KEGG   Alteromonas sp. Mac2: AV940_15595
Entry
AV940_15595       CDS       T05899                                 
Name
(GenBank) pectin methylesterase
  KO
K01728  pectate lyase [EC:4.2.2.2]
Organism
alz  Alteromonas sp. Mac2
Pathway
alz00040  Pentose and glucuronate interconversions
alz01100  Metabolic pathways
alz02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:alz00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00040 Pentose and glucuronate interconversions
    AV940_15595
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    AV940_15595
Enzymes [BR:alz01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.2  pectate lyase
     AV940_15595
SSDB
Motif
Pfam: Pectate_lyase_4 Pectinesterase Laminin_G_3 3keto-disac_hyd Glyco_hydro_59_C Laminin_G_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AMJ91782
LinkDB
Position
complement(3679871..3686005)
AA seq 2044 aa
MKLTKIAALVGGVILISACGEKSNTNVTLPPDPALTGVFVDSPVSGLGYTSASVPDGVTN
ASGEFSYFRGEQLSFHIGDLIFPDAPASSVISPLDLFATDNPFNQSVVNTIRLLQSLDID
GDASNGISVSDSAANVAVATLDDGQSLGDFFNQSDADFAADVEIWLGSAGGASSTLVDKA
TAVTHFVNYLETDLGTLFPNTFDVTKFTGEIYAPNIKGRTVSQATYTFTPSDETNLAGGF
VRVHGETNVTGSYTFSFGRKVITLNYDDQTEHLISRAYNTVNDVYSLCVVSGEEATTNAL
ALQVESCLAKDDPAAYLFAFTQAQSDAQLMKLEEAANAIQAALEENFDTDTDTFFSSSYK
RLSDEPDAGALYYVTGGSPLVDATTGQLTLEGDRFSIGNAAQNPGANTSSSNTVGSGIYN
LSEGFTISFDVISHNSGGSFSLYVDNNTTGQDNSVHGAASKFVSEGLADGAIVAGERFTY
TYEPGDDIGGGDPTAPDAKILDSSITNSFFQLRTDSSATITIDNLKIETIADAVEPPPPS
EPDPTEPEEPVIIPSVSLPLSLSFAEESEDIFSTNFAAIENGEGEQVPMLSITGGSVTQV
ATGIELDGGRFTLGNTEPDVISSSDDTSSTGALDLSRPYTVVFDVISAEDTEGDNHFQIY
VDNNTSGSANSHLGGDSRFFNEPVVDLVAGTTMTVEGQVATPNSYLQFRTESGSVVVIDN
IHIEYIEANVLLDETFETDIDTFFSAEYKATDATTPFYSVTGGGSGITITDGELSMDSAR
FTLGNTTPEIDTTAEDTTTTGVLDLSREYTISMDVIAIEDAEANNNFQIYVDNNTSSSGK
SIHGSDSKFYSELITSLIPGQKLTIEGLVATPTSFLQMRTESGGKVVIDNVVIAYVGDAP
NNSQFNCDSEPELYFCDDFAEGSLDNFTLIADDAGTNGPQGVFDILDDDGNNVLRYTAGG
EGGEILLVKETALSGLPESGNYYVEARIRPRQNSTTRNKQLFLMGRYVSAGNWYAGGLNI
QNSSSSTQVEVAISTDGSIARPVQKKSPILLGEKEETDGTWYRVRFDMDGENLTVYLDGE
NMGSTVDSTYNAAGLIGIFTNNRSFELDDLKVGNPLVKPVQLTLDYKEPNWETTTSSDPL
FIYVTAVQDDGITEDTFTVTTSDANVLTIAQDGPQVTLTPTAEGNAIVTITSGSDPTLVK
HIAVTVEEGFIMPTAAYGDLSADTIPSSGNQNAYVDTLLTLTFDDTPTLGSSGEIRIYNA
SDDTLVDVVNVAGDTDYIGFKGQERQRKVNYRPVYVKGNSLVVKPHTNALDYGHSYYVSI
GDNVLTSGTLNGETFVGLGKDADWAFSTREAAPSGNSIVVDDDAEADFRTVQGALNHIMQ
NVPVETPSNVTIRDGEYQEMLFLRGNNKVTLQGESRDNTLVYYDNFESFNSGSGKSEAPS
