Clostridium botulinum E3: CLH_2066
Help
Entry
CLH_2066 CDS
T00767
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
cbt
Clostridium botulinum E3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cbt02000
]
CLH_2066
Transporters [BR:
cbt02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CLH_2066
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD51786
LinkDB
All DBs
Position
2221977..2226230
Genome browser
AA seq
1417 aa
AA seq
DB search
MYFIKSLNFFNSNDKFNICFKDKPLDKGKKIILHKGHYLLKFFLELSKSNESDRFAILLD
NRIIFNNKLEIRTQYYVEISIPLEVLNEVSTLNFLNNSDDLLVANTIKGGLYMSDTTTFS
IVSIDNANNKSFDLTLSEAFTNNFTVTIKSLATNQVYPCSLVSNSLFPDDPTKKTVIIGK
IDYYSSTVHSATEQALINLIVPSHQTYEITIFKNDPLKTSASKSVILDSFNAIADPSTDV
KVNVTGDRIVSISFKYPLRNIFDVVPIDANGEITSNNPVGHVLSNFYALYYGRDTNSSID
PTKIKWSGAFNVDRTQFSATLSADGKTLLLQDIEIGLPLTDNSDPHKLSLNKGKYHVSYD
DKTKVLTDYSEEKRIIPKMEVPFITNLKSTPAIPISAFSPVRNKVIVNFDKAVMKPLDSK
VATAEILFKSDGTPLKLSSITRPENNLTTLIFELDSSNPLPAGPITLGIGSISDGVGDLV
DACGYIVPRTKLSFTVGSIPPTLISALQDKDIKYTDNTVVNLIFSNSMNPLSTGTGALNI
GNYLFVANDGDTQEIKSLNFVGADNKTVKVTFKNLLGAGNYRLIISAGALTDTISESIAY
TNVPVAIEDTTKPSVVEIIGLRRPATDVNTTITDKDNALIIKYKTPMLVSIPGLDNKYAA
DNPSNYKFVESTTNTNPPPAIIITPPTEGPLPTGSTGLALKDDKWIRFVLPTDLSPNYPI
FENKTTLSGNPNLNYSIYIGYTELDDIKNVRNTSGNIYPLCDLKKIDATVPLIDLTKGNI
EITSDSQLQYTYTDKTTISGKDYHNEFFALAPADFTIKVSNSTIPVPNAISPLNIKSLSL
SEDGRTITFNFASGTFTSADKYAYIEGSEDVLDIFGKGLSNSIFNNQVINSVPSTLVGIS
LTNISRTPTKVTLQGADFTIGYPIEIALQFSNIISNTSPSDFLVTFNNAINAPIISASVL
QKNNANTNTVLIESYIPSIATDNLDNILLVKTVSDKNLILSKDINNNPISPFGYLPVRNL
AVSSIDWSFITPNLNGATLKATFNKELDFTKLPLSALKAAGTTGITINDVTFVTSDGTNN
IIAPYAELKDSNNKFGTITLRKIDASKSIFTNSQESNIDTVVTAANTANTAATNIVTTDT
TPTIVNDANTAKTNATALVTAANTAKGSLIPANITALSNAATQAVGSANNLVTDTNAYKT
NIATALTNAQTADTSATNSNTLAQTSPYDGAAVLTSITNTQTAINTAKTSADTAANTATS
AAAANALSKATIAVTAATTASSGSPTQAQIDASKAAIADLKLATAALVTAATTANTAATP
AYNSAVAYRDSAIAAQTAVNNLVNSPSDSNTKFNVNIKLGSDNTILNLAFSSATNLPLNT
SNLAYVQYTGQKYEFMDSELELYVNTSLDYNANSSLK
NT seq
4254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattttataaaatcccttaacttctttaattcaaacgataaatttaacatttgtttt
aaggataagccactagataagggtaaaaaaattatacttcataaaggacactatcttctt
aaattttttttagaattatcaaaatcaaacgaaagtgatcgatttgcaattttattagat
aatagaattatttttaacaataagttagaaattagaactcagtattatgtagaaatttct
atacctttagaagtattaaatgaggttagtactttaaattttttaaataattctgatgac
ctattagttgcaaatacaattaaaggaggattatatatgtcagatacaactacttttagc
atcgttagtatagacaatgctaataataaaagttttgaccttactttaagtgaagctttt
actaataacttcacagtaacaataaaatcattagctactaatcaagtatatccttgttct
cttgtatcaaattcattatttcctgatgatcccactaaaaaaactgtaataattggtaaa
atagattattacagttcaactgttcattctgcaacagagcaagcgctaataaatttaata
gttccaagtcatcaaacttatgaaataactatctttaaaaatgacccattaaaaacttct
gcatctaaatctgttattttagattcatttaatgctatagcagatccatcaactgatgta
aaagtcaatgtaaccggagatagaattgtttcaatttcttttaaatatccattaagaaat
atatttgatgtagttcctatagatgctaatggtgaaataacttctaacaatcccgttgga
catgtcttaagcaatttttatgcattatattatggaagagacactaatagttcaatagat
cctactaaaattaaatggagtggggcctttaatgtagatagaactcagttctctgctact
ttatcagctgatggaaagactttactattacaagatattgaaatcggattacctttaact
gataactccgacccacataaattatctttaaacaaaggaaaataccatgtatcttatgat
gataaaactaaagtattaactgactatagtgaagaaaaaagaataattcctaagatggaa
gttccatttataacaaacttaaaatctactcctgctattcctataagtgcattttcacct
