KEGG   ORTHOLOGY: K07466
Entry
K07466                      KO                                     

Name
RFA1, RPA1, rpa
Definition
replication factor A1
Pathway
ko03030  DNA replication
ko03420  Nucleotide excision repair
ko03430  Mismatch repair
ko03440  Homologous recombination
ko03460  Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03420 Nucleotide excision repair
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03430 Mismatch repair
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03440 Homologous recombination
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03460 Fanconi anemia pathway
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03032 DNA replication proteins
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Zinc finger
   Cys2His2 others
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   RPA (replication protein A)
    K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
   MMR (mismatch excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RPA (replication factor A)
     K07466  RFA1, RPA1, rpa; replication factor A1
Other DBs
COG: COG1599
Genes
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POV: 109630206(rpa1) 109635662
LCF: 108875967 108893926(rpa1)
SDU: 111217109 111232241(rpa1)
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TAN: TA15495
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LMA: LMJF_28_1820(RPA1)
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MMD: GYY_05995
MMAK: MMKA1_11930(rpa)
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MAE: Maeo_0345
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ABI: Aboo_0797
PFU: PF2020
PHO: PH1893(PH1893)
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TKO: TK1961
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MBU: Mbur_1374
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HHB: Hhub_2571(rpa1)
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SMR: Smar_1419
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DKA: DKAM_0663
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SOL: Ssol_0176
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NEQ: NEQ199
MARH: Mia14_1030
PSYT: DSAG12_00658(rpa)
 » show all
Reference
  Authors
Mason AC, Haring SJ, Pryor JM, Staloch CA, Gan TF, Wold MS
  Title
An alternative form of replication protein a prevents viral replication in vitro.
  Journal
J Biol Chem 284:5324-31 (2009)
DOI:10.1074/jbc.M808963200
  Sequence
[hsa:6117]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K10739
Entry
K10739                      KO                                     

Name
RFA2, RPA2
Definition
replication factor A2
Pathway
ko03030  DNA replication
ko03420  Nucleotide excision repair
ko03430  Mismatch repair
ko03440  Homologous recombination
ko03460  Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   03420 Nucleotide excision repair
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   03430 Mismatch repair
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   03440 Homologous recombination
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   03460 Fanconi anemia pathway
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   RPA (replication protein A)
    K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
   MMR (mismatch excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RPA (replication factor A)
     K10739  RFA2, RPA2; replication factor A2
Genes
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Reference
  Authors
Zou Y, Liu Y, Wu X, Shell SM.
  Title
Functions of human replication protein A (RPA): from DNA replication to DNA damage and stress responses.
  Journal
J Cell Physiol 208:267-73 (2006)
DOI:10.1002/jcp.20622
Reference
  Authors
Lee DH, Pan Y, Kanner S, Sung P, Borowiec JA, Chowdhury D
  Title
A PP4 phosphatase complex dephosphorylates RPA2 to facilitate DNA repair via homologous recombination.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 17:365-72 (2010)
DOI:10.1038/nsmb.1769
  Sequence
[hsa:6118]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K10740
Entry
K10740                      KO                                     

Name
RPA3
Definition
replication factor A3
Pathway
ko03030  DNA replication
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ko03430  Mismatch repair
ko03440  Homologous recombination
ko03460  Fanconi anemia pathway
Brite
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 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    K10740  RPA3; replication factor A3
   03420 Nucleotide excision repair
    K10740  RPA3; replication factor A3
   03430 Mismatch repair
    K10740  RPA3; replication factor A3
   03440 Homologous recombination
    K10740  RPA3; replication factor A3
   03460 Fanconi anemia pathway
    K10740  RPA3; replication factor A3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K10740  RPA3; replication factor A3
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10740  RPA3; replication factor A3
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   RPA (replication protein A)
    K10740  RPA3; replication factor A3
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10740  RPA3; replication factor A3
   MMR (mismatch excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10740  RPA3; replication factor A3
  DSBR (double strand breaks repair)
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    RPA (replication factor A)
     K10740  RPA3; replication factor A3
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 » show all
Reference
  Authors
Zou Y, Liu Y, Wu X, Shell SM.
  Title
Functions of human replication protein A (RPA): from DNA replication to DNA damage and stress responses.
  Journal
J Cell Physiol 208:267-73 (2006)
DOI:10.1002/jcp.20622
Reference
  Authors
Kemp MG, Mason AC, Carreira A, Reardon JT, Haring SJ, Borgstahl GE, Kowalczykowski SC, Sancar A, Wold MS
  Title
An alternative form of replication protein a expressed in normal human tissues supports DNA repair.
  Journal
J Biol Chem 285:4788-97 (2010)
DOI:10.1074/jbc.M109.079418
  Sequence
[hsa:6119]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K10741
Entry
K10741                      KO                                     

Name
RPA4
Definition
replication factor A4
Pathway
ko03030  DNA replication
ko03420  Nucleotide excision repair
ko03430  Mismatch repair
ko03440  Homologous recombination
ko03460  Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    K10741  RPA4; replication factor A4
   03420 Nucleotide excision repair
    K10741  RPA4; replication factor A4
   03430 Mismatch repair
    K10741  RPA4; replication factor A4
   03440 Homologous recombination
    K10741  RPA4; replication factor A4
   03460 Fanconi anemia pathway
    K10741  RPA4; replication factor A4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K10741  RPA4; replication factor A4
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10741  RPA4; replication factor A4
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   RPA (replication protein A)
    K10741  RPA4; replication factor A4
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10741  RPA4; replication factor A4
   MMR (mismatch excision repair)
    RPA (replication factor A)
     K10741  RPA4; replication factor A4
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RPA (replication factor A)
     K10741  RPA4; replication factor A4
Genes
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NLE: 100580203(RPA4)
MCC: 699274(RPA4)
MCF: 102137101(RPA4)
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CGE: 113837703
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TMU: 101361689
 » show all
Reference
  Authors
Zou Y, Liu Y, Wu X, Shell SM.
  Title
Functions of human replication protein A (RPA): from DNA replication to DNA damage and stress responses.
  Journal
J Cell Physiol 208:267-73 (2006)
DOI:10.1002/jcp.20622
Reference
  Authors
Kemp MG, Mason AC, Carreira A, Reardon JT, Haring SJ, Borgstahl GE, Kowalczykowski SC, Sancar A, Wold MS
  Title
An alternative form of replication protein a expressed in normal human tissues supports DNA repair.
  Journal
J Biol Chem 285:4788-97 (2010)
DOI:10.1074/jbc.M109.079418
  Sequence
[hsa:29935]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system