KEGG   Campylobacter pinnipediorum: CPIN18020_0397
Entry
CPIN18020_0397    CDS       T05033                                 
Name
(GenBank) autotransporter domain protein
Organism
cpin  Campylobacter pinnipediorum
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: AQW85636
LinkDB
Position
360700..364842
AA seq 1380 aa
MKISKIVSAAILSVAVSGFAFGAGEANSNLEFYKLAKTQLETIATAKSDLNTQKENLTNE
VVKGAFKAILVAAKRLQVPEYGLNFPDLAMIDGKSVNLKLTKTSGKPSLEISYDDKKDVL
ALNGSNDELSFTARKLSKLTPIIEALKGQENTIISHDTIDAKTNETNKHLKMLDYLNAIN
TQATSLISNNLGKPIEVEETTHEVTDIDNHPDLKKLQDILLKAKAAKALGNTVEFNDVDI
GNYKLAINTDGNQLNIKYNDTKGTDTFALNNDKLTYIPNTTPNTAVPVIKFLEDSNAVKE
LTKEGSTLKTAQKEADKGAAKANLRSAIESSISLFATSLNALKSYDSTDKDNEIKRVAKS
ILNFAASDFLDFITSAGIKKSLTLDNGKADIILKKDNAAHQVELDIVYDHDESGNLTPSA
ANTSKFILNTQSNEITFTNATEAEDNFGKFASISQIGSKINTALDLDNSSNLVAKADINK
NINKGALYDVIIAGLPHILNSTKIDALIGAGTNGIVKNTDSFIADIITSANRYKLSDQTA
SDITAEVTIGDKTLVLTLKLDNQNSTIEVAEKETNGASATKKDIIIIEADKIKLTANSIE
NVATPIIKKLSDSKDDLTNLSAISNKINEKKTGELATLTTDILNKRKALLEAIYKPAGTD
ASLDPEFNAIAEILKANSTFALTDADKTSEDVFTKISEDSRTKIKAILEAAVAAGNDYVA
SLELNIAINGATIKLEVLNNQPVITVSKTEGDKSTKDTFSLNERNELVYESNKTEVADSV
LHLLADGFDPTALQSAIEGKIKEANEAVIKEALNSNNPKVKVTNDNASEVAKVANEKDEE
LKVAQDALASASKTSEQFDKEIAAAQQAVAEAEKAITAAGNNAEAKKAAEAKKAAEAKKT
HLEAVKTAVTSATGDDVAAKKKDLETKLATAQTQVNVLNEALVNSPILSKNANTELEVAQ
KAVNDAGTNPTDEQKQKLEKAKEKVAEVNSDRALRAAKVAKLDTQSQSIAQSLGEITKDL
PDLSKQFAEANTKEKIIDLVKNVSDSVTTSVDSISEISNTDIVKFNTDLSTSTRLASLSN
PFNADLALASAIRHLKDDSFASSDDSALSNVVREYTDRFNYDNNLWGSVLGGKTSVKNGA
SPKIFGVTLGYDKRFDNMIVGTTTTYTQTKADKSDVELKGKNIQLGLYTRGYFDENEVDA
RINFNFGDNKVKRTTSIGKTDGKFDSFATSFDLTYGRIYQLDNDVMIKPLGGVGYTYLKT
KSFAEKGEGALSYNSITTKVANLKAGVELRKYVESGKYFYVTPGVEREIFKNVKDPIVKF
IGADNGIKLVGDDKKNTYFTLQTGANFNITDSLSTNINFGTKLGSKNKFYNGTIGVNYKF
NT seq 4143 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatttcaaagattgtaagtgcagctatacttagtgtagctgtaagtggtttcgct
tttggtgcaggggaagctaattctaaccttgaattttataaacttgcaaaaacacaacta
gaaactatagccactgctaaatcagatctaaatacacaaaaagaaaaccttacaaatgag
gttgtaaaaggtgcgtttaaagcgattttagttgcagctaaacgcctacaagtcccagaa
tatggcttaaactttccagatttagcaatgattgatggtaaatcagttaacttaaaactt
accaaaacttcaggcaaacctagtcttgagatttcttatgatgataaaaaagatgttttg
gctttgaatggtagtaatgatgagcttagctttacagcaagaaaactaagcaaattaact
cctattatagaggctcttaagggtcaagaaaacacaattatatctcatgatacgatagat
gcgaagacaaatgaaacaaataaacatcttaagatgcttgattatctaaatgctattaat
actcaagccactagtttaatctctaacaatcttggaaaaccaatagaagttgaagaaaca
acgcacgaagtgactgatatagataatcaccctgatttaaaaaagcttcaagatattttg
cttaaagccaaggctgctaaagctttaggtaatactgtagaatttaatgatgtagacata
ggtaattataaattagccataaatacagatggcaaccagttaaatataaaatataatgat
accaaaggcaccgatacatttgctctaaacaacgataagttaacttatattccaaatacc
acaccaaatacagctgttcctgttattaaatttcttgaggatagcaatgcagtcaaagaa
ctgacaaaagaaggttcaactttaaaaacagctcaaaaagaggctgataaaggtgccgca
aaagcaaatttaagatcagctatagaatccagtatatcactttttgcaactagtttaaat
gcacttaaatcttacgactctacagataaagacaatgaaataaagcgtgttgctaaatca
attttaaattttgctgctagtgattttttggattttattacaagtgcaggtattaaaaaa
tcactaactttagataatggcaaggctgatataattcttaaaaaagataatgctgctcat
