3) 103349793(COL9A1)
TUP: 102478162(COL9A3) 102481685(COL9A1) 102497659(COL9A2)
CFA: 481873(COL9A1) 607609(COL9A2) 612430(COL9A3)
VVP: 112908232(COL9A2) 112914112(COL9A1) 112932157(COL9A3)
AML: 100477095(COL9A2) 105240457(COL9A3) 105240522(COL9A1)
UMR: 103657380(COL9A1) 103660572(COL9A3) 103682402(COL9A2)
UAH: 113258151(COL9A3) 113261138(COL9A1) 113268232(COL9A2)
ORO: 101362257(COL9A3) 101378050(COL9A1) 101385065(COL9A2)
FCA: 101081883(COL9A3) 101086148(COL9A1) 101090632(COL9A2)
PTG: 102958473(COL9A3) 102961364(COL9A2) 107180364(COL9A1)
PPAD: 109248201(COL9A1) 109253350 109254858(COL9A2)
AJU: 106969902(COL9A3) 106988407(COL9A2) 113598554(COL9A1)
BTA: 282195(COL9A1) 505942(COL9A2) 789493(COL9A3)
BOM: 102268693(COL9A1) 102279658(COL9A2) 102285810(COL9A3)
BIU: 109556449(COL9A2) 109563451(COL9A1) 109567262(COL9A3)
BBUB: 102391279(COL9A1) 102400772(COL9A2) 102411321(COL9A3)
CHX: 102185378(COL9A1) 102186825(COL9A2) 102188580(COL9A3)
OAS: 101102992(COL9A1) 101120183(COL9A3) 101121906(COL9A2)
SSC: 100155319(COL9A1) 100621911(COL9A2) 110257487(COL9A3)
CFR: 102503906(COL9A1) 102514243(COL9A2) 102523794(COL9A3)
CDK: 105085059(COL9A1) 105095699(COL9A3) 105103374(COL9A2)
BACU: 103005462(COL9A2) 103019864(COL9A3) 103020918(COL9A1)
LVE: 103072598(COL9A3) 103083485(COL9A2) 103089400(COL9A1)
OOR: 101271145(COL9A3) 101279052(COL9A1) 101282886(COL9A2)
DLE: 111175648(COL9A2) 111183266(COL9A1) 111186728(COL9A3)
PCAD: 102974331(COL9A1) 102975888(COL9A3) 102989754(COL9A2)
ECB: 100009713(COL9A2) 100057208(COL9A1) 100058660(COL9A3)
EPZ: 103553566(COL9A2) 103556870(COL9A3)
EAI: 106823110(COL9A2) 106831831(COL9A1) 106836329(COL9A3)
MYB: 102243552(COL9A2) 102251306(COL9A3) 102258848(COL9A1)
MYD: 102764185(COL9A1) 102767565(COL9A2) 102773089(COL9A3)
MNA: 107523880(COL9A1) 107529178(COL9A3) 107531189(COL9A2)
HAI: 109380077(COL9A3) 109383345(COL9A2) 109394154
DRO: 112299197(COL9A2) 112303890(COL9A3) 112319309(COL9A1)
PALE: 102878023(COL9A2) 102887814(COL9A1) 102893935(COL9A3)
RAY: 107504429(COL9A3) 107508321(COL9A2) 107517190(COL9A1)
MJV: 108399163(COL9A3) 108404568(COL9A2) 108408944
LAV: 100668022(COL9A1) 100671962 100675250(COL9A3)
MDO: 100020680(COL9A1) 100025683(COL9A3) 100032118(COL9A2)
SHR: 100916999(COL9A1) 100920428(COL9A3) 100920810(COL9A2)
PCW: 110205189(COL9A3) 110206299(COL9A2) 110217679(COL9A1)
OAA: 100074565(COL9A3) 100075830(COL9A2) 100079705(COL9A1)
GGA: 396242(COL9A3) 396524(COL9A2) 771873(COL9A1)
MGP: 100545906(COL9A3) 100547243(COL9A2) 100551098(COL9A1)
CJO: 107312063(COL9A1) 107322969(COL9A3) 107323826
NMEL: 110387441 110396978(COL9A1) 110408071(COL9A3)
APLA: 101795667(COL9A2) 101796660(COL9A1) 101799887(COL9A3)
ACYG: 106030377(COL9A1) 106037895(COL9A2) 106040776(COL9A3)
TGU: 100224952(COL9A1) 115497873(COL9A3) 115498284(COL9A2)
LSR: 110470494(COL9A1) 110483587(COL9A3) 110484282(COL9A2)
SCAN: 103818867(COL9A3) 103822655(COL9A2) 103822678(COL9A1)
GFR: 102032945(COL9A3) 102036387(COL9A2) 102037264(COL9A1)
FAB: 101806074(COL9A2) 101818737(COL9A3) 101820734(COL9A1)
PHI: 102100627(COL9A2) 102108087(COL9A3) 102108975(COL9A1)
PMAJ: 107202116(COL9A1) 107213142(COL9A3) 107214048(COL9A2)
CCAE: 111925824(COL9A1) 111938078(COL9A3) 111939163(COL9A2)
CCW: 104687648(COL9A3) 104693161(COL9A1) 104694782
ETL: 114056393(COL9A3) 114069279 114070608 114071538(COL9A2)
FPG: 101920089(COL9A3) 101921800(COL9A1) 101922146(COL9A2)
FCH: 102046174(COL9A1) 102057369(COL9A3) 102057992(COL9A2)
CLV: 102084863(COL9A2) 102091178(COL9A3) 102091755(COL9A1)
EGZ: 104122801(COL9A2) 104127401(COL9A1) 104130653(COL9A3)
NNI: 104009611(COL9A3) 104017777(COL9A2) 104021992(COL9A1)
ACUN: 113478716(COL9A1) 113487441(COL9A3) 113488314(COL9A2)
PADL: 103919390(COL9A3) 103924680(COL9A1) 103924863(COL9A2)
AAM: 106492535(COL9A1) 106493499(COL9A3) 106496618
ASN: 102368413(COL9A1) 102371811(COL9A3) 102386855(COL9A2) 102387123
AMJ: 102558702(COL9A1) 102570843(COL9A3) 102575507(COL9A2)
PSS: 102453519(COL9A1) 102459080(COL9A3) 102459957(COL9A2)
CMY: 102931800(COL9A1) 102935980(COL9A2) 102936886(COL9A3)
CPIC: 101931230(COL9A1) 101940961 101945753(COL9A3) 101945941(COL9A2)
ACS: 100554037(col9a3) 100565206(col9a2) 100567245(col9a1)
PVT: 110075009(COL9A1) 110082517(COL9A2) 110084906(COL9A3)
PBI: 103059142(COL9A2) 103059269(COL9A1)
PMUR: 114923236(COL9A1)
TSR: 106547333(COL9A2)
GJA: 107111651(COL9A1) 107121214(COL9A2)
XLA: 108702653(col9a3.S) 108709589(col9a2.S) 108719125 398560(col9a1-b) 446508(col9a3.L) 446631(col9a1.L) 734362(col9a2.L)
XTR: 100036633(col9a2) 100145133(col9a1) 100145619(col9a3)
NPR: 108789516(COL9A3) 108793880(COL9A1) 108804851(COL9A2)
DRE: 100170785(col9a1a) 100537277 321212(col9a2) 406548(col9a1b) 567110(col9a3)
EEE: 113577475(col9a2) 113581240 113582520(col9a1) 113586884(col9a3)
XMA: 102216439 102217617 102229172(col9a1) 102230159(col9a3) 102235054(col9a2)
XCO: 114137511(col9a1) 114145470 114145718(col9a3) 114155536(col9a2) 114155968
CVG: 107082734(col9a2) 107090271(col9a3) 107098689 107099953 107102088(col9a1)
