Aliarcobacter butzleri RM4018: Abu_0813
Help
Entry
Abu_0813 CDS
T00600
Name
(GenBank) hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
abu
Aliarcobacter butzleri RM4018
Pathway
abu01501
beta-Lactam resistance
abu01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
abu00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Abu_0813
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Abu_0813
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
abu02000
]
Abu_0813
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
abu01504
]
Abu_0813
Transporters [BR:
abu02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Abu_0813
Antimicrobial resistance genes [BR:
abu01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Abu_0813
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
DUF5693
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV67078
UniProt:
A8ET04
LinkDB
All DBs
Position
complement(820430..823558)
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MISSFFIKNPVFAGVLSIIIFLTGIIAMFNLPIEQYPRVLPPQIIVSTSYPGASADTIAK
TVAAPLEEQINGAKNMLYMNSLAEDSGRLSINVFFEVGTNPDDAKIDVNNRVQAALAKMP
EQVQRQGVVVGERSPSILQFIMLESPNKTFDSIYLSNYALLNLVESLKRVKGVGDAMIFG
AKDYSIRIWMDPLKLSKYSLATTDVITAIKEQNNQYAAGKIAAEPIAQKQMYTYTIRTPQ
RFENPEQFGNIVIRANEDGSSLRLKDIATIELGANDYSVTTRLNNAPSIPIGIFLQSGAN
SLETADAIKKALEEASKTFPEDMTYSIPYDSTDFITASIHEVVKTFVEALILVILIIFLF
LQSWRATIIPFIAVPVSIVGAFAGMYALGFSINLLTLFGLVLAIGIVVDDAIIVIENIER
HMEEGKTPKEAAFIAMKEVTGALIAIILVLGAVFIPVAFMGGLSGEMYRQFAITIVISVV
ISGFVALTLTPALCVKVLKNKKHEPKGFFKWFNDSFAKATQGYSVIVKKSIRFSLISVLL
YAGLLFISWDMFKSMKTGLLPDEDQGTIFVFGFNPPGYSMSKSLELSEEINKIIAEDPSV
NNIITLAGYDFTTSAQRSHTVATIIKLKDWSKRPNPEQEAQALLAKFSKQLMGTSEGFSF
AVVPPPIMGMSVTGGFDMYVQDRKGGTIEDLGKIVNQIVEKAKTRPELMGVRTALAANIP
QFQIDVDTEKAKAKGVSLSDIYSTINATFGSYYVNDFSLYGRTYKVNLQAKDEFRNNVDD
FQYVYVRSDKGELLPINSFINYKKVVGADIVERFNLFQAAKVSGQPAAGYSSGDSLRAIE
EVANEVLPEGYTISWTGTAYQEKQIGGSSAQAFIFGIVFLFLILCALYERWLLPLSVVLA
VPFAIFGAILATNIRSLDNNIYFQIGLLVLAGLAAKNAILIVEFAIQKQKEGIKLVDAAL
EAAKVRLRPIIMTSLAFTVGVMPLAISSGAGAASKHSIGTGVVGGMLTATFIAILFIPLF
FVLISRLSGHKDDEVLTNKEEE
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttcttcattttttattaaaaacccagtttttgctggtgttttatcgattataata
tttttgacgggaataattgctatgttcaatttaccaattgaacaatatccaagagtttta
ccacctcaaattattgtaagtacttcatatccaggagctagtgcagatactattgcaaaa
actgttgctgctcctcttgaagagcagataaatggtgcaaaaaatatgctttatatgaac
tctctagcagaagatagtggaagattaagtatcaacgtattttttgaagttggaacaaat
cctgatgatgcaaaaatcgatgtaaacaatagggtacaagctgccttagcaaaaatgcct
gaacaagtacaaagacaaggtgttgttgtaggtgaaagaagtccaagtattttgcaattt
attatgcttgaatctccaaacaaaacttttgattcaatttatttatcaaactatgcttta
ttaaacttagttgaatcattaaaaagagttaaaggagttggtgatgctatgatatttgga
