Bacteroides caccae: CGC64_08085
Help
Entry
CGC64_08085 CDS
T05064
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
bcac
Bacteroides caccae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
STN
CooC_C
FecR_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM65924
UniProt:
A0A414FB49
LinkDB
All DBs
Position
2079266..2082655
Genome browser
AA seq
1129 aa
AA seq
DB search
MQNYFSIQFLWVIKSLWLTSKKIPLSMRLLVLFLVCSIGLSYAADSYAQKAMISIDVHNQ
RVEDILKEIEAQSDFDFFFNNKHVDLNRRVSVSADKSNIFSVLKEIFAGTNVKYSVLDKK
IILSVEAQSPQQEKKVTVSGTVLDTHGEPVIGASVLEKGVQGNGTITDIDGIFKLSVSSS
KAQLDISYIGYQSQTVAVQVGKNLKIILQEDSKQLEEVVVVGYGTQSKKTLTGAVSMVNM
GDVEMNTVPNVSRALAGKAAGFRVNQISAQPGGEAKFRIRGEASTGAGNDPLFVIDGFPV
SSSGNLSSGNGYYESGNIDNVLESLNPDDIESISVLKDAASTAIYGARAGHGVVLITTKR
GKSQKPRVTYSGMGSVQVARSNYKMLDTRMYMDMYNKQQHEEWLKLNGMGIYKGYVEKPD
TPPTQYKPAFNNDEILLASGTDWLDAVMRNGYTQQHNLSVNGGTEKTRYLASVNYMDQEG
IVKNNGVSRFSARLNLDQELSKYVSFGLTATYSQNKYDNVPLGDKVNEYSGVLTGAIQSN
PTIPIYDSEGNYFIDPKRPFVANPVSLLEIKDNTVKDRLIGSAFVSVKPLKELEVKLQLG
ADRSFQKRSSYLPKTTLQGANKNGRADISQETSTTYLMELTAQYSKSFGDHNLKAIGGYS
FQKFKNDGFSAGNSDFLVDGFGYNSLGSGNYKKPSVSSWASINSIASLFARANYSYKGKY
LLEATVRADAASNFAPENRWGYFPSVSAGWMISEENFMKGASKWLSMLKLRASYGQTGNS
NVGYRIYDYYEVGRNAIIGGAESTGVYASDLGNKSITWETTTEFNLGVDFGIFNNRFKLA
AEYFKRKITDLLVTNKPLPFYNEVNKIAGNIGSTQSQGVEITLNTVNIVTKDFEWDTTLT
LSHYNDRWLKRDPNWKPRAYEKEDDPIRAWWEYEAIGILQPGEKAPDAQKDLVPGMMKLK
DRDGNGVLGDEDKVYMGNGDPKIIYGLNNSFRYKNFDLNIYFYGEAGRKRGASYYEGWTR
MDNGINVSTYALKAFSSNNLTATDPTYVRGGNGWGDYYVKSIYYVRCGSITLGYKVPISQ
KIVNNLRVYVDVNNPFVITNWTGLDPETDNGTYAYPNVTSYNFGVSISF
NT seq
3390 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaattattttagcatccaatttttatgggtgataaagtcgctttggctaacctca
aaaaaaatcccattatctatgagactattagttttgttcttagtatgttctatcggacta
agttatgcagccgatagttacgctcagaaagctatgatcagtatcgatgttcataaccag
cgtgtggaggatattttgaaagagattgaagcgcagtcggattttgacttcttcttcaat
aacaaacatgtagatttgaatcgtcgtgtttctgtgtctgctgataaaagtaatattttc
agtgtgttgaaggaaatctttgccggtacgaatgtgaagtattcggtgttggataagaaa
ataatattgtctgttgaagcgcaatcaccacagcaggaaaagaaagtaacagtatcgggt
acggtactggacactcatggtgaaccggtaatcggagctagtgtattggagaaaggcgta
cagggaaatggaacgattacagacattgacggtatcttcaaactttccgtatcttcatcg
aaagcacaattggatatttcctatatcggctatcagtcacagactgttgcggtgcaagtc
ggtaaaaatctaaaaatcattttacaggaagattccaaacaattggaagaagtagtagtg
gtaggttatggtacacagagtaaaaagacattgacaggtgctgtttctatggtaaatatg
ggtgatgtagaaatgaatactgttccgaatgtatctcgtgcattggcaggtaaggctgcc
ggatttcgtgtaaatcagatctctgcgcaacctggcggtgaggctaaattccgtattcgt
ggtgaggcttctacaggagcaggtaacgaccctttgtttgttattgatggttttccggta
tcgtcttccggtaatttaagttcggggaacggctattatgaatccggtaatattgataat