AOCE: 111562961(col9a1) 111565485 111570263(col9a2) 111574188(col9a3) 111580568 111581662
CSEM: 103383179 103385425(col9a3) 103387288(col9a1) 103394184 103394209(col9a2)
POV: 109631595 109633472(col9a1) 109635296(col9a3) 109641847 109645367(col9a2)
LCF: 108880016(col9a2) 108880844 108894531(col9a1) 108900229(col9a3) 108900287
SLAL: 111644711 111654545 111659000(col9a1) 111665646 111671547(col9a3) 111673336(col9a2)
HCQ: 109512614 109516103(col9a1) 109519203(col9a2) 109519630 109528549(col9a3)
BPEC: 110157118(col9a1) 110164363 110164732(col9a3) 110167304 110167327(col9a2)
MALB: 109951741(col9a2) 109951844 109961872(col9a1) 109961888 109966097(col9a3) 109970064
LCM: 102355403 102355648(COL9A3) 102360658(COL9A2) 102365808
CMK: 103185601(col9a1) 103190453(col9a3)
BFO: 118410107
CIN: 445733
SPU: 579258
APLC: 110978742
SKO: 100374450
MDE: 101887360
LCQ: 111677582
AME: 409448
BIM: 100743028
BTER: 100646889
SOC: 105200917
MPHA: 105830646
AEC: 105147844
ACEP: 105625744
PBAR: 105423489
VEM: 105561745
HST: 105187947
DQU: 106750704
CFO: 105247961
LHU: 105670002
PGC: 109853815
OBO: 105278486
TCA: 100141619
DPA: 109544991
ATD: 109609178
NVL: 108561009
BMOR: 101738205
PMAC: 106718642
PRAP: 111000641
HAW: 110383134
TNL: 113494238
PXY: 105380981
API: 100159937
DNX: 107169963
AGS: 114121240
RMD: 113560644
CLEC: 106669887
ZNE: 110833266
FCD: 110856837
PVM: 113824982
TUT: 107362793
CSCU: 111624125
PCAN: 112574514
CRG: 105326709
MYI: 110456584
OBI: 106871778
EPA: 110252702
 » show all
Reference
  Authors
Jakkula E, Makitie O, Czarny-Ratajczak M, Jackson GC, Damignani R, Susic M, Briggs MD, Cole WG, Ala-Kokko L
  Title
Mutations in the known genes are not the major cause of MED; distinctive phenotypic entities among patients with no identified mutations.
  Journal
Eur J Hum Genet 13:292-301 (2005)
DOI:10.1038/sj.ejhg.5201314
  Sequence
[hsa:1298]
Reference
PMID:8586434
  Authors
Brewton RG, Wood BM, Ren ZX, Gong Y, Tiller GE, Warman ML, Lee B, Horton WA, Olsen BR, Baker JR, et al.
  Title
Molecular cloning of the alpha 3 chain of human type IX collagen: linkage of the gene COL9A3 to chromosome 20q13.3.
  Journal
Genomics 30:329-36 (1995)
DOI:10.1006/geno.1995.9870
  Sequence
[hsa:1299]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K05637
Entry
K05637                      KO                                     

Name
LAMA1_2
Definition
laminin, alpha 1/2
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
ko05410  Hypertrophic cardiomyopathy
ko05412  Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy
ko05414  Dilated cardiomyopathy
ko05416  Viral myocarditis
Disease
H00593  Limb-girdle muscular dystrophy
H01958  Merosin-deficient congenital muscular dystrophy
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
  09166 Cardiovascular disease
   05410 Hypertrophic cardiomyopathy
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
   05412 Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
   05414 Dilated cardiomyopathy
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
   05416 Viral myocarditis
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
   05145 Toxoplasmosis
    K05637  LAMA1_2; laminin, alpha 1/2
Genes
HSA: 284217(LAMA1) 3908(LAMA2)
PTR: 455302(LAMA1) 472122(LAMA2)
PPS: 100990839(LAMA1) 100995714(LAMA2)
GGO: 101141143(LAMA2) 101143230(LAMA1)
PON: 100438698(LAMA1) 100458901(LAMA2)
NLE: 100583654(LAMA2) 100591959(LAMA1)
MCC: 715394(LAMA2) 722472(LAMA1)
MCF: 102145776(LAMA2) 102146003(LAMA1)
CSAB: 103222731(LAMA1) 103240395(LAMA2)
RRO: 104655298(LAMA2) 104670221(LAMA1)
RBB: 108523928(LAMA1) 108534366(LAMA2)
CJC: 100403734(LAMA1) 100405831(LAMA2)
SBQ: 101032961(LAMA2) 101041079(LAMA1)
MMU: 16772(Lama1) 16773(Lama2)
MCAL: 110302840(Lama2) 110312520(Lama1)
MPAH: 110335407(Lama1) 110337991(Lama2)
RNO: 309368(Lama2) 316758(Lama1)
MUN: 110552295(Lama1) 110559223(Lama2)
CGE: 100765555(Lama1) 100771923
NGI: 103729744(Lama2) 103735414(Lama1) 103740954
HGL: 101717328(Lama1) 101725515(Lama2)
CCAN: 109695361(Lama2) 109703366(Lama1)
OCU: 100350500(LAMA2) 100357482(LAMA1)
TUP: 102481486(LAMA2) 102488646(LAMA1)
CFA: 100683420(LAMA2) 102156629(LAMA1)
VVP: 112925240(LAMA1) 112930944(LAMA2)
AML: 100465830(LAMA1) 100484712(LAMA2)
UMR: 103663512(LAMA2) 103664656(LAMA1)
UAH: 113253229(LAMA1) 113259434(LAMA2)
ORO: 101364310(LAMA1) 101383157(LAMA2)
FCA: 101083299(LAMA1) 101092612(LAMA2)
PTG: 102950444(LAMA2) 102969465(LAMA1)
PPAD: 109248611(LAMA1) 109260619
AJU: 106975487(LAMA2) 106984540(LAMA1)
BTA: 100138434(LAMA2) 506387(LAMA1)
BOM: 102275509(LAMA1) 102287620(LAMA2)
BIU: 109563534(LAMA2) 109577666(LAMA1)
BBUB: 102398304(LAMA1) 102413540(LAMA2)
CHX: 102176003(LAMA1) 102187050(LAMA2)
OAS: 101102692(LAMA1) 101117424(LAMA2)
SSC: 100154420(LAMA2) 100625589(LAMA1)
CFR: 102504667(LAMA2) 102505642(LAMA1)
CDK: 105096330(LAMA2) 105099434(LAMA1)
BACU: 102998029(LAMA2) 103011922(LAMA1)
LVE: 103078532(LAMA2) 103081594(LAMA1)