TGTPSGGRSVFLIEGVDDLTFNNFTLKNSHIRSNAYSNQAETLYFNSDAGRLTAVRMNFV
SEQDTLLLKGFSWFYQSLVAGNVDFIWGYVDTALFEESEIRTIGDSKNGDPEEDTAGGYI
LQARVPEITNKGFIFLNNQFTHGPGPIGNGVLDNSTYIARSGGSADYFDNITLINNRFDT
HIATRGWAGEGVRNQPATNPSPATSTAGWREYGSMDINGNPLDLSAREFVYILSESEVAA
LTNRSDIFSHFNNGEGWEPQAPNVPEIAPAPTFTASGFAQYSFDLTGGAGGTVVTVDNGL
DLKTALDNASAANTPITIYVDGTITDANSGGTGSAIEIRDMNDVSIIGVANRGEFDGIGI
LIKRANNVIIRNLRIHHVLTEGKDAISIEGDNDGSSTSNIWIDHNELYSTLAVDKDFYDG
LVDSKRGAKNITISYNYLHDHWKASLHGHTESDTSSASTERLITFHHNRFENIESRLPLF
RYGHGHLYNNYYNQISSTAINSRIGAELQIENNVFENTKNPIVSFYSDVIGYWNTSGNVF
GEGVTWSEPEEGDVVAGPDATPTSSFEVPYDYVLENADVVKQRVINHSGVGKIIQDMSAI
PGKH
NT seq 6135 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaactcacaaaaatagcagcccttgtgggcggtgttattctcattagcgcctgcggc
gaaaaaagcaacactaatgtcacccttcccccagatcccgcattaacaggggtgtttgta
gacagtccggtgtcggggttgggttatacatctgcatcggtccccgatggcgtaaccaat
gccagtggagagttttcttattttagaggtgagcaactaagctttcatataggtgacctc
atatttcctgatgcgccagcatctagtgttatatcacctctcgatttattcgctaccgac
aacccatttaatcaatcggtagtgaataccattcgtttgcttcaatcgttagatattgat
ggcgatgctagcaacggtatatcggttagcgatagcgcggctaatgtggcagtggccacc
cttgatgacgggcagtcacttggtgatttctttaatcaatcagatgctgattttgccgcc
gacgtagaaatttggctaggctcggctggcggggcgagtagtacccttgttgataaagca
actgccgtaactcacttcgtcaattatcttgaaactgatcttggtacattgtttccaaat
acctttgatgtgacaaaatttactggggaaatatacgccccaaacattaaagggcgtacg
gtttctcaagccacttatacctttacaccaagcgatgaaacaaatttagcaggtggtttt
gtacgggttcacggcgaaactaacgttactggcagttacacgttttcatttggcagaaaa
gtcattacgttaaattatgacgatcagactgagcaccttatttctcgggcttacaatacg
gtaaacgatgtatacagcctttgtgtggtatcgggcgaagaagccacgactaacgcgtta
gcactacaagttgaaagttgtctggctaaagacgatcccgcagcgtatttgttcgctttt
actcaagcacagtctgacgcacaattgatgaagttagaggaggccgcgaacgctattcaa
gccgcactagaagagaattttgataccgatacagatacatttttttcatcttcatataaa
cgtctaagtgacgagcctgatgctggtgcgctttattacgttaccggtggtagcccatta
gttgatgctactacaggacagcttaccttggaaggcgatcggtttagcattggaaacgcc
gctcaaaaccctggtgcaaacacatcttcatctaataccgtaggctcgggtatttacaac
ctgagtgaaggttttaccattagcttcgatgttatttctcataatagtggtgggtcattc
tcgctttatgtcgacaacaacacgacaggacaagataactctgtacatggtgctgcctct
aaatttgtgagtgaaggtttagcggatggcgctatagtggcgggtgaacgtttcacttat
acctacgagcctggcgacgatattggcggtggtgatcccacggctccagatgccaaaata
ctcgacagcagtatcactaatagcttcttccaattacgcacagactcaagtgcaacgatt
accattgataatttaaaaattgagacgatagcagatgcggttgaaccgcctccgccgtca
