KEGG   ORTHOLOGY: K13789Help
Entry
K13789                      KO                                     

Name
GGPS
Definition
geranylgeranyl diphosphate synthase, type II [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
ko00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ko01100  Metabolic pathways
ko01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ko01130  Biosynthesis of antibiotics
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R01658 R02003 R02061
COG: COG0142
GO: 0004161 0004337 0004311
Genes
ATH: AT1G49530(GGPS6) AT2G18620 AT2G18640(GGPS4) AT2G23800(GGPS2) AT3G14510 AT3G14530 AT3G14550(GGPS3) AT3G20160 AT3G29430 AT3G32040 AT4G36810(GGPS1) AT4G38460(GGR)
ALY: ARALYDRAFT_478873 ARALYDRAFT_480765 ARALYDRAFT_480767 ARALYDRAFT_490952 ARALYDRAFT_891852 ARALYDRAFT_898426 ARALYDRAFT_900253 ARALYDRAFT_900865 ARALYDRAFT_912293 ARALYDRAFT_915906
CRB: 111829658 17879045 17889594 17890645 17891662 17891938 17892196 17892278
CSAT: 104700661 104702900 104709286 104713820 104716124 104716454 104720758 104721092 104727466 104729151 104729497 104742480 104745726 104746421 104746423 104747707 104748359 104748360 104748858 104752011 104759871 104765265 104765894 104765895 104766282 104767225 104767512 104767796 104777866 104779265 104779283 104785098 104785116 104785125 104786983
EUS: EUTSA_v10000201mg EUTSA_v10021022mg EUTSA_v10022044mg EUTSA_v10022207mg EUTSA_v10022745mg EUTSA_v10022750mg EUTSA_v10025481mg EUTSA_v10025662mg
BRP: 103835005 103837914 103839973 103842398 103850518 103859579 103860208 103864498 103865611 103869351 103870018
BNA: 106359950 106360195 106361432 106368637 106373100 106373101 106374163 106374421 106374714 106379695 106384672 106385166 106386463 106389691 106401977 106409529 106414355 106423506 106425731 106428853 106438661 106441455 106446607 106449872 111205413 111213308
BOE: 106293690 106301620 106304306 106312591 106316504 106317267 106332145 106332340 106333759 106336813 106343356 106343357
THJ: 104804224 104804225 104807556 104819809 104822600
CPAP: 110807892 110809730 110819081 110820609
LJA: Lj0g3v0109139.1(Lj0g3v0109139.1) Lj0g3v0124229.1(Lj0g3v0124229.1) Lj2g3v1804130.1(Lj2g3v1804130.1) Lj4g3v2405400.1(Lj4g3v2405400.1) Lj4g3v2405400.2(Lj4g3v2405400.2) Lj5g3v1015840.1(Lj5g3v1015840.1)
DOSA: Os01t0248701-00(Os01g0248701) Os02t0668100-01(Os02g0668100) Os05t0235701-00(Os05g0235701) Os07t0580900-01(Os07g0580900)
ATS: 109732885(LOC109732885) 109736634(LOC109736634) 109751671(LOC109751671) 109766338(LOC109766338) 109770604(LOC109770604)