OOR: 101282490(LAMA1) 101290006(LAMA2)
DLE: 111163079(LAMA1) 111168261(LAMA2)
PCAD: 102981656(LAMA2) 102992685(LAMA1)
ECB: 100059860(LAMA1) 100073067(LAMA2)
EPZ: 103552993(LAMA2) 103564595(LAMA1)
EAI: 106835371(LAMA2) 106838023(LAMA1)
MYB: 102256202(LAMA1) 102261526(LAMA2)
MYD: 102770077(LAMA2) 102773720(LAMA1)
MNA: 107530937(LAMA2) 107535878(LAMA1)
HAI: 109375466 109377451(LAMA1)
DRO: 112297058(LAMA2) 112322610(LAMA1)
PALE: 102884860(LAMA1) 102894718(LAMA2)
RAY: 107497012(LAMA2) 107498184(LAMA1)
MJV: 108397227(LAMA2) 108400452(LAMA1) 108406412
LAV: 100672596(LAMA1) 100677404(LAMA2)
MDO: 100015923(LAMA1) 100030895(LAMA2)
SHR: 100924495(LAMA2) 100925578(LAMA1)
PCW: 110199966(LAMA1) 110208858(LAMA2)
OAA: 100078011(LAMA2) 100079917(LAMA1)
GGA: 374016(LAMA1) 421709(LAMA2)
MGP: 100545053 100550433(LAMA1)
CJO: 107310030(LAMA1) 107311739(LAMA2)
NMEL: 110393606(LAMA1) 110396190(LAMA2)
APLA: 101790960(LAMA2) 101791570
ACYG: 106032489(LAMA2) 106034951(LAMA1)
TGU: 100222025(LAMA1) 100226618(LAMA2)
LSR: 110467844(LAMA1) 110479684(LAMA2)
SCAN: 103821940(LAMA2) 103826739(LAMA1)
GFR: 102031966(LAMA1) 102040597(LAMA2)
FAB: 101806802(LAMA2) 101809243(LAMA1)
PHI: 102100894(LAMA2) 102105406(LAMA1)
PMAJ: 107200340(LAMA1) 107202118(LAMA2)
CCAE: 111924007(LAMA1) 111927276(LAMA2)
CCW: 104687288(LAMA1) 104690723(LAMA2)
ETL: 114055925(LAMA2) 114056678(LAMA1)
FPG: 101918838(LAMA2) 101920298(LAMA1)
FCH: 102056264(LAMA1) 102059098(LAMA2)
CLV: 102087859(LAMA1) 102091939(LAMA2) 110358475
EGZ: 104127771(LAMA1) 104131156(LAMA2)
NNI: 104008903(LAMA2) 104017673(LAMA1)
ACUN: 113476109(LAMA1) 113478074(LAMA2)
PADL: 103912732(LAMA2) 103924544(LAMA1)
AAM: 106484524(LAMA1) 106497996(LAMA2)
ASN: 102377125(LAMA2) 102380091(LAMA1)
AMJ: 102565892(LAMA2) 106736709(LAMA1)
PSS: 102452116(LAMA1) 102462585(LAMA2)
CMY: 102940671(LAMA1) 102943418(LAMA2)
CPIC: 101943517(LAMA2) 101950807(LAMA1)
ACS: 100563687(lama1) 100565785(lama2)
PVT: 110077555(LAMA2) 110078890(LAMA1)
PBI: 103051723(LAMA2) 103061662(LAMA1)
TSR: 106537772(LAMA1) 106550024(LAMA2)
PMUA: 114594133(LAMA2) 114600729(LAMA1)
GJA: 107112746(LAMA1) 107115141(LAMA2)
XTR: 100488009(lama1) 100497008(lama2)
NPR: 108784886(LAMA1) 108786894(LAMA2)
DRE: 100049705(lama2) 569971(lama1)
IPU: 108272667(lama1) 108275333(lama2)
PHYP: 113526878(lama1) 113536689(lama2)
AMEX: 103025806(lama1) 103046019(lama2) 111189576
EEE: 113572390(lama1)
LCO: 104929878(lama2) 104934322(lama1)
NCC: 104956332
MZE: 101477084 101477553(lama2)
ONL: 100705533(lama1) 102080801(lama2)
OLA: 101172376(lama2)
XMA: 102223911(lama2) 102228775(lama1)
XCO: 114136599(lama1) 114158390(lama2)
PRET: 103457642(lama2) 103460170(lama1)
CVG: 107080976(lama2) 107100928
NFU: 107377827(lama2)
KMR: 108233446(lama2) 108251448
AOCE: 111569558(lama2) 111583399 111588685(lama1)
CSEM: 103381240(lama2) 103392033(lama1)
POV: 109635980 109643078(lama1)
SDU: 111236863(lama1) 111237038(lama2)
SLAL: 111644958(lama1) 111661403(lama2)
HCQ: 109520396(lama2) 109526303
BPEC: 110156398(lama2) 110175641(lama1)
MALB: 109962325(lama2) 109974984
ELS: 105017913(lama2) 105025738(lama1)
SFM: 108927611 108927982(lama1) 108928480(lama2)
PKI: 111836135(lama2) 111849741(lama1) 111850071
LCM: 102353402(LAMA2) 102367012(LAMA1)
CMK: 103181058(lama1) 103182330(lama2)
CIN: 100182119
SPU: 587274
APLC: 110979495
SKO: 100369691
DME: Dmel_CG42677(wb)
DER: 6543430
DSI: Dsimw501_GD23957(Dsim_GD23957)
DSR: 110185984
DPE: 6598088
DMN: 108162760
DAZ: 108611709
DNV: 115563711
DHE: 111600438
MDE: 101892460
LCQ: 111686173
AAG: 5570897
AME: 410775
BIM: 100748549
BTER: 100649561
CCAL: 108626474
SOC: 105193731
MPHA: 105837358
AEC: 105149529
ACEP: 105622440
PBAR: 105429888
HST: 105190900
DQU: 106743836
CFO: 105251592
OBO: 105276484
NVI: 100118105
CSOL: 105364840
MDL: 103569836
TCA: 658046
ATD: 109596062
BMOR: 101746347
BMAN: 114239326
PRAP: 111004471
PXY: 105385580
API: 100162936
DNX: 107169281
AGS: 114132102
RMD: 113555629
BTAB: 109031963
CLEC: 106666975
ZNE: 110827145
FCD: 110855859
DPTE: 113790124
CEL: CELE_T22A3.8(lam-3)
CBR: CBG24338(Cbr-lam-3)
BMY: Bm1_24440
TSP: Tsp_08686
PCAN: 112574511
CRG: 105339670
MYI: 110463298
LAK: 106163871
EGL: EGR_07741
EPA: 110252049
PDAM: 113686064
HMG: 100197510
 » show all
Reference
PMID:1714537
  Authors
Haaparanta T, Uitto J, Ruoslahti E, Engvall E
  Title
Molecular cloning of the cDNA encoding human laminin A chain.
  Journal
Matrix 11:151-60 (1991)
DOI:10.1016/s0934-8832(11)80153-8
Reference
  Authors
Miner JH, Yurchenco PD
  Title
Laminin functions in tissue morphogenesis.
  Journal
Annu Rev Cell Dev Biol 20:255-84 (2004)
DOI:10.1146/annurev.cellbio.20.010403.094555
Reference
PMID:8294519
  Authors
Vuolteenaho R, Nissinen M, Sainio K, Byers M, Eddy R, Hirvonen H, Shows TB, Sariola H, Engvall E, Tryggvason K
  Title
Human laminin M chain (merosin): complete primary structure, chromosomal assignment, and expression of the M and A chain in human fetal tissues.
