Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula: RGRSB_1522
Help
Entry
RGRSB_1522 CDS
T05747
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
Organism
cer
Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
Polysacc_deac_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA79939
UniProt:
A0A2Z5SYJ3
LinkDB
All DBs
Position
2381307..2384231
Genome browser
AA seq
974 aa
AA seq
DB search
MQAQQSLPLFILIDGHSLAFRAYYAFAKAKHGPLHTSTGIPTSVCFGFLNSLIQVIIDQK
PQYLAIAFDRQEPTFRHKIDANYKANRQETPEDFIHDIENLQELLMALNITIVTCPGYEA
DDVLGTLANQGSKSGYQVKILSGDRDLFQLVDESKNVSVLYLEKNAIKNLSSEGYTEFDS
KAVEVKLGVKPTQVIDYKALCGDRSDNIPGVKGIGDKTAVRFLQKYGNLQGIYSNLNQIK
GANNKKLREGMKDAEHSRNLAEIITNIPIEIDLSQCQLKGFDLSSLQRILHKLELNKFLK
EIDKIKNIFERKNIFLSQESFQETYGCEPRQLSLFPSKKLVKSPAELIIKDDLNSSQINP
EIITNLEQLNKLVSRLKQYIGSQHFIAWDTETTSLEPRDAELVGIGCCWGHAITDIAYIP
TGHTKGTQLKKKVILDKLRPILENDQYAKVFQNTKFDRLVLHHQGIKLTGVVFDTMLASY
VLHPEMSHNLSDLCYRYLPEISPQSYKELGIIKGKTIASLDIKIVANYCGMDAYITYLLV
NQLEKELKSIETLKKLLIEVEQPLESVLAVMENTGVRIDTNYLQKLSQQLQQDLEFIEQR
AYQEAGEKFNLSSPKQLGEVLFEKLDLSRKKSRKTKLGYSTDHATLEKLQGDHPIVDYIL
EHRTLSKLKSTYVDALPALVRDDTQRIHTNFNQTVTATGRLSSSNPNLQNIPIRSQFSRK
LRQAFIPKENWLLVSADYSQIELRILAHLSQESVLLEAYRNGQDVHTVTAKLLFNKETIT
PEERNLGKTINFGVIYGMGAQRFAREAGVTAAEGKIFIDKYHQRYAKVFEFLEKTKKEAI
TRGFVTTILGRRRYFNFVTYSLKKLKGTNPKNINLNELHLNYTDAQLLRAAANAPIQGSS
ADIIKAAMIKIQEILSHYKANLLLQVHDELVFEVPLEEWDELQKKIKQTMENAIILTVPL
VVDIYSGNNWMEAK
NT seq
2925 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggctcagcaatctttaccactttttattcttattgatggacattctctagcgttt
cgggcttattatgcttttgctaaagctaaacatggtcctctacatacttctacgggaatt
cctaccagtgtttgttttggatttttaaattcattaattcaagttattatagatcaaaaa
cctcaatatctagctattgcttttgatcgacaagaacctactttccgccataaaattgat
gctaactataaagcaaatcgtcaagaaactcctgaagattttattcatgatattgaaaat
cttcaagaattattaatggctttaaatataacaattgtgacttgtccaggttatgaagcg
gatgatgtattgggaaccttagcaaatcaagggagtaaatcaggatatcaagttaaaatt
ctaagcggtgatcgcgatctttttcaattggttgatgaaagtaaaaatgttagtgttttg
tatttagaaaaaaatgcgataaagaatctatcatctgaaggttatacagaatttgattct
aaagctgtagaagtcaaactaggagtgaaacccactcaggtgattgattataaggcgcta
tgtggagatagatcagataatattccaggagttaagggaattggagacaaaacagctgta
agatttttacaaaaatacggtaatctacaaggaatttatagtaatctaaatcagataaag
ggcgcgaataataaaaaattaagagagggaatgaaagatgcagagcactctcgtaactta
gctgaaatcataactaatatcccgattgaaattgatttaagccagtgccagttaaaagga
tttgatctatcttctttacagagaatattacacaagctagaacttaataagttcttaaaa
gaaattgataagataaaaaatatttttgaaagaaaaaatatttttctttctcaagaaagt
tttcaagaaacatacggatgtgaacccagacaactctctttatttcctagtaaaaaatta
gttaaaagtcctgctgaattaatcattaaagacgatcttaattcgtcacaaataaatcct
gaaattattacaaacttagagcagttaaataaattagttagcagactcaaacaatatata
ggatctcaacattttattgcttgggatactgaaacaacctcattagaacctagagatgcg
gaattagttggaattggctgttgttggggtcatgcaataactgacatagcttatattcct
acaggacatacgaaagggacacaactaaaaaaaaaggtaattttagacaaattaagacca
attctggagaacgatcaatatgctaaagtttttcaaaatacgaaatttgaccgtttggtt
ttacatcatcaaggaattaaactgaccggtgtagtgtttgataccatgttagctagttat
gttttgcatcctgaaatgagtcataatttgagtgatttatgttatcgatatttacctgaa
atcagtcctcagagttacaaagaattaggaattattaaagggaaaactattgccagttta
gatattaaaattgttgcaaattattgtggaatggatgcttatattacttatttgttagtt
aatcaattagaaaaagaattaaagtcaattgaaactttaaaaaaattactcatagaagtg
gaacaacccttagaatctgtcttggcagttatggaaaatacaggggttcgtattgacact
aactatttacagaaattgtctcaacaattacaacaagacttagaatttatcgaacaacga
gcataccaagaagcaggggaaaaatttaatttaagctctcctaaacaacttggagaagtt
ttgtttgaaaaactagatttaagtcgcaagaaatcccgaaaaactaaacttggatattct
accgatcatgctactttggaaaaactacaaggagatcatccgattgttgattatatttta
gaacatcgtactttatctaaattaaaatcaacctatgtggatgctttacctgcattagtt
cgtgatgatacccaacgaattcatactaactttaatcaaacggtaacagcaactggaagg
ttatcttcttctaaccctaacttacaaaatatccccattcgttctcaattttctcgtaag
cttcgtcaagcgtttattccgaaagaaaattggttattagtatcagcagattattcgcaa
atcgaactgagaattctagcacatttaagtcaggagtctgtattattagaagcatataga
aatggtcaggatgttcatactgtaactgctaagctattatttaataaggaaactattaca
ccagaagaaagaaatctaggtaaaacaattaattttggggtaatttacggaatgggtgct
cagaggtttgccagagaagcaggagttacagcagcagaaggaaaaatatttattgataag
tatcatcagcgatatgccaaggtatttgagtttttagaaaagacaaaaaaagaagcaatt
actaggggatttgtaacaactattttgggaagaagacgatactttaattttgttacatac
agtttgaaaaagcttaaaggtactaatccaaaaaatattaatttaaacgagttacatcta
aattatacagatgctcaattactacgtgctgcagctaatgcaccaattcaaggctcaagt
gctgatattattaaagctgctatgattaaaatacaagaaattttaagtcattataaagca
aatttattattacaagttcatgatgaattagtttttgaagttcctctagaggaatgggat
gaattacaaaaaaaaatcaaacaaactatggaaaatgctattattttaacagttccttta
gtggttgatatttattcaggtaacaattggatggaagcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
