KEGG   ORTHOLOGY: K12504
Entry
K12504                      KO                                     

Name
PDSS1
Definition
decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1 [EC:2.5.1.91]
Pathway
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ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Disease
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Brite
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  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K12504  PDSS1; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1
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    K12504  PDSS1; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1
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     K12504  PDSS1; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1
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   K12504  PDSS1; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1
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Reference
  Authors
Saiki R, Nagata A, Kainou T, Matsuda H, Kawamukai M
  Title
Characterization of solanesyl and decaprenyl diphosphate synthases in mice and humans.
  Journal
FEBS J 272:5606-22 (2005)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04956.x
  Sequence
[hsa:23590] [mmu:56075]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K12505
Entry
K12505                      KO                                     

Name
PDSS2
Definition
decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2 [EC:2.5.1.91]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Disease
H00999  Coenzyme Q10 deficiency
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K12505  PDSS2; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K12505  PDSS2; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2
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 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.91  all-trans-decaprenyl-diphosphate synthase
     K12505  PDSS2; decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2
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FCD: 110854301
DPTE: 113799408
CSCU: 111631093
TSP: Tsp_08290
PCAN: 112566407
CRG: 105348953
MYI: 110467190
OBI: 106877306
LAK: 106158460
SHX: MS3_04096
NVE: 5510480
EPA: 110235940
ADF: 107348036
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PDAM: 113678931
SPIS: 111323967
HMG: 100197374
AQU: 100641366
 » show all
Reference
  Authors
Saiki R, Nagata A, Kainou T, Matsuda H, Kawamukai M
  Title
Characterization of solanesyl and decaprenyl diphosphate synthases in mice and humans.
  Journal
FEBS J 272:5606-22 (2005)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04956.x
  Sequence
[hsa:57107] [mmu:71365]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 2.5.1.91
Entry
EC 2.5.1.91                 Enzyme                                 