  Journal
J Cell Biol 124:381-94 (1994)
DOI:10.1083/jcb.124.3.381
  Sequence
[hsa:3908]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06240
Entry
K06240                      KO                                     

Name
LAMA3_5
Definition
laminin, alpha 3/5
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H00586  Epidermolysis bullosa, junctional
H00813  Laryngo onycho cutaneous syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
   05145 Toxoplasmosis
    K06240  LAMA3_5; laminin, alpha 3/5
Genes
HSA: 3909(LAMA3) 3911(LAMA5)
PTR: 455339(LAMA3) 458387(LAMA5)
PPS: 100971419(LAMA5) 100977893(LAMA3)
GGO: 101132916(LAMA3)
PON: 100439539(LAMA3) 100456580
NLE: 100581144(LAMA5) 100601935(LAMA3)
MCC: 100430603(LAMA5) 701313(LAMA3)
MCF: 102120952(LAMA3) 102128796(LAMA5)
CSAB: 103222632(LAMA3) 103243076(LAMA5)
RRO: 104663822(LAMA5) 104678039
RBB: 108535245(LAMA5) 108536899(LAMA3)
CJC: 100401798(LAMA3) 103792989(LAMA5) 108588071
SBQ: 101042136(LAMA3) 101046958(LAMA5) 104650868
MMU: 16774(Lama3) 16776(Lama5)
MCAL: 110285111(Lama3)
MPAH: 110319686(Lama5) 110333444(Lama3)
RNO: 140433(Lama5) 307582(Lama3)
MUN: 110553478(Lama3) 110554009(Lama5)
CGE: 100755004(Lama3) 100755091(Lama5)
NGI: 103742237(Lama5) 103745694(Lama3)
HGL: 101708732(Lama5) 101709176(Lama3)
CCAN: 109674257(Lama3) 109675263 109689091(Lama5)
OCU: 100346886(LAMA3) 103347398(LAMA5)
TUP: 102471895(LAMA5) 102496463(LAMA3)
CFA: 442954(LAMA5) 480173(LAMA3)
VVP: 112925720(LAMA3) 112932206(LAMA5)
AML: 100482780(LAMA5) 100484669(LAMA3)
UMR: 103660581(LAMA5) 103664853(LAMA3)
UAH: 113253294(LAMA3) 113258790(LAMA5)
ORO: 101370639(LAMA5) 101386047(LAMA3)
FCA: 101083923(LAMA5) 101100161(LAMA3)
PTG: 102956725(LAMA3)
PPAD: 109253358(LAMA5) 109276486(LAMA3)
AJU: 106969907(LAMA5) 106978465(LAMA3)
BTA: 100336873(LAMA3) 506751(LAMA5)
BOM: 102266736(LAMA5) 102287154(LAMA3)
BBUB: 102404504(LAMA3) 102415747(LAMA5)
CHX: 102171801(LAMA5) 102190835(LAMA3)
OAS: 101120460(LAMA3) 101121444(LAMA5) 114110447
SSC: 100511642(LAMA3) 110257482(LAMA5)
CFR: 102503954(LAMA5) 102507092(LAMA3)
CDK: 105086476(LAMA3) 105095694(LAMA5)
BACU: 103004795 103010510(LAMA5) 103012309(LAMA3)
LVE: 103073424(LAMA5) 103084753(LAMA3)
OOR: 101274600(LAMA3) 101284962(LAMA5)
DLE: 111181472(LAMA3) 111186816(LAMA5)
PCAD: 102974155(LAMA5) 102982121(LAMA3)
ECB: 100058057(LAMA5) 791238(LAMA3)
EPZ: 103550984(LAMA5) 103565717 103566148(LAMA3)
EAI: 106822923(LAMA3) 106836404(LAMA5)
MYB: 102255410(LAMA3) 102256520 102263709(LAMA5)
HAI: 109380081(LAMA5) 109390109(LAMA3)
DRO: 112303887(LAMA5) 112322675
PALE: 102892706(LAMA5) 102897225(LAMA3)
RAY: 107503661(LAMA5) 107521547(LAMA3)
LAV: 100676944(LAMA5) 104845537(LAMA3) 111749628
MDO: 100011544(LAMA3) 100026192(LAMA5)
SHR: 100924531(LAMA5) 100934145(LAMA3)
PCW: 110195785(LAMA3) 110205178(LAMA5)
OAA: 100074317(LAMA3) 100074506(LAMA5)
GGA: 428148(LAMA5) 428524(LAMA3)
CJO: 107310092(LAMA3) 107322934(LAMA5)
NMEL: 110393896(LAMA3) 110408008(LAMA5)
APLA: 101799829(LAMA3) 101801954(LAMA5)
TGU: 100223855(LAMA5) 100225002(LAMA3)
LSR: 110482360 110483591(LAMA5)
SCAN: 103816012(LAMA3) 103818870(LAMA5)
GFR: 102039057(LAMA3) 102040047(LAMA5) 106631846
FAB: 101821218(LAMA5) 101821788(LAMA3) 107603345
PHI: 102107936(LAMA3) 102108636(LAMA5)
PMAJ: 107213297(LAMA5) 107216062(LAMA3)
CCAE: 111924827 111924930(LAMA3) 111938064(LAMA5)
CCW: 104687364(LAMA3) 104687815(LAMA5)
ETL: 114056424(LAMA5) 114059290(LAMA3)
FPG: 101915356(LAMA3) 101920966(LAMA5)
FCH: 102058399(LAMA5) 102059161(LAMA3)
CLV: 102092628(LAMA5) 102096169(LAMA3)
EGZ: 104130661(LAMA5) 104134156(LAMA3)
NNI: 104009577(LAMA5) 104018154(LAMA3)
ACUN: 113476588(LAMA3) 113487619(LAMA5)
PADL: 103919308(LAMA5) 103923209(LAMA3)
AAM: 106484867(LAMA3) 106492782(LAMA5)
AMJ: 102563156(LAMA3) 102566563(LAMA5)
PSS: 102445876(LAMA3) 102458379(LAMA5)
CMY: 102935975(LAMA5) 102938310(LAMA3)
CPIC: 101939396(LAMA3) 101950903(LAMA5)
ACS: 100552852(lama5) 100561436(lama3)
PVT: 110074919(LAMA3) 110086875(LAMA5)
PMUR: 107291296(LAMA3) 107296589(LAMA5) 107298950
PMUA: 114599718(LAMA5) 114600682(LAMA3)
GJA: 107118414(LAMA3) 107122549(LAMA5)
XLA: 108700926(lama5.L) 108702189 108718553(lama3.L)
XTR: 100145762(lama5) 100496680(lama3)
NPR: 108789987(LAMA5) 108795478(LAMA3)
DRE: 321243(lama5) 567640(si:ch211-241e1.3)
IPU: 108267308(lama3) 108270685 108275926(lama5)
PHYP: 113526350(lama3) 113530582(lama5) 113540076
EEE: 113576363(lama5) 113589210
LCO: 104918308(lama3) 104934349(lama5)
NCC: 104957653(lama3)
MZE: 101464839(lama5) 101467834(lama3) 101479911
ONL: 100694506(lama5) 100709653(lama3) 102080774
OLA: 101162509(lama5) 101163522(lama3)
XMA: 102223356(lama3) 102237100(lama5) 111609763
XCO: 114140734(lama5) 114146983(lama3) 114151640
PRET: 103461923(lama5) 103479641
CVG: 107083350(lama3) 107103366(lama5)
NFU: 107383938(lama3) 107390549(lama5)
KMR: 108239640 108248652(lama5)
ALIM: 106528741(lama5) 106534083 106534161(lama3)
AOCE: 111570251(lama5) 111579929(lama3)
CSEM: 103385170(lama5) 103396180(lama3)
LCF: 108883438(lama3) 108887436(lama5)
SDU: 111234903(lama5) 111238966(lama3)
SLAL: 111644198(lama5) 111669116 111670470(lama3)
BPEC: 110157494(lama3) 110161114(lama5)
MALB: 109957737(lama3) 109965221(lama5)
ELS: 105018940(lama3) 105027950(lama5)
SFM: 108925624(lama5) 108937590(lama3)
PKI: 111845899(lama3) 111855339(lama5)
LCM: 102355038(LAMA5) 102366759(LAMA3)
CMK: 103179715(lama3) 103186251(lama5)
CIN: 100176802
SKO: 102806714
DME: Dmel_CG10236(LanA)
