Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_1161
Help
Entry
RATSFB_1161 CDS
T01624
Name
(GenBank) putative helicase
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWI2_SNF2
ERCC3_RAD25_C
DUF4479
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81723
UniProt:
G2IEZ9
LinkDB
All DBs
Position
1335161..1338376
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MKKIDIGKITEFSNFNNGNDGITLYKKNKLNMQYYEFTKDGVHVGFDVPSMRNITYTTRI
YIVNNTVLNEFYCSCTYRNTKNDVCKHIVASYIFFLNELKDNIKPTLIYDFSQLDKLTTL
NEKDILNNADTDYFKVDYFLYLNDIDNILLEIKLISNKTYSISNISEFLNSILSSSPYPI
NKNTSLNISINSFNEKDRAFLSKLLTIYSLIKINAIIVDNIFFNQYIKLNYYLFENLVDS
LDENNLHIKFKHTLFDCCKIIKDDLDISPIISTDNNNNITLSLKTLNIIELFSGKHYFYH
DGSIFNTSSSFIKTYNCIKKLVLDNNTSYFTINDDNKNVFLNQIIPKLSLNFNLKISESL
SNIISIEECKCKFYIDKVSNDIVIIKVVFRYGNLDINPLDINSLNISILRDYGVENKVLT
SLNKLTEYKNSIYYVIKSPDKIIDFKENGISILKNLGEVYYTKKFKQYKLIHSSSYKTSF
SIGLNNLLNISFSFDGITNEELYSAIKNIRKGSKYLKLKDKGILNLDNDYLKEINSILKD
LNIDEKELKNDSLNIDKYYAFYINDAYSNNFKSIGELNKSENFLKITDDLSNISNIDLSP
PKNLNASLRNYQLEGFKWIKTLKEYNLSGILADEMGLGKTLQTIAFLQKEYENNSLGNAI
IICPKSLIYNWFDEIKKFAPELKVLIFNGNKNIRSKLLDEFQNYDIILTSYGIIQKDIDV
LKLKNFNICIIDEAQNIKNKSSKNTISLKELNVNYKFALTGTPIENSIEELWSIFNFLMP
GYLYSYSKFRSIYGDQENYSSSNLNKKISPFILRRLKKNVLTELPPKIETKIMIDLNNEQ
KKLYYSYINKFKEEFGFENENLNDKNIKFKMLSALTRLRQICCDPKVIFEDYSHGSSKID
TLMDIIDEYIKNNKKIIIFSNFTTVLKIIRDKFIKNNIKYTYLDGSVPSKDRIDIVNDFN
QNDYNIFLISLKAGGFGLNITSAEIVIHFDPWWNNAVEDQATDRAHRIGQKNTIHVIKLI
TKGTIEEKIFEIQERKNILINSIIKDSELEYSSISKMSVEDLKNLFTIDTL
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagatcgatataggaaaaataactgagttttccaattttaataatggaaatgac
ggtattactctttataaaaaaaataaattgaatatgcaatattacgaatttactaaagat
ggtgtacatgttggttttgatgtcccatctatgcgaaacataacatatacaaccagaata
tatatagtcaataatactgtactaaatgaattttattgttcctgtacatatagaaataca
aaaaatgatgtttgtaaacacattgtagctagttatatatttttcctaaatgaattaaag
gataatattaaacctactttgatatatgatttttcacaattagataaactaactacttta
aatgaaaaagatatcttaaataatgcagatacagattactttaaagtagattatttttta
tatctaaatgatatagataatattttacttgaaattaagcttatatcaaataaaacatat
tctatatcgaatatatccgaatttttaaattctatattatcatcatcaccatacccaata
aacaaaaatacatcactaaacatatcaattaatagtttcaatgaaaaagatagagctttt
ctatctaaattattaactatatactctcttataaaaattaatgctataattgtggacaat
atatttttcaatcaatatataaaattaaactattatttatttgaaaatttagttgattct
ttggatgaaaataatttacatataaaatttaaacatacattattcgactgttgcaagata
atcaaagatgatttagatatatctcccattatttcaacagataataataacaatatcacg
ttatctttaaaaacattaaatattattgaattatttagtggaaaacattatttctatcat