Name
all-trans-decaprenyl-diphosphate synthase;
decaprenyl-diphosphate synthase;
decaprenyl pyrophosphate synthetase;
polyprenylpyrophosphate synthetase;
terpenoidallyltransferase;
terpenyl pyrophosphate synthetase;
trans-prenyltransferase
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
Sysname
(2E,6E)-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase (adding 7 isopentenyl units)
Reaction(IUBMB)
(2E,6E)-farnesyl diphosphate + 7 isopentenyl diphosphate = 7 diphosphate + all-trans-decaprenyl diphosphate [RN:R09249]
Reaction(KEGG)
R09249
Substrate
(2E,6E)-farnesyl diphosphate [CPD:C00448];
isopentenyl diphosphate [CPD:C00129]
Product
diphosphate [CPD:C00013];
all-trans-decaprenyl diphosphate [CPD:C17432]
Comment
This enzyme catalyses the condensation reactions resulting in the formation of all-trans-decaprenyl diphosphate, the isoprenoid side chain of ubiquinone-10 and menaquinone-10. The enzyme adds seven isopentenyl diphosphate molecules sequentially to farnesyl diphosphate with trans stereochemistry.
History
EC 2.5.1.91 created 2010
Pathway
ec00900  Terpenoid backbone biosynthesis
Orthology
K12504  decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1
K12505  decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2
Genes
HSA: 23590(PDSS1) 57107(PDSS2)
PTR: 450362(PDSS1) 462912(PDSS2)
PPS: 100974595(PDSS2) 100994534(PDSS1)
GGO: 101146443(PDSS1) 101149271(PDSS2)
PON: 100438163(PDSS1) 100447066(PDSS2)
NLE: 100588079(PDSS1) 100588805(PDSS2)
MCC: 698357(PDSS2) 707598(PDSS1)
MCF: 101925968(PDSS1) 102119719(PDSS2)
CSAB: 103238032(PDSS1) 103240635(PDSS2)
RRO: 104663598(PDSS2) 104676588(PDSS1)
RBB: 108515831(PDSS1) 108535241
CJC: 100405832(PDSS2) 100413805(PDSS1)
SBQ: 101036241(PDSS2) 101054504(PDSS1)
MMU: 56075(Pdss1) 71365(Pdss2)
MCAL: 110289815(Pdss1) 110303059(Pdss2)
MPAH: 110318495(Pdss1) 110326549(Pdss2)
RNO: 100364990(Pdss1) 365592(Pdss2)
CGE: 100768592(Pdss2) 100772754(Pdss1)
NGI: 103733000(Pdss1) 103747766(Pdss2)
HGL: 101697310(Pdss1) 101703636(Pdss2)
CCAN: 109680824(Pdss1) 109690628(Pdss2)
OCU: 100342300(PDSS2) 100350927(PDSS1)
TUP: 102476792(PDSS2) 102503271(PDSS1)
CFA: 481950(PDSS2) 607944(PDSS1)
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UMR: 103675843(PDSS2) 103680139(PDSS1)
UAH: 113248692(PDSS1) 113264772(PDSS2)
ORO: 101364783(PDSS2) 101367851(PDSS1)
FCA: 101087491(PDSS1) 101097150(PDSS2)
PTG: 102966140(PDSS2) 102971115(PDSS1)
PPAD: 109263492(PDSS2) 109276363(PDSS1)
AJU: 106973553(PDSS1) 106978879(PDSS2)
BTA: 509696(PDSS1) 521115(PDSS2)
BOM: 102280131(PDSS2) 102280164(PDSS1)
BIU: 109563857(PDSS2) 109567910(PDSS1)
BBUB: 102403041(PDSS1) 102416418(PDSS2)
CHX: 102177538(PDSS1) 102191138(PDSS2)
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SSC: 100312977(PDSS2) 100514361(PDSS1)
CFR: 102507389(PDSS1) 102515007(PDSS2)
CDK: 105097127(PDSS2) 105102340(PDSS1)
BACU: 103008000(PDSS1) 103020081(PDSS2)
LVE: 103080757(PDSS1) 103081626(PDSS2)
OOR: 101269757(PDSS2) 101276704(PDSS1)
DLE: 111164196(PDSS2) 111178024(PDSS1)
PCAD: 102984880(PDSS1) 102996087(PDSS2)
ECB: 100065489(PDSS1) 100072062(PDSS2)
EPZ: 103551286(PDSS2) 103560860(PDSS1)
EAI: 106848388(PDSS1) 106848468(PDSS2)
MYB: 102248508(PDSS2) 102254813(PDSS1)
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PMAJ: 107199706(PDSS1) 107201545(PDSS2)
CCAE: 111924118(PDSS1) 111927121(PDSS2)
CCW: 104689240(PDSS1) 104691680(PDSS2)
ETL: 114060323(PDSS1) 114063225(PDSS2)
FPG: 101918383(PDSS1) 101919329(PDSS2)
FCH: 102053247(PDSS1) 102053315(PDSS2)
CLV: 102086507(PDSS1) 102092561(PDSS2)
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TAN: TA03505
 » show all
Reference
1  [PMID:16262699]
  Authors
Saiki R, Nagata A, Kainou T, Matsuda H, Kawamukai M.
  Title
Characterization of solanesyl and decaprenyl diphosphate synthases in mice and humans.
  Journal
FEBS J 272:5606-22 (2005)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04956.x
  Sequence
[hsa:23590 57107] [mmu:56075 71365]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.5.1.91
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.5.1.91
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.5.1.91
BRENDA, the Enzyme Database: 2.5.1.91
LinkDB

KEGG   REACTION: R09249
Entry
R09249                      Reaction                               

Name
(2E,6E)-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase (adding 7 isopentenyl units)
Definition
trans,trans-Farnesyl diphosphate + 7 Isopentenyl diphosphate <=> all-trans-Decaprenyl diphosphate + 7 Diphosphate
Equation
C00448 + 7 C00129 <=> C17432 + 7 C00013
Comment
Reaction class
RC00279  C00129_C17432
Enzyme
Pathway
rn00900  Terpenoid backbone biosynthesis
rn01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K12504  decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1 [EC:2.5.1.91]
K12505  decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2 [EC:2.5.1.91]
Other DBs
RHEA: 27805
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system