DER: 6545212
DSE: 6611005
DSI: Dsimw501_GD13136(Dsim_GD13136)
DAN: 6493776
DSR: 110184792
DPE: 6599465
DMN: 108165480
DWI: 6638910
DAZ: 108613407
DNV: 108650470
DHE: 111598070
DVI: 6623375
MDE: 101897673
LCQ: 111689072
AAG: 5571044
AALB: 109423873
AME: 412663
BIM: 100746728
BTER: 100645678
CCAL: 108625687
OBB: 114871097
SOC: 105204864
MPHA: 105828922
AEC: 105150546
ACEP: 105623902
PBAR: 105426527
VEM: 105561266
HST: 105187360
DQU: 106749965
CFO: 105257775
LHU: 105672030
PGC: 109858972
OBO: 105274579
PCF: 106784080
NVI: 100119934
CSOL: 105360206
MDL: 103577923
TCA: 661583(LanA)
DPA: 109541736
ATD: 109596769
NVL: 108564488
BMAN: 114246644
PMAC: 106717210
PRAP: 110999452
HAW: 110379473
TNL: 113499980
PXY: 105392052
API: 100169395
DNX: 107173414
AGS: 114127695
RMD: 113559323
BTAB: 109029840
CLEC: 106668245
FCD: 110842377
PVM: 113802906
DPTE: 113794311
CSCU: 111636130
PTEP: 107448892
CEL: CELE_K08C7.3(epi-1)
CBR: CBG04423(Cbr-epi-1)
BMY: Bm1_38590
PCAN: 112573177
CRG: 105335256
MYI: 110448329
 » show all
Reference
  Authors
McLean WH, Irvine AD, Hamill KJ, Whittock NV, Coleman-Campbell CM, Mellerio JE, Ashton GS, Dopping-Hepenstal PJ, Eady RA, Jamil T, Phillips R, Shabbir SG, Haroon TS, Khurshid K, Moore JE, Page B, Darling J, Atherton DJ, Van Steensel MA, Munro CS, Smith FJ, McGrath JA
  Title
An unusual N-terminal deletion of the laminin alpha3a isoform leads to the chronic granulation tissue disorder laryngo-onycho-cutaneous syndrome.
  Journal
Hum Mol Genet 12:2395-409 (2003)
DOI:10.1093/hmg/ddg234
  Sequence
[hsa:3909]
Reference
  Authors
Miner JH, Yurchenco PD
  Title
Laminin functions in tissue morphogenesis.
  Journal
Annu Rev Cell Dev Biol 20:255-84 (2004)
DOI:10.1146/annurev.cellbio.20.010403.094555
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06241
Entry
K06241                      KO                                     

Name
LAMA4
Definition
laminin, alpha 4
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05143  African trypanosomiasis
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
   05145 Toxoplasmosis
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
   05143 African trypanosomiasis
    K06241  LAMA4; laminin, alpha 4
Genes
HSA: 3910(LAMA4)
PTR: 462946(LAMA4)
PPS: 100973904(LAMA4)
GGO: 101146642(LAMA4)
NLE: 100587786(LAMA4)
MCC: 696685(LAMA4)
MCF: 102132640(LAMA4)
CSAB: 103240557(LAMA4)
RRO: 104659760(LAMA4)
RBB: 108512065(LAMA4)
CJC: 100396274(LAMA4)
SBQ: 101054093(LAMA4)
MMU: 16775(Lama4)
MCAL: 110302955(Lama4)
MPAH: 110326140(Lama4)
RNO: 309816(Lama4)
MUN: 110564967(Lama4)
CGE: 100757321(Lama4)
NGI: 103749527(Lama4)
CCAN: 109699573(Lama4)
OCU: 108177458(LAMA4)
CFA: 475034(LAMA4)
VVP: 112925190(LAMA4)
AML: 100472419(LAMA4)
UMR: 103676980(LAMA4)
UAH: 113264714(LAMA4)
ORO: 101369714
ELK: 111158255
FCA: 101086907(LAMA4)
PTG: 102953957(LAMA4)
PPAD: 109263563(LAMA4)
AJU: 106968914(LAMA4)
BTA: 529670(LAMA4)
BOM: 102282139(LAMA4)
BIU: 109563807(LAMA4)
BBUB: 102391381(LAMA4)
CHX: 102177440(LAMA4)
OAS: 101107969(LAMA4)
SSC: 100154581(LAMA4)
CFR: 102505297(LAMA4)
CDK: 105099215(LAMA4)
BACU: 103014236(LAMA4)
LVE: 103070825(LAMA4)
OOR: 101278374(LAMA4)
DLE: 111164771(LAMA4)
PCAD: 102983001(LAMA4)
ECB: 100066875(LAMA4)
EPZ: 103547537(LAMA4)
EAI: 106847044(LAMA4)
MYB: 102244301(LAMA4)
MYD: 102773988(LAMA4)
MNA: 107540693(LAMA4)
HAI: 109384762(LAMA4)
PALE: 102877962(LAMA4)
RAY: 107506303(LAMA4)
MJV: 108399832(LAMA4)
LAV: 100662531(LAMA4)
TMU: 101352772
MDO: 100029499(LAMA4)
SHR: 100926054(LAMA4)
PCW: 110222892(LAMA4)
OAA: 100074197(LAMA4)
GGA: 421749(LAMA4)
MGP: 100541748(LAMA4)
CJO: 107311854(LAMA4)
NMEL: 110395980(LAMA4)
APLA: 101800985(LAMA4)
ACYG: 106032574(LAMA4)
TGU: 100228260(LAMA4)
LSR: 110484676(LAMA4)
SCAN: 103818521(LAMA4)
GFR: 102038317(LAMA4)
FAB: 101808787(LAMA4)
PHI: 102104140(LAMA4)
PMAJ: 107201853(LAMA4)
CCAE: 111927161(LAMA4)
CCW: 104691288(LAMA4)
ETL: 114062023(LAMA4)
FPG: 101924138(LAMA4)
FCH: 102057374(LAMA4)
CLV: 102095906(LAMA4)
EGZ: 104131982(LAMA4)
NNI: 104011135(LAMA4)
ACUN: 113478128(LAMA4)
PADL: 103917343(LAMA4)
AAM: 106489675(LAMA4)
ASN: 102384015(LAMA4)
AMJ: 102564492(LAMA4)
PSS: 102444833(LAMA4)
CMY: 102935888(LAMA4)
CPIC: 101949188(LAMA4)
ACS: 100556625 100565882(lama4)
PVT: 110085314(LAMA4)
PBI: 103058868(LAMA4)
PMUR: 107287159(LAMA4)
TSR: 106552708(LAMA4)
PMUA: 114594058(LAMA4)
GJA: 107111673(LAMA4)
XLA: 108716825(lama4.L) 108717424
XTR: 100489161(lama4)
NPR: 108797114
DRE: 566796(lama4)
SRX: 107715692(lama4)
SANH: 107670252(lama4)
SGH: 107565453(lama4)
IPU: 108275439(lama4)
PHYP: 113525660
AMEX: 103026767(lama4)
EEE: 113586226(lama4)
TRU: 101072818(lama4)
LCO: 104922932(lama4)
NCC: 104943210
MZE: 101466004(lama4)
ONL: 100697814(lama4)
OLA: 101163050(lama4)
XMA: 102221061(lama4)
XCO: 114158264(lama4)
PRET: 103458006(lama4)
CVG: 107092354(lama4)
NFU: 107384793(lama4)
KMR: 108249467(lama4)
ALIM: 106534329(lama4)
AOCE: 111587139(lama4)
CSEM: 103380641(lama4)
POV: 109632364(lama4)
LCF: 108899321(lama4)
SDU: 111240464(lama4)
SLAL: 111672906(lama4)
HCQ: 109509329(lama4)
BPEC: 110153303(lama4)
MALB: 109966580(lama4)
ELS: 105017888(lama4)
SFM: 108929407(lama4)
PKI: 111843020(lama4)
LCM: 102359744(LAMA4)
CMK: 103182579(lama4)
RTP: 109938902(lama4)
BFO: 118409620
 » show all
Reference
PMID:8706685
  Authors
Richards A, Al-Imara L, Pope FM
  Title
The complete cDNA sequence of laminin alpha 4 and its relationship to the other human laminin alpha chains.