gatggatcaatatttaacacttcttcatcgtttataaaaacctataattgcataaagaag
ttagtgcttgataacaacacatcttattttacaataaatgatgacaataaaaatgttttc
cttaatcaaatcatacctaagctatctttaaattttaatttaaaaatttccgaaagttta
agcaacataataagtattgaagaatgtaaatgtaaattctacatagataaagtttcaaac
gatatagtcataataaaagttgtgtttagatatggaaatttagatataaatccactagat
ataaattctttaaatatatctatcttaagagattatggtgttgaaaataaagtattaact
tcactaaacaaattaactgaatacaaaaactcaatttattacgtaataaaatctcccgat
aaaataattgattttaaagaaaatggaatctcaatacttaaaaatttaggggaagtttat
tacacgaaaaaattcaaacaatacaaactaattcattcatcttcttataaaacttcattt
agtataggattaaataatttattaaatatatcattttcatttgatggaataacaaatgaa
gaattatattcagctattaaaaacataagaaaaggttcgaaatatcttaaactaaaagat
aaaggtattttaaatttggataatgattatttaaaagaaataaattcaattcttaaagat
ttgaatatcgatgagaaggaactcaaaaatgattcacttaatattgataaatattatgca
ttctatataaacgatgcatattctaataattttaaatcaataggtgaattgaataaaagt
gaaaattttttaaaaataacagacgatctttctaacatttctaacattgatttatctccc
ccaaaaaatttaaacgcttctcttagaaattatcagttagaaggatttaaatggataaag
acattaaaagaatataatttatcaggaattttagcagatgaaatgggacttggtaaaact
cttcaaactatcgcatttcttcaaaaagaatatgaaaataattcacttggtaatgcaata
ataatttgtccaaaatcacttatatataactggtttgatgaaatcaaaaaatttgcacca
gaacttaaagttcttatatttaatggaaataaaaatattcgatcaaagcttttagatgag
tttcaaaattacgatataatattaacttcttacggtataattcaaaaagatatagatgta
ctaaaattaaagaattttaacatttgcataattgatgaagcccaaaatataaagaataaa
tcctctaaaaatacaatttctttaaaagaacttaatgtaaattataaatttgcattaaca
ggtactcctatagaaaattcaattgaagaattgtggtcaatatttaactttttgatgcct
ggatatttatattcttattcaaaatttagatcaatctatggagatcaagaaaactatagt
tcatctaatttaaacaaaaaaatatcccctttcatattaagaagacttaaaaagaatgta
ttaactgaactccctcctaagattgaaactaaaataatgattgatttaaataatgagcag
aaaaaattatattactcatatataaacaaattcaaagaagaatttggatttgagaatgag
aatttaaatgataagaatatcaaatttaaaatgctaagtgcattaactcgtttaaggcaa
atttgttgtgatcctaaagtaatatttgaggattactctcatggaagctctaaaatagac
acattaatggacataatagacgaatatatcaaaaacaataaaaaaattataatattttca
aattttacaactgtacttaaaattattagagataaatttatcaaaaataatataaagtat
acgtacttggatggaagtgttccatctaaagatagaattgatattgtaaatgattttaat
caaaatgattataatatatttctaatttcccttaaagctggaggattcggtttaaatata
acatctgctgaaattgtaattcatttcgatccttggtggaataatgctgttgaagatcaa
gctacagatagagctcatagaattggtcaaaagaacacaattcatgttataaaattaata
actaagggaactattgaagagaaaatatttgaaatacaggagaggaaaaatatacttatc
aactctataataaaagacagtgaacttgaatacagttcaatctccaaaatgtcagttgaa
gatcttaaaaatttatttacgatcgatacattataa
DBGET
integrated database retrieval system
