Croceimicrobium hydrocarbonivorans: H4K34_09255
Help
Entry
H4K34_09255 CDS
T07152
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
chyd
Croceimicrobium hydrocarbonivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNR22575
UniProt:
A0A7H0VA27
LinkDB
All DBs
Position
complement(2050260..2053433)
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MKITKTSILRPTLVVVLFTLLIGAGSFSYKALNYELLPDMSTPILTVSTIYPGASPTEVE
NSVTKEIEDAVSTLEGLDRLSSTSMESVSIVTIELKQDVDVDQAMQEAQRNINAMVSDLP
DDAQQPSVGKFDLGDLPIMNLGVSADLSGTELYDLIDQKLKPQLSKIEGVAQVDVIGGQA
REIRININADKLETYGISLLQLSQIVQNANMDFPTGKISDDETQTLIRLSGKYHSLDQIR
ALVLRSMPNGSVIRLGDVAEVQDTEKEAEILSRVNGENAIGLNIRKQGDANTVEVSAATK
EIIADLEEAYADKNLKISIAKDSSDFTLEAADAVIHDLFFAVILVALVMLLFLHSLRNAV
IVMVSVPASIIATFTAMMLLGFTLNLMSLLALSLVVGILVDDAIVVIENIYRHMEMGKSP
FQAAYDGIREIGVTVISITLVIVAVFVPISLTGGIIGNLLRQFSLTVAISTLLSLLVAFT
LIPLLASRFSRLSNLKSKGLIGNFIRWFEGVLKSFEEGMTQALKWSFQHKLVVLAITFAL
FIGSFTLVTKGFIGSEFVSAGDRGEFLMQIELPKKASLHQTNLLSQKAEYFVSQFPEVKE
ISTVVGQQSGSRSGNTNTPYVAELSVKMIDADQRTVTAPIFSRQLQIALQENIPGAKFKA
VPASLVGSGTQAPIQIVLSGSEAEQMKSYADKVMEIVQSVQGTAEVESSLKDGNPEIQVQ
IDRDKMASLGLSLELVGGTMRTAFNGVQESKYRDGDNEYDINILLDQFDRQKIEDIQSLV
LMNNKGDQIRLDQFASVIEASGPAQLNRRDKVPTITVSAQVIGRPVGTVGEEIQNQLASI
DFPAGLTYSMGGDLENQAEAFGSLLLALLTSLVLVYLIMVALYNSYAYPLVVMFSLPLAV
IGALLALALSGNALSIFSILGMIMLIGLVAKNAILVVDFTNQLKESGLEVREALIRATQV
RIRPILMTTLAMVIGMLPIALASGAGAEWKNGLAWVLIGGLTSSMFLTLIVVPLVYYIFD
RVMARFGWDKEQKIELVETPREELNTEIEETLQTSMA
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagattaccaaaacttccatactccgccccacattggtggtggtgctatttacccta
cttatcggtgccgggtccttcagttataaggcgctcaactacgagctgctccctgatatg
agcacccctatacttaccgtttctaccatataccccggagcttcgcctactgaggtggag
aactcggtaaccaaagaaattgaagatgccgtttccaccctcgaaggcttggacaggctg
agttctacctccatggaaagtgtttccatcgttaccatcgagctgaaacaagatgtagat
gtagaccaggccatgcaagaggcccaaaggaacattaatgccatggtaagcgatttaccc
gatgatgcccaacaaccatcggtaggtaaattcgatttgggtgatttacccattatgaac
ctgggcgtttccgccgacctctccggaacggagctctacgaccttattgatcaaaagcta
aaacctcagctatccaaaattgaaggagtagcgcaggtagatgtaattggtggtcaggcc
cgtgaaatccgcatcaacatcaacgccgataaactggaaacctacggcattagcctcttg
caattaagtcagattgtgcaaaatgccaatatggacttccctaccggtaagattagtgat
gacgaaactcaaaccctgatccgcttgagcgggaaataccattcgctggatcaaattcgg
gccctggtattacgcagcatgcccaatggttccgtgatccgcctgggagatgttgccgaa
gtgcaagacaccgagaaagaagcggaaattttatcccgtgtaaacggcgaaaatgccatt
ggtcttaatatccgtaaacagggggatgccaataccgtagaggttagtgccgcgaccaaa
