KEGG   ORTHOLOGY: K13787
Entry
K13787                      KO                                     

Name
idsA
Definition
geranylgeranyl diphosphate synthase, type I [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00365  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, archaea
M00921  Cyclooctatin biosynthesis, dimethylallyl-PP + isopentenyl-PP => cyclooctatin
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Other DBs
RN: R01658 R02003 R02061
COG: COG0142
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Genes
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VHA: VIBHAR_02161
VCA: M892_02520
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MTU: Rv2173(idsA2) Rv3383c(idsB) Rv3398c(idsA1)
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MBT: JTY_2182(idsA2) JTY_3452(idsB) JTY_3468(idsA1)
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MCE: MCAN_21951(idsA2) MCAN_34071(idsB)
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MCV: BN43_31397 BN43_70037(idsB) BN43_70051(idsA)
MCX: BN42_40087 BN42_50042(idsB) BN42_50056(idsA)
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MLI: MULP_00255(idsB_3) MULP_02289(idsB) MULP_03434(idsA2) MULP_03445(idsB_1) MULP_05037(crtE)
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CPP: CpP54B96_1430(idsA)
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NCY: NOCYR_1854(crtE)
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SALJ: SMD11_1099(idsA) SMD11_4445 SMD11_5872(idsA) SMD11_6154(idsA) SMD11_6940(idsA) SMD11_6947(idsA)
TWH: TWT_217(idsA)
TWS: TW554
LXL: KDY119_02079(idsA) KDY119_02697(ggpS)
LXX: Lxx15370(gds)
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AMR: AM1_6022
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CAG: Cagg_1604
HAU: Haur_4493
TRO: trd_1197
ATM: ANT_20520
TTR: Tter_1465
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THM: CL1_0563
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HALH: HTSR_0762 HTSR_1035(idsA) HTSR_1817(idsA2)
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HSU: HLASF_0198(idsA2) HLASF_0824(idsA) HLASF_1449
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Reference
PMID:8182085
  Authors
Ohnuma S, Suzuki M, Nishino T
  Title
Archaebacterial ether-linked lipid biosynthetic gene. Expression cloning, sequencing, and characterization of geranylgeranyl-diphosphate synthase.
  Journal
J Biol Chem 269:14792-7 (1994)
  Sequence
[sai:Saci_0092]
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9
LinkDB

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