Halarcobacter anaerophilus: AANAER_0330
Help
Entry
AANAER_0330 CDS
T06853
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
aana
Halarcobacter anaerophilus
Pathway
aana01501
beta-Lactam resistance
aana01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aana00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
AANAER_0330
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
AANAER_0330
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aana02000
]
AANAER_0330
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
aana01504
]
AANAER_0330
Transporters [BR:
aana02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AANAER_0330
Antimicrobial resistance genes [BR:
aana01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
AANAER_0330
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDF27832
LinkDB
All DBs
Position
313556..316675
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MFSRFFINRPIFATVVSILIILAGLISINILPIKEYPSVTPPQINVRATYPGADAKTLSA
TVATTLENEINGVDNMTYMSSTASPSGVLSLSIIFDVGTDVEQAKVDVNNRVQLALSKLP
QEVQRQGISVKERSPDMLKVIAFRSKGQVHDRLYISNYLTVNVVDDLKRIKGIGDVNVFG
AKDYSIRVWIDPEKLAFYNLVPSDVRAIVESQNNQYSTGSVAAEPIDNIQPFTYSLTTEG
RLKTVQEFENIIVRSNPDGSTLKLKDIARIELGSNSHDTSANYNKEPMVPVGIFLSPGAN
ALEVSGALDEKLKELSEKFPEDLEYKIPYDATQFVDESIQEVVKTLLEAVVLVIVLIYVF
LGNFRATIIPVLAIPVSIIGTFAGLYAAGFSINLLTLFGLILAIGLVVDDAIIVIENVER
VLRTSKGISVKDATIEAMKELTTPLIAIILVLSAVFIPAALTGGFSGVMYKQFAITIVIS
VVISGLVALTLTPALCAIFLKEEEKEPILPIRKFNEFFDWSTKVFIGITKKTIRLWFFSL
ALFAILLGATYSIMKITPTGLVPSEDKGVLLVIVNMMPATSLGESKKIANDIESQLLDNP
EVFSTGAITGLDISSFAYKTDAALMFAKLKPWDERPLASQSSQAVAGQLMGHFMMTSKEA
FVIPVNPPPIMGMSTTGGFEMWIQDRTGGDLSTLNQYIQQIVSKAMQDPRLTSVRTTLNT
NVPQYLLTVDREKAKSMNVSISSIYNVIQNSFGMGYINDFNLYSRTFHVNIQSESEYRKT
RDDFKNIFVKSSEGDLIPVSELTTLERKVDASIIERFNMFNAAKITGNPAMGFASSDATN
AIEEIATSILPDGYTVAWSGTTFQEKKLEKEGNYTSLYAALFVFLILAALYESWSIPLSV
ILSIPFAIFGAALGVFLRGLEADIYFQVGLITLVGLSAKNAILIVEFAMDKLRDGLSLFD
ATIEAARLRFRPIVMTSLAFIAGTLPLATSTGAGSASRHILGTTVVAGMIAAVVIGVVFI
PLFFYGVMRIKQKFSKDID
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcacgtttttttataaatagacccatctttgcaacagttgtctctattttaata
atacttgcagggttaatttcaattaatattttacctataaaagagtacccttcagtaact
cctccccagattaatgtaagagctacatatcccggagctgatgctaagactctatctgca
actgttgcaactacacttgaaaatgagattaacggtgttgacaatatgacatatatgtct
tcaactgcatcgccaagtggagtattatctttaagtataatttttgatgtaggaactgat
gttgaacaagcaaaagttgatgtaaacaacagagtacaattagcattaagtaaattaccg
caagaggttcaaagacaaggaatctcggtaaaagagagatctcctgatatgttaaaagta
attgctttcagatcaaaagggcaagttcatgaccgtctttatatatcaaactacttaaca
gtaaatgttgttgatgatttaaaaagaatcaaaggtatcggagatgtaaatgtatttgga
gctaaagattactctattagagtttggattgatcctgagaaattagctttttataattta
