Brassica napus (rape): 106400570
Help
Entry
106400570 CDS
T04128
Name
(RefSeq) extensin-2-like isoform X1
Organism
bna
Brassica napus (rape)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106400570
NCBI-ProteinID:
XP_048596901
LinkDB
All DBs
Position
A9:complement(30894999..30913593)
Genome browser
AA seq
962 aa
AA seq
DB search
MTSSPGMGRSAHLVYALGFVIMATMVAASYEPYTYSSPPPPMYNSPAPKVDYKSPPPPYV
YSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPHYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYY
SPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYSSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPP
YVYNSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYTSPPPPYYSPSPKPEYKSPPPPYVYNSPPPP
YYSPSPMIDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPIYKSPPPPYAYSSPPPPYYSPSPKPIY
KSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPSYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYS
SPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYIYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPS
PKHVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPAYKSPPPQYVYSSPPPPYYSPSPKPAYKSPPP
PYVYSSPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYNSPPPP
YYSPSPKVVYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSHSPKIEYKSPPTPYVYHSPPPPPYYSPSPKH
AYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKHAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSFKPTYKSPPPPYV
YSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPSPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPP
YYSPSPKVEYKSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYV
YSSPPPPSYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPP
YYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPLYVYSSPPPPPYYSPSPKV
EYKSSPPPYVYSSPPPPAYYSPSPKVDYKSPPPPYVYTSPPPPAYSPSPKAEYKSPPPPS
YY
NT seq
2889 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatcttctcccgggatggggcgttcagcccatctcgtttatgctcttggttttgta
atcatggcaacaatggttgctgcttcttatgagccctacacttatagctctccaccacca
ccaatgtacaattctcctgcaccgaaagttgactacaagtctccaccacctccttacgta
tacagttctcctcctcctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggactataaatcc
ccaccacctccttacgtctacagttcaccaccaccgccacactattcaccttctccaaag
gtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcaccaccaccaccatattac
tcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttacgtctacagctcccca
ccaccaccaccatacatatatagttctccacccccaccaccatactactcaccttctcct
aaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtctatagctctccaccaccgccccct
tacgtttacaactcaccaccaccacccccatactactcaccctctcctaaagttgattac
aaatctcctccaccaccttacgtctacacttctccaccaccaccatactattcaccttct
ccaaaacccgaatacaaatctccaccacctccatatgtttacaactctccaccaccacca
tactactcaccttctccaatgattgattacaaatctccaccacctccttacgtctacagc
tctccacccccaccatattactcaccttcacctaaaccaatatacaaatctccaccccca
ccgtatgcttacagctcaccaccaccaccatactactcgccttcacccaaacccatatac
aaatctccacccccaccatatgtctacagctccccaccaccaccttattactctccgtca
cccaaaccgtcatacaagtctccaccacctccatacgtatacaactctccaccaccacca
tactactctccttctcctaaacccgcatacaaatcgccaccaccaccatatgtctacagc
tcaccaccaccaccatactactcgccttcacctaaaccagcatacaaatctccaccacca
ccatatatctacagctctcccccaccaccatactactcgccttcacccaagcccgtatac
aaatccccaccaccgccatacgtctacagctccccacccccaccttactattctccatca
cctaaacatgtatacaaatctccaccacctccgtatgtctacagctctccgccaccacca
tactactctccttctcctaagcccgcgtacaaatctcctccaccacaatatgtctacagt
tctcctccaccaccatactattctccttcccctaagcccgcatacaaatcaccaccaccg
ccatatgtgtacagttctcccccgccaccatattactcgccttctcccaaacccgcttac
aaatctccaccaccaccatatgtatacagctccccacctccaccttattactctccttca
ccaaaacctgtatacaaatcaccaccaccaccatatgtttacaactctccaccaccacca
tactattcaccatcacctaaggtggtatacaaatctccaccacacccacatgtttgtgtc
tgtccacctcctcctccatgttactctcattctccaaagattgagtacaaatctcctcca
acaccatatgtttaccattccccacctcccccaccttattactcgccttcacctaaacat
gcatacaaatccccaccaccgccgtacgtctacagttctccaccaccaccatactactct
cctactcctaagcatgcatacaaatctcctccaccaccatacgtttacagctccccacca
ccaccatactactctccttcctttaagcccacatacaaatctcctccaccaccgtatgtc
tatagctctccacccccaccaccgtattactccccttctccaaaggttgagtacaaatct
cctccaccaccatatgtttacagctctccacctccatcaccgtattactctccttctcca
aaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtctacagctctcctcccccaccaccg
tattattctccttccccaaaggttgaatacaaatctcccccaccaccatattattctcct
tctccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtttacagctctccacctcca
ccaccgtattactctccttctccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtc
tacagctctcctcccccaccatcgtattattctccttccccaaaggttgaatacaaatct
cccccaccaccatatgtctacagctctccacccccaccaccatattattctccttctcca
aaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtttacagctctccacctccaccacct
tattactctccctctccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtctacagc
tccccacctccaccaccgtattactctccttctccgaaggttgagtacaaatctcctcca
ccactatatgtctacagctctccacctccaccaccatattactctccttctccaaaggtt
gagtacaaatcttccccaccaccttatgtttacagttcaccacctccaccagcgtattac
tctccatcaccaaaggttgactacaaatcgccacccccaccgtatgtctacacatctcca
ccaccaccagcatactctccatctccaaaggccgaatacaaatctcctcctccaccttcg
tattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