AOF: 109821636
CRE: CHLREDRAFT_195038(GGPS)
MIS: MICPUN_104883(GGPS1)
MPP: MICPUCDRAFT_50196(GGPS1)
CVR: CHLNCDRAFT_31906(GPS)
APRO: F751_1472
TPS: THAPSDRAFT_268480(GGPS1)
ESA: ESA_00347
CSK: ES15_0622(crtE)
CTU: CTU_35390(crtE)
AHN: NCTC12129_03054(ispB_1)
PSTS: E05_04230
EGE: EM595_0222(crtE)
PAM: PANA_4158(crtE)
PLF: PANA5342_p10299(crtE)
PAJ: PAJ_p0126(crtE)
PAQ: PAGR_p225
PVA: Pvag_pPag30175(crtE)
PSTW: DSJ_25980
PLU: plu4337(crtE)
PAE: PA4043(ispA)
PAEV: N297_4172
PAEI: N296_4172
PAU: PA14_11560(ispA)
PAP: PSPA7_1058(is)
PAG: PLES_09331(ispA)
PAF: PAM18_0897(ispA)
PNC: NCGM2_5243(ispA)
PAEB: NCGM1900_0918(ispA)
PAEP: PA1S_04615
PAEM: U769_04625
PAEL: T223_04565
PAEU: BN889_04492(ispA)
PAEG: AI22_29000
PAEC: M802_4170
PAEO: M801_4038
PMY: Pmen_3841
PMK: MDS_4220
PRE: PCA10_06920(ispA)
PPSE: BN5_3630
PCQ: PcP3B5_53230(ispA)
PPU: PP_0528(ispA)
PPF: Pput_0562
PPT: PPS_0523
PPB: PPUBIRD1_0568(ispA)
PPI: YSA_06068
PPX: T1E_5743(ispA)
PPUH: B479_03120
PPUT: L483_02770
PPUN: PP4_05630(ispA)
PPUD: DW66_0537
PMON: X969_01060
PMOT: X970_01050
PST: PSPTO_0699(ispA)
PSB: Psyr_0605
PSYR: N018_03470
PSP: PSPPH_0600(ispA)
PFL: PFL_5509(ispA)
PPRC: PFLCHA0_c54620(ispA)
PPRO: PPC_5461
PFO: Pfl01_5006(ispA)
PFS: PFLU_5461(ispA)
PFE: PSF113_5227(ispA2)
PFC: PflA506_4757(ispA)
PFW: PF1751_v1c48850(ispA)
PFB: VO64_2345
PMAN: OU5_4173
PEN: PSEEN0601(ispA)
PSA: PST_3705(ispA) PST_3877
PPUU: PputUW4_04817(ispA)
PKC: PKB_0835(GGPS1)
PSES: PSCI_1129
PSEM: TO66_27820
PSEC: CCOS191_4797(ispA)
PSOS: POS17_5456
PANR: A7J50_5185
PSET: THL1_785
PSIL: PMA3_26880
PADE: C3B55_00317(ispA)
AVN: Avin_07880(ispA-1) Avin_20600(ispA-2)
AVL: AvCA_07880(ispA-1) AvCA_20600(ispA-2)
AVD: AvCA6_07880(ispA-1) AvCA6_20600(ispA-2)
ACX: Achr_15310(crtE) Achr_33330(ispA-2)
PSEN: PNC201_12105(sdsA)
MAQ: Maqu_2437
MHC: MARHY0809(ispA)
MAD: HP15_581
MBS: MRBBS_2792(idsA)
GPS: C427_1924
CJA: CJA_3335(ispA)
SDE: Sde_3221
SAGA: M5M_09805
HHA: Hhal_1613
TKM: TK90_0416
HCH: HCH_05865(ispA)
CSA: Csal_0098
HAM: HALO0255
HCO: LOKO_00961(ispA)
HBE: BEI_0053(ispA)
TOL: TOL_3217
GPB: HDN1F_25840(ispA)
PLG: NCTC10937_04812(ispA)
RTA: Rta_07740
RGE: RGE_33730(crtE)
GSU: GSU1765
GME: Gmet_1935
GUR: Gura_2176
GLO: Glov_2183
GBM: Gbem_1257
GEO: Geob_2628(ispA)
GEM: GM21_3026
GEB: GM18_1115
PCA: Pcar_1668
PPD: Ppro_2404
DEU: DBW_2426
DVU: DVU1349
DVL: Dvul_1719
DVM: DvMF_0125
DDE: Dde_2201
DDS: Ddes_0955
DMA: DMR_24330(ispA)