  Journal
Eur J Biochem 238:813-21 (1996)
DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0813w.x
  Sequence
[hsa:3910]
Reference
PMID:7781776
  Authors
Iivanainen A, Sainio K, Sariola H, Tryggvason K
  Title
Primary structure and expression of a novel human laminin alpha 4 chain.
  Journal
FEBS Lett 365:183-8 (1995)
DOI:10.1016/0014-5793(95)00462-I
  Sequence
[hsa:3910]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K05636
Entry
K05636                      KO                                     

Name
LAMB1
Definition
laminin, beta 1
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H00268  Lissencephaly
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
   05145 Toxoplasmosis
    K05636  LAMB1; laminin, beta 1
Genes
HSA: 3912(LAMB1)
PTR: 463656(LAMB1)
PPS: 100994583(LAMB1)
GGO: 101134136(LAMB1)
PON: 100458670(LAMB1)
NLE: 100581721(LAMB1)
MCC: 702111(LAMB1)
MCF: 102126233(LAMB1)
CSAB: 103226726(LAMB1)
RRO: 104677415(LAMB1)
RBB: 108540465(LAMB1)
CJC: 100400907(LAMB1)
SBQ: 101045731(LAMB1)
MMU: 16777(Lamb1)
MCAL: 110306938(Lamb1)
MPAH: 110324954(Lamb1)
RNO: 298941(Lamb1)
MUN: 110558987(Lamb1)
CGE: 100757343(Lamb1)
NGI: 103732168(Lamb1)
HGL: 101700233(Lamb1)
CCAN: 109690109(Lamb1)
OCU: 100358679(LAMB1)
TUP: 102469659(LAMB1)
CFA: 475882(LAMB1)
VVP: 112908586(LAMB1)
AML: 100472572(LAMB1)
UMR: 103674704(LAMB1)
UAH: 113258474(LAMB1)
ORO: 101382657(LAMB1)
ELK: 111155260
FCA: 101080367(LAMB1)
PTG: 102962439(LAMB1)
PPAD: 109268056(LAMB1)
AJU: 106980652(LAMB1)
BTA: 520030(LAMB1)
BOM: 102278503(LAMB1)
BIU: 109557393(LAMB1)
BBUB: 102412743(LAMB1)
CHX: 102176661(LAMB1)
OAS: 101105743(LAMB1)
SSC: 396707(LAMB1)
CFR: 102521906(LAMB1)
CDK: 105093058(LAMB1)
BACU: 102997450(LAMB1)
LVE: 103071744(LAMB1)
OOR: 101278853(LAMB1)
DLE: 111184472(LAMB1)
PCAD: 102996119(LAMB1)
ECB: 100060360(LAMB1)
EPZ: 103567994(LAMB1)
EAI: 106825193(LAMB1)
MYB: 102250973(LAMB1)
MYD: 102774918(LAMB1)
MNA: 107526620(LAMB1)
HAI: 109372668(LAMB1)
DRO: 112302957(LAMB1)
PALE: 102881611(LAMB1)
RAY: 107501076(LAMB1)
MJV: 108404581
LAV: 100675837(LAMB1)
MDO: 100010605(LAMB1)
SHR: 100929086(LAMB1)
PCW: 110207016(LAMB1)
OAA: 100078794(LAMB1)
GGA: 396478(LAMB1)
MGP: 100548782(LAMB1)
CJO: 107307972(LAMB1)
NMEL: 110392386(LAMB1)
APLA: 101801494(LAMB1)
ACYG: 106042002(LAMB1)
TGU: 100222516(LAMB1)
LSR: 110475188(LAMB1)
SCAN: 103813510(LAMB1)
GFR: 102035516(LAMB1)
FAB: 101809033(LAMB1)
PHI: 102104811(LAMB1)
PMAJ: 107204235(LAMB1)
CCAE: 111923008(LAMB1)
CCW: 104686917(LAMB1)
ETL: 114060556(LAMB1)
FPG: 101913281(LAMB1)
FCH: 102053954(LAMB1)
CLV: 102091353(LAMB1)
EGZ: 104123792(LAMB1)
NNI: 104010798(LAMB1)
ACUN: 113491434(LAMB1)
PADL: 103917268(LAMB1)
AAM: 106487735(LAMB1)
ASN: 102384699(LAMB1)
AMJ: 102568782(LAMB1)
PSS: 102458826(LAMB1)
CMY: 102929487(LAMB1)
CPIC: 101942545(LAMB1)
ACS: 100555341(lamb1)
PVT: 110070347(LAMB1)
PBI: 103059637(LAMB1)
PMUR: 107299685
TSR: 106546531
PMUA: 114605032(LAMB1)
GJA: 107119904(LAMB1)
XLA: 108711179(lamb1.L) 108713081(lamb1.S)
XTR: 100495516(lamb1)
NPR: 108802662(LAMB1)
DRE: 286830(lamb1a) 556605(lamb1b)
IPU: 108275309(lamb1) 108276201(lamb2) 108279853
LCO: 104929904 104933728(lamb1)
NCC: 104941784(lamb1)
OLA: 101165682 101167953(lamb1)
XMA: 102229311(lamb1) 102232124
XCO: 114159996(lamb1) 114160832
PRET: 103459158 103466311(lamb1)
CVG: 107085845 107102511(lamb1)
NFU: 107387385 107389091(lamb1)
KMR: 108233277 108241880(lamb1)
ALIM: 106525802(lamb1) 106535973
CSEM: 103379635(lamb1) 103382600
POV: 109642034(lamb1)
BPEC: 110161568 110163781(lamb1)
ELS: 105007961 105018083(lamb1)
SFM: 108918620(lamb1) 108931561
LCM: 102357660(LAMB1)
CIN: 100179911
DME: Dmel_CG7123(LanB1)
DER: 6542002
DSE: 6611578
DSI: Dsimw501_GD23490(Dsim_GD23490)
DAN: 6504480
DSR: 110176842
DPE: 113565379
DMN: 108163072
DWI: 6642771
DAZ: 108609825
DNV: 115562595
DHE: 111592895
DVI: 6628452
MDE: 101887411
LCQ: 111680404
AAG: 5578743
AME: 726736
BIM: 100746803
BTER: 100642555
CCAL: 108632521
OBB: 114872818
SOC: 105197652
MPHA: 105840453
AEC: 105152359
ACEP: 105626418
PBAR: 105431459
VEM: 105562399
HST: 105180834
DQU: 106744261
CFO: 105250996
LHU: 105667788
OBO: 105286797
PCF: 106786605
NVI: 100123956
CSOL: 105362638
MDL: 103568562
TCA: 661297
DPA: 109537961
ATD: 109608806
BMOR: 100862837(LanB1-w) 692392
PMAC: 106708834
PRAP: 110992852
HAW: 110372331
TNL: 113508286
PXY: 105398039
API: 100159769
AGS: 114125503
RMD: 113556601
BTAB: 109043593
CLEC: 106670439
ZNE: 110833184
FCD: 110856721