gaaccggatcctaccgagcctgaagaacccgttattattccaagtgtatcgctacccctg
tcgctcagctttgccgaagagagtgaagatatattttcaactaattttgctgcaatagaa
aatggggagggtgaacaagttcctatgcttagtattaccggcggctctgtaactcaggtt
gcaaccggtattgaactggatggtggtcgtttcacgttaggaaacactgagccggatgta
ataagctcgtctgacgatacatcttctaccggcgcactcgatttaagtcggccatacacg
gtggtattcgatgttatctcagcggaagataccgaaggcgataatcacttccaaatttac
gtagataataatacgtcaggtagcgctaattcacacttagggggagattcacgtttcttt
aatgagccggtggttgatttagtagcagggactaccatgaccgtagaggggcaggtagcg
acaccaaattcatacctacaatttagaaccgaaagtggctcagttgtcgtaatcgacaat
attcatattgagtatatcgaagcgaatgtattgttagatgaaacgtttgaaaccgatatc
gatactttctttagtgcagagtataaagcgaccgatgctactacgcctttttatagtgtt
accggtggtggttcaggtattaccatcactgacggcgaattatctatggacagcgctcga
ttcacgttgggcaataccactcctgaaatcgataccacagctgaagataccaccacgact
ggcgtgcttgatttaagccgtgaatacacgattagcatggatgtgattgctatagaagat
gccgaagctaataacaacttccaaatctatgtcgataacaataccagtagtagtggtaag
tcgatacatggcagtgattctaagttctacagcgaactcattacctccctcataccaggc
caaaagttgacgatagaaggattggttgcaacgcccacgtcgtttcttcaaatgcgaact
gaaagtggcggtaaagtagtgattgataacgtggtcatcgcctacgttggtgatgcgcct
aacaatagtcagttcaattgtgatagcgagcctgaactttatttttgtgacgattttgca
gaaggttcattggataactttaccctgattgcagacgatgcaggcactaacggacctcaa
ggcgtattcgatattcttgatgatgatggcaacaacgttcttcgttataccgctggtggc
gaaggcggggaaattttgttagttaaagaaacggcactaagtgggttgcctgaaagcggc
aattattatgtcgaagcccgtattcgtccgcgtcaaaatagtactactcgtaacaaacaa
cttttcttaatggggcgttatgttagtgctggcaactggtacgctggtggacttaatata
caaaattcatcgagtagcacgcaagttgaagtggcgattagtactgatgggagcattgcc
cgtcctgtacagaaaaaatcacctatcttgctaggtgaaaaagaggaaactgatggcacg
tggtatcgagtacgttttgacatggatggtgaaaacctaacggtttaccttgatggtgaa
aacatggggagtactgtggattcaacctataacgcagcgggtttaataggaatttttacc
aacaacagatcttttgaattagatgacctcaaggttggaaacccgttggtaaagccggtt
cagcttacgcttgattataaagagcctaattgggaaaccaccaccagtagcgatccgttg
tttatctatgtcaccgcagtgcaagatgatggtattaccgaagatacatttaccgtaaca
accagtgatgccaatgtattaacgattgctcaagatggcccgcaggtgacacttacgcct
acggctgaaggaaatgcgatagtcacaatcacatcgggttctgaccccacgttagtaaag
cacattgctgttactgtcgaggaaggatttattatgccgacggccgcttatggtgatttg
tctgcggatacgatccccagttctggcaatcaaaatgcttatgtcgatacgctactcacc
ttaacgtttgacgatacgcccacgttagggagtagcggtgaaattcgcatttacaacgct
tctgacgatacgcttgtcgatgtggtgaatgtagctggtgataccgactacattggtttc
aaaggccaggaaagacaacgcaaagttaattatcgtccagtttacgttaaggggaattca