DHY: DESAM_20161(ispA)
DGG: DGI_2796
DTR: RSDT_0513(ispA)
DFL: DFE_0550
DAS: Daes_0910
DPI: BN4_11490
PPRF: DPRO_2796(ispA)
LIP: LI0407
LIR: LAW_00423
DBA: Dbac_0942
DRT: Dret_1759
DPS: DP2699
DSF: UWK_02515
DOL: Dole_1663
DML: Dmul_10410(ispA)
DAL: Dalk_0837
DTO: TOL2_C19800(ispA)
MXA: MXAN_4644(crtE)
CCX: COCOR_04848(crtE) COCOR_06210(idsA1)
SCL: sce0586(crtE)
HOH: Hoch_5911
SAT: SYN_02457
SFU: Sfum_1417
DBR: Deba_1928
BBA: Bd0199(yqiD)
BBAT: Bdt_0183(yqiD)
BBW: BDW_00715
BBAC: EP01_12960
BEX: A11Q_2303
HAX: BALOs_2044(ispA)
REC: RHECIAT_PB0000284(ctrE)
REP: IE4803_PB00390(ctrE)
RHN: AMJ98_PC00297(ctrE)
RPHA: AMC79_PC00274(ctrE)
RHX: AMK02_PC00292(ctrE)
RHK: Kim5_PA00361(ctrE)
REZ: AMJ99_PB00292(ctrE)
BRA: BRADO1615(crtE) BRADO6509(crtE)
BBT: BBta_6440(crtE)
BRS: S23_19150(crtE)
AOL: S58_59210
BRO: BRAD285_5784(crtE)
RPA: RPA1519(crtE)
RPB: RPB_4004
RPC: RPC_1290
RPD: RPD_3759
RPE: RPE_1324
RPT: Rpal_1707
XAU: Xaut_4133
MEX: Mext_2727
MEA: Mex_1p2924(crtE)
MDI: METDI3493(crtE)
MCH: Mchl_2954
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MET: M446_3694
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META: Y590_13125
MAQU: Maq22A_1p32530(ispA)
MSL: Msil_2049
RVA: Rvan_0153
BVR: BVIR_597
BLAG: BLTE_02330
CAK: Caul_1707
RSP: RSP_0265(crtE)
RCP: RCAP_rcc00684(crtE)
JAN: Jann_0182(crtE)
RDE: RD1_0114(crtE)
RLI: RLO149_p940130(crtE)
DSH: Dshi_3514(crtE)
PTP: RCA23_c29590(crtE)
RSU: NHU_04284(crtE)
RHC: RGUI_1964
SPHI: TS85_04280
AMV: ACMV_18820(crtE)
RRU: Rru_A2983
RRF: F11_15280
RCE: RC1_2091(crtE)
RPM: RSPPHO_02324(crtE)
MGM: Mmc1_1049
BSU: BSU24280(ispA)
BSR: I33_2508
BSL: A7A1_3614
BSH: BSU6051_24280(ispA)
BSUT: BSUB_02603(ispA)
BSUL: BSUA_02603(ispA)
BSUS: Q433_13290
BSS: BSUW23_12020(ispA)
BST: GYO_2688
BSO: BSNT_08862(yqiD)
BSQ: B657_24280(ispA)
BSX: C663_2310
BLI: BL01524(ispAB)
BLD: BLi02599(ispA)
BLH: BaLi_c26850(ispA2)
BAY: RBAM_022610(yqiD)
BAQ: BACAU_2274(yqiD)
BYA: BANAU_2414(yqiD)
BAMP: B938_11695
BAML: BAM5036_2183(ispA)
BAMA: RBAU_2397(ispA)
BAMN: BASU_2186(ispA)
BAMB: BAPNAU_1321(yqiD)
BAMT: AJ82_12815
BAMY: V529_25360(yqiD)
BAO: BAMF_2332(ispA3)
BAZ: BAMTA208_12485(ispA3)
BQL: LL3_02623
BXH: BAXH7_02546(yqiD)
BQY: MUS_2725(yqiD)
BAMI: KSO_008075
BAMC: U471_23390
BAMF: U722_12320
BHA: BH2781
BAN: BA_4402(ispA)
BAR: GBAA_4402(ispA)
BAT: BAS4082
BAH: BAMEG_4437(ispA)
BAI: BAA_4419(ispA)
BANT: A16_43970
BANR: A16R_44510
BANS: BAPAT_4221
BANV: DJ46_3086
BCE: BC4177
BCA: BCE_4251(ispA)