PVM: 113808921
DPTE: 113796827
CSCU: 111638324
PTEP: 107439460
CEL: CELE_W03F8.5(lam-1)
CBR: CBG20003(Cbr-lam-1) CBG20114
BMY: Bm1_01080
TSP: Tsp_02564
PCAN: 112572248
CRG: 105348811
OBI: 106877208
SHX: MS3_08997
EGL: EGR_08084
EPA: 110253703
AQU: 105314164
 » show all
Reference
PMID:3611077
  Authors
Pikkarainen T, Eddy R, Fukushima Y, Byers M, Shows T, Pihlajaniemi T, Saraste M, Tryggvason K
  Title
Human laminin B1 chain. A multidomain protein with gene (LAMB1) locus in the q22 region of chromosome 7.
  Journal
J Biol Chem 262:10454-62 (1987)
  Sequence
[hsa:3912]
Reference
  Authors
Durbeej M
  Title
Laminins.
  Journal
Cell Tissue Res 339:259-68 (2010)
DOI:10.1007/s00441-009-0838-2
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06243
Entry
K06243                      KO                                     

Name
LAMB2
Definition
laminin, beta 2
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H00576  Pierson syndrome
H01657  Nephrotic syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
   05145 Toxoplasmosis
    K06243  LAMB2; laminin, beta 2
Genes
HSA: 3913(LAMB2)
PTR: 460365(LAMB2)
PPS: 100969648(LAMB2)
GGO: 101131073(LAMB2)
PON: 100441641(LAMB2)
NLE: 100591482(LAMB2)
MCC: 707892(LAMB2)
MCF: 102135628(LAMB2)
CSAB: 103227619(LAMB2)
RRO: 104667469(LAMB2)
RBB: 108527002(LAMB2)
CJC: 100389118(LAMB2)
SBQ: 101027384(LAMB2)
MMU: 16779(Lamb2)
MCAL: 110301253(Lamb2)
MPAH: 110327357(Lamb2)
RNO: 25473(Lamb2)
MUN: 110565216(Lamb2)
CGE: 100762566(Lamb2)
NGI: 103750198(Lamb2)
HGL: 101706277(Lamb2)
CCAN: 109691976(Lamb2)
OCU: 100009388(LAMB2)
TUP: 102484646(LAMB2)
CFA: 476626(LAMB2)
VVP: 112911607(LAMB2)
AML: 100477974(LAMB2)
UMR: 103675103(LAMB2)
UAH: 113256862(LAMB2)
ORO: 101380776(LAMB2)
ELK: 111144053
FCA: 101082047(LAMB2)
PTG: 102950017(LAMB2)
PPAD: 109247785(LAMB2)
AJU: 106979235(LAMB2)
BTA: 520167(LAMB2) 530599
BOM: 102278118(LAMB2) 102282698
CHX: 102179246 102183372(LAMB2)
SSC: 101101688(LAMB2)
CFR: 102510254(LAMB2)
CDK: 105087776(LAMB2)
BACU: 102999125(LAMB2)
LVE: 103071970(LAMB2)
OOR: 101271226(LAMB2)
DLE: 111174406(LAMB2)
PCAD: 102987884(LAMB2)
ECB: 100053539(LAMB2)
EPZ: 103553398(LAMB2)
EAI: 106830680(LAMB2)
MYB: 102258809(LAMB2)
MYD: 102765623(LAMB2)
MNA: 107529446(LAMB2) 107529447
DRO: 112309635(LAMB2) 112309774
PALE: 102889392(LAMB2)
RAY: 107513328(LAMB2)
MJV: 108383249(LAMB2)
LAV: 100655070(LAMB2)
TMU: 101354877
MDO: 100027514(LAMB2) 100619627
PCW: 110216959 110216962(LAMB2)
OAA: 100075055(LAMB2) 103170249
GGA: 101748153 373980(LAMB2)
MGP: 100543991(LAMB2)
CJO: 107319878 107319879(LAMB2)
APLA: 101791187(LAMB2) 113845089
ACYG: 106044086(LAMB2)
TGU: 100222711(LAMB2) 115496947
LSR: 110470675 110471047(LAMB2)
SCAN: 103817186(LAMB2) 115483849
GFR: 102039808(LAMB2) 102039977
FAB: 101807978(LAMB2) 101815023
PHI: 102105000 102108687(LAMB2)
CCAE: 111935032 111935299(LAMB2)
CCW: 104683487
FPG: 101924374(LAMB2) 101924542
FCH: 102046242(LAMB2)
EGZ: 104134764(LAMB2)
NNI: 104016978(LAMB2)
AAM: 106489385
AMJ: 102565881 102567932(LAMB2)
CPIC: 101935096(LAMB2) 101948213
ACS: 100562869(lamb2) 100563069
PMUR: 107297531(LAMB2)
PMUA: 114591919(LAMB2) 114591921
GJA: 107119587 107119588(LAMB2)
XLA: 108714682 108715891(lamb2.S) 108715892 494988(lamb2.L)
XTR: 100170549 100485566(lamb2)
NPR: 108804386 108804387(LAMB2)
DRE: 337767(lamb2)
SGH: 107568838(lamb2) 107593425
CCAR: 109064189
IPU: 108275997
PHYP: 113530759(lamb2)
AMEX: 103045854(lamb2)
EEE: 113569948(lamb2)
TRU: 101074108
LCO: 104931246(lamb2)
MZE: 101470464
ONL: 100706244
OLA: 101158524(lamb2)
XMA: 102225466
XCO: 114148576
PRET: 103466896(lamb2)
CVG: 107104369(lamb2)
NFU: 107391424
KMR: 108233124
ALIM: 106523000
AOCE: 111584481(lamb2)
CSEM: 103384674(lamb2)
POV: 109630873(lamb2)
LCF: 108884707(lamb2) 108884737
SDU: 111234736(lamb2) 111234737
SLAL: 111661876(lamb2) 111661935
HCQ: 109511755(lamb2)
BPEC: 110172200(lamb2)
MALB: 109970407(lamb2)
OTW: 112216009(lamb2) 112221344
SALP: 111966437(lamb2) 112074269
ELS: 105027768(lamb2)
SFM: 108925622 108925623(lamb2)
PKI: 111851173
LCM: 102357973(LAMB2)
CMK: 103176693 103176694(lamb2)
BFO: 118416742
SPU: 588438
SKO: 100371750
NVE: 5511143
ADF: 107353269
AMIL: 114958866
 » show all
Reference
PMID:7698745
  Authors
Wewer UM, Gerecke DR, Durkin ME, Kurtz KS, Mattei MG, Champliaud MF, Burgeson RE, Albrechtsen R
  Title
Human beta 2 chain of laminin (formerly S chain): cDNA cloning, chromosomal localization, and expression in carcinomas.
