Caloramator sp. E03: FDN13_12095
Help
Entry
FDN13_12095 CDS
T05994
Name
(GenBank) M6 family metalloprotease domain-containing protein
Organism
cale
Caloramator sp. E03
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Big_5
LRR_8
Peptidase_M6
LRR_9
Big_7
EF-hand_5
EF-hand_1
EF-hand_6
EF-hand_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCX34381
UniProt:
A0A5B7TLH6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2533864..2539194)
Genome browser
AA seq
1776 aa
AA seq
DB search
MLQNKKRYILLILFLFFNVFLFYKNASAAPARSEKFLLTQPDGTSFYARIKGDEWLNWIE
GEKGDVIIKGTDNYWYYAQLNLNKLTKTDRRYKIDPKPQNSVTGKTVSKNSKKLLNAKYS
SSILRAIQRTTDINPVTNWNQKILVVLVEFSDVKIKNSDSVWNNQFFGTTGKTVRTYYRE
VSENKFNFIPADETYNNYNDGIIKVQLPYNHPNTGPETDYRNQQLVIDALTKASNDKYID
FSKFDTNNNGYIDNSELHIVTIIAGYECSYSGIYSSDKPSVWGHRWSISGLKLNGKYVCS
PYYGGYTQQGEIHGSYYYNDDHIATIGILCHELGHDLGLPDLYDYDYSSEGVGIHSIMAV
GSWASLPSEYLGASPVHFDAWSKIMLGFANPTVVSQNSNYTINSFASPSGYNVLKIPTQN
SNEYFLLENRQFNGFDQSLSSYLISGGIEILHIDENVYYANYGYGINDDESHKAVDVEEA
NEGELEYSQLDNRIYWDDYDHYYYVGGFTSFNSISTPSSKLYDGSDSEINIEVLSTSSNS
MDVQISFGPTLSKTVTFKDKELERAIREALNKPEGEITDQDMLNLYSLSMYGYNITDITG
LEYAKNLTYLDLTNNSIKDIKPLSGLRKLTNLYLDYNLISDISPLSNLTELSALDLAHNS
ITNIYPLINLNKLIYLNLSGNRITNFEALLYLSNLELLDLSYTGFTNISSIINLTGLKHL
YLNGNKLTNFNLISNFYDLYTLELYNTGITSISPLRNMNNLLSLNIGGNRISDLSLLSNF
KNLYSLDLSNAGLTNISFLQNLTQLEKLKLSYNSITDISPLSNLINLYVLKLNNNSITNI
SALSKMTDLIELNISNNKISDISVLSDLTFLSMLNISGNKITNISSLSSLENLSILIMNS
NSITDISSLENLTNIFALYADNNNIQSIDSIANMQDLYLLSLSNNPITNIEPIGSIPNLF
ELNINGIKTSDFSPIEGLHNLFTLSLSNNNISNLDFISTLSRLRYLNLSGNEISDLTPLE
GLVNLKQLKIDSNNISDITSLVILAQNGAFKGIEKTRANTTNADRTNYNEKELSNLKNTL
NYTNSREKQLDIIKSLSETQLEFGYGEGYIDVTNNLLDISPGTKALNDIYTIKSNGITIY
YQPQKGIPVYVTKTSPADNTENVATNNLVITVTFDRKIALGTGASLITLTDMDGTNIPVT
SSVSNNILTIKPLSKVKVLTKYTVTIPKNAVKDYSNSTLTLGSNYSFSFTTTDDVAPSIT
TSTPTQNASDASLTQEIRIVFDESIQLTDNFACTLLDKSNKPISIIYEISKDNPNMLIVK
PEKKLSPLSSYTFKLVKGSIRDSYGNICNSDITIKFKTADSPVPYVISSTPASASQNIDV
KAQIKIKYNKPIQVLNSNLIVLEDKNGNKIDISWSLKNSELTITPKSSLDYYSDYKFSIL
KGAVSYAEGANATDEDYSLTFKTKKPETTAPKITVLSSTLAYIDDTTYVLSFKAEDKSNI
KSALIKWQYTNPSTGQKETITATPVLNEENLVYTAALDLTGKNSSYTIEVCDQWDNAAQK
SLSVTKQTDSAKPTITITNPRVSTVSISNYLTSYNLAFNVFDAISGIEKVTLSVKVDNTD
TISKDIYNHTEGFYEKSLSFNETLENLGVRKENGTAVVTITVVDRAGNVQSKAITIKRIA
DIKAPTVTFKYPKSTSTTVSTNRVTLDFKAVDDSGIKSIILILNGTEQRVCSYDETIFEV
NSNIDVDIENGLNTIKVRVTDNMDNIFEKTFTITKK
NT seq
5331 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgcaaaataaaaaaaggtatattctactaatcttatttcttttttttaatgttttt
ttattttataaaaacgcatcagcagcaccggcaagatctgaaaagtttctacttactcag
ccagatggtacatcattttatgcaaggataaaaggtgatgaatggctaaattggatagaa
ggggaaaaaggcgatgtgattataaagggaacggataactattggtattatgctcaacta
