Alteromonas stellipolaris R10SW13: AVL56_08495
Help
Entry
AVL56_08495 CDS
T04403
Name
(GenBank) multidrug transporter AcrB
Organism
aaw
Alteromonas stellipolaris R10SW13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ94337
LinkDB
All DBs
Position
1978479..1981523
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MDIARYSIDKPVNVWLMVVILLLGGIIAMTNIGRLEDPEFTIKQVKVYTSYSGAGAEKVE
REITEPLEIAIQQMPQLKKLTSISSPALSEITVEVKSNYDSNELPQIWDELRKRLRDAAT
SLPTGAQDPVVFDDFGDVYGLYYALSAPDFTTSELREFARLIRRDLLTTEGVAKVTVSGV
QTEQIVAYVNPYQLAGLGISFPDLTSLFEENLRPFNGGRVLVDEKNVRLIVERAPDKIKE
ISNLSLVMPGTNRSIRVSDVATLKLEPADIQSQLIRYNGEEALTVSVSALSNVNIVDVGT
RVNAKVDHLLNTLPLGITLTPIYDQAAVVDESVDGFIANLVMSVVVVTLTLCLFMGWRSG
VVVGMVLLVTVLGTILIMWLMDIQLQRISLGAMVIAMGMLVDNAIVVAEGMMLRMATGAS
AKDAASFIVKRTQWPLLGATVIGIAAFSGIGLSDDATGEFLYSLFAVVLVSLMMSWVLAV
TLVPVLGELVFRKGVKQTDGDEPTLLQRWFTKTLTGALKLRWVTMAVLFVITVVAYGSFG
MVKQGFFPPSNAPLFFVHYWGPQDRDIRATEKIIKEAEERILAQENVTAVTTIIGQGADR
FTLTYAPKSANENYGFFMVRVNELENIPAVQEKLSGLLDNIDLDANFYQERMQFGPGSGA
KLEARFSGPDAEVLRTLAEEAKGMMLADGNIKDIRHNWREKGVAINTQYDNYNAGIAGVS
HSDFSQTVQYASSGLRLGSVQDGDYAYSIVAKMGHPDDTAIQSVRESQVWSSQQRQYVPF
TQVSSGLDIVTEELRIHRKDRLRTITVEAEPSDNETAAKAFARIRPQIEAMDIPAGYALE
WGGEFESSSDAQAALGAGLPVGFLVMFIISVLLFGHARQPLIIWLVVPMAIVGVVTGLLS
TNMPFGFMSLLGFLSLFGMLIKNAIVLIEEIDLQIEEGLEIKKAIVEATLSRLRPVTLAA
LTTILGMAPLLFDAFFADMAVTIMGGLTFATILTLIAVPVLYSILFKVSYRKAS
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatcgctcgttattcaattgataaacccgtaaatgtatggcttatggtggtgata
ctgctactaggcggtattattgcaatgaccaatattggtcgtttggaagaccccgaattc
accattaagcaagtgaaggtttataccagctactccggcgctggtgcagaaaaggtggag
cgggaaattaccgaacctcttgaaattgctatccagcaaatgccacaacttaaaaagctg
acatcaatctcttcgcccgctttatctgaaattaccgttgaagtgaaaagtaactacgac
agtaatgagcttccccaaatttgggatgaactcagaaagcgcttacgagatgcagctacc
tccttgccgaccggtgcgcaagaccctgtggttttcgatgactttggtgatgtttacggg
ctttattacgcgctgagtgcgcctgatttcactaccagcgaattgcgggaatttgcgcgc
ttaattcgaagagatttattaaccactgagggcgtagcgaaagtcactgttagcggtgtg
caaaccgaacagatagttgcttatgttaacccttaccagcttgctgggttaggtatttca
tttcctgatttaacctcgctatttgaagaaaatttgcgcccttttaatggcggaagagtc
ttggtagacgaaaagaacgtacgcttaatcgtagagcgggctccagataaaattaaagaa
atatcaaacctttcgttagttatgcctggcacaaatcgctctattcgggtttccgacgtg
gccacacttaagttagagcctgccgatatccagtctcagcttattcgttacaacggagaa