  Journal
Genomics 24:243-52 (1994)
DOI:10.1006/geno.1994.1612
  Sequence
[hsa:3913]
Reference
  Authors
Durbeej M
  Title
Laminins.
  Journal
Cell Tissue Res 339:259-68 (2010)
DOI:10.1007/s00441-009-0838-2
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K06244
Entry
K06244                      KO                                     

Name
LAMB3
Definition
laminin, beta 3
Pathway
ko04151  PI3K-Akt signaling pathway
ko04510  Focal adhesion
ko04512  ECM-receptor interaction
ko05145  Toxoplasmosis
ko05146  Amoebiasis
ko05165  Human papillomavirus infection
ko05200  Pathways in cancer
ko05222  Small cell lung cancer
Disease
H00586  Epidermolysis bullosa, junctional
H00615  Amelogenesis imperfecta
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04151 PI3K-Akt signaling pathway
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05200 Pathways in cancer
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
  09162 Cancer: specific types
   05222 Small cell lung cancer
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
  09172 Infectious disease: viral
   05165 Human papillomavirus infection
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
  09174 Infectious disease: parasitic
   05146 Amoebiasis
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
   05145 Toxoplasmosis
    K06244  LAMB3; laminin, beta 3
Genes
HSA: 3914(LAMB3)
PTR: 469668(LAMB3)
PPS: 100980738(LAMB3)
GGO: 101147168(LAMB3)
PON: 100434204(LAMB3)
NLE: 100593136(LAMB3)
MCC: 720945(LAMB3)
MCF: 102116149(LAMB3)
CSAB: 103230157(LAMB3)
RRO: 104664167(LAMB3)
RBB: 108539549(LAMB3)
CJC: 100400492(LAMB3)
SBQ: 101041547(LAMB3)
MMU: 16780(Lamb3)
MCAL: 110305044(Lamb3)
MPAH: 110322146(Lamb3)
RNO: 305078(Lamb3)
MUN: 110559812(Lamb3)
CGE: 100763082(Lamb3)
NGI: 103727074(Lamb3)
HGL: 101713053(Lamb3)
CCAN: 109697854(Lamb3)
OCU: 100342905(LAMB3)
TUP: 102500921(LAMB3)
CFA: 442953(LAMB3)
VVP: 112907138(LAMB3)
AML: 100465597(LAMB3)
UMR: 103672489(LAMB3)
UAH: 113262643(LAMB3)
ORO: 101368738(LAMB3)
ELK: 111162354
FCA: 101088641(LAMB3)
PTG: 102966519(LAMB3)
PPAD: 109255133(LAMB3)
AJU: 106981781(LAMB3)
BTA: 529939(LAMB3)
BOM: 102274964(LAMB3)
BIU: 109570638(LAMB3)
BBUB: 102407847(LAMB3)
CHX: 102168376(LAMB3)
OAS: 101105176(LAMB3)
SSC: 100736655(LAMB3)
CFR: 102503746(LAMB3)
CDK: 105099347(LAMB3)
BACU: 103003030(LAMB3)
LVE: 103087166(LAMB3)
OOR: 101284932(LAMB3)
DLE: 111184724(LAMB3)
PCAD: 102993220(LAMB3)
ECB: 100056564(LAMB3)
EPZ: 103548659(LAMB3)
EAI: 106827171(LAMB3)
MYB: 102258165(LAMB3)
MYD: 102772410(LAMB3)
MNA: 107532931(LAMB3)
HAI: 109396115(LAMB3)
DRO: 112297463(LAMB3)
PALE: 102896504(LAMB3)
RAY: 107517630(LAMB3)
LAV: 100666736(LAMB3)
TMU: 101340544
MDO: 100021649(LAMB3)
SHR: 100922990(LAMB3)
PCW: 110222728(LAMB3)
OAA: 100079022(LAMB3)
GGA: 428268(LAMB3)
MGP: 100550212(LAMB3)
CJO: 107324774(LAMB3)
NMEL: 110388297(LAMB3)
APLA: 101803829(LAMB3)
ACYG: 106041273(LAMB3)
TGU: 100219268(LAMB3)
LSR: 110475376(LAMB3)
SCAN: 103823330(LAMB3)
GFR: 102045655(LAMB3)
FAB: 101812663(LAMB3)
PHI: 102114134(LAMB3)
PMAJ: 107214830(LAMB3)
CCAE: 111939699(LAMB3)
CCW: 104692501(LAMB3)
ETL: 114063118(LAMB3)
FPG: 101910502(LAMB3)
FCH: 102053143(LAMB3)
CLV: 102086173(LAMB3)
EGZ: 104126830(LAMB3)
NNI: 104010308(LAMB3)
ACUN: 113488844(LAMB3)
PADL: 103923603(LAMB3)
AAM: 106490981(LAMB3)
ASN: 102384455(LAMB3)
AMJ: 102568796(LAMB3)
PSS: 102458677(LAMB3)
CMY: 102934621(LAMB3)
CPIC: 101933356(LAMB3)
ACS: 100558673(lamb3)
PVT: 110072367(LAMB3)
PBI: 103060496(LAMB3)
PMUR: 107290603(LAMB3)
TSR: 106539665(LAMB3)
PMUA: 114599351(LAMB3)
GJA: 107108297(LAMB3)
XLA: 108709379(lamb3.S)
XTR: 100125073(lamb3)
NPR: 108792087(LAMB3)
DRE: 101885031 572057(si:ch1073-15f12.3)
SRX: 107710800(lamb3)
SANH: 107667625(lamb3)
SGH: 107574763(lamb3)
IPU: 108281073(lamb3)
PHYP: 113525224(lamb3)
AMEX: 103034394(lamb3)
EEE: 113591745(lamb3)
TRU: 101072355(lamb3)
LCO: 104922486(lamb3)
NCC: 104944693(lamb3)
MZE: 101474838(lamb3)
OLA: 101160896(lamb3)
XMA: 102232579(lamb3)
XCO: 114135621(lamb3)
PRET: 103465466(lamb3)
CVG: 107100662(lamb3)
KMR: 108240365(lamb3)
ALIM: 106536528(lamb3)
AOCE: 111576725(lamb3)
CSEM: 103386619
POV: 109640341(lamb3)
LCF: 108873528(lamb3)
SDU: 111221777(lamb3)
SLAL: 111668559(lamb3)
HCQ: 109514514(lamb3)