gtaccaagcgatgtaagagctattgtagagagtcaaaataatcaatattcaaccggatcg
gttgctgccgaaccaatagataatattcaaccgtttacttactctttaaccacagagggt
agattaaaaactgttcaagaatttgagaatataatagttagatctaatcctgacggttct
acgcttaaattaaaagatattgcaagaattgaacttggttcaaattctcatgatacaagt
gctaattataacaaagaacctatggtacccgttggtattttcttgtctccaggagcaaat
gctcttgaagtttcaggagcattggatgaaaaattaaaagagctttcggaaaaattccct
gaagatttagagtataaaataccttatgatgcaacacagtttgtggatgaatcaatccaa
gaggttgttaaaacattattagaagcagttgttcttgttattgttttaatatatgtattc
ttaggaaactttagagcaacgattattcctgttttggcaattccagtatcgattatcggt
acctttgccggactttatgcagcaggtttttcaataaaccttttaacgctgttcggactt
attctggccattggtctggttgttgatgatgccattattgttattgaaaatgttgaaagg
gttttacgaacaagcaaaggtattagcgtaaaagatgctactattgaagcgatgaaagag
ttaacgactccgttaattgcgattattcttgttttatctgcagtatttattcctgcagct
cttacgggaggttttagtggggttatgtataagcagtttgcaatcacaattgttatttca
gttgtaatttcaggtctagtagcattaacattaactcctgccttatgtgcaatttttcta
aaagaagaggagaaagagccaatattaccgattagaaaatttaatgaattttttgattgg
tctacaaaagtttttataggaattactaaaaaaacaattaggttatggtttttctctcta
gcactatttgctattttactaggagcgacatattcaattatgaaaataactccgacagga
ttagttccttctgaagataaaggggtgttacttgttattgttaatatgatgcctgcaact
tctttaggtgaatctaaaaaaattgcaaatgatatagaatcacaacttcttgataatcct
gaagtattttctacaggtgctattacaggtctggatatttcatcatttgcttataaaacc
gatgcggcgttaatgtttgcaaaactaaaaccttgggatgaaagacctcttgctagccaa
agttctcaagcagttgcgggacaattaatgggacactttatgatgacaagtaaagaggca
tttgttattcctgttaacccgcctccgattatgggtatgagtacaacaggtggttttgaa
atgtggattcaagatagaacaggtggagatttaagtactttaaatcagtatattcaacaa
attgtttcaaaagcaatgcaggatccaagacttacatctgtaagaacaacacttaataca
aatgttcctcaatatttgttaacagttgatagagaaaaagctaaatctatgaatgtaagt
ataagttctatatacaatgtaattcaaaacagtttcggtatggggtatataaatgacttc
aacctttatagtagaacattccatgtaaatattcagtctgaatctgaatatagaaaaaca
agagatgattttaaaaatatttttgttaaatcaagcgaaggtgatttgattcctgtaagt
gaattgactacgttagaaagaaaagtggatgcaagtattatcgaaagatttaatatgttt
aatgcggcaaaaataacaggtaatcctgcaatgggatttgcttcaagtgatgcaaccaat
gcaattgaagagattgcaacttcaattttaccagacggttatactgtagcttggtcagga
acaacatttcaagagaaaaaacttgaaaaagagggaaattatacctctctttatgcggca
cttttcgtattcttgattcttgcggctctttatgaaagttggagtattcctttatctgta
atcttgtcaataccttttgccattttcggtgcggctttaggagtatttttaagaggattg
gaagcagatatctatttccaagtaggtcttattacgctagtaggattgtctgctaaaaat
gcaattttgattgttgagtttgcaatggacaaattacgtgacggcttgtccttatttgat
gcgactattgaggcagcaagacttagatttagacctattgtaatgacgtctttggcattt
attgccggaacattgcctttggcaacaagtaccggagcaggaagtgcaagtagacatatt
ttaggtacaacagttgttgcaggtatgattgcagcggttgtaataggagttgtttttatt
cctctgtttttctatggagtaatgagaataaaacaaaaattttcaaaagatatagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