caagtagagctagatatagtctatgatcatgatgaaagtggaaatttaacgcctagtgca
gccaatacaagtaaatttatcttaaacactcaaagcaacgaaataacatttacaaatgct
actgaagcggaagataattttggtaaatttgctagtataagccaaataggttcaaaaata
aatacagcactagatttagataatagttctaatttggttgctaaagctgatataaataaa
aacataaacaagggcgctttatatgatgtgataatagctggtttaccacatatactaaac
tcaactaaaattgatgccctgataggtgctggaactaatggtatagttaaaaatacagat
agctttatagcagatattattacatcagctaatcgctataaacttagcgatcaaaccgcc
agcgacataactgctgaagtaactataggagataaaacattagttctcactttaaaatta
gataatcagaattcgaccatagaagtagctgaaaaagaaactaatggtgcaagtgcaacc
aaaaaagatatcataataatagaggcagataaaatcaagcttactgcaaatagcatagaa
aatgttgctactcctattataaaaaagctatcagattcaaaggatgacttaaccaatttg
tctgctatttctaataagataaatgagaaaaaaactggcgaattggctacgcttaccacc
gatatcttaaataaaagaaaagctttacttgaagctatttataagccagctgggacagat
gcttctttagatcctgaatttaacgccattgctgaaattttaaaggctaatagtactttt
gctctaacagatgcagataaaacatccgaagatgtttttactaaaatcagcgaagatagt
cgaactaagataaaagctatccttgaagcagcagttgcagctggtaatgactatgttgca
tcactagagcttaatatagcaataaatggtgcaacaataaaattagaagtattaaataat
caacctgttataactgtttctaaaactgaaggagacaaaagcacaaaagacacattcagc
ctaaatgagagaaatgaactagtatacgaatcaaacaaaacagaagttgctgattctgta
ttacacttattggcagatggatttgaccctacagcattacaatcagctattgaaggcaaa
atcaaagaagcaaatgaagctgtcataaaagaagctttaaattctaacaatccaaaagta
aaagtaacaaatgacaatgcaagtgaagttgctaaagtagctaatgaaaaagatgaagaa
cttaaggtagcacaagatgcccttgcttcggcttcaaaaactagcgaacagtttgataaa
gaaatagcagctgcacaacaagcagtagcagaagcagaaaaagccataacagcagcagga
aataatgcagaagctaaaaaagcagcagaagctaaaaaagcagcagaagctaaaaaaact
cacctagaagctgttaaaacagctgtaactagtgcaacaggagatgatgtagcagctaag
aaaaaagacttagaaactaaactagcaacagcacaaacacaagtaaatgttctaaatgaa
gcattagttaatagccctatcttatcaaaaaatgctaatactgagctagaagttgcacaa
aaagcagtaaatgatgcaggaacaaatccaacagacgaacaaaaacaaaaattagaaaaa
gctaaagaaaaagtagcagaagtaaactcagatcgtgcattaagagcagctaaggtagct
aaactagatactcaatctcaaagcatagctcagtctttaggtgaaattactaaagattta
ccagatctaagcaaacaatttgctgaagctaatacaaaagaaaaaataattgatcttgtc
aaaaacgtatcagattctgtaacaacatcagttgactcaatatctgaaatatctaataca
gatatcgttaagtttaatacagatctttcaacctctacaagacttgcaagtctaagcaac
ccattcaatgctgatttagcattagcaagtgctatcagacatttaaaagatgatagcttt
gcaagtagtgatgacagtgcattaagcaacgtagtaagagaatacacagatagatttaac
tatgacaataacctatggggaagtgtcttaggtggtaagacaagtgttaaaaatggtgca
agtccaaaaatctttggtgtaactcttggttatgataagagatttgataatatgatagtt
ggtacaactacaacttatactcaaacaaaagcagacaaaagtgatgttgagttaaaaggt
aaaaatatccaattaggtctttatacaagaggatactttgatgaaaatgaagtagatgca
agaatcaactttaactttggagataacaaggtaaaaagaacaactagcataggtaaaact
gatggtaagtttgattcatttgcaacatcttttgatctaacttatggtcgcatatatcag
ttagataacgatgtaatgatcaaaccacttggtggtgttggatatacatatctaaaaaca
aaatcatttgctgaaaaaggcgagggcgctttatcatataactctataacaacaaaagta
gctaacttaaaagctggtgttgagttaagaaaatatgttgaatctggtaaatacttctat
gtaactcctggtgtagaaagagagatatttaaaaacgttaaagatcctatagttaaattt
ataggagcagataatggcattaaactagtaggtgatgataagaaaaatacttactttact
ttacaaacaggtgctaattttaacataacagatagcttaagcacaaatataaactttgga
acaaaactaggttctaaaaacaaattctataacggaactataggtgttaactataagttt
taa

DBGET integrated database retrieval system