cttgtagttaagccgcatacaaatgcactcgattacggtcattcttactatgtatctatt
ggggataacgtcttaaccagcggtactctgaatggagaaacgtttgtaggccttgggaaa
gatgcggattgggcctttagtactcgagaggccgctccttcaggcaattcgattgtcgtt
gatgacgacgctgaggccgattttcgcacggtgcagggcgcgcttaatcacattatgcaa
aatgtccctgttgaaacaccgtcgaacgtcacgattagagacggtgaatatcaagaaatg
ctgttcttacggggtaacaataaggttactttgcaaggagagagccgtgacaataccctt
gtttattacgacaactttgaaagctttaacagcgggagtggcaaaagcgaagcgccctca
acagggactccttcaggcggcagaagtgtgtttcttatagagggcgtagatgacttaacc
tttaataactttactctgaaaaattcacatattcgaagtaatgcctattcaaaccaagca
gaaacactttattttaatagcgatgccggaagattaaccgcggtgcgtatgaactttgtc
agtgaacaagatacgctcttgcttaaaggctttagttggttctaccaatcgttagtggca
ggcaatgtagatttcatctggggctatgttgatactgcgttgtttgaagagagtgaaatt
cgaacaattggtgattctaaaaatggagatccagaggaagacaccgcaggtgggtacatt
ctgcaggcgagagttcctgagattaccaataaaggttttattttcctgaacaatcaattt
acccatggaccaggtcctatcggtaacggtgtacttgataactcaacctatattgcacgc
agtggtggaagtgcggattacttcgataatatcacccttattaataatcgatttgatact
cacatagcgactaggggctgggcgggtgaaggcgttcgaaaccaacccgctaccaatcct
agtccagcaacatcgacggcaggctggcgcgagtatggcagtatggacatcaacggtaac
ccactagatctttcagctagagagttcgtgtacattttatctgagagtgaggttgctgcg
cttaccaatcgaagtgatattttttctcattttaacaatggtgaaggctgggaaccgcaa
gcacccaatgtaccagagattgcgccggcacctacctttacggcaagcggcttcgcacag
tatagtttcgatttaactggtggagcgggtggaacggtcgttactgtggataacggtttg
gatttaaagactgcactggataatgcaagtgcagcgaatacaccgataacgatttatgtt
gatggcactattactgatgccaactcaggaggcacggggtctgccattgaaatacgtgat
atgaatgatgtgtcgattattggtgtggccaacagaggtgaatttgatggaattggtatt
ttaattaaacgtgccaataatgtgataattcgcaacttacgtatccaccatgtacttaca
gaaggtaaagatgctatctctattgaaggtgataacgacggttcaagcacaagcaatatt
tggatcgaccataacgagttatatagcaccttagcggtagataaagatttttacgatggg
ttagttgatagtaaacggggcgcaaaaaatattactatttcatacaattatctgcatgat
cactggaaggcatcgttgcacggtcataccgaaagcgatactagcagtgcaagcactgag
cgcttaattaccttccatcacaatcgctttgagaatattgaatctcgattgccattattt
cgctatggccacgggcatttgtataataactactataaccaaatatcctctaccgccatc
aattcgagaattggtgctgagttacaaattgagaacaacgtgttcgagaataccaaaaac
ccaatagtatctttttactccgatgttattgggtattggaacacatcgggtaacgtattc
ggtgagggagtcacgtggtctgagcctgaagaaggggatgttgtcgctgggccagatgca
actcctacatcaagttttgaagtaccttacgattatgtgcttgaaaacgcagatgtcgtg
aagcagcgtgttattaatcactctggcgtaggtaagattatccaagatatgtctgctatt
ccaggtaaacactaa

DBGET integrated database retrieval system