KEGG   ORTHOLOGY: K13525
Entry
K13525                      KO                                     

Name
VCP, CDC48
Definition
transitional endoplasmic reticulum ATPase
Pathway
ko04141  Protein processing in endoplasmic reticulum
ko05014  Amyotrophic lateral sclerosis
ko05022  Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
ko05134  Legionellosis
Disease
H00058  Amyotrophic lateral sclerosis (ALS)
H00078  Frontotemporal lobar degeneration
H00264  Charcot-Marie-Tooth disease
H02031  Inclusion body myopathy with Paget disease of bone and frontotemporal dementia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05014 Amyotrophic lateral sclerosis
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
  09171 Infectious disease: bacterial
   05134 Legionellosis
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
   04131 Membrane trafficking
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Ran-mediated transport factors
     K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
Membrane trafficking [BR:ko04131]
 SNARE
  SNARE associated proteins
   Others
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
 Autophagy
  Aggrephagy
   Other aggrephagy associated proteins
    K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of haemopoietic cells  (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
   K13525  VCP, CDC48; transitional endoplasmic reticulum ATPase
Other DBs
COG: COG0464
TC: 3.A.16.1
Genes
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CSQ: CSCA_2557
CTH: Cthe_2407
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STH: STH1386
DAE: Dtox_3020
PTH: PTH_0431(SpoVK)
DAU: Daud_1492
HMO: HM1_2631
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MTHO: MOTHE_c15930(ftsH3)
MTHZ: MOTHA_c16760(ftsH5)
ADG: Adeg_0681
TOC: Toce_0454
STED: SPTER_09410(ftsH_2)
AYW: AYWB_229(hflB)
PSOL: S284_03670
MTU: Rv0435c
MTC: MT0451
MRA: MRA_0440
MTUR: CFBS_0452
MTD: UDA_0435c
MTUE: J114_02310
MTUH: I917_03135
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MTUT: HKBT1_0452
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MAVU: RE97_20140
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MIA: OCU_45870
MYO: OEM_46300
MUL: MUL_1384
MMC: Mmcs_0592
MKM: Mkms_0605
MJL: Mjls_0583
MMI: MMAR_0752
MMM: W7S_23185
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MSHG: MSG_00648
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METE: tca_01587(ftsH_2)
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MRU: mru_0435
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FAI: FAD_0487 FAD_1805(cdc48)
MEAR: Mpt1_c12160(vat1) Mpt1_c14070(vat2)
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PAB: PAB2086
TGA: TGAM_1689(cdc48-1) TGAM_1722(cdc48-2)
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SAI: Saci_0773 Saci_0838(sav)
TTN: TTX_0455(cdc48-1) TTX_1041(cdc48)
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Reference
  Authors
Zhong X, Shen Y, Ballar P, Apostolou A, Agami R, Fang S
  Title
AAA ATPase p97/valosin-containing protein interacts with gp78, a ubiquitin ligase for endoplasmic reticulum-associated degradation.
  Journal
J Biol Chem 279:45676-84 (2004)
DOI:10.1074/jbc.M409034200
  Sequence
[hsa:7415] [mmu:269523]
Reference
  Authors
Meerang M, Ritz D, Paliwal S, Garajova Z, Bosshard M, Mailand N, Janscak P, Hubscher U, Meyer H, Ramadan K
  Title
The ubiquitin-selective segregase VCP/p97 orchestrates the response to DNA double-strand breaks.
  Journal
Nat Cell Biol 13:1376-82 (2011)
DOI:10.1038/ncb2367
  Sequence
[hsa:7415]
Reference
PMID:1382975
  Authors
Egerton M, Ashe OR, Chen D, Druker BJ, Burgess WH, Samelson LE
  Title
VCP, the mammalian homolog of cdc48, is tyrosine phosphorylated in response to T cell antigen receptor activation.
  Journal
EMBO J 11:3533-40 (1992)
DOI:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05436.x
  Sequence
[mmu:269523]
LinkDB

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