Clostridium bornimense: CM240_2499
Help
Entry
CM240_2499 CDS
T03165
Symbol
yesW
Name
(GenBank) Rhamnogalacturonan endolyase YesW
KO
K18197
rhamnogalacturonan endolyase [EC:
4.2.2.23
]
Organism
clt
Clostridium bornimense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clt00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
CM240_2499 (yesW)
Enzymes [BR:
clt01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.23 rhamnogalacturonan endolyase
CM240_2499 (yesW)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RGL11_C
RGI_lyase
RicinB_lectin_2
FG-GAP_3
Ricin_B_lectin
FG-GAP
PQQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM69629
UniProt:
W6S180
LinkDB
All DBs
Position
rep1:2711322..2713724
Genome browser
AA seq
800 aa
AA seq
DB search
MIKKTFIKTIITFTTAIALTLNSSAIASFSSLKTNVYAATSTARQMEYLDRGVIATKVNN
GVYIGWRMLGTDNENISFNIYRDGKKINSSPITNSTNYLDTSGTTNSKYSIKPVINNKEQ
DGTSEVSVSSTPYKSIPIKKPADGKTPSGEEYSYSANDGSVGDVDGDGQYEIILKWDPSN
SKDNSQDGYTGNTYIDAYKMDGTFLWRIDLGVNIRSGAHYTQFIVYDFDGDGKAEVACKT
ADGTKDGTGKYIGDKSKDYRNSKGRVLSGPEYLTMFEGSTGKALSTIDFSPERGKVSDWG
DSYGNRVDRFLGGVAYLDGKTPSLVMSRGYYAKTAITTYNFKNGKLTKNWEFVADGSTNS
SYRDRGCHSLSVADVDNDNKDEIIFGSATIDDNGKGLYSTGLSHGDALHVGDLDPTNDGL
EVFQVHESKTSKYGFDLRDAETGKVLWGIKTGTDVGRGLTADIDPTHPGEEMWASGQGLY
NSSGEKISSSTPGSINFAAWWDGDLSRELVDRNRIDKWDYQNNKLNRLLTATGCSANNST
KATPVLQADILGDWREEIIWRTDDSSELRIYSTTDITEYRIHTLMHDYVYRLGVAWQNVA
YNQPPHTSFFLGNGMSKVSSPNIYLAGSSNSSNDSSSSSNTSTSNNSTTVTKITSGKCYR
LKNANSGQYMDVKNGNYANNTNIQQHPSNDESAQVFKIVSVGDGYYKMVSQVGNADKVVD
VSGKKTSNGTNIALYTDKSATNQQFKFKCLDNGNFVIYTRVSKNKSVIEVENASKSKKAN
IQQWEYNSNLCQEWILELAD
NT seq
2403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgataaaaaaaacttttattaaaactataataacttttacaactgctattgctctaact
ctaaattcttcagccattgcaagtttttcatcgttaaaaactaacgtttacgctgccact
tctacagcaagacaaatggagtatttagatcgtggcgttatagctactaaagttaacaat
ggtgtatatattggttggagaatgttaggtactgataatgaaaatatttctttcaacata
tatagagatggtaaaaaaataaattcttcacctataactaacagcaccaattatcttgat
actagcggaactacaaactctaaatattctataaagccagtaataaacaataaagaacag
gacggaacatctgaggtatctgtatcctcaacaccatataaatctatcccaataaaaaaa
cctgctgatggaaaaactccatctggagaagaatatagctatagtgctaatgatggtagt
gtaggagatgtagatggtgatggacaatatgaaattatattaaaatgggatccatctaat
agtaaagataactctcaagatggatatacaggaaacacttatatcgatgcttataaaatg
gatggtacttttctatggcgcatagatttaggagtaaatattcgctctggtgctcattat
actcaatttatagtttatgattttgatggcgatggtaaagctgaagtagcatgtaaaact
gcagatggaacaaaggacggtactggaaaatacattggtgataagagtaaagattataga
aatagcaaaggacgtgttttaagtggtcctgagtatttaacaatgtttgaaggctccacc
ggtaaagctttatctactatagatttttctcctgaaagaggcaaagtaagtgattgggga
gatagctatggtaatagagttgatcgtttccttggtggtgttgcatatttagatggtaaa
actccaagtcttgttatgagcagaggatattatgctaaaactgctataacaacttataac
tttaaaaacggcaagcttacaaagaattgggagttcgttgcagatggttcaacaaattct
agctatagagatcgtggttgccacagcttaagtgtagctgatgtagataatgacaataaa
gatgagataatatttggttcagcaactatagatgataatggtaaaggattatattctaca
ggactttctcatggtgatgcgttacatgttggagacttagatcctactaatgatggattg
gaagttttccaagtacacgaatcaaagacctccaaatatggatttgatcttcgcgatgca
gaaactggaaaagtgctttggggcataaagactggtactgatgtaggtagaggtcttact
gctgatatagatcctactcatccaggcgaagaaatgtgggcatcaggccaaggcttatat
aactcttctggtgaaaaaataagttcttcaactccaggttctataaactttgctgcatgg
tgggatggcgacttatctcgtgaattagtagatcgaaatagaatagataaatgggattat
caaaataacaaattaaacagacttttaaccgctactggatgctctgctaataatagtaca
aaggccactcctgtattacaggctgatatattaggagattggcgcgaagaaataatttgg
agaactgacgatagtagtgaattaaggatttattcaacaacagatataactgaatatcgt
attcatacattaatgcatgattatgtatatagattgggagtagcttggcaaaatgttgca
tataatcaacctccacatacaagctttttcttaggtaatggtatgtcaaaggtttcttca
cctaatatatatttagcaggtagctctaacagctcaaatgattcatctagttctagtaat
acttctacatctaataattcaactactgtaactaaaattactagtggtaagtgctataga
cttaaaaatgcaaatagtggtcaatatatggatgtaaaaaacggcaactatgctaataat
actaatatacaacaacatccttctaatgatgaatctgcccaagttttcaaaatagtaagt
gttggtgatggatattataaaatggtatctcaagttggaaatgcagataaagttgtagat
gttagcggcaaaaaaacttctaatggtactaatatagcattatatactgataaatctgct
actaatcaacaattcaagttcaaatgtctagataatggtaactttgttatatacactaga
gtttcaaaaaataaatctgtcatcgaagtagaaaatgccagcaaaagtaaaaaagcaaat
attcaacaatgggaatataattctaacctatgccaagaatggattcttgaattagctgat
taa
DBGET
integrated database retrieval system