gcaaaagattactctattagaatctggatggatccattaaaattatcaaaatattcactt
gctacaactgatgttataacagcaattaaagaacaaaataatcaatatgcagctggaaaa
attgcagctgaaccaattgctcaaaaacagatgtatacatatacaattagaactccacaa
aggtttgaaaatcctgaacaatttggaaatattgtaattagagcaaatgaagatggaagt
agtttaagattaaaagatatcgcaactattgaacttggagctaatgattatagtgttaca
acaagattaaataatgcaccttcgattcctattggaatatttttacaaagtggtgcaaac
tcacttgaaactgctgatgctataaaaaaagccttagaagaagcaagtaaaactttccct
gaagatatgacatatagtattccttatgatagtacagattttattacagcttcaattcat
gaagttgttaaaactttcgttgaagctttaatacttgtaattttaattattttcttattc
ttacaaagctggagagcaactattattccttttattgcggttccagtatcaatagttggt
gcatttgcagggatgtatgctttaggatttagtattaacttactaactttatttggttta
gttcttgctattggtatcgttgttgatgatgctattatcgttattgaaaatattgaaaga
cacatggaagaaggaaaaactcctaaagaagctgcatttattgctatgaaagaggtaact
ggagctttaattgctattattttagttttaggtgctgtatttattcctgttgcatttatg
ggtggattaagtggagaaatgtatagacagtttgccataacaattgttatttctgttgtt
atttctggattcgttgctttaactttaactccagctctttgtgtaaaagtattaaaaaac
aaaaaacatgaaccaaaaggttttttcaaatggttcaatgattcttttgcaaaagctaca
caagggtattcagtaatagttaaaaaaagtattagattttctttaatctctgttttatta
tatgctggattattgtttatatcttgggatatgtttaagtctatgaaaactggacttctt
cctgatgaagatcaaggaacaatctttgtatttggatttaaccctccaggatactctatg
tcaaaatctttagagttaagtgaagagataaataaaattattgcagaagatccaagcgta
aataatataattactcttgctggatatgactttacaacttcggcacaaagaagccataca
gttgcaacaattattaaattaaaagattggagcaaaagaccaaatcctgagcaagaagca
caagcacttttagcaaaatttagtaaacaactaatgggaacaagtgaagggttttcattt
gccgttgtaccacctcctattatggggatgagtgttacaggtggatttgatatgtacgtt
caagatagaaaaggtggaactattgaagatttaggaaaaattgtaaatcagatagttgaa
aaagccaaaactagacctgaattaatgggagttagaactgcattagctgctaatattcca
caatttcaaattgatgtagatactgaaaaagcaaaagcaaaaggtgtaagtctaagtgat
atttatagcactataaatgcaacttttggaagttattatgtaaatgatttttctttatat
ggaagaacttataaagttaatttacaagctaaagatgaatttagaaataatgttgatgat
ttccaatatgtttatgttagatcagataaaggtgaacttttaccaattaattcatttata
aactataaaaaagttgttggagctgatatcgtagaaagatttaaccttttccaagcagca
aaagtttcaggacaaccagcagctggatatagttctggagattcattaagagctattgaa
gaagttgcgaatgaagttttaccagaaggttatacaatcagctggacaggaactgcttat
caagaaaaacaaattggtggaagttctgcacaagcatttatttttggtattgtttttctg
ttcttaattctttgtgcactttatgaaagatggttattaccactttctgttgtattagca
gtaccatttgcaatttttggagcaattcttgctacaaatataagaagcttagacaataat
atctatttccaaattggacttcttgttcttgcaggacttgcagctaaaaatgcaatttta
attgtagagtttgctattcaaaaacaaaaagaaggtataaaattggttgatgcggcactt
gaagctgctaaagtaagacttagaccaattattatgacttcattagcatttacagttgga
gttatgccacttgctattagtagtggagcgggagctgcaagtaaacactctattggaact
ggagttgtaggaggaatgttaactgctacatttatagcaattttatttattccactattc
ttcgttttaatttcaagacttagtggtcataaagatgacgaagttctaacaaataaagaa
gaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