gaagcattaacagtttcggtttcagcgttatctaacgtgaacattgttgatgtaggcacc
cgcgtaaatgccaaagtagatcatttacttaatacccttccactaggcattacccttacc
cccatttacgaccaagcagcggtagttgacgagtcggtcgatggctttattgctaacctt
gtgatgtcagtagtcgtagttacccttacattgtgcttattcatgggctggcgttcaggt
gtggtggtaggcatggtgctgttagtcactgtgctaggtacaattcttatcatgtggcta
atggacattcagcttcagcgtatatcccttggcgcgatggttattgccatgggaatgttg
gtagacaacgctattgtagtggccgaaggcatgatgcttcgaatggctaccggcgcctct
gccaaagatgcagcaagctttattgtaaaacgaacgcagtggcctttattaggcgcaaca
gtaataggtatcgcggcattctcagggattggattatctgatgatgctaccggtgagttc
ttgtattccttatttgccgtcgtattagtatctttgatgatgagttgggtacttgctgta
accttagtacccgtgcttggcgagctagtgtttcgtaaaggcgtaaagcaaacggatggt
gatgaaccaaccttactgcagcgctggttcaccaaaaccctcactggggctttaaaatta
cgatgggtgaccatggccgtgttgtttgtgattaccgtggtagcctacggcagtttcggg
atggttaaacaaggctttttcccaccctccaacgcaccgctgttctttgtgcattattgg
ggccctcaagaccgtgatattcgggctaccgaaaaaatcattaaagaggctgaagaacgt
attttagcccaagaaaatgtaacggctgtaaccaccattataggtcaaggtgctgaccgc
tttacgctgacttacgcgccaaaaagtgccaatgaaaactatggatttttcatggttcgc
gttaatgaattagagaatattcccgccgttcaagaaaagctttccggtttgctcgacaac
atcgatcttgatgccaacttctaccaagaacgtatgcaatttgggccaggttctggcgct
aaacttgaagcacgcttctcaggccctgatgcagaagttttacgcacccttgccgaagaa
gcgaaaggcatgatgttagccgatggtaatattaaagatattcgccataattggcgtgaa
aaaggcgtagccataaacacccagtacgataattacaatgccggtattgctggtgtttct
cactctgactttagtcaaaccgtgcaatatgccagtagcggattgcgtctaggcagcgtg
caagatggagactatgcctacagtattgtggcaaaaatggggcatcctgatgataccgcc
attcaatcggtgcgagaaagccaagtatggtcgtcacagcaacgtcaatacgtgcctttt
acgcaagtatctagcggtttagatattgtgacagaagagctgcgcattcaccgaaaagac
agattacgtactatcacagtagaagctgagcctagcgataatgaaactgccgcgaaagca
tttgcccgtattcgccctcaaattgaagcaatggacattcctgctgggtatgcccttgaa
tggggtggtgagtttgaaagctctagcgatgcacaagcggcgcttggtgcaggtttacct
gtgggtttcttagtgatgttcattatctctgtactgctatttggacacgctcgtcagccc
ctgatcatttggttagtggtgcctatggcgatagttggtgtagtgacagggcttctgtct
accaatatgccatttggctttatgtcacttcttgggttcttaagtttattcggcatgttg
attaaaaatgccatcgtacttattgaagagatagacttacaaattgaagaaggactagaa
attaaaaaggcaatagtagaagcaacgctaagccgtttgcgtcctgtaacgttggctgca
ttaaccactattttaggtatggcgccactgttattcgatgccttctttgcagatatggca
gtgacgattatgggcggactaacctttgccaccattctaacgcttattgcagtgcctgtg
ctctatagcattttgttcaaagtaagctatcgaaaagccagttag
DBGET
integrated database retrieval system