gtgctggagtctttgaatccggatgatattgaatcaatttcagttttgaaagatgccgct
tctacggctatttatggagcacgtgccggtcatggagttgttctgattacaacaaaacgc
ggtaagagtcagaagcccagagtgacttattccggtatgggatctgtgcaggtagcccgt
tcgaattataagatgcttgatactcgtatgtatatggatatgtataataagcagcagcac
gaggagtggctgaagttgaatggaatggggatttataaaggatatgtggagaaaccggat
actccgcccactcaatataaaccagctttcaataatgatgagatattgttggcaagtggt
actgattggcttgatgcggtaatgcgtaacggatatacgcaacaacacaatctttctgtt
aatggtggtacggagaaaacccgttatttggcttccgtcaactatatggatcaagaaggt
attgtcaagaataatggtgtcagccgtttttctgcccgtttaaatctggatcaagaatta
agtaaatatgtatctttcggattaaccgctacttactcacagaataagtatgataacgtt
cctttaggagataaggttaatgaatattcaggtgtgttgaccggtgctattcagtccaat
cctactattcctatttatgattctgaagggaattattttattgacccgaaacgtcctttt
gttgcgaatccggtttctttgttggaaataaaagataatacggtaaaagatcggttgatc
ggttcagcatttgtttcagtaaaaccattgaaagaattagaagtgaaattacagttggga
gctgaccgcagtttccagaaacgttccagttatttgcctaagacaactttgcaaggggca
aataagaatggaagggcagatatttcacaagagacaagcactacttatctaatggaattg
accgctcaatattctaaaagttttggtgatcataatctgaaagctattggtggttattca
ttccaaaagttcaagaatgacggattcagtgccggaaattcagattttctggtggatgga
tttgggtataacagtttggggtcgggtaattataaaaagccttctgtcagttcatgggct
tctataaatagtattgcttctttgtttgcccgtgctaattattcttacaaaggaaaatat
ttgttggaagccacggtacgtgctgatgctgcatctaattttgcaccggaaaatcgttgg
ggatatttcccttctgtatcagcaggttggatgattagtgaagaaaatttcatgaaaggg
gcttctaaatggttatccatgttgaaattgagagcttcttatggacagaccggtaattct
aatgtcggttatcgtatttatgattattatgaggtaggaagaaatgccattattggaggc
gcggagtcaacaggagtatatgcttcggatttgggaaacaagagtatcacttgggaaaca
actacggaatttaatcttggagtagactttggaatatttaataaccggtttaagttggct
gccgagtactttaagcgtaaaataacagatttgttagtgacaaacaagcccttgccattt
tataatgaggtaaataaaattgcaggaaatataggatcaacgcaaagccagggtgtggaa
atcacattgaatacagtgaatattgttacaaaagactttgaatgggataccacattgact
ttatcgcattataatgaccgttggttgaaacgtgatccgaactggaagccaagagcctat
gaaaaagaagatgacccgatacgggcatggtgggaatatgaagcaatcggtatcctgcaa
ccgggagagaaggcaccggatgcccagaaagatttggttccgggaatgatgaagttgaaa
gatcgggatggaaatggtgtgttaggagatgaagataaggtctatatggggaatggtgat
ccgaaaataatctacggtttgaacaattcattccgctataagaattttgatttgaatatc
tatttttacggagaagcgggtagaaagcggggagccagctattatgaaggttggacacgc
atggataatggtatcaacgtttccacttacgcattgaaagcgttcagtagtaataacttg
acagctactgatcctacctacgtgagagggggaaacggttggggagactattacgtaaaa
tctatctattacgttcgttgcggaagtataacattgggatataaagtaccgatcagccaa
aagatcgtgaataatcttcgtgtatatgtagatgtgaacaatccgtttgtgattaccaat
tggacagggctggatcctgaaacggataacggaacttatgcatatccgaatgtgacctct
tataattttggtgtatcaatatctttctaa
DBGET
integrated database retrieval system