gttagaaataaagttatagtaaattttgataaagctgttatgaaaccattagatagtaaa
gtagctactgctgaaatattatttaaatctgatggaacaccattaaaattatctagtatt
acaagacctgaaaataatctaacaactttaatttttgaattagattcttctaatcctcta
cctgctggacctattactctaggtattggttctataagtgatggtgttggagatttagtt
gatgcgtgtggttatattgtaccaagaacaaaattgtcatttactgtaggtagtattcca
cctacattaataagtgcactacaagataaggatattaaatacactgataatacagttgtt
aatttaattttttcaaattcaatgaatcctttaagcacaggtactggtgcgttaaatata
ggaaattatctttttgtagctaatgatggagacactcaagaaataaaatctttgaatttt
gtaggtgcggataataaaactgttaaggtaacatttaagaatttattaggcgctggcaat
tatagattaattatttcagctggagcacttacagatacaataagtgaatctatagcctat
actaatgtacctgtagcaattgaagatacaactaaaccatcagttgtagaaattatcggt
ctaagaagacccgctacagatgtcaatactactataacagataaggataatgctcttatc
ataaaatacaaaacaccaatgcttgttagcattcctggattagataataaatatgcagca
gataatccttcaaattataaatttgttgaatctactacaaatactaatccaccaccagca
attataataacaccaccaacagaaggaccgcttcctactggaagtactggtttagcatta
aaagatgataaatggataagatttgtattgcctacagatttaagtcctaattatccaatt
ttcgaaaataaaactactttaagcggaaatccgaaccttaactatagtatatatatagga
tatactgagttagatgacattaaaaatgttcgtaatacctcaggaaatatttatccactt
tgtgacttaaagaaaatagatgcaactgttcctctaatagatttaactaaaggtaatatt
gaaataacttctgatagtcaacttcaatacacttatactgataaaacaactattagtggc
aaagactatcataatgaattttttgctttagcaccagctgactttacaataaaagtaagt
aattcaactattcctgtccctaatgctatttctccattaaatattaaatctctttcttta
tcagaagatggcaggacaataacatttaattttgcaagtggaacctttacttctgcagat
aaatatgcatatatagaaggtagtgaagatgtacttgatatatttggtaaaggattatca
aattctatatttaataatcaagttattaatagtgttccttcaactttagttggaataagc
ttaacaaatatttctcgtaccccaacaaaagttactcttcaaggtgctgattttacaata
ggatatccaattgaaatagcattacaattttctaatataattagtaacacatctccaagt
gatttcttggtaacatttaacaatgcaattaatgcacctataattagcgcaagtgtttta
caaaaaaataatgctaatacaaatacagttcttattgaatcttatattccatcaattgct
acagataatttagataatattcttcttgttaaaactgtaagtgataagaatttaatttta
agtaaggatataaataacaaccctattagtccatttggttatcttccagttagaaattta
gctgtttcaagtattgattggagctttataactcctaacttaaatggagctactttgaaa
gctacatttaataaagaattagatttcactaaacttccattatcagctcttaaagctgct
ggtactactggaataactataaatgatgtaaccttcgttacttcagatggtactaataat
attatagcgccttatgcagaattaaaagattctaataataaatttggtactattacttta
agaaagatagatgcatctaaatctatatttaccaattcacaagaaagcaatatagatact
gttgtcaccgctgctaatactgctaatactgctgccactaacattgttactactgatact
actcctactattgtaaatgatgctaatactgctaaaactaatgctacagctttagttaca
gctgctaacactgctaaaggtagcttaattccagctaatataactgcattatctaatgct
gccactcaagctgttggatctgctaataatttagttacagatactaatgcttataagact
aatatcgctacagctcttacaaatgctcaaactgctgatacttctgctactaattcaaat
acacttgctcaaacaagtccatatgatggagctgctgttcttacttctataactaatact
caaactgctatcaataccgctaaaacttctgctgacactgctgccaatactgctacttca
gcagcagctgctaacgctctatctaaagctactattgctgtaactgctgctactactgct
tcaagtggttcacctactcaagcacaaattgatgcatctaaagctgctattgctgatcta
aaacttgctactgctgctttagtaactgctgctactactgctaataccgctgcaactcct
gcttacaactcagctgttgcttatagagactctgctatagctgctcaaactgcagttaat
aatttagttaattctccttctgattcaaatactaaatttaatgttaatattaaactaggt
agtgataatactatactaaacttagcatttagttctgctactaatctacctcttaatact
agtaatttagcttatgttcaatatactggacaaaaatatgaatttatggattctgaacta
gaattgtatgttaatacaagtttagactacaatgctaattcatctctaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