aatcttaataaattaaccaaaacagaccgcagatataaaatagatccaaaacctcagaat
tcggtaactggaaaaacagtttcaaaaaatagtaaaaaactgctaaatgcaaaatacagt
tcttcaatcctaagagcaattcaacgtactacagatataaatccagtaacaaactggaat
caaaaaattttagttgtacttgtagaattttctgatgtaaaaataaaaaactctgacagc
gtatggaacaaccagttttttggaactacaggtaaaactgtaagaacttattatagggaa
gtgtctgaaaataagtttaactttataccggctgatgaaacatacaacaactacaatgac
ggtattataaaagttcaattaccctacaatcatccaaatactggcccagaaactgattat
aggaatcagcagcttgtaatcgatgctttaactaaagcaagcaatgacaaatatatagac
ttctcaaagtttgatacaaataacaatgggtatatagataacagtgaactccatattgta
accataattgcaggctatgaatgctcatattctggaatttattcttcagacaagccttca
gtatgggggcacagatggagtatttcaggactaaaactaaatggcaaatacgtatgttca
ccatattatggtgggtatacccagcaaggcgaaatacacggttcatactattataatgat
gaccatatagctacaataggtatactctgtcatgagcttgggcatgaccttgggctgcca
gatttatatgattacgattattcctctgaaggtgttggaatacacagtataatggcagtc
ggcagttgggcaagccttccttcagagtacctaggagcctcacctgtacattttgatgcg
tggagtaaaataatgcttggctttgcaaacccaacagttgtaagccagaattcaaactac
acaataaactcctttgcttcaccttcaggatacaacgttttaaagattccaacacaaaat
tcaaatgaatacttcctgcttgaaaacaggcagtttaatggatttgaccagtcattatcc
tcatatcttataagcggcgggatagaaatcctgcatattgatgaaaacgtatattatgca
aactatggatatggcataaatgatgatgaatcacataaagctgttgacgttgaagaggca
aatgaaggggaattagaatacagccaacttgataatagaatctattgggatgattatgat
cattattattatgttggtgggtttacatcttttaattcaatatcaacaccaagcagcaaa
ttatatgacggcagtgacagcgaaattaatattgaagttctaagtacaagctcaaactct
atggatgtacaaatatcctttggccctactttatctaaaactgtaactttcaaggataag
gaacttgaaagggcaattagggaagctcttaataaacctgaaggggaaataactgatcag
gatatgctaaatttatattccctaagcatgtatggttacaatataacagatattacaggg
cttgaatatgctaaaaatcttacttaccttgatctaacaaacaattcaattaaggatatt
aagcctttatcaggccttagaaagcttacaaatttatatttagattataatttaattagc
gatatatctcctttatcaaacttaactgaattatcagcattagaccttgctcataacagc
attactaatatatatccgttaataaatctaaacaaacttatatatctaaacctaagtgga
aacagaattacaaattttgaagcacttttatatttatcaaaccttgagttattagattta
tcctatactggctttaccaatatttcatctattataaatttgacaggcctgaaacatctt
tatcttaacggaaacaaacttacaaattttaatcttatttcaaacttttatgacctatat
actttagaactctacaacactggtattactagtatttctccattaagaaatatgaataat
cttctatccctgaatatcggtggaaatcgcataagtgatttatcactgctttcaaacttt
aaaaacctttattctcttgatttaagcaacgcagggcttacaaatataagctttttacaa
aatttaactcagcttgagaagctgaagctttcttataattcaattactgatataagccct
ttatcaaaccttataaatctatatgttcttaaattaaacaacaacagcataacaaatatt
tctgctttaagtaaaatgacagatttaatagagcttaatatatccaacaataaaataagc
gatatatcagtattaagtgatctaacatttttatcaatgcttaatatttcaggaaataaa
ataactaatatatcttctttatcaagccttgaaaatctttcaatattaataatgaattca
aacagcattacagacataagttcacttgaaaacttaactaacatttttgcactttatgct
gataataataacattcaaagtattgattcaattgcaaatatgcaggatttatatttacta