gagattattgctgatttggaagaggcttatgccgataagaaccttaaaatatccatcgct
aaggatagctccgactttaccctcgaagcagcagatgcggttattcacgaccttttcttt
gccgtaattctggtagccctggtaatgctcctattcctgcatagcttgcggaatgctgta
attgtaatggtatcagtacccgcctccattatagccaccttcacggcgatgatgctcctg
ggctttaccctcaacctgatgagtcttttagccctctccctggtagttggtatcctggtg
gatgatgcgattgtagtaattgaaaatatttaccgccacatggaaatgggtaaaagtccc
ttccaagcggcctatgatggtattcgtgaaattggagtaaccgtaatttccattacactg
gtaattgttgcggtattcgtaccgatctccttaactggtggtattattggaaacttactg
cgtcagttctccttaaccgttgccattagcaccctgctgagtttattggtggcctttacc
ttaattccattattggcctcacgtttctcgcgcttgtccaatttaaaaagcaagggcctt
atcgggaactttattcgctggttcgaaggcgtgctcaagagctttgaggagggaatgact
caagccttaaaatggtctttccaacataagctggtggttttggccatcacctttgctctc
tttattggctccttcaccttggtaaccaaaggctttatcggatccgaattcgtttcggct
ggtgaccgtggtgagttcttaatgcaaattgaattacctaaaaaggccagtttgcaccaa
accaacctcctcagccaaaaggccgaatacttcgttagtcagtttccggaggttaaagaa
atctctaccgtagttggacagcagtctggcagccgatctgggaataccaataccccatat
gtagcggagcttagcgttaaaatgatcgacgctgatcaacggacggttaccgcacccatt
ttctctcgtcagttgcaaattgccttgcaagagaatatccctggagccaagtttaaggcc
gttcctgcttctttagtaggctccggaactcaggctcccattcaaattgtattgagtgga
tccgaagcggagcaaatgaagagctatgccgataaggtgatggagattgtgcaatcagtg
caaggtaccgccgaagtggaaagcagcttaaaagacggtaatcctgaaattcaagtgcag
atcgaccgcgataaaatggccagcctgggcttaagcctcgaattagtaggaggaaccatg
cgtaccgcctttaatggggtgcaagaatccaaataccgcgatggcgacaatgagtacgat
atcaatatccttttggatcaatttgatcgtcagaaaattgaggacatccaaagtctggtg
ctgatgaataataagggcgatcaaatccgcttagatcaattcgctagcgtaattgaagct
tcaggacctgctcagcttaatcgtcgggataaggtgcccaccattacggtgtcggctcag
gttattggtcgacctgtaggtacggttggggaagaaattcagaaccaattagcgagcatt
gacttccccgccggattgacttacagcatgggaggtgatctcgaaaatcaggcggaagcc
tttggcagcctcttgctggcccttttaacctctttggtattggtgtacttgattatggta
gccctttacaatagttatgcttatccactagtagtgatgttctccttaccattggcggtg
attggagccctcttagccctggctttaagtggaaatgccttaagtatattctccattttg
gggatgattatgttgattggtttggtagccaagaatgccattctggtggttgactttacc
aatcaattgaaggaaagtggactggaagtacgcgaagcgctgattcgcgctactcaggtg
cggattcgtcccatcttgatgactaccctggcgatggtaattggtatgctacctattgct
ttggccagtggtgccggtgctgaatggaaaaacggattggcctgggtgctgattggcggc
ctcaccagttctatgttcttaaccctgattgtagtgcccttggtgtattacatcttcgac
cgggtgatggctcgttttggatgggataaagagcaaaagatcgaattagtagaaacccct
cgagaagagctgaacaccgaaatcgaagagacgcttcaaaccagtatggcctga
DBGET
integrated database retrieval system