BCZ: BCE33L3931(ispA)
BCR: BCAH187_A4308(ispA)
BCB: BCB4264_A4288(ispA)
BCU: BCAH820_4198(ispA)
BCG: BCG9842_B0946(ispA)
BCQ: BCQ_3964(ispA)
BCX: BCA_4287(ispA)
BAL: BACI_c41450(ispA)
BNC: BCN_4091
BCF: bcf_20765
BCER: BCK_14295
BTK: BT9727_3920(ispA)
BTL: BALH_3786(ispA)
BTB: BMB171_C3838(ispA)
BTT: HD73_4480
BTHI: BTK_22070
BTC: CT43_CH4192(ispA)
BTM: MC28_3470
BTG: BTB_c43190(ispA)
BTI: BTG_28505
BTW: BF38_5346
BWW: bwei_0759(ispA)
BMYO: BG05_1839
BMYC: DJ92_1279
BCL: ABC2463(ispA)
BPU: BPUM_2160
BPUM: BW16_11715
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BPF: BpOF4_01510(ispA)
BMQ: BMQ_4456(ispA)
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BMH: BMWSH_0779(yqiD)
BMEG: BG04_1373
BAG: Bcoa_2861
BCOA: BF29_706
BJS: MY9_2450
BACW: QR42_10920
BACP: SB24_17415
BACB: OY17_14580
BACO: OXB_2744
BACY: QF06_10330
BACL: BS34A_26660(ispA_2)
BALM: BsLM_2384
BEO: BEH_19520
BGY: BGLY_2876(ispAB)
BBEV: BBEV_1308(ispA)
OIH: OB1877
GKA: GK2393
GTN: GTNG_2323
GGH: GHH_c24670(ispA)
AFL: Aflv_0947
AAMY: GFC30_2582
AXL: AXY_11780
LSP: Bsph_3510
HHD: HBHAL_3474(yqiD)
HLI: HLI_19480
BSE: Bsel_2266
SAU: SA1352(ispA)
SAV: SAV1521(ispA)
SAW: SAHV_1509(ispA)
SAM: MW1474(ispA)
SAS: SAS1460
SAR: SAR1599
SAC: SACOL1566(ispA)
SAX: USA300HOU_1523(ispA)
SAE: NWMN_1427(ispA)
SAD: SAAV_1514(ispA)
SUE: SAOV_1522(ispA)
SUJ: SAA6159_01457(ispA)
SUK: SAA6008_01491(ispA)
SUZ: MS7_1539(ispA)
SUG: SAPIG1587
SAUA: SAAG_01436
SAUE: RSAU_001388(ispA)
SAUS: SA40_1393
SAUU: SA957_1476
SAUG: SA268_1480
SAUT: SAI1T1_2011060(ispA)
SAUJ: SAI2T2_1011080(ispA)
SAUK: SAI3T3_1011060(ispA)
SAUQ: SAI4T8_1011070(ispA)
SAUV: SAI7S6_1011080(ispA)
SAUW: SAI5S5_1011030(ispA)
SAUX: SAI6T6_1011040(ispA)
SAUY: SAI8T7_1011070(ispA)
SAUF: X998_1533
SAB: SAB1394c
SUY: SA2981_1480(ispA)
SAUB: C248_1564
SAUC: CA347_1519
SAUR: SABB_05032(ispA)
SAUI: AZ30_07760
SAUD: CH52_11460
SAMS: NI36_08215
SEP: SE1202
SER: SERP1082(ispA)
SEPP: SEB_01222
SEPS: DP17_161
SHA: SH1394(ispA)
SHH: ShL2_01278(ispA)
SSP: SSP1233
SCA: SCA_1145
SDT: SPSE_1276(ispA)
SPAS: STP1_0097
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Okada K, Saito T, Nakagawa T, Kawamukai M, Kamiya Y
  Title
Five geranylgeranyl diphosphate synthases expressed in different organs are localized into three subcellular compartments in Arabidopsis.
  Journal
Plant Physiol 122:1045-56 (2000)
DOI:10.1104/pp.122.4.1045
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9
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