tcactttcaaacaacccaataacaaatattgaaccaattggcagcattcctaatctattt
gaacttaatattaatggaataaaaacaagtgattttagtccaatagaaggattacataat
ttatttacattatcattatcaaataacaatataagtaatcttgattttataagcacatta
tcaagacttagatatcttaatttatctggaaatgaaataagtgatttgacaccacttgaa
ggtcttgttaacttaaaacagcttaagatagattcaaataatattagcgatataacatca
cttgttattttagcacagaatggtgcttttaaaggtatagaaaagacaagggctaataca
actaatgctgacagaactaattataatgagaaggaactatcaaatcttaaaaatacatta
aattatactaatagcagggaaaagcagcttgatataataaaaagtctatctgaaactcag
ttggaattcggatatggggaaggttatattgacgttactaataatcttttagacatttca
ccaggaaccaaagccttaaacgatatatatactataaaaagcaatggtattacaatatat
tatcagccccagaagggaataccagtatacgttactaaaacctcacctgctgataataca
gaaaatgttgcaacaaacaatcttgtaataactgttacctttgacaggaagatagccctt
ggcacaggcgcaagccttattacccttaccgatatggatggtacaaatattcctgtaaca
tcctcagtatcaaataacatactcacaataaaacctttatcaaaggttaaagtattaaca
aagtacaccgtaactattcctaaaaatgcagtaaaggactattcaaacagcactttaaca
cttggcagtaattatagcttctcctttactactacagatgatgttgcaccatcaattaca
acaagcactccaacgcaaaatgcttctgatgcatcattaacacaggaaatacgcattgtc
tttgatgagagtatacaattaactgataattttgcatgtactctgcttgataaatcaaat
aagcctataagcattatatatgagatatcaaaggataatcctaatatgcttattgtaaag
cctgaaaagaaacttagccctttgtcaagctatacattcaaactagtaaagggaagcatc
cgcgacagttatggcaatatttgtaacagcgatataacaattaagtttaaaacagcagat
tctccagtaccttatgtaattagctcaacgccggcatcagcatcacaaaatattgatgtt
aaggcacaaataaaaataaaatacaacaagccgatacaagttctaaatagtaatttaatt
gtattagaagataaaaacggaaataaaatagatatatcatggtcactgaagaatagtgaa
cttacaattaccccaaagagcagtcttgattactattctgattataaattttcaatctta
aagggagcggtatcttatgctgaaggcgcaaatgctacagatgaggattattctctgaca
tttaaaactaaaaagcctgaaacaacagccccgaagataacagtgctctcaagcacctta
gcctatattgatgatacaacttatgtactaagctttaaggcagaggataagtcaaatata
aaaagtgccttgataaagtggcagtatacaaatcctagtacagggcaaaaagaaactata
accgcaacacctgttttaaatgaagaaaacttagtttatacagcagctttggatttaact
gggaaaaatagcagttatacaattgaagtttgcgaccaatgggataatgctgctcaaaag
tccctttcggttacaaagcagactgatagtgctaaaccaactattacaataacaaaccca
agggtcagcactgtttcaataagcaattaccttacatcttataaccttgccttcaatgtc
tttgatgctatatcgggaattgaaaaggtaactttatctgttaaagtagataatactgat
acaatatcaaaggatatatataatcatactgaaggattctatgaaaagtccctaagtttc
aacgaaacccttgaaaaccttggagtaaggaaagaaaacggaactgcagttgtaacaata
accgttgtagacagggctggtaatgttcaatccaaggcaattacaataaaaaggatcgct
gatataaaggcaccaacagtaacatttaagtatccaaaatccacaagcacaaccgtaagt
acaaacagagttacccttgattttaaagcagttgatgactcgggtataaagtcaataata
cttatattaaacggcacggagcaaagagtttgctcttatgatgaaaccatttttgaagta
aacagcaatattgacgttgatattgaaaatggcttaaataccataaaggtaagggtaacg
gacaacatggataatatatttgaaaaaacctttacaattacaaaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system