Clostridium beijerinckii NCIMB 14988: LF65_03107
Help
Entry
LF65_03107 CDS
T04773
Name
(GenBank) diguanylate phosphodiesterase
Organism
cbei
Clostridium beijerinckii NCIMB 14988
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
dCache_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJG99673
UniProt:
A0A0B5QS67
LinkDB
All DBs
Position
complement(3420293..3423262)
Genome browser
AA seq
989 aa
AA seq
DB search
MFLIKNKNSIIRKLLIPMVIVVLAQVVLFVSVVLLSGIVGILKNNSFNLLNQKIQSRGSY
IQNEMIQHWSNVSESESLINANILHKLHSKGITVKDLDSNTQFTKELLEDVSSNLIFMLR
KNYVTGAFLILDNKSEEKVGLYFRDLDPNSNPSDNSDLLMERGPASIAQNLGIPLDTWWN
NRFIFNQNKNSSPEGFFSKPINAAADNKGLSYKDLGYWSKPFSLNDKDIQIVTYSVPLLD
ENGKPYGVLGIAISLNYLNSLLSYDEIDSNGRGVYLVGVDDNKNMNFEKITTTGPLAGKI
LGEEKNIQFNKKEIYDSIYEIKEPDSKNIAYASTKYINLYNTNTPFEKDTWAIIGIIEKD
NLLYYSERFERLLAVSLIISTLGGIIVIVIVGERVTKPIRNLAHDVRESNPSKPIELGKI
SISEIDELSSAIMTLSSNVADSSSKMSQIIKLFNMPIGAFEYKIGHEVVLCTDTFFDVIG
IEKSKRFDSYVDKRYFSKIIKKITEEKESFQEETYRIKGANKETKWIKLKILEEESRTLG
VVSDITQEILEKQKIEYERDYDILTNMLNRRAFHNIVKEILESDDLKIGAFIMWDLDNLK
YVNDTYGHDYGDEYIRKASEILKEFEKYGGIVGRRSGDEFYTFLYGYEDKYEIRKIVKSI
HSGIENSVLKLPNNRELKVRISTGIAWYPYDAVTFNDLAKYSDFAMYKIKKTVKGNISEF
NKEEYTEDSFLFSSQEDLNKLLDEKLIKYAFQPIIDARTGKIFAYEALMRSQLESLKNPL
HIIKLATADSRLYEIEKITFFKALDSFVKNKEEFKDAKLFINSLPNYVLSYEDTKRFEEL
YGEHLDRLVIELLENERSNGDNISIKRKVIERWNAKLAIDDFGSGYNNEAVLLAITPDYV
KIDMEIVRGIDKDLNRQQISKNLISYAKQRKIKVVAEGVETREELTKLIEFGVDYLQGYY
FSKPEFTPPEISKDLVMDILEINKKFNTK
NT seq
2970 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcttaataaaaaataagaactctataattagaaagttacttattccaatggtaatt
gttgtattagcacaagtagtgctttttgtaagtgtggttttattgagtggaattgttggg
attcttaaaaataattcatttaatttgttaaaccagaaaattcaatcaagaggtagttac
attcaaaatgagatgattcaacattggagtaatgttagtgaatctgaaagcttgattaat
gccaatattttgcacaagcttcatagtaaggggattacggtaaaggatttggacagcaac
acacaattcactaaagagttattggaagatgtttcgagtaatttgatatttatgctcaga
aagaattatgtaactggagcatttttaatacttgataataagtctgaagaaaaagtagga
ttatattttagggatttagaccctaattcaaatccaagtgataattcagatttattgatg
gaaagaggtcctgcttccattgcacaaaatttggggattcctttagatacatggtggaat
aataggtttatatttaatcaaaataagaattcatctccagaaggatttttctcaaagcct
attaacgcagctgcagataataaaggattatcttataaggatttaggatattggagtaaa
ccattttcattaaatgataaagatatacaaattgttacttattcggttccattgttagac
gaaaatggcaaaccatatggagttcttggaattgctatttcattaaattatctaaattca
ttactttcatatgatgaaatagactctaatgggagaggtgtttatctagtaggagttgac
gataacaagaatatgaactttgaaaagattacaacaacaggaccattagcaggaaaaata
cttggagaagaaaaaaatattcagtttaataaaaaagaaatatatgattcaatatatgag
ataaaggaaccagattcaaaaaatatagcttatgcatcaacaaaatatattaatttatat
aatacaaatacaccatttgaaaaagatacttgggcaattattggaataatagaaaaggat
aatcttctatattattcagagcgatttgaaaggcttctagcggtatcattaattatttcg
actcttggtggaataatagtaattgttattgtaggtgaaagggttacgaagccaataaga
aatttagctcacgatgttagagaaagtaatcctagtaaaccaatagaacttgggaaaata
agcatctcagaaattgatgagttgtcatcagcaataatgacgttaagttctaacgtggca
gactcttcttcgaaaatgtctcaaattataaaattattcaatatgcccataggggctttt
gaatataaaataggacatgaagtggtgctatgtacagacacatttttcgatgtaatagga
attgaaaaatcaaagcgatttgattcatatgtagataaaagatattttagtaaaatcata
aagaagataacagaggagaaagaaagttttcaagaagaaacttataggattaaaggagcg
aataaagaaactaagtggattaaattaaaaattttagaggaagagtctagaaccttagga
gtagtaagtgatattacacaagaaattttagaaaagcaaaaaatagagtatgaaagagat
tatgatatacttactaatatgttaaatagaagagcatttcataatatagtaaaagaaata
ttagaaagcgatgatcttaaaataggagcatttataatgtgggatttagataacttgaaa
tatgtaaatgatacttatggacatgattatggcgatgaatacataagaaaagcatccgaa
atattaaaggaatttgagaaatatggaggaattgttggaagaagatcaggggatgaattc
tatacatttttatacggatatgaagataagtacgaaattagaaaaattgtaaaaagtatt
cattctggtatcgagaattcagtacttaagttacctaataatagagaattgaaagttaga
atatcaacagggatagcatggtatccgtatgatgctgtaacttttaatgatttagctaag
tattcagatttcgcaatgtataaaattaagaaaacagtaaaaggaaatataagtgagttt
aataaagaagaatatactgaggattctttcttgtttagcagtcaagaagatttaaataaa
ttacttgatgaaaaacttattaagtatgcatttcagccaataatagatgcaagaacagga
aaaatatttgcgtatgaagctcttatgcgttcacagttagagtcccttaaaaatccgctt
catataataaagcttgcaactgctgattcacgattatatgaaatagagaaaattacattt
tttaaagctcttgatagctttgtaaagaataaagaggaattcaaggatgctaaacttttt
ataaattctttgccaaactatgtattatcatatgaggatacgaagaggtttgaagaattg
tatggagaacatcttgatagattagtaatagaactacttgaaaatgaacgctctaatgga
gataacatttctataaaaagaaaagtaattgaaagatggaatgccaaacttgctattgat
gattttggctcaggatataataatgaagcagtattgttagcaattacaccagattatgtt
aaaatagatatggaaattgtaagaggaattgataaagatttaaataggcagcagatttca
aaaaacctcatatcttatgctaaacaaagaaaaattaaagttgtagctgaaggggttgaa
acaagagaagaattaacgaaacttatagaatttggagttgactatctccaaggatattat
tttagcaaaccagaatttactccacctgagataagtaaagacttagttatggatattctg
gaaatcaataaaaaatttaacacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system